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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2212#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 857 fasta sequence
[TCTTTTGTCGATCATTTTCGGCGTCAAGCTGTCGACGCTGTACCAAAAGTCGGATCCCTACCCGGGCCCGATGGTGGAATCGTAAGTGCCAAATGATAGTTCTTCTCTCCCTTTCCACACCCCTCTAGCTTACAGTAGTGATTCCAGCAGCCACCCCTGAACAACTGCATGGCTTAAGTAGATCTCCAAAAAGTATAGTTAAACATTGCGCTTGCATGCGTGTATGTATGTACTAAAACGTGTCGACGTTTTACTGTAGTTTAGTGATCATTGCACGAGATTAGTTTGTGCGGAGTATTAGACTGTGCTGCTGCATGCCGATCGCTTTATAACGAGCTTCCCACTGTAACAGTATTAAAATGTGACCGGCAGGGTATTCGGATTCCACTTAAGCTTTAAGATTTGCTTTTTAGTTTTTAAAAATTCCTTCCGGGCAGCACG-GAGCGTAATTCATGGTTTAAGTTTATTTTATGCAAAATATTAACATTAAGCTTTTAGCGAATTTTGTGAAATTGGCAAGTTTGAATGGGTATATGCTGTTTTTTCTTTGGTGGAATGTATACATTAGCTGGTAATGGCAGCTGTTACTATTTAAAGAGATTTTCCTATGTTACATACGGTTATGTTTTTGCAATTATTTAATAAATCCACTGTACATCGAATGCACTACTTAAGTTATTTGGTTATGCTAGCAAGTTGTAAATATGCAAACTCCTTTCTGTTGACCCTAATAATACTGTAAAACTCAATTTAACCTTAATTTAGCCTAGGTTAGTGTAGAGACTGCAATCAGTTTAATAAAAAAAAAAACGTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCTCGGGCTTGGGGT]
[+] EMBL CNS09L26 [TCTTTTGTCGATCATTTTCGGCGTCAAGCTGTCGACGCTGTACCAAAAGTCGGATCCCTACCCGGGCCCGATGGTGGAATCGTAAGTGCCAAATGATAGTTCTTCTCTCCCTTTCCACACCCCTCTAGCTTACAGTAGTGATTCCAGCAGCCACCCCTGAACAACTGCATGGCTTAAGTAGATCTCCAAAAAGTATAGTTAAACATTGCGCTTGCATGCGTGTATGTATGTACTAAAACGTGTCGACGTTTTACTGTAGTTTAGTGATCATTGCACGAGATTAGTTTGTGCGGAGTATTAGACTGTGCTGCTGCATGCCGATCGCTTTATAACGAGCTTCCCACTGTAACAGTATTAAAATGTGACCGGCAGGGTATTCGGATTCCACTTAAGCTTTAAGATTTGCTTTTTAGTTTTTAAAAATTCCTTCCGGGCAGCACG GAGCGTAATTCATGGTTTAAGTTTATTTTATGCAAAATATTAACATTAAGCTTTTAGCGAATTTTGTGAAATTGGCAAGTTTGAATGGGTATATGCTGTTTTTTCTTTGGTGGAATGTATACATTAGCTGGTAATGGCAGCTGTTACTATTTAAAGAGATTTTCCTATGTTACATACGGTTATGTTTTTGCAATTATTTAATAAATCCACTGTACATCGAATGCACTACTTAAGTTATTTGGTTATGCTAGCAAGTTGTAAATATGCAAACTCCTTTCTGTTGACCCTAATAATACTGTAAAACTCAATTTAACCTTAATTTAGCCTAGGTTAGTGTAGAGACTGCAATCAGTTTAATAAAAAAAAAAACGTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCTCGGGCTTGGGGT]
[-] EMBL CNS09L27 [ TTCCAGCAGCCACCCCTGAACAACTGCATGGCTTAAGTAGATCTCCAAAAAGTATAGTTAAACATTGCGCTTGCATGCGTGTATGTATGTACTAAAACGTGTCGACGTTTTACTGTAGTTTAGTGATCATTGCACGAGATTAGTTTGTGCGGAGTATTAGACTGTGCTGCTGCATGCCGATCGCTTTATAACGAGCTTCCCACTGTAACAGTATTAAAATGTGACCGGCAGGGTATTCGGATTCCACTTAAGCTTTAAGATTTGCTTTTTAGTTTTTAAAAATTCCTTCCGGGCAGCACGCGAGCGTAATTCATGGTTTAAGTTTATTTTATGCAAAATATTAACATTAAGCTTTTAGCGAATTTTGTGAAATTGGCAAGTTTGAATGGGTATATGCTGTTTTTTCTTTGGTGGAATGTATACATTAGCTGGTAATGGCAGCTGTTACTATTTAAAGAGATTTTCCTATGTTACATACGGTTATGTTTTTGCAATTATTTAATAAATCCACTGTACATCGAATGCACTACTTAAGTTA TTGGTTATGCTAGCAAGTTGTAAATATGCAAACTCCTTTCTGTTGACCCTAATAATACTGTAAAACTCAATTTAACCTTAATTTAGCCTAGGTTAGTGTAGAGACTGCAATCAGTTTAATAAAAAAAAAAAC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||