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Takifugu rubripes
cluster # 2143 cluster # 2143       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2143#0 length = 637 sequences # 4  

consensusID : consensus_2143#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 637
fasta sequence
                              [CTGGGAAAATGTTTATTCACAT-CATCTTTAATGATTATGATGGCTTCAACAACTAGATTTAGAGCTTTCAAATGTAATAACATGAAAAACAAATGGATTCCATATTTGGGTTTTATTCAGGGAAGGATTTTATCAAAACCTTTAATAAAGGACAGGAAATTTAACAGCTAAGTTTCAACCATCTGGTGTTTAACGTAACAGATGAATCTAAAAAGCAAAACCAAAACCTTCCAGCGTGTAGACTAAACTGATGAAAACTCACATGGAACAAAAAAACGCCAAGCAAACGGCTTGTTATCTTTTTCTTTAAAGATAGAAGAGAAGGTTGTCCAGCTGCATGTTGGGCTCCTTGTGGATGCTCTGGCCAACAAGGAAAGCCAGTTTGTGGGCATACTGGCAGGGGGCGGGCACTCTGATAACCCCCTGCCAGTTGTAGTACATGTGGCACAGCTTGTACGTAAGTCTCTGCATGTGATCTGGCTTCAGACCACTACTGTCATGGATGACGTTGTAGTGAGTCGGCGAGAAGCTTCCAGAGCGAACGGCCTGGCTCACAATGAAGAAATCATACCACTCTGGACGAGTGACCTCTGGGGAAATGAAAGATCCCCGGAAGGGGGTTGAGACATCTTCCCCC]

[+] EMBL CA331427             [CTGGGAAAATGTTTATTCTTTTCCCTCTTTAATGATTATGATGGCTTCAACAACTAGATTTAGAGCTTTCAAATGTAATAACATGAAAAACAAATGGATTCCATATTTGGGTTTTATTCAGGGAAGGATTTTATCAAAACCTTTAATAAAGGACAGGAAATTTAACAGCTAAGTTTCAACCATCTGGTGTTTAACGTAACAGATGAATCTAAAAAGCAAAACCAAAACCTTCCAGCGTGTAGACTAAACTGATGAAAACTCACATGGAACAAAAAAACGCCAAGCAAACGGCTTGTTATCTTTTTCTTTAAAGATAGAAGAGAAGGTTGTCCAGCTGCATGTTGGGCTCCTTGTGGATGCTCTGGCCAACAAGGAAAGCCAGTTTGTGGGCATACTGGCAGGGGGCGGGCACTCTGATAACCCCCTGCCAGTTGTAGTACATGTGGCACAGCTTGTACGTAAGTCTCTGCATGTGATCTGGCTTCAAACCACTACTGTCATGGATGACGTTGTAGTGAGTCGGCGAAAACCTTCCAAAGCGAACGGCCTGGCTCACAATGAAAAAATCATACCACTCTGGACCAATGACCTCTGGGGAAATGAAAGATCCCCGGAAGGGGGTTGAGACATCTTCCCCC]
[+] EMBL CA331491             [  GTGAAAATGTTTATTCACTT CATCCTTAATGATTATGATGGCTTCAACAACTAGATTTAGAGCTTTCAAATGTAATAACATGAAAAACAAACGGATTCCATATTTGGGTTTTATTCAGGGAAGGATTTTATCAAAACCTTTAATAAAGGACAGGAAATTTAACAGCTAAGTTTCAACCATCTGGTGTTTAACGTAACAGATGAATCTAAAAAGCAAAACCAAAACCTTCCAGCGTGTAGACTAAACTGATGAAAACTCACATGGAACAAAAAAACGCCAAGCAAACGGCTTGTTATCTTTTTCTTTAAAGATAGAAGAGAAGGTTGTCCAGCTGCATGTTGGGCTCCTTGTGGATGCTCTGGCCAACAAGGAAAGCCAGTTTGTGGGCATACTGGCAGGGGGCGGGCACTCTGATAACCCCCTGCCAGTTGTAGTACATGTGGCACAGCTTGTACGTAAGTCTCTGCATGTGATCTGGCTTCAGACCACTACTGTCATGGATGACGTT                                                                                                                               ]
[+] EMBL CA329727             [     AAAATGTTTATTCACAT CATTTTTAATGATTATGATGGCTTCAACAACTAGATTTAGAGCTTTCAAATGTAATAACATGAAAAACAAATGGATTCCATATTTGGGTTTTATTCAGGGAAGGATTTTATCAAAACCTTTAATAAAGGACAGGAAATTTAACAGCTAAGTTTCAACCATCTGGTGTTTAACGTAACAGATGAATCTAAAAAGCAAAACCAAAACCTTCCAGCGTGTAGACTAAACTGATGAAAACTCACATGGAACAAAAAAACGCCAAGCAAACGGCTTGTTATCTTTTTCTTTAAAGATAGAAGAGAAGGTTGTCCAGCTGCATGTTGGGCTCCTTGTGGATGCTCTGGCCAACAAGGAAAGCCAGTTTGTGGGCATACTGGCAGGGGGCGGGCACTCTGATAACCCCCTGCCAGTTGTAGTACATGTGGCACAGCTTGTACGTAAGTCTCTGCATGTGATCTGGCTTCAGACCACTACTGTCATGGATGACGTTGTAGTGAGTCGGCGAGACGCTTCCAGAGCGAACGGCCTGGCTCACAATGTAGAAATCATACCACTCTGGACGAGTGACCTCTGTGTCAATGACAG TTCCTGAAAGTGGGTT               ]
[+] EMBL CA329288             [      tttTGGTTATTCACAT CATTTTTAATGATTATGATGGCTTCAACAACTAGATTTAGAGCTTTCAAATGTAATAACATGAAAAACAAATGGATTCCATATTTGGGTTTTATTCAGGGAAGGATTTTATCAAAACCTTTAATAAAGGACAGGAAATTTAACAGCTAAGTTTCAACCATCTGGTGTTTAACGTAACAGATGAATCTAAAAAGCAAAACCAAAACCTTCCAGCGTGTAGACTAAACTGATGAAAACTCACATGGAAC AAAAAACGCCAAGCAAACGGCTTGGTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_2143#0 CTGGGAAAATGTTTATTCACATCATCTTTAATGATTATGATGGCTTCAACAACTAGATTT AGAGCTTTCAAATGTAATAACATGAAAAACAAATGGATTCCATATTTGGGTTTTATTCAG GGAAGGATTTTATCAAAACCTTTAATAAAGGACAGGAAATTTAACAGCTAAGTTTCAACC ATCTGGTGTTTAACGTAACAGATGAATCTAAAAAGCAAAACCAAAACCTTCCAGCGTGTA GACTAAACTGATGAAAACTCACATGGAACAAAAAAACGCCAAGCAAACGGCTTGTTATCT TTTTCTTTAAAGATAGAAGAGAAGGTTGTCCAGCTGCATGTTGGGCTCCTTGTGGATGCT CTGGCCAACAAGGAAAGCCAGTTTGTGGGCATACTGGCAGGGGGCGGGCACTCTGATAAC CCCCTGCCAGTTGTAGTACATGTGGCACAGCTTGTACGTAAGTCTCTGCATGTGATCTGG CTTCAGACCACTACTGTCATGGATGACGTTGTAGTGAGTCGGCGAGAAGCTTCCAGAGCG AACGGCCTGGCTCACAATGAAGAAATCATACCACTCTGGACGAGTGACCTCTGGGGAAAT GAAAGATCCCCGGAAGGGGGTTGAGACATCTTCCCCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)