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Takifugu rubripes
cluster # 2260 cluster # 2260       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2260#0 length = 713 sequences # 5  

consensusID : consensus_2260#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 713
fasta sequence
                              [GGCCAAAAACTTGGTCACGGGGCCCCCCCCGGGGTT-----TTTTTTTTTNTNTTTTTTACTTGTGAGCTACTTTATTCTTAATAGCTTATTAATGTACAGAAGTTCATTACGGTGTATTTTC-CCGAGTTTGCTGGTGTCTGATTTCAGCCACTGCGCTGAATAATGTGAGAAAACATCCGCAGTTTCTGTCTAAGGTTTGACAGCTGTTTGAAAGCTCTTAGAGCTGCTGAAATGTTTAATGGCAGTTCATAGTCGAATTAAGTTACAATGTTTTATAGCCGCTGTTATCAGAGGGAGGGTTAGATGTTACCTCACTGCTTCCATTTCTAACTTTGACTCAGTCGGCTTTAAACAACAATTAACCTCAAGCAAGTTAGTAGACGCGTTTAGCCACAGCCAGTGATGATTTTGTGTTTTAAATATTTAAGATGAAGTTTAAAAATAAAAATAAATGTATTCTATCCAGACATTTTGATCATCAACCATAAACTGCTTTAGTTTATCTTCAGGTAATAAGTGAGGTATTCTATGTACAGACTAACAGACTACAGAGATGGGAGAGGTAATCACACTTAAACCAACCTGTTCAGGTCTGCTAATGCAGGTTTAACTGACTAATAAATCACTAGACTCTCATCCTGGTGCTTCCTGCTGAGCCCTAAATTTCTCTGTATGTCTTATAGATTGATATTCAGCACCTCATCATCCTGTGAGTG]

[-] EMBL FR0056987            [GGCCAAAAACTTGGTCACGGGGCCCCCCCTGGGGTT     TTTTTTTTTNTNTTTTTTACTTGTGAGCTACTTTATTCTTAATAGCTTATTAATGTACAGAAGTTCATTACGGTGTATTTTC CCGAGTTTGCTGGTGTCTGATTTCAGCCGCTGCGCTGAATAATGTGAGAAAACATCTGCAGTTTCTGTCTAAGGTTTGACAGCTGTTTGAAAGCTCTTAGAGCTGCTGAAATGTTTAATGGCAGTTCATAGTCGAATTAAGTTACAATGTTTTATAGCCGCTGTTATCAGAGGGAGGGTTAGATGTTACCTCACTGCTTCCGTTTCTAACTTTGACTCAGTCGGCTTTAAACAACAATTAACCTCAAGCAAGTTAGTAGACGCGTTTAGCCACAGCCAGTGATGATTTTGTGTTTTAAATATTTAAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL FR0056680            [            GGTC CGGGCCCCCCCCCGGGGTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTGTGAGCTACTTTATTCTTAATAGCTTATTAATGTACAGAAGTTCATTACGGTGTATTTTC CCGAGTTTGCTGGTGTCTGATTTCAGCCACTGCGCTGAATAATGTGAGAAAACATCCGCAGTTTCTGTCTAAGGTTTGACAGCTGTTTGAAAGCTCTTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CA331857             [                                                             TTGTGAGCTACTTTATTCTTAATAGCTTATTAATGTACAGAAGTTCATTACGGTGTATTTTC CCGAGTTTGCTGGTGTCTGATTTCAGCCACTGCGCTGAATAATGTGAGAAAACATCCGCAGTTTCTGTCTAAGGTTTGACAGCTGTTTGAAAGCTCTTAGAGCTGCTGAAATGTTTAATGGCAGTTCATAGTCGAATTAAGTTACAATGTTTTATAGCCGCTGTTATCAGAGGGAGGGTTAGATGTTACCTCACTGCTTCCATTTCTAACTTTGACTCAGTCGGCTTTAAACAACAATTAACCTCAAGCAAGTTAGTAGACGCGTTTAGCCACAGCCAGTGATGATTTTGTGTTTTAAATATTTAAGATGAAGTTTAAAAATAAAAATAAATGTATTCTATCCAGACATTTTGATCATCAACCATAAACTGCTTTAGTTTATCTTCAGGTAATAAGTGAGGTATTCTATGTACAGACTAACAGACTACAGAGATGGGAGAGGTAATCACACTTAAACCAACCTGTTCAGGTCTGCTAATGCAGGTTTAACTGACTAATAAATCACTAGACTCTCATCCTGGTGCTTCCTGCTGAGCCCTAAAT                                                    ]
[-] EMBL CA847153             [                                                               GTGAGCTACTTTATTCTTAATAGCTTATTAATGTACAGAAGTTCATTACGGTGTATTTTCAAGGAGTTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CA331842             [                                                                                                                                                                                                                          TCTTAGAGCTGCTGAATTGTCTCATGGCAGTTCATAGTCGAATTAAGTTACAATGTTTTATAGCCGCTGTTATCAGAGGGAGGGTTAGATGTTACCTCACTGCTTCCATTTCTAACTTTGACTCAGTCGGCTTTAAACAACAATTAACCTCAAGCAAGTTAGTAGACGCGTTTAGCCACAGCCAGTGATGATTTTGTGTTTTAAATATTTAAGATGAAGTTTAAAAATAAAAATAAATGTATTCTATCCAGACATTTTGATCATCAACCATAAACTGCTTTAGTTTATCTTCAGGTAATAAGTGAGGTATTCTATGTACAGACTAACAGACTACAGAGATGGGAGAGGTAATCACACTTAAACCAACCTGTTCAGGTCTGCTAATGCAGGTTTAACTGACTAATAAATCACTAGACTCTCATCCTGGTGCTTCCTGCTGAGCCCTAAATTTCTCTGTATGTCTTATAGATTGATATTCAGCACCTCATCATCCTGTGAGTG]


>consensus_2260#0 GGCCAAAAACTTGGTCACGGGGCCCCCCCCGGGGTTTTTTTTTTTNTNTTTTTTACTTGT GAGCTACTTTATTCTTAATAGCTTATTAATGTACAGAAGTTCATTACGGTGTATTTTCCC GAGTTTGCTGGTGTCTGATTTCAGCCACTGCGCTGAATAATGTGAGAAAACATCCGCAGT TTCTGTCTAAGGTTTGACAGCTGTTTGAAAGCTCTTAGAGCTGCTGAAATGTTTAATGGC AGTTCATAGTCGAATTAAGTTACAATGTTTTATAGCCGCTGTTATCAGAGGGAGGGTTAG ATGTTACCTCACTGCTTCCATTTCTAACTTTGACTCAGTCGGCTTTAAACAACAATTAAC CTCAAGCAAGTTAGTAGACGCGTTTAGCCACAGCCAGTGATGATTTTGTGTTTTAAATAT TTAAGATGAAGTTTAAAAATAAAAATAAATGTATTCTATCCAGACATTTTGATCATCAAC CATAAACTGCTTTAGTTTATCTTCAGGTAATAAGTGAGGTATTCTATGTACAGACTAACA GACTACAGAGATGGGAGAGGTAATCACACTTAAACCAACCTGTTCAGGTCTGCTAATGCA GGTTTAACTGACTAATAAATCACTAGACTCTCATCCTGGTGCTTCCTGCTGAGCCCTAAA TTTCTCTGTATGTCTTATAGATTGATATTCAGCACCTCATCATCCTGTGAGTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)