These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2324#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! 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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 637 fasta sequence [CCGCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTTCACGATCACGCTCCTTCTCACGCTCCTTCTCACGTTCCTTCTCGCGCTCCTTCTCGCGCTCCTTCTCACGCTCCTTCTCGCGTTCTTTTTCCCGCTCGCGATCCTTCTCCATGTCGCGGTCCTTTTCCTTGTCGCGATCCTTTTCCCGCTCTCGATCCTTCTCACCCCGCTCGCGATCCTTTTCCTTGTCGCGTTCCTTTTCTCTGTCCCGCAGCCTTTCCTTCTCGCGCTCCTTTTCGCGTACCTTTTCCCGCTCCCGCTCCTTCTCCCGCTCGCGCTCCTTTTCCTTCTCCTTTTCGCGCTCCTTCTCCTTCCTTCGGTCCCGGTCGCGATCATGATGTTCGGCGTGATCGCCCCGCTCCTTCTCCTTGTTGCGATCCTTCTCCCGCTCACGGTCCCGCTGCCGGTCTCGATCGCGCTCCCGCTCGCGATCACGCTGGTGATCACCTCCGCGCTCATTCTCGCCCCGTTCCTTGCCCCGCTCCCGATGATGATGGTCACGCTCGTCTCCTCCCCGCCGGCCGTGCTGGTCCACCGGCTCGCTGCGCTTGTCCTTCTCCGAGGGCTGAATGTTTGCGGTCCTGCTTGTCCC] [+] EMBL BM607425 [CCGCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTTCACGATCACGCTCCTTCTCACGCTCCTTCTCACGTTCCTTCTCGCGCTCCTTCTCGCGCTCCTTCTCACGCTCCTTCTCGCGTTCTTTTTCCCGCTCGCGATCCTTCTCCATGTCGCGGTCCTTTTCCTTGTCGCGATCCTTTTCCCGCTCTCGATCCTTCTCACCCCGCTCGCGATCCTTTTCCTTGTCGCGTTCCTTTTCTCTGTCCCGCAGCCTTTCCTTCTCGCGCTCCTTTTCGCGTACCTTTTCCCGCTCCCGCTCCTTCTCCCGCTCGCGCTCCTTTTCCTTCTCCTTTTCGCGCTCCTTCTCCTTCCTTCGGTCCCGGTCGCGATCATGATGTTCGGCGTGATCGCCCCGCTCCTTCTCCTTGTTGCGATCCTTCTCCCGCTCACGGTCCCGCTGCCGGTCTCGATCGCGCTCCCGCTCGCGATCACGCTGGTGATCACCTCCGCGCTCATTCTCGCCCCGTTCCTTGCCCCGCTCCCGATGATGATGGTCACGCTCGTCTCCTCCCCGCCGGCCGTGCTGGTCCACCGGCTCGCTGCGCTTGTCCTTCTCCGAGGGCTGAATGTTTGCGGTCCTGCTTGTCCC] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_2324#0 CCGCCCACGCGTCCGCTCTTTTCTTTTTAATCCACTTCCAACTGCGTTACGTCCTTCCAT 60 consensus_2324#1 CCGCCTTTCCCTCCTTTCCCTCCTTTCC--CTCCTTTCCCTCCTTTTCACGATCACGCTC 58 ***** * *** ** * **** * **** * * *** * * consensus_2324#0 CTATGGATGGTTTAGGTATCCGGGACGTGATGAGCGCGAACGAAGTGTCGGTAGCTACGG 120 consensus_2324#1 CTTCTCACGCTCCT--TCTCACGTTCCTTCT---CGCGCTCCTTCTCGCGCTCCTTCTCA 113 ** * * * * ** * * * * **** * * ** * * consensus_2324#0 AGGTGCCAAGCAATCGGCGGACTTTGGCGAAGGAGGGGAGCATCATATGCAGCATCCGAA 180 consensus_2324#1 CGCTCCT-----TCTCGCGTTCTTTTTCCCGCTCGCG----ATCCTTCTCCATGTCGCGG 164 * * * *** **** * * * *** * * ** consensus_2324#0 CGTACCGCCTGGCGGCGAGCAACGGCACAGAA-CAAGCCGACA-GTCCAGCCGGCAATCT 238 consensus_2324#1 TCCTTTTCCTTGTCGCGATCCTTTTCCCGCTCTCGATCCTTCTCACCCCGCTCGCGATCC 224 *** * **** * * * * * ** * ** ** ** *** consensus_2324#0 TCTCCGATGGGTGGTGCTCATCAGCAAGGCGTCGGA-CATCAAGATCCTGCGCAGCGTGG 297 consensus_2324#1 TTTTCCTTG--TCGCGTTCCTTTTCTCTGTCCCGCAGCCTTTCCTTCTCGCGCTCCTTTT 282 * * * ** * * * ** * * * ** * * * ** **** * * consensus_2324#0 TAGGGAGGGTGAGTGGCCAGAACACACTGACGATCCCGCCTACCACCACCAACACCATCA 357 consensus_2324#1 CGCGTACCTTTTCCCGCTCCCGCTCCTTCTCCCGCTCGCGCTCCTTTTCCTTCTCCTTTT 342 * * * ** * * * * * *** ** ** * ** * consensus_2324#0 GCAACAGCAACAGCATCACGCTGATC-GGCCGAG-TCCCGAG--TCGAAGGGCGCCCGCG 413 consensus_2324#1 CGCGCTCCTTCTCCTTCCTTCGGTCCCGGTCGCGATCATGATGTTCGGCGTGATCGCCCC 402 * * * * ** * * * ** ** * ** ** *** * * * * * consensus_2324#0 GTACGTCCGAACAGCGGCCAGCGT-CAATGGCCAGCGGTAGTCACGGTCGGGGAAGATCA 472 consensus_2324#1 GCTCCTTCTCCTTGTTGCGATCCTTCTCCCGCTCACGGTC-CCGCTGCCGGTCTCGATCG 461 * * * * * ** * * * * ** **** * * * *** **** consensus_2324#0 CGTTCGCGCGACCGCAAGCGCCCTCCCCCGCACCGGGGCAGGTCAGGACGGGTCTGATCG 532 consensus_2324#1 CGCTCCCGC--TCGCGATCACGCTGGTGATCACCTCCGC-GCTCATTCTCGCCCCGTTCC 518 ** ** *** *** * * * ** **** ** * *** * * * ** consensus_2324#0 GGATGGTGCGGACCGCAGAAGGCACCGATCGAAA-CGTTCCGAGTCGGCGGAGCGGCACG 591 consensus_2324#1 ---TTGCCCCGCTC-CCGATGATGATGGTCACGCTCGTCTCCTCCCCGCCGGCCGTGCTG 574 * * * * * * ** * * ** *** * * ** * ** * consensus_2324#0 AACGATCGAACCGAGGCTCCCGTTCGGCTGGGCGGCGGCGGTGAACATGAGCGGGACAAG 651 consensus_2324#1 GTCCACCGGCTCGCTGCGCTTGTCCTTCTCCGAGG----GCTGAATGTTTGCGGTCCTGC 630 * * ** ** ** * ** * ** * ** * **** * **** * consensus_2324#0 CAGGACCGCAAACATCAGCCCTCGGAGAA 680 consensus_2324#1 TTGTCCC---------------------- 637 * ** |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||