Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Takifugu rubripes
cluster # 2363 cluster # 2363       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2363#0 length = 656 sequences # 5  

consensusID : consensus_2363#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 656
fasta sequence
                              [AGGGAACTTATGTATTGCAGTCATATTCCTGAAGAAAAAAAAACACATCTAATTTTGTACAGTGGCATCTTATCGTAAAGCTGTGCGGGGGTCCTTCCCATCAATTTGGTAGATGTCCAC-CCCTACAGACACAACAGGTGGTATGTCCCATCCTGGTCCTTCACCTGGGACAGGTCTGTCCCCAGGACCTATTATGGGCCCCAGCCCAGGACCAGACCCATCTCCAGGCTCTGTTCACAGTATGATGGGACCCAGCCCTGGACCTGGAACACCTAATGTACCTCATGGCATGCAGCCCCAGGGACAAAGTGATTACTCTCAGGACAGCATGTATCCTATGCACAAGACGATGGAGGGGATGAATGACAAGACCATGGCAGATGCGATACACTTTGGCCACATGAAAAATGTTGGGATTAGGACTCTGCACAGTGGTATGGGGCCTCCCCAGAGTCCTATGGACCAGCACAGCCAAGGGTACATGTCTCCCCATCCATCTCCCATGGGCGTCCATGAGCACGCATCGAGTCCCTTGTCAGGCNGGTTGGNCGGGGGACCCACGCCACCGAATTTACCTCCCTCCCAGTCAGGTTCTATGATAACCATGATACCCCCAGAACCGAGTGGTCCCATGGGTCATCAGGGGGCGGGGGCCT]

[+] EMBL BU805045             [AGGGAACTTATGTATTGCAGTCATATTCCTGAAGAAAAAAAAACACATCTAATTTTGTACAGTGGCATCTTATCGTAAAGCTGTGCGGGGGTCCTTCCCATCAATTTGGTAGATGTCCAC CCCTACAGACACAACAGGTGGTATGTCCCATCCTGGTCCTTCACCTGGGACAGGTCTGTCCCCAGGACCTATTATGGGCCCCAGCCCAGGACCAGACCCATCTCCAGGCTCTGTTCACAGTATGATGGGACCCAGCCCTGGACCTGGAACACCTAATGTACCTCATGGCATGCAGCCCCAGGGACAAAGTGATTACTCTCAGGACAGCATGTATCCTATGCACAAGACGATGGAGGGGATGAATGACAAGACCATGGCAGATGCGATACACTTTGGCCACATGAAAAATGTTGGGATTAGGACTCTGCACAGTGGTATGGGGCCTCCCCAGAGTCCTATGGACCAGCACAGCCAAGGGTACATGTCTCCCCATCCATCTCCCATGGGCGTCCATGAGCACGCATCGAGTCCTTTGTCAGGCNGGTGGGCGGGGGGACCCACGCCACCGAATTTACCTCCCTCCCAG                                                                      ]
[+] EMBL CA590008             [                                       AAAACACATCTAATTTTGTACAGTGGCATCTTATCGTAAAGCTGTGCGGGGGTCCTTCCCATCAATTTGGTAGATGTCCAC CCCTACAGACACAACAGGTGGTATGTCCCATCCTGGTCCTTCACCTGGGACAGGTCTGTCCCCAGGACCTATTATGGGCCCCAGCCCAGGACCAGACCCATCTCCAGGCTCTGTTCACAGTATGATGGGACCCAGCCCTGGACCTGGAACACCTAATGTACCTCATGGCATGCAGCCCCAGGGACAAAGTGATTACTCTCAGGACAGCATGTATCCTATGCACAAGACGATGGAGGGGATGAATGACAAGACCATGGCAGATGCGATACACTTTGGCCACATGAAAAATGTTGGGATTAGGACTCTGCACAGTGGTATGGGGCCTCCCCAGAGTCCTATGGACCAGCACAGCCAAGGGTACATGTCTCCCCATCCATCTCCCATGGGCGTCCATGAGCACGCATCGAGTCCCTTNTCAGGCCGGTTGG CGGGGGACCCACGCCACCGAATTTACCTCCCTCCCAGTCAGGTTCTATGATAACCATGATACCCCCAGAACCGAGTGGTCCCATGGGTCATCAGGGGGCGGGGGCCT]
[+] EMBL CA590382             [                                       AAAACACATCTAATTTTGTACAGTGGCATCTTATCGTAAAGCTGTGCGGGGGTCCTTCCCATCAATTTGGTAGATGTCCAC CCCTACAGACACAACAGGTGGTATGTCCCATCCTGGTCCTTCACCTGGGACAGGTCTGTCCCCAGGACCTATTATGGGCCCCAGCCCAGGACCAGACCCATCTCCAGGCTCTGTTCACAGTATGATGGGACCCAGCCCTGGACCTGGAACACCTAATGTACCTCATGGCATGCAGCCCCAGGGACAAAGTGATTACTCTCAGGACAGCATGTATCCTATGCACAAGACGATGGAGGGGATGAATGACAAGACCATGGCAGATGCGATACACTTTGGCCACATGAAAAATGTTGGGATTAGGACTCTGCACAGTGGTATGGGGCCTCCCCAGAGTCCTATGGACCAGCACAGCCAAGGGTACATGTCTCCCCATCCATCTCCCATGGGCGTCCATGAGCACGCATCGAGTCCCTTGTCAGGGGGGGTGGNCGGGGGACCCACGCCACCGAATTTACCTCCCTCCCAG                                                                      ]
[+] EMBL CA590637             [                                       AAAACACATCTAATTTTGTACAGTGGCATCTTATCGTAAAGCTGTGCGGGGGTCCTTCCCATCAATTTGGTAGATGTCCAC CCCTACAGACACAACAGGTGGTATGTCCCATCCTGGTCCTTCACCTGGGACAGGTCTGTCCCCAGGACCTATTATGGGCCCCAGCCCAGGACCAGACCCATCTCCAGGCTCTGTTCACAGTATGATGGGACCCAGCCCTGGACCTGGAACACCTAATGTACCTCATGGCATGCAGCCCCAGGGACAAAGTGATTACTCTCAGGACAGCATGTATCCTATGCACAAGACGATGGAGGGGATGAATGACAAGACCATGGCAGATGCGATACACTTTGGCCACATGAAAAATGTTGGGATTAGGACTCTGCACAGTGGTATGGGGCCTCCCCAGAGTCCTATGGACCAGCACAGCCAAGGGTACATGTCTCCCCATCCATCTCCCATGGGCGTCCATGAGCACGCATCGAGTCCt                                                                                                                            ]
[+] EMBL FR0058383            [                                                                                                             TAGATGTCCACGCCCTACAGACACAACAGGTGGCATGTCCCATCCTGGTCCTTCACCTGGGACAGGTCTGTCCCCAGGACCTATTATGGGCCCCAGCCCAGGACCAGACCCATCTCCAGGCTCTGTTCACAGTATGATGGGACCCAGCCCTGGACCTGGAACACCTAATGTACCTCATGGCATGCAGCCCCAGGGACAAAGTGATTACTCTCAGGACAGCATGTATCCTATGCACAAGACGATGGAGGGGATGAATGACAAGACCATGGCAGATGCGATACACTTTGGCCACATGAAAAATGTTGGGATTAGGACTCTGCACAGTGGGATGGGGCCTCCCCAGAGTCCTATGGACCAGCACAGCCAAGGGGACATGGCTCCCCATCCATCT                                                                                                                                                             ]


>consensus_2363#0 AGGGAACTTATGTATTGCAGTCATATTCCTGAAGAAAAAAAAACACATCTAATTTTGTAC AGTGGCATCTTATCGTAAAGCTGTGCGGGGGTCCTTCCCATCAATTTGGTAGATGTCCAC CCCTACAGACACAACAGGTGGTATGTCCCATCCTGGTCCTTCACCTGGGACAGGTCTGTC CCCAGGACCTATTATGGGCCCCAGCCCAGGACCAGACCCATCTCCAGGCTCTGTTCACAG TATGATGGGACCCAGCCCTGGACCTGGAACACCTAATGTACCTCATGGCATGCAGCCCCA GGGACAAAGTGATTACTCTCAGGACAGCATGTATCCTATGCACAAGACGATGGAGGGGAT GAATGACAAGACCATGGCAGATGCGATACACTTTGGCCACATGAAAAATGTTGGGATTAG GACTCTGCACAGTGGTATGGGGCCTCCCCAGAGTCCTATGGACCAGCACAGCCAAGGGTA CATGTCTCCCCATCCATCTCCCATGGGCGTCCATGAGCACGCATCGAGTCCCTTGTCAGG CNGGTTGGNCGGGGGACCCACGCCACCGAATTTACCTCCCTCCCAGTCAGGTTCTATGAT AACCATGATACCCCCAGAACCGAGTGGTCCCATGGGTCATCAGGGGGCGGGGGCCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)