These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_223#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 644 fasta sequence [TTTTCTTGCGCCCCGAGCGTGTGTAGGACAGCGAGTGAAGAACACTATAACAGTGATAAAAGTGTCTGTTGTGGTGCGGCTCGACATTATCATTCTTTCGGTCCATTCGGCCTCATTTTTGCGGCTGGCGGGGCGAGGGGGACGGGTTTTCTTCTATGTTCAATAATAGCCTAACGTCTGAAATGGATAATGTTAAACACATATCTCATCGGGTCTGACCTATTAACAGACACGTAGCTATATACTGAATGGGTGATGGAATCTCACTATACTACGTCTTTTCAAGAAGACGCATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTCATTTTTTACTTTAATAATTAAATACAAGAAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAAAATAAAATTTTATATTTTTTATAATTTTCAAATAAATATAAGCTTAATAATAGCTATTATTAATAAATTTGCTATAATTTATTTTTTATAAAAAATTATTTAATTTAAATTAAATTATTTATTAAAATTTAAATTTTAATAATAAAAATTTAGTAATTATGATAAAATTAGTATATAAATCTATATAAAGTAATTAATTTGATAGGTTTTAATGAAGAATTCGGCAAATTAAATATATTCACCTGTTTAACAAAACATGTCTTTTT] [+] EMBL BM655823 [TTTTCTTGCGCCCCGAGCGTGTGTAGGACAGCGAGTGAAGAACACTATAACAGTGATAAAAGTGTCTGTTGTGGTGCGGCTCGACATTATCATTCTTTCGGTCCATTCGGCCTCATTTTTGCGGCTGGCGGGGCGAGGGGGACGGGTTTTCTTCTATGTTCAATAATAGCCTAACGTCTGAAATGGATAATGTTAAACACATATCTCATCGGGTCTGACCTATTAACAGACACGTAGCTATATACTGAATGGGTGATGGAATCTCACTATACTACGTCTTTTCAAGAAGACGCATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTCATTTTTTACTTTAATAATTAAATACAAGAAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAAAATAAAATTTTATATTTTTTATAATTTTCAAATAAATATAAGCTTAATAATAGCTATTATTAATAAATTTGCTATAATTTATTTTTTATAAAAAATTATTTAATTTAAATTAAATTATTTATTAAAATTTAAATTTTAATAATAAAAATTTAGTAATTATGATAAAATTAGTATATAAATCTATATAAAGTAATTAATTTGATAGGTTTTAATGAAGAATTCGGCAAATTAAATATATTCACCTGTTTAACAAAACATGTCTTTTT] consensusID : consensus_223#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 378 fasta sequence [CCGCCCACGCGTCCGATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAATTTTTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAAAATAAAATTTTATATTTTTTATAATTTTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAGCTATTATTAATAAATTTGTTATAATTTATTTTTTATAAAAAATTATTTAATTTAAATTAAATTATTTATTAAAATTTAAATTTTAATAATAAAAATTTAGTAATTATGATAAAATTAGTATATAAATTTATATAAAGTAATTAATTTGATAGGTTTTAATGAAGAATTCGGCAAATTAAATATATTCACCTGTTTAACAAAAACATGTCTTTTTGTATTTTA] [+] EMBL BM639685 [CCGCCCACGCGTCCGATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAATTTTTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAAAATAAAATTTTATATTTTTTATAATTTTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAGCTATTATTAATAAATTTGTTATAATTTATTTTTTATAAAAAATTATTTAATTTAAATTAAATTATTTATTAAAATTTAAATTTTAATAATAAAAATTTAGTAATTATGATAAAATTAGTATATAAATTTATATAAAGTAATTAATTTGATAGGTTTTAATGAAGAATTCGGCAAATTAAATATATTCACCTGTTTAACAAAAACATGTCTTTTTGTATTTTA] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_223#0 TTTTCTTGCGCCCCGAGCGTGTGTAGGACAGCGAGTGAAGAACACTATAACAGTGATAAA 60 consensus_223#1 ------------------------------------------------------------ consensus_223#0 AGTGTCTGTTGTGGTGCGGCTCGACATTATCATTCTTTCGGTCCATTCGGCCTCATTTTT 120 consensus_223#1 ------------------------------------------------------------ consensus_223#0 GCGGCTGGCGGGGCGAGGGGGACGGGTTTTCTTCTATGTTCAATAATAGCCTAACGTCTG 180 consensus_223#1 ------------------------------------------------------------ consensus_223#0 AAATGGATAATGTTAAACACATATCTCATCGGGTCTGACCTATTAACAGACACGTAGCTA 240 consensus_223#1 ------------------------------------------------------------ consensus_223#0 TATACTGAATGGGTGATGGAATCTCACTATACTACGTCTTTTCAAGAAGACGCATTTAAT 300 consensus_223#1 ---------------------------------CCGCCCACGCGTCC-GATGAATTTAAT 26 ** * * ** * ******* consensus_223#0 TTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTCATTTTTTACTTTAATAATTAAATACAAGAAATATT 360 consensus_223#1 TTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAATTTTTTAATTTAATAATTAAATA-AAGTAATATT 85 ************************ ******** *************** *** ****** consensus_223#0 TTAAGGGATGAGCTTTAAAATAAAATTTTATATTTTTTATAATTTTCAAATAAATATAAG 420 consensus_223#1 TTAAGGGATGAGCTTTAAAATAAAATTTTATATTTTTTATAATTTTTAAATAAATATAAG 145 ********************************************** ************* consensus_223#0 CTTAATAATAGCTATTATTAATAAATTTGCTATAATTTATTTTTTATAAAAAATTATTTA 480 consensus_223#1 CTTAAAAATAGCTATTATTAATAAATTTGTTATAATTTATTTTTTATAAAAAATTATTTA 205 ***** *********************** ****************************** consensus_223#0 ATTTAAATTAAATTATTTATTAAAATTTAAATTTTAATAATAAAAATTTAGTAATTATGA 540 consensus_223#1 ATTTAAATTAAATTATTTATTAAAATTTAAATTTTAATAATAAAAATTTAGTAATTATGA 265 ************************************************************ consensus_223#0 TAAAATTAGTATATAAATCTATATAAAGTAATTAATTTGATAGGTTTTAATGAAGAATTC 600 consensus_223#1 TAAAATTAGTATATAAATTTATATAAAGTAATTAATTTGATAGGTTTTAATGAAGAATTC 325 ****************** ***************************************** consensus_223#0 GGCAAATTAAATATATTCACCTGTTTAACAAAA-CATGTCTTTTT-------- 644 consensus_223#1 GGCAAATTAAATATATTCACCTGTTTAACAAAAACATGTCTTTTTGTATTTTA 378 ********************************* *********** |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||