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consensusID : consensus_2572#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 594 fasta sequence
[AATCTCCTCAATTGGGTGGCAAATAGTCTTTAATCAAGCTCAAACTGATAAATA---------TTTTTGTTATTAATTTGGTGCTTTTTCACTAATTTTCATGTTTTAGCATTTTAATGTGTGTATTTGGATGCAGAGTGAATGAGTAACAACCAGGCTGAGTTGGGGAGAACAGAAAGGGGACCTCCTGTGGTTTCTGTCAGGCTCTTTGTGTCTGTGTAACCTTAGGTAGGGTGTCGGATTATTCACCATTTAAGACGTGGAACAACCATTAGTGTCATGTTCTCTTCCCAAAAAGCTCCTTCCTTACTGCTGCCATTTCCTTTCTTATATTAATGCGAGTTCAAATGTATGTTTTTCCTGTTTAGAGATTTATTTTTATATGAAGGTCATCTGCCATATCAGTGCATATGCATTGGCTCATACTGTCAGAAATTAATACCGGTAACTCCTCTGCCTCTTGTTAAAGATTTATTTCATTGTGAAATATTGCGTAATGACTAATATTTAGTTGCCAGGCCAGTGAGTCTGCATAAGTATTACTACAACAAACTCTCTTGAACTGTTTTCTTGTTTATTCAAATAAAATAAAGCAATCCAGTG]
[+] EMBL CA845109 [AATCTCCTCAATTGGGTGGCAAATAGTCTTTAATCAAGCTCAAACTGATAAATA TTTTTGTTATTAATTTGGTGCTTTTTCACTAATTTTCATGTTTTAGCATTTTAATGTGTGTATTTGTATGCAGAGTGAATGAGTAACAACCAGGCTGAGTTGGGGAGAACAGAAAGAGGACCTCCTGTGGTTTCTGTCAGGCTCTTTTTGTCTGTGTAACCTTAGGGAGGGTGTCGGATTATTCACCATTTAAGACATGGAACAACCATTAGTGTCATGTTCTCTTCCCAAAAAGCTCCTTCCTTACTGCTGTCATTTCCTTTCTTATATTAATGCGAGTTCAAATGTATGTTTTTCCTGTTTAGAGATTTATTTTTATATGAAGGTCATCTGCCATATCAGTGCATATGCATTGGCTCATACTGTCAAAAATTAATACCGGTAACTCCTCTGCCTCTTGTTAAAGATTTATTTCATTGTGAAATATTGCGTAATGACTAATATTTAGTTGCCAGGCCAGTGAGTCTGCATAAGTATTACTACAAC ]
[-] EMBL CA332074 [ TCTCCTCAATTGGGTGGCAAATAGTCTTTAATCAAGCTCAAACTGATAAATATTTTTGTTGTTTTTGTTGTTAATTTGGTGCTTTTTCACTAATTTTCATGTTTTAGCATTTTAATGTGTGTATTTGGATGCAGAGTGAATGAGTAACAACCAGGCTGAGTTGGGGAGAACAGAAAGGGGACCTCCTGTGGTTTCTGTCAGGCTCTTTGTGTCTGTGTAACCTTAGGTAGGGTGTCGGATTATTCACCATTTAAGACGTGGAACAACCATTAGTGTCATGTTCTCTTCCCAAAAAGCTCCTTCCTTACTGCTGCCATTTCCTTTCTTATATTAATGCGAGTTCAAATGTATGTTTTTCCTGTTTAGAGATTTATTTTTATATGAAGGTCATCTGCCATATCAGTGCATATGCATTGGCTCATACTGTCAGAAATTAATACCGGTAACTCCTCTGCCTCTTGTTAAAGATTTATTTCATTGTGAAATATTGCGTAATGACTAATATTTAGTTGCCAGGCCAGTGAGTCTGCATAAGTATTACTACAACAAACTCTCTTGAACTGTTTTCTTGTTTATTCAAATAAAATAAAGCAATCC ]
[-] EMBL CA333007 [ CTCCTCAATTGGGTGGCAAATAGTCTTTAATCAAGCTCAAACTGATAAATA TTTTTGTTATTAATTTGGTGCTTTTTCACTAATTTTCATGTTTTAGCATTTTAATGTGTGTATTTGTATGCAGAGTGAATGAGTAACAACCAGGCTGAGTTGGGGAGAACAGAAAGGGGACCTCCTGTGGTTTCTGTCAGGCTCTTTTTGTCTGTGTAACCTTAGGGAGGGTGTCGGATTATTCACCATTTAAGACATGGAACAACCATTAGTGTCATGTTCTCTTCCCAAAAAGCTCCTTCCTTACTGCTGTCATTTCCTTTCTTATATTAATGCGAGTTCAAATGTATGTTTTTCCTGTTTAGAGATTTATTTTTATATGAAGGTCATCTGCCATATCAGTGCATATGCATTGGCTCATACTGTCAGAAATTAATACCGGTAACTCCTCTGCCTCTTGTTAAAGATTTATTTCATTGTGAAATATTGCGTAATGACTAATATTTAGTTGCCAGGCCAGTGAGTCTGCATAAGTATTACTACAACAAACTCTCTTGAACTGTTTTCTTGTTTATTCAAATAAAATAAAGCAATCCAGTG]
