These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2597#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 578 fasta sequence [GCCAAAAATTGGGTTCCGGGCCCCCCCCGGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATTTTTTTGTTGTTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTGCTTTGCAGGTAAGAAAGAGTCACACAGGTAGAAATAAAGCCTGGGGCCGGCGTTTGCTCAGAAACGTTTTCGG] [-] EMBL FR0056683 [GCCAAAAATTGGGTTCCGGGCCCCCCCCGGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATTTTTTTGTTGTTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGG ] [+] EMBL CA332534 [ TTTTTTTGTTGTTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAATGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCGTCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAA ] [+] EMBL CA332177 [ TTTTTGTTGTTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAA TTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACA ] [+] EMBL CA331906 [ TTGGTGGTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTGCTTTGCAGGTAA ] [+] EMBL CA333003 [ TTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTCAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTG ] [+] EMBL CA331946 [ gTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAG ] [+] EMBL CA332602 [ TTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAATGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCGTCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTGCT ] [-] EMBL CA845395 [ TACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAA TTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTGCTTTGCAGGTAAGAAAGAGTCACACAGGTAGAAATAAAGCCTGGGGCCGGCGTTTGCTCAGAAACGTTTTCGG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |