|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2386#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 813 fasta sequence
[AGGAGCTTCTTGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGG-CTCC--CCGACCTGAAGCAGAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGATGTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGATCGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCGACCGTCCACGACTTCTTTAACTGGCTGTCGGTGTTGATCCTTCTGCCTCTGGAGGTGGCTACAGGAGTTCTTTACAAGTTCACCCAGTTCCTGATTACGTCCTTCAACATCCAGAGTGGCGAGGATGCCCCGGACCTGCTGAACGTCATCACGGACCCTCTCACCGACTCTATCATTCAGGTGGATAAATCGGTCATCAATGACCTCGCTACG]
[+] EMBL CA589861 [AGAAGCTTCTTGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGG CTCC CCGACCTGAAGCAGAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGATGTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGATCGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCGACCGTCCACGACTTCTTTAACTGGCTGTCGGTG ]
[+] EMBL CA588156 [ GGTGATGCCCGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATCG TAC AGGACCTGAAGNAGAGNCTGGCTCCCCCGCCGCTCTCAGGGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCCCCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGGTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGATGTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGAACGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCGACCGGCCACGACTTCCTTAACTGGCTGTCGGTGTTGATCCTTCTGCCTCTGGAGGTGGCTACAGGGAGTCTTAACAAGTTCACCCAGGTCCTGATTACCGCCTTCAACATCCAGAGGGGGGAGGAAGGCCCGGACCGGCTGAACGTCATCACGGGACCCCTCACCGACTCTATC ]
[+] EMBL CA588286 [ ccATCAAATTGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGG NCCCTTTCGAACTGAAGCAGAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGATGTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGATCGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCGACCGTCCACGACTTCTTTAACTGGCTGTCGGTGTTGATCCTTCTGCCTCTGGAGGTGGCTACAGGAGTTCTTTACAAGTTCACCCAGTTCCTGATTACGTCCTTCCACATCCAGAGTGGCGAGGATGCCCCGGACCTGCTGAACGTCATCACGGACCCTCTCACCGACTCTATCATTCAGGTGGATAAATCGGTCATCAATGACCTCGCTACG]
[+] EMBL CA588344 [ ATCTTCTTGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGGCCTCC CCGACCTGAAGCAGAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGATGTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGATCGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCGACCGTCCACGACTTCTTTAACTGGCTGTCGGTGTTGATCCTTCTGCCTCTGGAGGTGGCTACAGGAGTTCTTTACAAGTTCACCCAGTTCCTGATTACGTCCTTCAACATCCAGAGTGGCGAGGATGCCCCGGACCTGCTGAACGTCATCACGGACCCTCTCACCGACTCTATCATTCAGTTGGAT ]
[+] EMBL CA589871 [ CGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGG CTCC CCGACCTGAAGCAGAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCT CATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGT ]
[+] EMBL FR0059893 [ GTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCACTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGTTGGGCTGGTGA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
|||||||
| Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |