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consensusID : consensus_10357#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 20 consensus length = 1076 fasta sequence
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[+] EMBL CNS09KA6 [ ACTGTGCGCGTCTGGG AGTGGGACGTTAATCGAGATGATTTTGCCGCTAGTAGCTACGTTTGCGTTTATTGGACTAG CGCAGGCTGGTCCAATCGATCAATCAAAGATCGTCAACGGTACAGATGCAGCAATCGAAAACTATCCATTTGTTGTGTCTCTGCGTGGTGCTAGTGGAGGTCATTCGTGTGGTGGCAGTATCTTAAATGATCGCTGGATTCTTACGGCTGCTCACTGCGTCGATTATACTACGCCCCTGTACCAGACGATACAGGTGGGAAGGGCCGACATTTCCCGGACTGAAGACGAATCCGTATATGCGATTGAGGATGTTGTAATTCATCCCGGATACAACCCCGCCGACAGCTATATTGATGATATTGCTCTGCTGAAACTGCGCAAACCGCTGGTGTTTAGTGACCAGGTTCAACCGGTTCGACTGCCGAAACGATTTTTCGAAATCGACGTGCAGGAGTCTAATCTGGTGACGCTTGTTGGATGGGGCCGCAATGCTTCAGATGGACCAGTCCAGACCACTTTGCAGGAGATCGATTACTATGCAGTGCCGAACGATGAATGTAATCGTATCCACTCCAATCACATTTATCCAACACAGATTTGCGCAGC G AG CCTGGCGGTGGAAAAGGCCAATGCAGTGGAGATTCTGGTGGTCCCTTGATATATAAAGAATTCCAGGTGGGCATCGTTTCCTGGAGTATTAAACCCTGTGCTATCGCTCCATATCCCGGCGTGTTAACCAAGGTGTCGTACTATGTTGATTTTATCAATCAACATGCTAGTGGTTATAGTGTTTAAACACCTAAGCAGCATCATATTTTTTCTGTGAACATTCGCTTCCTCAACAAAGCTGTAGCTTGAACACACTTTAAAGAACAGACCACAACTTATATTCATCTATGTACCAGCGTTTGTTTATTATCCTTAAAAATAAACTACGCTCTCTTTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAAAAAAAGTC]
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[+] EMBL CNS098CL [ tgaaCGCGTCTGGGAAGTGGGACGTTAATCGAGATGATTTTGCCGCTAGTAGCTACGTTTGCGTTTATTGGACTAG CGCAGGCTGGTCCAATCGATCAATCAAAGATCGTCAACGGTACAGATGCAGCAATCGAAAACTATCCATTTGTTGTGTCTCTGCGTGGTGCTAGTGGAGGTCATTCGTGTGGTGGCAGTATCTTAAATGATCGCTGGATTCTTACGGCTGCTCACTGCGTCGATTATACTACGCCCCTGTACCAGACGATACAGGTGGGAAGGGCCGACATTTCCCGGACTGAAGACGAATCCGTATATGCGATTGAGGATGTTGTAATTCATCCCGGATACAACCCCGCCGACAGCTATATTGATGATATTGCTCTGCTGAAACTGCGCAAACCGCTGGTGTTTAGTGACCAGGTTCAACCGGTTCGACTGCCGAAACGATTTTTCGAAATCGACGTGCAGGAGTCTAATCTGGTGACGCTTGTTGGATGGGGCCGCAATGCTTCAGATGGACCAGTCCAGACCACTTTGCAGGAGATCGATTACTATGCAGTGCCGAACGATGAATGTAATCGTATCCACTCCAATCACATTTATCCAACACACATggctccacc ]
[+] EMBL CNS08MAA [ agcgtatGTCTGGGAAGTGGGACGTTAATCGAGATGATTTTGCCGCTAGTAGCTACGTTTGCGTTTATTGGACTAG CGCAGGCTGGTCCAATCGATCAATCAAAGATCGTCAACGGTACAGATGCAGCAATCGAAAACTATCCATTTGTTGTGTCTCTGCGTGGTGCTAGTGGAGGTCATTCGTGTGGTGGCAGTATCTTAAATGATCGCTGGATTCTTACGGCTGCTCACTGCGTCGATTATACTACGCCCCTGTACCAGACGATACAGGTGGGAAGGGCCGACATTTCCCGGACTGAAGACGAATCCGTATATGCGATTGAGGATGTTGTAATTCATCCCGGATACAACCCCGCCGACAGCTATATTGATGATATTGCTCTGCTGAAACTGCGCAAACCGCTGGTGTTTAGTGACCAGGTTCAACCGGTTCGACTGCCGAAACGATTTTTCGAAATCGACGTGCAGGAGTCTAATCTGGTGACGCTTGTTGGATGGGGCCGCAATGCTTCAGATGGACCAGTCCAGACCACTTTGCAGGAGATCGATTACTATGCAGTGCCGAACGATGAATGTAATCGTATCCACTCCAATCACATTTATCCAACACAGATTTGCGCAGC GAAG CCTGGCGGTGGAAAAGGCCAATGCAGTGGAGATTCTGGTGGTCCCTTGATATATAAAGAATTCCAGGTGGGCATCGTTTCCTGGAGTATTAAATTCTGTGCTATCGCTCCATATCCCGGCGTGTTAACCAAGGTGTCGTACTATGTTGATTTTATCAATCAACATGCTAGTGGTTATAGTGTTTAAACACCTAAGCAGCATCATATTTTTTCTGTGAACATTCGCTTCCTCAACAAAGCTGTAGCTTGAACACACTTTAAAGAACAGACCACAACTTATATTCATCTATGTACCAGCGTTTGTTTATTATCCTTAAAAATAAACTACG ]
[+] EMBL CNS08UHU [ AGCTATTTTGATGATATTGCTCTGCTGAAACTGCGCAAACCGCTGGTGTTTAGTGACCAGGAAAAAACGGTTCGACTGCCGAAACGATTTTTCGAAATCGACGTGCAGGAGTCTAATCTGGTGACGCTTGTTGGATGGGGCCGCAATGCTTCAGATGGACCAGTCCAGACCACTTTGCAGGAGATCGATTACTATGCAGTGCCGAACGATGAATGTAATCGTATCCACTCCAATCACATTTATCCAACACAGATTTGCGCAGCGG AG CCTGGCGGTGGAAAAGGCCAATGCAGTGGAGATTCTGGTGGTCCCTTGATATATAAAGAATTCCAGGTGGGCATCGTTTCCTGGAGTATTAAACCCTGTGCTATCGCTCCATATCCCGGCGTGTTAACCAAGGTGTCGTACTATGTTGATTTTATCAATCAACATGCTAGTGGTTATAGTGTTTAAACACCTAAGCAGGATGATATTTT ]
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[-] EMBL CNS08W4H [ ctttttttTACCGCGCGTTTGTTTATTATCCTTAAAAATAAACTACGCTCTCTTTGTTACTCGATTTGTTGATAACTAAAAATGCAAAATGAATAAACC TTTTACAT ]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_10357#2 ------------------------------------------------------------
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*********************** ************************
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************************************************************
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******************************************** ***************
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****** ******************************** ********* **********
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***********************************************************
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************************************************************
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************************************************************
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********** *************************************************
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************************************************* **********
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****************************************************** *
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consensus_10357#0 -
consensus_10357#1 -
consensus_10357#2 A 830
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| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||