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Takifugu rubripes
cluster # 2406 cluster # 2406       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2406#0 length = 931 sequences # 6  

consensusID : consensus_2406#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 931
fasta sequence
                              [GCACGAGCTCTGGAGCAACTTATTGGTAGAGGTTTTGTACTTGGAAACAAAGTAGCAGGGATGTTTTCATACAGTATTTTTTTCAGAGGTTATGCACCGTGCGTCGCTGTATTTGCTGCTTGAAAATATGCATTTTGAGATGTTAGCTTAAGGAGAGCGTCTTTAGCTTGGTGTGAGCCATCGCCTGCTCGCTTTAAAATACACTGCACTGTGGGGCTCCGACCCAAGCTCATAAGCACTGCCACTCTAGGTTGTTCCTGATGACGTAATCACGCCACTATTTGAGATTTTCCAGAACCGTTTTAGTTTCTTTTAGCACTGGGATATCGTCTTGGAGGTCTATTC-TTCTATGATCAGCCTCTTATCTATTTTCATAAATTCTTTCATAGACTGTATTTCACATGGTGCAACTAGGACATGCCTTATTCTTTGAACTGAGGATGCCGTCTACATTTGAATGCATATATAAAACGGCGCTTAAATCTATTTTATGGTTCTTTTTGTACTAAGCTGAGACATGAGGTCCCCCTTGAGGAACACGGACTCTCGACGTGCCGGTCATAGGACGTCAGGGAGATAAATTTGGAGGAATAACCGCGTGATGTTTTTGGGATGCTGTTCATCCTCGCCTGTTTTGTCTTTGATTACCGTGTGCAGGATTATCAACGCCTTTGCTTTCAAGAGTGACGGGAGGGTGGGGGAATGTCTCCCCCACAAGTCTGTTCCTGCACTCTTCTGTGCTCATCCTTTCCTCAAGTGTTGACTTGACCTGTAGCATCCTTCCTTCCACGGTGGCACCACTGCATAATTGCTCTGAAAGAAATACAGTTCATTGTGTTGGACAACTGAAGTGCTTTAGGAATGTGTGAAATCCAGCCCTGCTATTGGAGACCTCTGTCGGTAAATAAAGGTGGTCGATAAATGTTAAAAA]

[+] EMBL CA333451             [GCACGAGCTCTGGAGCAACTTATTGGTAGAGGTTTTGTACTTGGAAACAAAGTAGCAGGGATGTTTTCATACAGTATTTTTTTCAGAGGTTATGCACCGTGCGTCGCTGTATTTGCTGCTTGAAAATATGCATTTTGAGATGTTAGCTTAAGGAGAGCGTCTTTAGCTTGGTGTGAGCCATCGCCTGCTCGCTTTAAAATACACTGCACTGTGGGGCTCCGACCCAAGCTCATAAGCACTGCCACTCTAGGTTGTTCCTGATGACGTAATCACGCCACTATTTGAGATTTTCCAGAACCGTTTTAGTTTCTTTTAGCACTGGGATATCGTCTTGGAGGTCTATTC TTCTATGATCAGCCTCTTATCTATTTTCATAAATTCTTTCATAGACTGTATTTCACATGGTGCAACTAGGACATGCCTTATTCTTTGAACTGAGGATGCCGTCTACATTTGAATGCATATATAAAACGGCGCTTAAATCTATTTTATGGTTCTTTTTGTACTAAGCTGAGACATGAGGTCCCCCTTGAGGAACACGGACTCTCGACGTGCCGGTCATAGGACGTCAGGGAGATAAATTTGGAGGAATAACCGCGTGATGTTTTTGGGATGCTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CA333500             [GCACGAGCTCTGGAGCAACTTATTGGTAGAGGTTTTGTACTTGGAAACAAAGTAGCAGGGATGTTTTCATACAGTATTTTTTTCAGAGGTTATGCACCGTGCGTCGCTGTATTTGCTGCTTGAAAATATGCATTTTGAGATGTTAGCTTAAGGAGAGCGTCTTTAGCTTGGTGTGAGCCATCGCCTGCTCGCTTTAAAATACACTGCACTGTGGGGCTCCGACCCAAGCTCATAAGCACTGCCACTCTAGGTTGTTCCTGATGACGTAATCACGCCACTATTTGAGATTTTCCAGAACCGTTTTAGTTTCTTTTAGCACTGGGATATCGTCTTGGAGGTCTATTC TTCTATGATCAGCCTCTTATCTATTTTCATAAATTCTTTCATAGACTGTATTTCACATGGTGCAACTAGGACATGCCTTATTCTTTGAACTGAGGATGCCGTCTACATTTGAATGCATATATAAAACGGCGCTTAAATCTATTTTATGGTTCTTTTTGTACTAAGCTGAGACATGAGGTCCCCCTTGAGGAACACGGACTCTCGACGTGCCGGTCATAGGACGTCAGGGAGATAAATTTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL FR0061457            [                                                     AGCTGGGATGGTTTCATACAGTATGGGGTTCAGAGGTTATGCACCGTGCGTCGCTCTATTTGCTGCTTGAAAATATGCATTTTGAGATGTTAGCTTAAGGAGAGCGTCTTTAGCTTGGTGTGAGCCATCGCCTGCTCGCTTTAAAAAACACTGCACTGTGGGGCTCCGACCCAAGCTCATAAGCACTGCCACTCTAGGTTGTTCCTGATGACGTAATCACTCCACTATTTGAGATTTTCCAGAACCGGTTTAGTTTCTTTTATCACTGGGATATCGTCTTGGAGGTCTATTCTTTCTATGATa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CA332544             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CGTTTTAGTTTCTTTTAGCACTGGGATATCGTCTTGGAGGTCTATTC TTCTATGATCAGCCTCTTATCTATTTTCATAAATTCTTTCATAGACTGTATTTCACATGGTGCAACTAGGACATGCCTTATTCTTTGAACTGAGGATGCCGTCTACATTTGAATGCATATATAAAACGGCGCTTAAATCTATTTTATGGTTCTTTTTGTACTAAGCTGAGACATGAGGTCACCCTTGAGGAACACGGACTCTCGACGTGCCGGTCATAGGACGTCAGGGAGATAAATTTGGAGGAATAACCGCGTGATGTTTTTGGGATGCTGTTCATCCTCGCCTGTTTTGTCTTTGATTACCGTGTGCAGGATTATCAACGCCTTTGCTTTCAAGAGTGACGGGAGGGTGGGGGAATGTCTCCCCCACAAGTCTGTTCCTGCACTCTTCTGTGCTCATCCTTTCCTCAAGTGTTGACTTGACCTGTAGCATCCTTCCTTCCACGGTGGCACCACTGCATAATTGCTCTGAAAGAAATACAGTTCATTGTGTTGGACAACTGAAGTGCTTTAGGAATGTGTGAAATCCAGCCCTGCTATTGGAGACCTCTGTCGGTAAATAAAGGT                   ]
[+] EMBL BU808468             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCTTTGAACTGAGGATGCCGTCTACATTTGAATGCATATATAAAACGGCGCTTAAATCTATTTTATGGTTCTTTTTGTACTAAGCTGAGACATGAGGTCACCCTTGAGGAACACGGACTCTCGACGTGCCGGTCATAGGACGTCAGGGAGATAAATTTGGAGGAATAACCGCGTGATGTTTTTGGGATGCTGTTCATCCTCGCCTGTTTTGTCTTTGATTACCGTGTGCAGGATTATCAACGCCTTTGCTTTCA                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CA332504             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATAAAACGGCGCTTAAATCTATTTTATGGTTCTTTTTGTACTAAGCTGAGACATGAGGTCCCCCTTGAGGAACACGGACTCTCGACGTGCCGGTCATAGGACGTCAGGGAGATAAATTTGGAGGAATAACCGCGTGATGTTTTTGGGATGCTGTTCATCCTCGCCTGTTTTGTCTTTGATTACCGTGTGCAGGATTATCAACGCCTTTGCTTTCAAGAGTGACGGGAGGGTGGGGGAATGTCTCCCCCACAAGTCTGTTCCTGCACTCTTCTGTGCTCATCCTTTCCTCAAGTGTTGACTTGACCTGTAGCATCCTTCCTTCCACGGTGGCACCACTGCATAATTGCTTTGAAAGAAATACAGTTCATTGTGTTGGACAACTGAAGTGCTTTAGGAATGTGTGAAATCCAGCCCTGCTATTGGAGACCTCTGTCGGTAAATAAAGGTGGTCGATAAATGTTAAAAA]


>consensus_2406#0 GCACGAGCTCTGGAGCAACTTATTGGTAGAGGTTTTGTACTTGGAAACAAAGTAGCAGGG ATGTTTTCATACAGTATTTTTTTCAGAGGTTATGCACCGTGCGTCGCTGTATTTGCTGCT TGAAAATATGCATTTTGAGATGTTAGCTTAAGGAGAGCGTCTTTAGCTTGGTGTGAGCCA TCGCCTGCTCGCTTTAAAATACACTGCACTGTGGGGCTCCGACCCAAGCTCATAAGCACT GCCACTCTAGGTTGTTCCTGATGACGTAATCACGCCACTATTTGAGATTTTCCAGAACCG TTTTAGTTTCTTTTAGCACTGGGATATCGTCTTGGAGGTCTATTCTTCTATGATCAGCCT CTTATCTATTTTCATAAATTCTTTCATAGACTGTATTTCACATGGTGCAACTAGGACATG CCTTATTCTTTGAACTGAGGATGCCGTCTACATTTGAATGCATATATAAAACGGCGCTTA AATCTATTTTATGGTTCTTTTTGTACTAAGCTGAGACATGAGGTCCCCCTTGAGGAACAC GGACTCTCGACGTGCCGGTCATAGGACGTCAGGGAGATAAATTTGGAGGAATAACCGCGT GATGTTTTTGGGATGCTGTTCATCCTCGCCTGTTTTGTCTTTGATTACCGTGTGCAGGAT TATCAACGCCTTTGCTTTCAAGAGTGACGGGAGGGTGGGGGAATGTCTCCCCCACAAGTC TGTTCCTGCACTCTTCTGTGCTCATCCTTTCCTCAAGTGTTGACTTGACCTGTAGCATCC TTCCTTCCACGGTGGCACCACTGCATAATTGCTCTGAAAGAAATACAGTTCATTGTGTTG GACAACTGAAGTGCTTTAGGAATGTGTGAAATCCAGCCCTGCTATTGGAGACCTCTGTCG GTAAATAAAGGTGGTCGATAAATGTTAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)