[-] EMBL CA331824 [ TTTCACTAATTTTCATGTTTTAGCATTTTAATGTGTGTATTTGGATGCAGAGTGAATGAGTAACAACCAGGCTGAGTTGGGGAGAACAGAAAGGGGACCTCCTGTGGTTTCTGTCAGGCTCTTTGTGTCTGTGTAACCTTAGGTAGGGTGTCGGATTATTCACCATTTAAGACGTGGAACAACCATTAGTGTCATGTTCTCTTCCCAAAAAGCTCCTTCCTTACTGCTGCCATTTCCTTTCTTATATTAATGCGAGTTCAAATGTATGTTTTTCCTGTTTAGAGATTTATTTTTATATGAAGGTCATCTGCCATATCAGTGCATATGCATTGGCTCATACTGTCAGAAATTAATACCGGTAACTCCTCTGCCTCTTGTTAAAGATTTATTTCATTGTGAAATATTGCGTAATGACTAATATTTAGTTGCCAGGCCAGTGAGTCTGCATAAGTATTACTACAACAAACTCTCTTGAACTGTTTTCTTGTTTGGTCAAATAAAATAAAGCAATCC ]
[-] EMBL CA331761 [ GAGAACAGAAAGGGGACCTCCTGTGGTTTCTGTCAGGCTCTTTGTGTCTGTGTAACCTTAGGTAGGGTGTCGGATTATTCACCATTTAAGACGTGGAACAACCATTAGTGTCATGTTCTCTTCCCAAAAAGCTCCTTCCTTACTGCTGCCATTTCCTTTCTTATATTAATGCGAGTTCAAATGTATGTTTTTCCTGTTTAGAGATTTATTTTTATATGAAGGTCATCTGCCATATCAGTGCATATGCATTGGCTCATACTGTCAGAAATTAATACCGGTAACTCCTCTGCCTCTTGTTAAAGATTTATTTCATTGTGAAATATTGCGTAATGACTAATATTTAGTTGCCAGGCCAGTGAGTCTGCATAAGTATTACTACAACAAACTCTCTTGAACTGTTTTCTTGTTTATTCAAATAAAATAAA ]
[-] EMBL CA331046 [ GGGCCCTCCTGTGGTTTCTGTCAGGCTCTTTTTGTCTGTGTAACCTTAGGGAGGGTGTCGGATTATTCACCATTTAAGACATGGAACAACCATTAGTGTCATGTTCTCTTCCCAAAAAGCTCCTTCCTTACTGCTGTCATTTCCTTTCTTATATTAATGCGAGTTCAAATGTATGTTTTTCCTGTTTAGAGAAATAATATTATATGAAGGTCATCTGCCATATCAGTGCATATGCATTGGCTCATACTGTCAGAAATTAATACCGGTAACTCCTCTGCCTCTTGTTAAAGATTTATTTCATTGTGAAATATTGCGTAATGACTAATATTTAGTTGCCAGGCCAGTGAGTCTGCATAAGTATTACTACAACAAACTCTCTTGAACTGTTTTCTTGTTGGGTCAAATAAAATAAAGCAATCCAG ]
[+] EMBL FR0056853 [ ACCTCCTGTGGTTTCTGTCAGGCTCTTTGTGTCTGTGTAACCTTAGGTAGGGTGTCGGATTATTCACCATTTAAGACGTGGAACAACCATTAGTGTCATGTTCTCTTCCCAAAAAGCTCCTTCCTTACTGCTGCCATTTCCTTTCTTATATTAATGCGAGTTCAAATGTATGTTTTTCCTGTTTAGAGATTTATTTTTATATGAAGGTCATCTGCCATATCAGTGCATATGCATTGGCTCATACTGTCAGAAATTAATACCGGTAACTCCTCTGCCTCTTGTTAAAGATTTATTTCATTGTGAAATATTGCGTAATGACTAATATTTAGGTGCCAAGCCAGTGAGTCTGCATAAGTATGACTACAACAGACTCT ]
consensusID : consensus_2572#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 511 fasta sequence
[CTTTTTTTTTTTTGCTGCACAGAGTTGTTAAAATGACTCTTGAGAAATGGTGTTGCTGCCACTTTGTTTACTTGAAGGTGTGCTGCCATATCAGTGCGTATGCTGCCACCGGTTACATTGCCTGAGTGGACAGAACAACGCTATTTCTAAAAAGAAAAGAGATTTTAAATTCACATTGCGAAAAGGTTTCCAGAATAAAATGTGTGGTAATGTTGCACACTGACAATTTTGCAAAAAATGTACAAAATGCTTTGGTAAACTTAGACGTCATAATTGTCCTGTACTGGTGCCAGTTGCTCTGTGTGTATGAATGGGAGCAGGCACTTCCCTATGTTTAAAATGTATGTCTACAATAAGTTAAGTCCATATAAGAGAGAGCACTGGTGCCTCCAAACAGAGGTCTGCTGAGGATGCTGTGGAAACGAGGGAGTGAGGTCGGTCCAGAGGCTGGTTTCTTCATGTAATCTCCTCAATTGGGTGGCAAATAGTCTTTAATCAAGCTCAAACTGAT]
