These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2260#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 713 fasta sequence [GGCCAAAAACTTGGTCACGGGGCCCCCCCCGGGGTT-----TTTTTTTTTNTNTTTTTTACTTGTGAGCTACTTTATTCTTAATAGCTTATTAATGTACAGAAGTTCATTACGGTGTATTTTC-CCGAGTTTGCTGGTGTCTGATTTCAGCCACTGCGCTGAATAATGTGAGAAAACATCCGCAGTTTCTGTCTAAGGTTTGACAGCTGTTTGAAAGCTCTTAGAGCTGCTGAAATGTTTAATGGCAGTTCATAGTCGAATTAAGTTACAATGTTTTATAGCCGCTGTTATCAGAGGGAGGGTTAGATGTTACCTCACTGCTTCCATTTCTAACTTTGACTCAGTCGGCTTTAAACAACAATTAACCTCAAGCAAGTTAGTAGACGCGTTTAGCCACAGCCAGTGATGATTTTGTGTTTTAAATATTTAAGATGAAGTTTAAAAATAAAAATAAATGTATTCTATCCAGACATTTTGATCATCAACCATAAACTGCTTTAGTTTATCTTCAGGTAATAAGTGAGGTATTCTATGTACAGACTAACAGACTACAGAGATGGGAGAGGTAATCACACTTAAACCAACCTGTTCAGGTCTGCTAATGCAGGTTTAACTGACTAATAAATCACTAGACTCTCATCCTGGTGCTTCCTGCTGAGCCCTAAATTTCTCTGTATGTCTTATAGATTGATATTCAGCACCTCATCATCCTGTGAGTG] [-] EMBL FR0056987 [GGCCAAAAACTTGGTCACGGGGCCCCCCCTGGGGTT TTTTTTTTTNTNTTTTTTACTTGTGAGCTACTTTATTCTTAATAGCTTATTAATGTACAGAAGTTCATTACGGTGTATTTTC CCGAGTTTGCTGGTGTCTGATTTCAGCCGCTGCGCTGAATAATGTGAGAAAACATCTGCAGTTTCTGTCTAAGGTTTGACAGCTGTTTGAAAGCTCTTAGAGCTGCTGAAATGTTTAATGGCAGTTCATAGTCGAATTAAGTTACAATGTTTTATAGCCGCTGTTATCAGAGGGAGGGTTAGATGTTACCTCACTGCTTCCGTTTCTAACTTTGACTCAGTCGGCTTTAAACAACAATTAACCTCAAGCAAGTTAGTAGACGCGTTTAGCCACAGCCAGTGATGATTTTGTGTTTTAAATATTTAAGAT ] [-] EMBL FR0056680 [ GGTC CGGGCCCCCCCCCGGGGTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTGTGAGCTACTTTATTCTTAATAGCTTATTAATGTACAGAAGTTCATTACGGTGTATTTTC CCGAGTTTGCTGGTGTCTGATTTCAGCCACTGCGCTGAATAATGTGAGAAAACATCCGCAGTTTCTGTCTAAGGTTTGACAGCTGTTTGAAAGCTCTTAG ] [+] EMBL CA331857 [ TTGTGAGCTACTTTATTCTTAATAGCTTATTAATGTACAGAAGTTCATTACGGTGTATTTTC CCGAGTTTGCTGGTGTCTGATTTCAGCCACTGCGCTGAATAATGTGAGAAAACATCCGCAGTTTCTGTCTAAGGTTTGACAGCTGTTTGAAAGCTCTTAGAGCTGCTGAAATGTTTAATGGCAGTTCATAGTCGAATTAAGTTACAATGTTTTATAGCCGCTGTTATCAGAGGGAGGGTTAGATGTTACCTCACTGCTTCCATTTCTAACTTTGACTCAGTCGGCTTTAAACAACAATTAACCTCAAGCAAGTTAGTAGACGCGTTTAGCCACAGCCAGTGATGATTTTGTGTTTTAAATATTTAAGATGAAGTTTAAAAATAAAAATAAATGTATTCTATCCAGACATTTTGATCATCAACCATAAACTGCTTTAGTTTATCTTCAGGTAATAAGTGAGGTATTCTATGTACAGACTAACAGACTACAGAGATGGGAGAGGTAATCACACTTAAACCAACCTGTTCAGGTCTGCTAATGCAGGTTTAACTGACTAATAAATCACTAGACTCTCATCCTGGTGCTTCCTGCTGAGCCCTAAAT ] [-] EMBL CA847153 [ GTGAGCTACTTTATTCTTAATAGCTTATTAATGTACAGAAGTTCATTACGGTGTATTTTCAAGGAGTTTG ] [+] EMBL CA331842 [ TCTTAGAGCTGCTGAATTGTCTCATGGCAGTTCATAGTCGAATTAAGTTACAATGTTTTATAGCCGCTGTTATCAGAGGGAGGGTTAGATGTTACCTCACTGCTTCCATTTCTAACTTTGACTCAGTCGGCTTTAAACAACAATTAACCTCAAGCAAGTTAGTAGACGCGTTTAGCCACAGCCAGTGATGATTTTGTGTTTTAAATATTTAAGATGAAGTTTAAAAATAAAAATAAATGTATTCTATCCAGACATTTTGATCATCAACCATAAACTGCTTTAGTTTATCTTCAGGTAATAAGTGAGGTATTCTATGTACAGACTAACAGACTACAGAGATGGGAGAGGTAATCACACTTAAACCAACCTGTTCAGGTCTGCTAATGCAGGTTTAACTGACTAATAAATCACTAGACTCTCATCCTGGTGCTTCCTGCTGAGCCCTAAATTTCTCTGTATGTCTTATAGATTGATATTCAGCACCTCATCATCCTGTGAGTG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |