These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10995#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 36 consensus length = 1866 fasta sequence [GGGCCCGCAGCTCGGGCACATGTGGCCT-TTTTTTTTTTTTT--TTTTTTTTTGAGCTG-TTGCTTTGATTTTGGTTTTTATTTAATTTGTTACAGAACGGTTACGAAAACAATTGGGCTAATGGAAGAATCTATAATGCGGCCAAACAGGTGGAATCGTTGGTGGATAGTGA-GATAC-AGCACAACTTCAATGCGTGTGTAGCGCAGAACGGGTACTTCCTGAACTATCACAACATTCAGGAGATGTGCATATACAGC-AAGAAACGAACGCGCTATCGTAATCGGTGGACAAAGAAGTAGTGGTTCAACATTGCCCCATTCAATAAAGTTACGCCTTGCGAATGCTATTCCCTGTTGATCTTTTTAATTTCATGCTAGTGGATAATACGTCGACGTATCGGCGGCGGCAGACATGATCCGACAAGATTCACGGAGTCCAGCGTTTCGAACGAATTGCAA-TACGCGATCATTGCACAGTGGCAGCTCTTCCTGGACCTGCTGGAAGTACAGATGGCTGGCAAGGTCGAGCAGGAAGAACTTGTCCCTGAAGTCAATGGTAGCAACGATATCATCCAAACATTCGCTCATCCTCTCGAACGGTTGCTGGAAGCA-G-ATATTCAATCGCCCATAGACTGCGGTAACGTACGGCCGTAGGAAATTATTCGCAAGCGACACCAGCTGCGATGAGCCTTGATTTTCGAGATTCGTCTGCTCGG-TTAGGCATGCCGCTACACGTGAAGTCACCTGTGCTGGAAGCGCGTTAAACGTCGTAACAAATCCAGTTGCGCAGAAATTTTCACCACTCAGTACGTCCAGCATGACGCGCGTGTACAGATCGGTTTCTTCTCGCAGGTAGCTGAGTGGGTTATTGCCCTCTTTGAACAGGGCACTCGTGCGCTCGAGATTCTGCGCGACCGTTACCGTTCGCTGCAGCAAGTTCCCCGTCAAATGATCGATGGAATGATTGATGCACGGACTCGCTAAACAGTAACGGCCAGCGGAAGACGAAGCTTTCGTTCGTGTCTTTGAGGTGTGTTAGGAGCGAGTCGGCCGCCGTCAGAAAGCGGTAGAACGATGTGTTTGATGCAGTATTGTACCGGTCAACGTTGGTGTTGATAGATGCCTGGTTTGTTCTTAGCAAGGCATACGATCGGGCTTGGAAGTCGTTGGCAGCACGAACTGCTGCCACC-AGAGTGCTAACACTGGTAGAGTACTCTCCGGATAGTCGCACAGTGTATTCCACTACATCCAGCAGCTGCTGCAGTGTCCCATTTGCCGACACTACCTGCAGAAACTGTTGTGTGTTTAGCGGCTGTCCAGCAACCGGGAGGACCGCATCA-CCCAACCGCACGAGTACTTCCGCCAGCTCTTGCACGTTTTGACCGAACGCATTCCGCAACTTCTCCAG-ATAGCTGGCCGTGTTGGAATTCACATCGTAGTTAAACGCCTCCTTCAACACCTCGAGCGAGCTGGATAGGTTTCGGTTCCACTGTGCCACACCCTGGACGGCCAGCGTAAGCCGGGTGAAGACGACGGCCGGTGCCGTGGTACGATCGACGGCAACCTGTGCCACCTCGCGGAACACCTGCCCCATCACGGTCGTCGTATTGCCGACGTAATCGCGCAGTGCCGCCGCTCCAGCGCTGAGAAAGTTTGAAGACGTTGGGTTCAGTCCACGAACCTGCAGCTGGGCGGCGTCTAGATTGCGCACCACCGCGGTGGCGGAACTGGCAAGCCGGGCACCTTGCGGGAGCACATAATTGTTGCCGAAAAAGGGACTTCCTTCGGTACAGGCGATTGCAAGAAGCAGCACAACGACAGGCACCTTCACTGAACTAGACG-CCGGACGCGTGGGCGGACGCGTGGGCGG] 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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 808 consensus length = 1446 fasta sequence 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Sequences nbr = 5 consensus length = 1436 fasta sequence 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EMBL CNS09FMJ [ GTTATTCCACTGCAGTAA ACTAATCTCATCATGCCAGTCCCGGAGCTCCAGAAACCCGCGCCCGCA TTCAGCGGTACCGCCGT CGT GAACGGTGAGTTCAAGGAAATCCGCCTGTCGGACTACCTCGGC AAGTACGTGGTGCTGCTCTTCTACC CGCTCGACTTTACCTTCGTCTGCCCGACG GAGATCGTCGCCTTCTCCGACCGGGCGGAC GAGTTCCACGA GAAGAAG TGCCAGGTGATCGCC TGCTCG A CGGACAGCCAC TT CA CCCA TCTG GCGTGGATCAACACGCCCC GCAAGCAGGG TGGGCTGGG CGAGC TGAAGA TCCCGCTGC TGGCGGACAAGTCGAT GAAGATCGC GCGCGACTACGGCGTGCTG CAGGA GG AGTCGGGCGTCCCG TTCCGC GGCCTGTTCATCATCGAC GACAA GGGCAACCT GCG CCAGGTGACGGTGAACGAT CTGC CGGTC GGACGCAGCGTGG ACGAG ACGCTGCGCCT GGTGGAGGCG TTCCGCTACACCG ATGAG T TCGGCG AGGTG TGCCC GGCCAACT GGAAG CCCGGCAGCAAG ACGATGGTGGCCGAT CCGCACAAGTCGAAGGATTACTTCAATGCCGTC AACTAAAAGGATGTTTGT G GGGAATACGTTGAGCCGAAC AAGAACAGAAGGA T CTTTCACACACACAC ACATTCTTTCCGCGTGATATCATCTATTTTATGGGAATACATCATCGCCCTCTGACCGCGGCATTAAATTAAAAATCATCATCCAGAGGAGAGGAGGCTAATTAATCGC ACAGGTTGAACCT GC GA GGAGGAGAAAATGC T CTTTTAATGAAAAGAAGAACACGAGGATCAAAACAGAAACTGTTTCGATGTTTAGAATATCATCAACCCC CCT C C 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CATCTGCCCATCGACGTCTACCGAGTGCACCGCAAGAAGGTGACGGTGGAGAAGTGGTTCGGCTCCAAGAAGGAGCTGGCTGCCG TCCGCACCGTCTGC CGCACATCGAGAACA T GATCAAGGGTGT CACCAAGGGATTCCA GTACAAGATGCGTGCTGTACA TGCTCACTTCCCGATCAACTGCGTGATCAGTGAGAACAACACGCTGGTGGAGATCCGTAACTTCCTCGGCGAGAAGCACATCCGTCGCGTG AAGA TGCAGCCGGGCGTGACCGTGGTGAACTCCGCCAAGCAGAAGGACGAGCTGGTGCTCGAGGGTAACGACATCGAAGCGGTCTCCCTGTCCGCCGCCCTCATCCAGCAGTCGACGACCGTCCACAACAAGGATATCCGTAAGTTCTTGGACGGTCTGTACGTT TCCGAGAAGACGACAGTTGTACAGGACGAGGAATAAGTTGTAACATTG TTGTAAGCGAAAGTAAACGGAATGAAGCAGCAGCAGAAAAC AAA GT GGGGGTGGCCCGTGAGAAATGGAAACT AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACAGGGT CCCGGGGGGGGGGGGGGG] [+] EMBL CNS0988V [ CATCTGCCCATCGACGTCTACCGAGTGCACCGCAAGAAGGTGACGGTGGAGAAGTGGTTCGGCTCCAAGAAGGAGCTGGCTGCCG TCCGCACCGTCTGCTCGCACATCGAGAACA T GATCAAGGGTGT CACCAAGGGATTCCA GTACAAGATGCGTGCTGTACA TGCTCACTTCCCGATCAACTGCGTGATCAGTGAGAACAACACGCTGGTGGAGATCCGTAACTTCCTCGGCGAGAAGCACATCCGTCGCGTG AAGA 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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! 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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 60 consensus length = 730 fasta sequence [CCGCCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCG-CACTATCGAACAGTGTTCCAGTGTCATTCTTACGACCCACCAAACCA-CCACCAC-C-CAACTTCATCATCATGAACACCATCGTAGCAGCAGTCATCCTCTCCATCGTCGTCGTCGGTGCCATGGG-CGATTACGCCGCCCCGGCCAAGTACGAGGCGCCCGCCAAGG-CGTACCACGCCCCGGCCCCGGCCTACCACGCTCCGGCTCACCACGCCCCGGCCCCGGCCTACCACGCACCGGCTCCCCACCACGGCGGATACGCTCACCACTCGGCTCCGGTTGTCCACGCTTACGCCGCCAAGGCCCCGCATGTCAAGTGCGGCGCTAACCTGCTGGTCGGCTGCGCTCCCAACGTTGCCCACGTGCCGTGCGTCCCCGCCCACGGC-GGACACGGTGGATACGCCGCCCCTGCCCACGCCCCGGCCATGCACCATGGATACGCCGCACCCGCCCACGGATACCGCTCGTTCTCCGAGGCTGACC-AGGCTTCGGCGGCTTTCGATTTCGAGGAAT-AAGCGCGGCGACTGATCAACTGAGCAACTCTACTGGACAACACTGGATCAACACTGGATAGATGGAAACGAAAAAC--TGGACAC-GG-AACTTGGAT-CC-GGCCTTTGAGGGACCAACAGCA-CC-GGGG-AAGTAGCGAGAGACAGCATCG-ACCGTAGCGC-GGTGCTCGGGTGTGCGGCCACAGAACTGACCTCCGAAG] [+] EMBL BM589544 [CCGCCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCG CTATCGAACAGTGTTCCAGTGTCATTCTTACGACCCACCAAACCA CCACCAC C CAACTTCATCATCATGAACACCATCGTAGCAGCAGTCATCCTCTCCATCGTCGTCGTCGGTGCCATGGG 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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! 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Sequences nbr = 1 consensus length = 172 fasta sequence [TATTTTTTATATTAGGTCCTTTCGTACTACAATATAATAATTTATTAAAGATAGAAACCAACCTGGCTTACGCCGGGTTGAACTCAGATCATGTAAGAATTCAAAGGTCGAACAGACCTAAACTTTAAACTTCTACACCTAAAAATAACTCTTAATCCCAGTAGGCCAAAAG] [+] EMBL CNS08I8M [TATTTTTTATATTAGGTCCTTTCGTACTACAATATAATAATTTATTAAAGATAGAAACCAACCTGGCTTACGCCGGGTTGAACTCAGATCATGTAAGAATTCAAAGGTCGAACAGACCTAAACTTTAAACTTCTACACCTAAAAATAACTCTTAATCCCAGTAGGCCAAAAG] consensusID : consensus_10995#59 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 149 fasta sequence [GACTATCGTTCTTTTTCGCCGTAGAACACATTAACGGGGAGAAAAAAAGAACGAAAACCATCCACACACACACGCCCTTTCAAAAAAAAAGGGACCACCACCGACAAGCAACGGTTTTCCCCCTTCTCCTAACAAAAAGTGACGAGACG] [+] EMBL CNS09J06 [GACTATCGTTCTTTTTCGCCGTAGAACACATTAACGGGGAGAAAAAAAGAACGAAAACCATCCACACACACACGCCCTTTCAAAAAAAAAGGGACCACCACCGACAAGCAACGGTTTTCCCCCTTCTCCTAACAAAAAGTGACGAGACG] consensusID : consensus_10995#60 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 133 fasta sequence [CCCACCTGATAGCAAGGCGGGGGGGACAGGGGGGGCTTCGGCACGGCGCGCGCGCGCGCTCTGTAGGTTGTGTAAAACAGGCGGCACATTAAGAAAATCTGAAAACAACTCCCGGAACTAAAACAAAAGACCA] [+] EMBL BX614350 [CCCACCTGATAGCAAGGCGGGGGGGACAGGGGGGGCTTCGGCACGGCGCGCGCGCGCGCTCTGTAGGTTGTGTAAAACAGGCGGCACATTAAGAAAATCTGAAAACAACTCCCGGAACTAAAACAAAAGACCA] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_10995#16 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#27 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#0 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#15 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#42 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#11 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#34 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#53 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#21 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#24 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#5 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#25 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#48 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#52 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#8 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#29 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#39 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#31 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#41 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#1 CAAAATACCGCGGCCCTTTAAAACTCAGTGGGCAGGCTAGACTTTAAATAAAATACAAAA 60 consensus_10995#22 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#35 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#59 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#36 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#60 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#33 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#12 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#20 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#58 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#3 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#17 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#46 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#57 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#19 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#30 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#50 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#51 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#10 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#28 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#40 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#43 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#47 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#56 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#2 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------------------------------------------------------------ consensus_10995#53 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#21 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#24 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#5 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#25 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#48 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#52 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#8 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#29 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#39 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#31 ------------------------------------------------------------ consensus_10995#41 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Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||