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Anopheles gambiae
cluster # 3213 cluster # 3213       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3213#0 length = 1439 sequences # 3  

consensusID : consensus_3213#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1439
fasta sequence
                              [GATGTTTTCTTCTTTATTTGATGTTAAGTTTTCATGCTTGAAGTTGTTATTATTTTTTGCAAGGAAGTTGTTCAATCTTGCAGCACACAGAAGATAATCGTGTTGGTTTTTCTTTGGTCTATATGCATTAACCGTCATATATAACTTGAAGTCTTCACATGCCTAACCTTCCGGCCAAACGACGGCGTTCGATGGCAACTGGTGCAAGGAACGCGTGTTTCGCGCGGGGATTCTACAGATCTCTGCTCCATCTATGCTTAAACAAACCAGTTTTGGGCACACGCTCCCAATCAAGAGAAAATCGCGTACTGTAAACCCCTGCCGTCCGATGGTGAGATGTTTTAGTATTCGAATCTACCAGATGGAACGTAGATGGATAGAAGTTGATTTAGACACGGCGCGATTTGAGGTTTCCTCTTAAAATGGGTGGTGCTTTTTTGGCTTTGCTGTTATTGTTTTGGTGCTGCGTGTACCTTCGCTACCATTTTCCGTTGCTATATTCCTGGATGTGTTTCAGTTGTTCATTGCCGTTCATATTGTATTGTAATAGTGTGCTGTCGTTCAGGATACACAGCCGCTCGCAGGATGGTAGGATCGAGCAACGGTGCATCCTGACGGGGGTACACACAACGTCTTAGCTTATCTAAGCATAAATGTCTAAAATGGTGGTGGTGGTGGTCTCTTGCCTCTACTCTATGGGTGGATGTGCCGAAGATGCTGATGTTGATCTTTTGAGCTGATGATGGGTATTAGTTGTTGGTGGAACAAAAATTTATTCCGGAATTGGGCCGTACAGGTAGATGGCCGGGCACTTGGCGTTCTCGTTGCCCATGAACTGCGCGTACAGCTCCTGGTATCTCTCCAGGGTGATGCCACCCTTCTTGTTGTCCTCCTCGCTGACCAGGTTGTTGTAGGAATCATCGACCAGCTTGATGTCATCAACAGCCAGACGGGTGATGCAGTTGTAACGGTACTCCTCTATGCTGACCAGACCGTCGTTGTTGATGTCCATCATCTTGTAGTGGGCATCAATGAAGGCCTTCATCGCCTTCGGGAATTCGGAGTAGGGCTTGCCAACGCAGGTCTGCTTGACGGCCTGTTTGAATTCGTCGGTGGTGATTTTGCCATCCTTATCGAAATCGGCAAGGGCGGAGATCTCATCCCAGAGCGACTTCATGATGAACTTGTATTCGTTCAGACGGGCCGGGTTGATTTCGCCCTTGCCTTCGATGACGGTGGCACGGAGGGCCATGCACTGGAAATCGTTGTTGTCCAGGAAGCCATTGTTGTCAATGTCATACATGTGACGGACGATGAATTCGACGCGCTGATCCCACGAGTAGCTCATTTTGATTTTGGTTTTGTGTTTGGAATTTAGATCCTAATCTGAAACTAATTGTCTAAACCAACTTCCGTCGAAGACTAAAACAATTTCCAGT]

[+] EMBL CNS09K3W             [GATGTTTTCTTCTTTATTTGATGTTAAGTTTTCATGCTTGAAGTTGTTATTATTTTTTGCAAGGAAGTTGTTCAATCTTGCAGCACACAGAAGATAATCGTGTTGGTTTTTCTTTGGTCTATATGCATTAACCGTCATATATAACTTGAAGTCTTCACATGCCTAACCTTCCGGCCAAACGACGGCGTTCGATGGCAACTGGTGCAAGGAACGCGTGTTTCGCGCGGGGATTCTACAGATCTCTGCTCCATCTATGCTTAAACAAACCAGTTTTGGGCACACGCTCCCAATCAAGAGAAAATCGCGTACTGTAAACCCCTGCCGTCCGATGGTGAGATGTTTTAGTATTCGAATCTACCAGATGGAACGTAGATGGATAGAAGTTGATTTAGACACGGCGCGATTTGAGGTTTCCTCTTAAAATGGGTGGTGCTTTTTTGGCTTTGCTGTTATTGTTTTGGTGCTGCGTGTACCTTCGCTACCATTTTCCGTTGCTATATTCCTGGATGTGTTTCAGTTGTTCATTGCCGTTCATATTGTATTGTAATAGTGTGCTGTCGTTCAGGATACACAGCCGCTCGCAGGATGGTAGGATCGAGCAACGGTGCATCCTGACGGGGGTACACACAACGTCTTAGCTTATCTAAGCATAAATGTCTAAAATGGTGGTGGTGGTGGTCTCTTGCCTCTACTCTATGGGTGGATGTGCCGAAGATGCTGATGTTGATCTTTTGAGCTGATGATGGGTATTAGTTGTTGGTGGAACAAAAATTTATTCCGGAATTGGGCCGTACAGGTAGATGGCCGGGCACTTGGCGTTCTCGTTGCCCATGAACTGCGCGTACAGCTCCTGGTATCTCTCCAGGGTGATGCCACCCTTCTTGTTGTCCTCCTCGCTGACCAGGTTGTTGTAGGAATCATCGACCAGCTTGATGTCATCAACAGCCAGACGGGTGATGCAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CNS09MJT             [         TTCTTTATTTGATG TAAG TTTCATGCTTGAAGTTGTAATTATTTTTTGCAAGGAAGTTGTTCAATCTTGCAGCACACAGAAGATAATCGTGTTGGTTTTTCTTTGGTCTATATGCATTAACCGTCATATATAACTTGAAGTCTTCACATGCCTAACCTTCCGGCCAAACGACGGCGTTCGATGGCAACTGGTGCAAGGAACGCGTGTTTCGCGCGGGGATTCTACAGATCTCCGCTCCATCTATTCTTAAACAAACCATTTTTTTTCACACTCTCCCAAACAAtata                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CNS094FU             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCAGGATACACAGCCGCTCGCAGGATGGTAGGATCGAGCATTTTTGCATCCTGACGGGGGTACACACAACGTCTTAGCTTATCTAAGCATAAATGTCTAAAATGGTGGTGGTGGTGGTCTCTTGCCTCTACTCTATGGGTGGATGTGCCGAAGATGCTGATGTTGATCTTTTGAGCTGATGATGGGTATTAGTTGTTGGTGGAACAAAAATTTATTCCGGAATTGGGCCGTACAGGTAGATGGCCGGGCACTTGGCGTTCTCGTTGCCCATGAACTGCGCGTACAGCTCCTGGTATCTCTCCAGGGTGATGCCACCCTTCTTGTTGTCCTCCTCGCTGACCAGGTTGTTGTAGGAATCATCGACCAGCTTGATGTCATCAACAGCCAGACGGGTGATGCAGTTGTAACGGTACTCCTCTATGCTGACCAGACCGTCGTTGTTGATGTCCATCATCTTGTAGTGGGCATCAATGAAGGCCTTCATCGCCTTCGGGAATTCGGAGTAGGGCTTGCCAACGCAGGTCTGCTTGACGGCCTGTTTGAATTCGTCGGTGGTGATTTTGCCATCCTTATCGAAATCGGCAAGGGCGGAGATCTCATCCCAGAGCGACTTCATGATGAACTTGTATTCGTTCAGACGGGCCGGGTTGATTTCGCCCTTGCCTTCGATGACGGTGGCACGGAGGGCCATGCACTGGAAATCGTTGTTGTCCAGGAAGCCATTGTTGTCAATGTCATACATGTGACGGACGATGAATTCGACGCGCTGATCCCACGAGTAGCTCATTTTGATTTTGGTTTTGTGTTTGGAATTTAGATCCTAATCTGAAACTAATTGTCTAAACCAACTTCCGTCGAAGACTAAAACAATTTCCAGT]


>consensus_3213#0 GATGTTTTCTTCTTTATTTGATGTTAAGTTTTCATGCTTGAAGTTGTTATTATTTTTTGC AAGGAAGTTGTTCAATCTTGCAGCACACAGAAGATAATCGTGTTGGTTTTTCTTTGGTCT ATATGCATTAACCGTCATATATAACTTGAAGTCTTCACATGCCTAACCTTCCGGCCAAAC GACGGCGTTCGATGGCAACTGGTGCAAGGAACGCGTGTTTCGCGCGGGGATTCTACAGAT CTCTGCTCCATCTATGCTTAAACAAACCAGTTTTGGGCACACGCTCCCAATCAAGAGAAA ATCGCGTACTGTAAACCCCTGCCGTCCGATGGTGAGATGTTTTAGTATTCGAATCTACCA GATGGAACGTAGATGGATAGAAGTTGATTTAGACACGGCGCGATTTGAGGTTTCCTCTTA AAATGGGTGGTGCTTTTTTGGCTTTGCTGTTATTGTTTTGGTGCTGCGTGTACCTTCGCT ACCATTTTCCGTTGCTATATTCCTGGATGTGTTTCAGTTGTTCATTGCCGTTCATATTGT ATTGTAATAGTGTGCTGTCGTTCAGGATACACAGCCGCTCGCAGGATGGTAGGATCGAGC AACGGTGCATCCTGACGGGGGTACACACAACGTCTTAGCTTATCTAAGCATAAATGTCTA AAATGGTGGTGGTGGTGGTCTCTTGCCTCTACTCTATGGGTGGATGTGCCGAAGATGCTG ATGTTGATCTTTTGAGCTGATGATGGGTATTAGTTGTTGGTGGAACAAAAATTTATTCCG GAATTGGGCCGTACAGGTAGATGGCCGGGCACTTGGCGTTCTCGTTGCCCATGAACTGCG CGTACAGCTCCTGGTATCTCTCCAGGGTGATGCCACCCTTCTTGTTGTCCTCCTCGCTGA CCAGGTTGTTGTAGGAATCATCGACCAGCTTGATGTCATCAACAGCCAGACGGGTGATGC AGTTGTAACGGTACTCCTCTATGCTGACCAGACCGTCGTTGTTGATGTCCATCATCTTGT AGTGGGCATCAATGAAGGCCTTCATCGCCTTCGGGAATTCGGAGTAGGGCTTGCCAACGC AGGTCTGCTTGACGGCCTGTTTGAATTCGTCGGTGGTGATTTTGCCATCCTTATCGAAAT CGGCAAGGGCGGAGATCTCATCCCAGAGCGACTTCATGATGAACTTGTATTCGTTCAGAC GGGCCGGGTTGATTTCGCCCTTGCCTTCGATGACGGTGGCACGGAGGGCCATGCACTGGA AATCGTTGTTGTCCAGGAAGCCATTGTTGTCAATGTCATACATGTGACGGACGATGAATT CGACGCGCTGATCCCACGAGTAGCTCATTTTGATTTTGGTTTTGTGTTTGGAATTTAGAT CCTAATCTGAAACTAATTGTCTAAACCAACTTCCGTCGAAGACTAAAACAATTTCCAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)