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Takifugu rubripes
cluster # 2117 cluster # 2117       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2117#0 length = 518 sequences # 4  

consensusID : consensus_2117#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 518
fasta sequence
                              [TGAGGTTCAAACTCCTTTAATATCTCAGCAGAGGCAGCGTGAGGTGGCTGGTTCCCGTGGTCGTTCTCAGGATACGCGTCTCTTCTAAGGCGGTTTGGTCAGCTGGTGCTTGAAGACGGAGACGAAGCACATGTCCACCACCGGACTGTCCAGGTTCAGCAGGGTCACCACGTTGTGCTCGCCGCCCCACCGCCGCCTCAGCTCCCCGGAGATTCTGCCACCGATGTTGTTCGCCGTCTGGATGCTGACAGTCGCCGCTTCCTTCTTCACGTTGGAGCCGACGACTTCGAAGAGACGGTTGTGGAGGTCGTGTCTGTTTTGGGCGTACAGGTGCGTCTTCTCGTAGATCCTCAACAGGATGTTGTCGATGAGATGGTAGAGGAGCGTTTCCTGGGTGATGTGGGCCGTCCCGCCTGCTCTGTCTTCACCCTCCTCGGGGGCCCCTCTGAGGCCTGCCACCTCCTCTTCGTCAGTGAGGGTCACCTGTTCGCTGATGCTGGTCACCTGTGTGGTCAGCC]

[+] EMBL CA331351             [TGAGGTTCAAACTCCTTTAATATCTCAGCAGAGGCAGCGTGAGGTGGCTGGTTCCCGTGGTCGTTCTCAGGATACGCGTCTCTTCTAAGGCGGTTTGGTCAGCTGGTGCTTGAAGACGGAGACGAAGCACATGTCCACCACCGGACTGTCCAGGTTCAGCAGGGTCACCACGTTGTGCTCGCCGCCCCACCGCCGCCTCAGCTCCCCGGAGATTCTGCCACCGATGTTGTTCGCCGTCTGGATGCTGACAGTCGCCGCTTCCTTCTTCACGTT                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CA329842             [   GTTTCAAACTCCTTTAATATCTCACCAGAGGCAGCGTGAGGTGGCTGGTTCCCGTGGTCGTTCTCAGGATACGCGTCTCTTCTAAGGCGGTTTGGTCAGCTGGTGCTTGAAGACGGAGACGAAGCACATGTCCACCACCGGACTGTCCAGGTTCAGCAGGGTCACCACGTTGTGCTCGCCGCCCCACCGCCGCCTCAGCTCCCCGGAGATTCTGCCACCGATGTTGTTTTTCGTCTGGATGCTGACAGTCGCCGCTTCCTTCTTCACGTTGGAGCCGACGACTTCGAAGAGACGGTTGTGGAGGTCGTGTCTGTTTTGGGCGTACAGGTGCGTCTTCTCGTAGATCCTCAACAGGATGTTGTCGATGAGATGGTAGAGGAGCGTTTCCTGGGTG                                                                                                                         ]
[+] EMBL CA329469             [        AAACTCCTTTAATATCTCAGCAGAGGCAGCGTGAGGTGGCTGGTTCCCGTGGTCGTTCTCAGGATACGCGTCTCTTCTAAGGCGGTTTGGTCAGCTGGTGCTTGAAGACGGAGACGAAGCACATGTCCACCACCGGACTGTCCAGGTTCAGCAGGGTCACCACGTTGTGCTCGCCGCCCCACCGCCGCCTCAGCTCCCCGGAGATTCTGCCACCGATGTTGTTCGCCGTCTGGATGCTGACAGTCGCCGCTTCCTTCTTCACGTTGGAGCCGACGACTTCGAAGAGACGGTTGTGGAGGTCGTGTCTGTTTTGGGCGTACAGGTGCGTCTTCTCGTAGATCCTCAACAGGATGTTGTCGATGAGATGGTAGAGGAGCGTTTCCTGGGTGATGTGGGCCGTCCCGCCTGCTCTGTCTTCACCCTCCTCGGGGGCCCCTCTGAGGCCTGCCACCTCCTCTTCGTCAGTGAGGGTCACCTGTTCGCTGATGCTGGTCACCTGTGTGGTCAGCC]
[+] EMBL CA329540             [         AACTCCTTTAATATCTCAGCAGAGGCAGCGTGAGGTGGCTGGTTCCCGTGGTCGTTCTCAGGATACGCGTCTCTTCTAAGGCGGTTTGGTCAGCTGGTGCTTGAAGACGGAGACGAAGCACAAGTCCACCACCGGACTGTCCAGGTTCAGCAGGGTCACCACGTTGTGCTCGCCGCCCCACCGCCGCCTCAGCTCCCCGGAGATTCTGCCACCGATGTTGTTCTTTGTCTGGATGCTGACAGTCGCCGCTTCCTTCTTCACGTTGGAGCCGACGACTTCGAAGAGACGGTTGTGGAGGTCGTGTCTGTTTTGGGCGTACAGGTGCGTCTTCTCGTAGATCCTCAACAGGATGTTGTCGATGAGATGGTAGAGGAGCGTTTCCTGGGTGATGTGGGCCGTCCCGCCTGCTCTGTCTTCACCCTCCT                                                                                    ]


>consensus_2117#0 TGAGGTTCAAACTCCTTTAATATCTCAGCAGAGGCAGCGTGAGGTGGCTGGTTCCCGTGG TCGTTCTCAGGATACGCGTCTCTTCTAAGGCGGTTTGGTCAGCTGGTGCTTGAAGACGGA GACGAAGCACATGTCCACCACCGGACTGTCCAGGTTCAGCAGGGTCACCACGTTGTGCTC GCCGCCCCACCGCCGCCTCAGCTCCCCGGAGATTCTGCCACCGATGTTGTTCGCCGTCTG GATGCTGACAGTCGCCGCTTCCTTCTTCACGTTGGAGCCGACGACTTCGAAGAGACGGTT GTGGAGGTCGTGTCTGTTTTGGGCGTACAGGTGCGTCTTCTCGTAGATCCTCAACAGGAT GTTGTCGATGAGATGGTAGAGGAGCGTTTCCTGGGTGATGTGGGCCGTCCCGCCTGCTCT GTCTTCACCCTCCTCGGGGGCCCCTCTGAGGCCTGCCACCTCCTCTTCGTCAGTGAGGGT CACCTGTTCGCTGATGCTGGTCACCTGTGTGGTCAGCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)