These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2304#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 629 fasta sequence [TGAAAGGCCCATTAAGATTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGTTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTATTAGAGCCAATATCATGAATCATGTAAAGCCTCTTAGCTCTAGAATTCTATTTTTTTTAAAGCATGAACATGCCACCGTGGAAACTGTTATTCACTTTATATCTAACTACATTCATGGCTGGATCGACAGTTCACTACTAAAAGGCTGCAAGGCGGGACAAAAACTTTAGCACTTTGCATGGTAAGATCGTAAAAACGAGTACTGCATTGCTTCCGATATCAACTCTCTTCATTGCATCACTTTGGTATTGCATTTATACTTCACAATATTCTGCAAAGAAACAAAATGTACAACTGCATAAATATAAAATTCTTCCACTATGTTTAATGGTCAAAACATTCAGAGAGTTACACTAAAATGCTGTGATGAATTCAGCAAAACAAAAACCAAAAATAATAAAACTTAAGTTAGCACCGTTGCCAGTGTCAACTAACAGGCTGGTCACATTTCTACTACATTCAAGACAAAATCAATCAAAAGGCATGGAAAATAATAAAACCCCTTCACA] [+] EMBL CA332001 [TGAAAGGCCCATTAAGATTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGTTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTATTAGAGCCAATATCATGAATCATGTAAAGCCTCTTAGCTCTAGAATTCTATTTTTTTTAAAGCATGAACATGCCACCGTGGAAACTGTTATTCACTTTATATCTAACTACATTCATGGCTGGATCGACAGTTCACTACTAAAAGGCTGCAAGGCGGGACAAAAACTTTAGCACTTTGCATGGTAAGATCGTAAAAACGAGTACTGCATTGCTTCCGATATCAACTCTCTTCATTGCATCACTTTGGTATTGCATTTATACTTCACAATATTCTGCAAAGAAACAAAATGTACAACTGCATAAATATAAAATTCTTCCACTATGTTTAATGGTCAAAACATTCAGAGAGTTACACTAAAATGCTGTGATGAATTCAGCAAAACAAAAACCAAAAATAATAAAACTTAAGTT ] [+] EMBL CA331707 [ GCCCATTAAGATTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGTTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTATTAGAGCCAATATCATGAATCATGTAAAGCCTCTTAGCTCTAGAATTCTATTTTTTTTAAAGCATGAACATGCCACCGTGGAAACTGTTATTCACTTTATATCTAACTACATTCATGGCTGGATCGACAGTTCACTACTAAAAGGCTGCAAGGCGGGACAAAAACTTTAGCACTTTGCATGGTAAGATCGTAAAAACGAGTACTGCATTGCTTCCGATATCAACTCTCTTCATTGCATCACTTTGGTATTGCATTTATACTTCACAATATTCTGCAAAGAAACAAAATGTACAACTGCATAAATATAAAATTCTTCCACTATGTTTAATGGTCAAAACATTCAGAGAGTTACACTAAAATGCTGTGATGAATTCAGCAAAACAAAAACCAAAAATAATAAAACTTAAGTTAGCACCGTTGCCAGTGTCAACTAACAGGCTGGTCACATTTCTACTACATTCAAGACA ] [+] EMBL CA329207 [ CCATTAAGATTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGTTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTATTAGAGCCAATATCATGAATCATGTAAAGCCTCTTAGCTCTAGAATTCTATTTTTTTTAAAGCATGAACATGCCACCGTGGAAACTGTTATTCACTTTATATCTAACTACATTCATGGCTGGATCGACAGTTCACTACTAAAAGGCTGCAAGGCGGGACAAAAACTTTAGCACTTTGCATGGTAAGATCGTAAAAACGAGTACTGCATTGCTTCCGATATCAACTCTCTTCATTGCATCACTTTGGTATTGCATTTATACTTCACAATATTCTGCAAAGAAACAAAATGTACAACTGCATAAATATAAAATTCTTCCACTATGTTTAATGGTCAAAACATTCAGAGAGTTACACTAAAATGCTGTGATGAATTCAGCAAAACAAAAACCAAAAATAATAAAACTTAAGTTAGCACCGTTGCCAGTGTCAACTAACAGGCTGGTCACATTTCTACTACATTCAAGACAAAATCAATCAAAAGGCATGGAAAATAATAAAACCCCTTCACA] [-] EMBL CA847218 [ TTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGGTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTATTAGAGCCAATATTATGAATCATGTTATACGTCTTAGCTCTAGAAGTCTATTTTTTTTAAAGCA ] [-] EMBL CA846774 [ TATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGTTAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |