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Anopheles gambiae
cluster # 147 cluster # 147       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_147#0 length = 875 sequences # 2  

consensusID : consensus_147#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 875
fasta sequence
                              [ACGGACATGATGTTGATGCTACTGATGGGGTTGCTGATGATATTGCAGAAGATGGCAACCGAGCAATCGTGTGGGGCAAGCTCTTTCCAAACTACTGCATCATACAAGAACAATAGTAATGGTTACTGTGAGAAAATGTTAGAAATAACTAACTCAACGGAGAATAATAGTGCCTTATTGTTTGCTGTCAGTAAGAACCAAAGTCCAAGCAGTTAGAGCTGAATGGTTTTGTCTAAAACTGGTAGTATATTTAGTTAAGAACAGAGCGAGAGAGCCATGCTCATGATAGGGAATGTTAGATTGTAATTGTTATCGTTTTTTAGCTTTTGTTTAGTATGTAGCTTATTATTTGAAGAAAAAAAAGCAGAACAACATTTACATAATGCATAAAGCTATGTGTTAATATCTACTAAATTCAATCATCACAATTAGGACCATTCCCATAAAAAAAGTATTCGATGAAAAAGCACCAGCTAAAAAAATTCATCTGGTGATACATATATACTTCATTTATCGTTCATACAATAATTTTTAGTTTTTTTTTTGCCATTGCTTATTTTCTTATTTATTTTTGGAGAAATTAAAGTCTTAGTTACGTTTTTTCCAATTTTTTTTTTCATAAAAAAACACAATGTTCACTATTTTATTTTATTGTGTAGCTGCTATAACAGCACAAAATAGCTTTTGTTGAGTTTGTATTTGTTTGTGATAGTTTGTTAAAGTCTCCTATGTTTGGTTTGGTTTGCGATGATACTGGTGTGGNAGTATTAATGGTACGATTTTTCCTTTAATTTTTGACAACATATGTTGCTTTCNATGACACTTTAACGAATTTCGATTTTCGAACACATTTTGGTGATTTATAAATAACTTAT]

[+] EMBL BX612744             [ACGGACATGATGTTGATGCTACTGATGGGGTTGCTGATGATATTGCAGAAGATGGCAACCGAGCAATCGTGTGGGGCAAGCTCTTTCCAAACTACTGCATCATACAAGAACAATAGTAATGGTTACTGTGAGAAAATGTTAGAAATAACTAACTCAACGGAGAATAATAGTGCCTTATTGTTTGCTGTCAGTAAGAACCAAAGTCCAAGCAGTTAGAGCTGAATGGTTTTGTCTAAAACTGGTAGTATATTTAGTTAAGAACAGAGCGAGAGAGCCATGCTCATGATAGGGAATGTTAGATTGTAATTGTTATCGTTTTTTAGCTTTTGTTTAGTATGTAGCTTATTATTTGAAGAAAAAAAAGCAGAACAACATTTACATAATGCATAAAGCTATGTGTTAATATCTACTAAATTCAATCATCACAATTAGGACCATTCCCATAAAAAAAGTATTCGATGAAAAAGCACCAGCTAAAAAAATTCATCTGGTGATACATATATACTTCATTTATCGTTCATACAATAATTTTTAGTTTTTTTTTTGCCATTGCTTATTTTCTTATTTATTTTTGGAGAAATTAAAGTCTTAGTTACGTTTTTTCCAATTTTTTTTTTCATAAAAAAACACAATGTTCACTATTTTATTTTATTGTGTAGCTGCTATAACAGCACAAAATAGCTTTTGTTGAGTTTGTATTTGTTTGTGATAGTT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BX620059             [                                                                                                                                                                                                                                  TTTTGTCTAAAACTGGTAGTATATTTAGTTAAGAACAGAGCGAGAGAGCCATGCTCATGATAGGGAATGTTAGATTGTAATTGTTATCGTTTTTTAGCTTTTGTTTAGTATGTAGCTTATTATTTGAAGAAAAAAAAGCAGAACAACATTTACATAATGCATAAAGCTATGTGTTAATATCTACTAAATTCAATCATCACAATTAGGACCATTCCCATAAAAAAAGTATTCGATGAAAAAGCACCAGCTAAAAAAATTCATCTGGTGATACATATATACTTCATTTATCGTTCATACAATAATTTTTAG   TTTTTTTGCCATTGCTTATTTTCTTATTTATTTTTGGAGAAATTAAAGTCTTAGTTACGTTTTTTTCA  TTTTTTTTTCAT AAAAAACACAATGTTCACTATTTTATTTTATTGTGTAGTTGCTATAACAGCACAAAATAGCTTCTGTTGAGTTTGTATTTGTTTGTGATAGTTTGTTAAAGTCTCCTATGTTTGGTTTGGTTTGCGATGATACTGGTGTGGNAGTATTAATGGTACGATTTTTCCTTTAATTTTTGACAACATATGTTGCTTTCNATGACACTTTAACGAATTTCGATTTTCGAACACATTTTGGTGATTTATAAATAACTTAT]


>consensus_147#0 ACGGACATGATGTTGATGCTACTGATGGGGTTGCTGATGATATTGCAGAAGATGGCAACC GAGCAATCGTGTGGGGCAAGCTCTTTCCAAACTACTGCATCATACAAGAACAATAGTAAT GGTTACTGTGAGAAAATGTTAGAAATAACTAACTCAACGGAGAATAATAGTGCCTTATTG TTTGCTGTCAGTAAGAACCAAAGTCCAAGCAGTTAGAGCTGAATGGTTTTGTCTAAAACT GGTAGTATATTTAGTTAAGAACAGAGCGAGAGAGCCATGCTCATGATAGGGAATGTTAGA TTGTAATTGTTATCGTTTTTTAGCTTTTGTTTAGTATGTAGCTTATTATTTGAAGAAAAA AAAGCAGAACAACATTTACATAATGCATAAAGCTATGTGTTAATATCTACTAAATTCAAT CATCACAATTAGGACCATTCCCATAAAAAAAGTATTCGATGAAAAAGCACCAGCTAAAAA AATTCATCTGGTGATACATATATACTTCATTTATCGTTCATACAATAATTTTTAGTTTTT TTTTTGCCATTGCTTATTTTCTTATTTATTTTTGGAGAAATTAAAGTCTTAGTTACGTTT TTTCCAATTTTTTTTTTCATAAAAAAACACAATGTTCACTATTTTATTTTATTGTGTAGC TGCTATAACAGCACAAAATAGCTTTTGTTGAGTTTGTATTTGTTTGTGATAGTTTGTTAA AGTCTCCTATGTTTGGTTTGGTTTGCGATGATACTGGTGTGGNAGTATTAATGGTACGAT TTTTCCTTTAATTTTTGACAACATATGTTGCTTTCNATGACACTTTAACGAATTTCGATT TTCGAACACATTTTGGTGATTTATAAATAACTTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)