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Takifugu rubripes
cluster # 2543 cluster # 2543       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2543#0 length = 608 sequences # 7  

consensusID : consensus_2543#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 608
fasta sequence
                              [TTGTGTCTGGACACCTTCGCACACCCGTCAGAATGCTCTCCTTGTTGGTTCTCATTGTGCTGTGCTCCGGTGCCCTCGTCGAAGGTGCGTCATACTCCTTCTCCCCCTCTGTGGGAAGTGGCACCGGTACGTCCTTCTCCCTAGCTGGAAATGACAAGATCACTGCAGTCAGGCTCTATGAGGCGCCGAACGCTTACATCAGCGGTATCCAGCTTCAATTTGGGGGTATCTGGACCACACTGATCGGCCGTAAACTGGGTACTGCACTGGAGCTGGACCTTGAAGATGATGAGCACATTATTCAGGTCTCTGGTAAATTCCACCAGTCAAACTACATCTACCAGCTGATCTTTGATACCTCTGCTGGGCGCTCCCTCAGGGCTGGTCAGCCCGTTCAGAATTCGTTCAACATGTACGCAACAAGCAAGGACCAGCAGCTCGTCATCCTGAGTGGTCGGTTCAACACCGCTGGAATTACAGCTATAGCAGCTCACTGGGGCACTCCTGGCATGGATTATGAAAACACCACCAGCTCTTCGTAAAGAGTCGTGATTGATAAACACGCATGAACATTTTAAATACATATTTCTGTTATTCTCTATGCTCGG]

[+] EMBL CA846966             [TTGTGTCTGGACACCTTCGCACACCCGTCAGAATGCTCTCCTTGTTGGTTCTCATTGTGCTGTGCTCCGGTGCCCTCGTCGAAGGTGCGTCATACTCCTTCTCCCCCTCTGTGGGAAGTGGTACCGGTACGTCCTTCTCCCTAGCTGGAAATGACAAGATCACTGCAGTCAGGCTCTATGAGGCGCCGAACGCTTACATCAGCGGTATCCAGCTTCAATTTGGGGGTATCTGGACCACACTGATCGGCCGTAAACTGGGTACTGCACTGGAGCTGGACCTTGAAGATGATGAGCACATTATTCAGGTCTCTGGTAAATTCCACCAGTCAAACTACATCTACCAGCTGATCTTTGATACCTCTGCTGGGCGCTCCCTCAGGGCTGGTCAGCCCGTTCAGAATTCGTTCAACATGTACGCAACAAGCAAGGACCAGCAGCTCGTCATCCTGAGTGGTCGGTTCAACACCGCTGGAATTACAGCTATAGCAGCTCACTGGGGCACTCCTGGCATGGATTATGAAAACACCACCAGCTCTTCGTAAAGAGTCGTGATTGATAAACACGCATGAACATTTTAAATACATATTTCTGTTATTCTCTATGCTCGG]
[+] EMBL CA844834             [  GTGTCTGGACACCTTCGCACACCCGTCATAATGCTCTCCTTGTTGGTTCTCATTGTGCTGTGCTCCGGTGCCCTCGTCGAAGGTGCGTCATACTCCTTCTCCCCCTCTGTGGGAAGTGGCACCGGTACGTCCTTCTCCCTAGCTGGAAATGACAAGATCACTGCAGTCAGGCTCTATGAGGCGCCGAACGCTTACATCAGCGGTATCCAGCTTCAATTTGGGGGTATCTGGACCACTTTTTTCGGCCGTAAACTGGGTACTGCACTGGAGCTGGACCTTGAAGATGATGAGCACATTATTCAGGTCTCTGGTAAATTCCACCAGTCAAACTACATCTACCAGCTGATCTTTGATACCTCTGCTGGGCGCTCCCTCAGGGCTGGTCAGCCCGTTCAGAATTCGTTCAACATGTACGCAACAAGCAAGGACCAGCAGCTCGTCATCCTGAGTGGTCGGTTCAACACCGCTGGAATTACAGCTATAGCAGCTCACTGGGGCACTCCTGGCATGGATTATGAAAACACCACCAGCTCTTCGTAAAGAGTCGTGATTGATAAACACGCATGAACATTTTAAATACATATTTCTG                 ]
[+] EMBL CA844918             [  GTGTCTGGACACCTTCGCACACCCGTCATAATGCTCTCCTTGTTGGTTCTCATTGTGCTGTGCTCCGGTGCCCTCGTCGAAGGTGCGTCATACTCCTTCTCCCCCTCTGTGGGAAGTGGCACCGGTACGTCCTTCTCCCTAGCTGGAAATGACAAGATCACTGCAGTCAGGCTCTATGAGGCGCCGAACGCTTACATCAGCGGTATCCAGCTTCAATTTGGGGGTATCTGGACCTCTTTGATCGGCCGTAAACTGGGTACTGCACTGGAGCTGGACCTTGAAGATGATGAGCACATTATTCAGGTCTCTGGTAAATTCCACCAGTCAAACTACATCTACCAGCTGATCTTTGATACCTCTGCTGGGCGCTCCCTCAGGGCTGGTCAGCCCGTTCAGAATTCGTTCAACATGTACGCAACAAGCAAGGACCAGCAGCTCGTCATCCTGAGTGGTCGGTTCAACACCGCTGGAATTACAGCTATAGCAGCTCACTGGGGCACTCCTGGCA                                                                                                  ]
[+] EMBL FR0056511            [                            CAGAATGCTCTCCTTGTTGGTTCTCATTGTGCTGTGCTCCGGTGCCCTCGTCGAAGGTGCGTCATACTCCTTCTCCCCCTCTGTGGGAAGTGGCACCGGTACGTCCTTCTCCCTAGCTGGAAATGACAAGATCACTGCAGTCAGGCTCTATGAGGCGCCGAACGCTTACATCAGCGGTATCCAGCTTCAATTTGGGGGTATCTGGACCACACTGATCGGCCGTAAACTGGGTACTGCACTGGAGCTGGACCTTGAAGATGATGAGCACATTATTCAGGTCTCTGGTAAATTCCACCAGTCAGACTACATCTACCAGCTGATCTTTGATACCTCTGCTGGGCGCTCCCTCAGGGCTGGTCAGCCCGTTCAGAATTCG                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL FR0056580            [                            CAGAATGCTCTCCTTGTTGGTTCTCATTGTGCTGTGCTCCGGTGCCCTCGTCGAAGGTGCGTCATACTCCTTCTCCCCCTCTGTGGGAAGTGGTACCGGTACGTCCTTCTCCCTAGCTGGAAATGACAAGATCACTGCAGTCAGGCTCTATGAGGCGCCGAACGCTTACATCAGTGGTATCCAGCTTCAATTTGGGGGTATCTGGACCACACTGATCGGCCGTAAACTGGGTACTGCACTGGTGCTGGGCCTTGACGATGATGAGCATATTATTCAGGTCTCTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL FR0058948            [                                                        GTGCTGTGCTCCGGTGCCCTCGTCGAAGGTGCGTCATACTCCTTCTCCCCCTCTGTGGGAAGTGGCACCGGCACGTCCTTCTCCCTAGCTGGAAATGACAAGATCACTGCAGTCAGGCTCTATGAGGCGCCGAACGCTTACATCAGCGGTATCCAGCTTCAATTTGGGGGTATCTGGACCACACTGATCGGCCGTAAACTGGGTACTGCACTGGAGCTGGACCTTGAAGATGATGAGCACATTATTCAGGTCTCTGGTAAATTCCACCAGTCAAACTACATCTACCAGCTGATCTTTGATACCTCTGCTGGGCGCTCCCTCAGGGGCTGGCAGCCCGTTCAGAATTCGGTCAACATGTACGCAACAAGCAAGGACCAGCAGCTTCGCATCCTGAGTGGGC GTTCAACACCGCTGGAA TACAGCTATAGCAGCTCACT                                                                                                                 ]
[+] EMBL FR0056489            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTGGGCGCTCCCTCAGGGCTGGTCAGCCCGTTCAGAATTCGTTCAACATGTACGCAACAAGCAAGGACCAGCAGCTCGTCATCCTGAGTGGTCGGTTCAGCACCGCTGGAATTACAGCTATAGCAGCTCACTGGGGCACTCCTGGCATGGATTATGAAGACACCACCAGGTCTTCGTAGAGAGTCGTGATTGAGAAACACGCATGAGCATTTTAAA                             ]


>consensus_2543#0 TTGTGTCTGGACACCTTCGCACACCCGTCAGAATGCTCTCCTTGTTGGTTCTCATTGTGC TGTGCTCCGGTGCCCTCGTCGAAGGTGCGTCATACTCCTTCTCCCCCTCTGTGGGAAGTG GCACCGGTACGTCCTTCTCCCTAGCTGGAAATGACAAGATCACTGCAGTCAGGCTCTATG AGGCGCCGAACGCTTACATCAGCGGTATCCAGCTTCAATTTGGGGGTATCTGGACCACAC TGATCGGCCGTAAACTGGGTACTGCACTGGAGCTGGACCTTGAAGATGATGAGCACATTA TTCAGGTCTCTGGTAAATTCCACCAGTCAAACTACATCTACCAGCTGATCTTTGATACCT CTGCTGGGCGCTCCCTCAGGGCTGGTCAGCCCGTTCAGAATTCGTTCAACATGTACGCAA CAAGCAAGGACCAGCAGCTCGTCATCCTGAGTGGTCGGTTCAACACCGCTGGAATTACAG CTATAGCAGCTCACTGGGGCACTCCTGGCATGGATTATGAAAACACCACCAGCTCTTCGT AAAGAGTCGTGATTGATAAACACGCATGAACATTTTAAATACATATTTCTGTTATTCTCT ATGCTCGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)