[+] EMBL CA847141 [CTTTTTTTTTTTTGCTGCACAGAGTTGTTAAAATGACTCTTGAGAAATGGTGTTGCTGCCACTTTGTTTACTTGAAGGTGTGCTGCCATATCAGTGCGTATGCTGCCACCGGTTACATTGCCTGAGTGGACAGAACAACGCTATTTCTAAAAAGAAAAGAGATTTTAAATTCACATTGCGAAAAGGTTTCCAGAATAAAATGTGTGGTAATGTTGCACACTGACAATTTTGCAAAAAATGTACAAAATGCTTTGGTAAACTTAGACGTCATAATTGTCCTGTACTGGTGCCAGTTGCTCTGTGTGTATGAATGGGAGCAGGCACTTCCCTATGTTTAAAATGTATGTCTACAATAAGTTAAGTCCATATAAGAGAGAGCACTGGTGCCTCCAAACAGAGGTCTGCTGAGGATGCTGTGGAAACGAGGGAGTGAGGTCGGTCCAGAGGCTGGTTTCTTCATGTAATCTCCTCAATTGGGTGGCAAATAGTCTTTAATCAAGCTCAAACTGAT]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_2572#0 AATCTCCTCAATTGGGTGGCAAATAGTCTTTAATCAAGCTCAAACTGATAAATATTTTTG 60
consensus_2572#1 --CTTTTTTTTTTTTGCTGCACAGAGTTGTTAAAATGACTC---TTGAGAAATGGTGTTG 55
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consensus_2572#0 TTATTAATTTGGTGCTTTTTCACTAATTTTCATGTTTTAGCATTTTAATGTGTGTATTTG 120
consensus_2572#1 CTGCCACTTTG----TTTACTTGAAGGTGTGCTGCCATATCAGTGCGTATGCTGCCACCG 111
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consensus_2572#0 GATGCAGAG--TGAATGAGTAACAACCAGGCTGAGTTGGGGAGAACAGAAAGGGGACCTC 178
consensus_2572#1 GTTACATTGCCTGAGTGGACAG-AACAACGCTATTTCTA----AAAAGAAAAGAGATTTT 166
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consensus_2572#0 CTGTGGTTTCTGTCAGGCTCTTTGTGTCTGTGTAACCTTAGGTAGGGTGTCGGATTATTC 238
consensus_2572#1 AAATTCACATTGCGAAAAGGTTTCCAGA-ATAAAATGTGTGGTAATGTTGCACACTGACA 225
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consensus_2572#0 ACCATTTAAGACGTGGAACAACCATTAGTGTCATGTTCTCTTCCCAAAAAGCTCCTTCCT 298
consensus_2572#1 ATTTTGCAAAAAATGTACAAAATGCTT-TGGTAAACTTAGACGTCATAA---TTGTCCTG 281
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consensus_2572#0 TACTGCTGCCATTTCCTTTCT-TATATTAATGCGAGTTCAAATGTATGTTTTTCCTGTTT 357
consensus_2572#1 TACTGGTGCCAGTTGCTCTGTGTGTATGAATGGGAGC----AGGCAC-TTCCCTATGTTT 336
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consensus_2572#0 AGAGATTTATTTTTATATGAAGGTCATCTGCCATATCAGTGCATATGCATTGGCTCATAC 417
consensus_2572#1 A-AAATGTATGTCTACAATAAGTTAAGT--CCATATAAGAGAGA--GCACTGGTGCCTCC 391
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consensus_2572#0 TGTCAGAAATTAATACCGGTAACTCCTCTGCCTCTTGTTAAAGATTTATTTCATTGTGAA 477
consensus_2572#1 AAACAGAGGTC--TGCTGAGGATGCTGTGGAAACGAGGGAGTGAGGTCGGTC-CAGAGGC 448
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consensus_2572#0 ATATTGCGTAATGACTAATATTTAGTTGCCAGGCCAGTGAGTCTGCATAAGTATTACTAC 537
consensus_2572#1 TGGTTTCTTCATGTAATCTCCTCAATTGGGTGGCAAATAGTCTTTAATCAAGCTCAAACT 508
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consensus_2572#0 AACAAACTCTCTTGAACTGTTTTCTTGTTTATTCAAATAAAATAAAGCAATCCAGTG 594
consensus_2572#1 GAT------------------------------------------------------ 511
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| Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |