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Anopheles gambiae
cluster # 2356 cluster # 2356       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2356#0 length = 1529 sequences # 2  

consensusID : consensus_2356#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1529
fasta sequence
                              [TCTACCCTAATTATATTCCTATTTGTATAGCATTAGATCTTCTACACACTTATCGAATAAAGAAGAAGTAGTCTGCAAGGACAAATCATGTCGTTATGTCTTCTCCCACATCCTCCAGTCAAGTTATGGTTGTAGTTTAATGATGCGATTGAATGCCCTGACCCATCTGTTGCTGCTGCAGTTGTTGCTGTAACGCAACGTTTTGATTACCCACAACGCCTACAACCTGCTGGGGCTGTTGTGGTCCCGCCGCCGTACCTGGTGCTGCCTGTCCCGATGCAACAACTCCCTGCGTTGCGCCGGGTGCACCAGCAGCTACACCGCCCGGGGAAGGACCAACCCCAGGTCCAGCTCCTGCCACTCCCTGGCCGGTGGCCGTTGCAGCACCGCCAGCACCACCACCACCACCACCAGCAGCATATTCTTTCTGATCGACGCCAATCTCCTCCACATTCAGGCGCGTAATGAACCGCAGCCGCATCTGCAGCGCCGGTCGCAGCCGGCGAAATGATCGCTTCCAGCTCCGTCTTCATCGTATCGCCCACGAACATGTACTTGATGTGGTACAGCAAATCGCAAATCGGATCCATGTAGCGCAGGGCTTGTTGCGGGCTGCGCCTTGTCCACCTGTTCCAGCAGCTCGTACAGCATGAGCGTGATGTCCGCCACTGCGCGGGCCCGCTCGATGCTTAGCCGGTGCAGGAACGGCCCGACCACGTGGCAAAGGTAGATCAGCTGATACTCGGTGTGTACCAGTGGCTTCAACTTTTCCTTGATTGAGTCGGTAATCGTTGCCAGCTGCCCTATTCCAAAGTGGTGGAATATGCTGTGCACGATCGCCAGCACCGTCACGTAGCTCCGGTCGAGCATTGCCTCCTTCACGATCTTAAAGTTGAACATATCGAACGGGCTCTGCCGGTAGGTCCAGTCCTTCATCGCCTTCGAGCTGAGCGCTTCCTGCATCCGCTCGTAGATTACGCTCCAGTACGCCTCGGGCAGGGCGGCCATTATCAGCCCGATCGTGTTGGCCCAGTTGTGTATCACGCCGTTCGGCACGACCGGGTAGCCCTTGACCAGCACGTCGATGATGCTGTTGGCGACCACGCTCGGTGTAACCGGCAGCCCGAGCAGCTCGACGCACGTCACGTACAGGGCGTGGGCCGGCGGGTTCGGGAACTCGTTGAACCGCCAGTCGGTGCCTGCAAATATATTCTTCCCATCCATAGTGTCTTGCATGCGACGGACAAGATTGATGTAGTAGCTCAGCTCCGGCACCCAGTTCACGTTGTCCGACTCTTTCGTCATCATGTACGCCTGGTAGGCTTCGGTAAGGGCCCAATTCTCCGGTCGTACGTCTTTCAGCGATCCAACAACCGTGCCAACCAAACGCTTCTTCAACTGTGGCCGATCGCGCCAGTTACGCTCGTAATAGTGCAGCGTGTTGTACAGGTAGGTAATGGGACGATCGTGAAACTTGTACAGCGACCCCAAATGGTCCAGTATCACGTCGAGCGTTTTGCTCAGCTGTG]

[+] EMBL CNS09RAU             [TCTACCCTAATTATATTCCTATTTGTATAGCATTAGATCTTCTACACACTTATCGAATAAAGAAGAAGTAGTCTGCAAGGACAAATCATGTCGTTATGTCTTCTCCCACATCCTCCAGTCAAGTTATGGTTGTAGTTTAATGATGCGATTGAATGCCCTGACCCATCTGTTGCTGCTGCAGTTGTTGCTGTAACGCAACGTTTTGATTACCCACAACGCCTACAACCTGCTGGGGCTGTTGTGGTCCCGCCGCCGTACCTGGTGCTGCCTGTCCCGATGCAACAACTCCCTGCGTTGCGCCGGGTGCACCAGCAGCTACACCGCCCGGGGAAGGACCAACCCCAGGTCCAGCTCCTGCCACTCCCTGGCCGGTGGCCGTTGCAGCACCGCCAGCACCACCACCACCACCACCAGCAGCATATTCTTTCTGATCGACGCCAATCTCCTCCACATTCAGGCGCGTAATGAACCGCAGCCGCATCTGCAGCGCCGGTCGCAGCCGGCGAAATGATCGCTTCCAGCTCCGTCTTCATCGTATCGCCCACGAACATGTACTTGATGTGGTACAGCAAATCGCAAATCGGATCCATGTAGCGCAGGGCTTGTTGCGGGCTGCGCCTTGTCCACCTGTTCCAGCAGCTCGTACAGCATGAGCGTGATGTCCGCCACTGCGCGGGCCCGCTCGATGCTTAGCCGGTGCAGGAACGGCCCGACCACGTGGCAAAGGTAGATCAGCTGATACTCGGTGTGTACCAGTGGCTTCAACTTTTCCTTGATTGAGTCGGTAATCGTTGCCAGCTGCCCTATTCCAAAGTGGTGGAATATGCTGTGCACGATCGCCAGCACCGTCACGTAGCTCCGGTCGAGCATTGCCTCCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CNS09RAT             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATTCCAAAGTGGTGGAATATGCTGTGCACGATCGCCAGCACCGTCACGTAGCTCCGGTCGAGCATTGCCTCCTTCACGATCTTAAAGTTGAACATATCGAACGGGCTCTGCCGGTAGGTCCAGTCCTTCATCGCCTTCGAGCTGAGCGCTTCCTGCATCCGCTCGTAGATTACGCTCCAGTACGCCTCGGGCAGGGCGGCCATTATCAGCCCGATCGTGTTGGCCCAGTTGTGTATCACGCCGTTCGGCACGACCGGGTAGCCCTTGACCAGCACGTCGATGATGCTGTTGGCGACCACGCTCGGTGTAACCGGCAGCCCGAGCAGCTCGACGCACGTCACGTACAGGGCGTGGGCCGGCGGGTTCGGGAACTCGTTGAACCGCCAGTCGGTGCCTGCAAATATATTCTTCCCATCCATAGTGTCTTGCATGCGACGGACAAGATTGATGTAGTAGCTCAGCTCCGGCACCCAGTTCACGTTGTCCGACTCTTTCGTCATCATGTACGCCTGGTAGGCTTCGGTAAGGGCCCAATTCTCCGGTCGTACGTCTTTCAGCGATCCAACAACCGTGCCAACCAAACGCTTCTTCAACTGTGGCCGATCGCGCCAGTTACGCTCGTAATAGTGCAGCGTGTTGTACAGGTAGGTAATGGGACGATCGTGAAACTTGTACAGCGACCCCAAATGGTCCAGTATCACGTCGAGCGTTTTGCTCAGCTGTG]


>consensus_2356#0 TCTACCCTAATTATATTCCTATTTGTATAGCATTAGATCTTCTACACACTTATCGAATAA AGAAGAAGTAGTCTGCAAGGACAAATCATGTCGTTATGTCTTCTCCCACATCCTCCAGTC AAGTTATGGTTGTAGTTTAATGATGCGATTGAATGCCCTGACCCATCTGTTGCTGCTGCA GTTGTTGCTGTAACGCAACGTTTTGATTACCCACAACGCCTACAACCTGCTGGGGCTGTT GTGGTCCCGCCGCCGTACCTGGTGCTGCCTGTCCCGATGCAACAACTCCCTGCGTTGCGC CGGGTGCACCAGCAGCTACACCGCCCGGGGAAGGACCAACCCCAGGTCCAGCTCCTGCCA CTCCCTGGCCGGTGGCCGTTGCAGCACCGCCAGCACCACCACCACCACCACCAGCAGCAT ATTCTTTCTGATCGACGCCAATCTCCTCCACATTCAGGCGCGTAATGAACCGCAGCCGCA TCTGCAGCGCCGGTCGCAGCCGGCGAAATGATCGCTTCCAGCTCCGTCTTCATCGTATCG CCCACGAACATGTACTTGATGTGGTACAGCAAATCGCAAATCGGATCCATGTAGCGCAGG GCTTGTTGCGGGCTGCGCCTTGTCCACCTGTTCCAGCAGCTCGTACAGCATGAGCGTGAT GTCCGCCACTGCGCGGGCCCGCTCGATGCTTAGCCGGTGCAGGAACGGCCCGACCACGTG GCAAAGGTAGATCAGCTGATACTCGGTGTGTACCAGTGGCTTCAACTTTTCCTTGATTGA GTCGGTAATCGTTGCCAGCTGCCCTATTCCAAAGTGGTGGAATATGCTGTGCACGATCGC CAGCACCGTCACGTAGCTCCGGTCGAGCATTGCCTCCTTCACGATCTTAAAGTTGAACAT ATCGAACGGGCTCTGCCGGTAGGTCCAGTCCTTCATCGCCTTCGAGCTGAGCGCTTCCTG CATCCGCTCGTAGATTACGCTCCAGTACGCCTCGGGCAGGGCGGCCATTATCAGCCCGAT CGTGTTGGCCCAGTTGTGTATCACGCCGTTCGGCACGACCGGGTAGCCCTTGACCAGCAC GTCGATGATGCTGTTGGCGACCACGCTCGGTGTAACCGGCAGCCCGAGCAGCTCGACGCA CGTCACGTACAGGGCGTGGGCCGGCGGGTTCGGGAACTCGTTGAACCGCCAGTCGGTGCC TGCAAATATATTCTTCCCATCCATAGTGTCTTGCATGCGACGGACAAGATTGATGTAGTA GCTCAGCTCCGGCACCCAGTTCACGTTGTCCGACTCTTTCGTCATCATGTACGCCTGGTA GGCTTCGGTAAGGGCCCAATTCTCCGGTCGTACGTCTTTCAGCGATCCAACAACCGTGCC AACCAAACGCTTCTTCAACTGTGGCCGATCGCGCCAGTTACGCTCGTAATAGTGCAGCGT GTTGTACAGGTAGGTAATGGGACGATCGTGAAACTTGTACAGCGACCCCAAATGGTCCAG TATCACGTCGAGCGTTTTGCTCAGCTGTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)