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Anopheles gambiae
cluster # 4029 cluster # 4029       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4029#0 length = 1065 sequences # 3  

consensusID : consensus_4029#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1065
fasta sequence
                              [TTAATGCTTGGTACAATTATTATTACGTCTAAAGCACTAGCTTAACAGTAGGCCCCGACAGTTACGCTCCGCCGTGTAATATTTTGTTGTTTTTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTGTCTCCCCCTTTCGGCGTTGCGACGCCCAGTGAATGTGAAGCATGAAATTTGGCCATTTCATTTGTGTATGGAAGCGCCTACCGACGGCCGTGTTTAGCGAACGCATCCTTCTCCTTCCTCCTTCGCCGTTACGTTACGCTTTTATTTTGTGTTAATTTATGTTTGCGATGTAATTCCCTTCGCCTATCCCGTCGGACTTCCTTCCCAGCGGGTGAACGTGGGGAAGGATTTGGTGTCTTTCCTTTCCTTTCTTCTACCTCCTCTATTTGGCGTAACCGTCCTACGCGAACATGCCGGCGGACACGACTGTACCACCGGACCGCCCCCTCCGTAATTCCTTTCCTTTTTTACCTTCACTTAATCGCTAGCAGTGCCTTAACCTACTTAACACAAAAAAAAGAGCTGATTCGGTGAACAAATCCTAAGCAAAGGAACTGCTGTTGCGGGTGCAA-CAGCGCACCTTCCATGGAGAGGGAGATAAAATGCTAAACATAAGATGAATTAAAAATGAAAACAAACA-CCGCGCGTAAGCGTTCTAAATCGAACTGAAACTCTGCGCGCTAGAAGTTTCAGCGAGCCTTAATGTTGTATTTTCTTGTTCATTTACCCATTTGTGTGTTTAATTCCGATACGTATAGGGTTTCTATTTCTTTGTGTAATTATAATATTACCGGCGCGTTATATATATAAATATGAATCGTGCACGGATAGCTGACGTTGATGGTGCTGTTCCCATCAACGTACAAACAATATAAAAGTATGTATATTAAACTAGCGTAGTTGAATTAACACGTGTGAGCGATTGCACGCACAACGGGGGGGCGTATGAATGGATGTAAATGCGTAATAAAGCATCAACAAAAAACTACAATCGTCAGTTGGAAAAATAAACGGCCAGCCGAACGGGGGAAAGGGAATGCAAAGTACAAACCGGGA]

[+] EMBL CNS08ZA4             [TTAATGCTTGGTACAATTATTATTACGTCTAAAGCACTAGCTTAACAGTAGGCCCCGACAGTTACGCTCCGCCGTGTAATATTTTGTTGTTTTTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTGTCTCCCCCTTTCGGCGTTGCGACGCCCAGTGAATGTGAAGCATGAAATTTGGCCATTTCATTTGTGTATGGAAGCGCCTACCGACGGCCGTGTTTAGCGAACGCATCCTTCTCCTTCCTCCTTCGCCGTTACGTTACGCTTTTATTTTGTGTTAATTTATGTTTGCGATGTAATTCCCTTCGCCTATCCCGTCGGACTTCCTTCCCAGCGGGTGAACGTGGGGAAGGATTTGGTGTCTTTCCTTTCCTTTCTTCTACCTCCTCTATTTGGCGTAACCGTCCTACGCGAACATGCCGGCGGACACGACTGTACCACCGGACCGCCCCCTCCGTAATTCCTTTCCTTTTTTACCTTCACTTAATCGCTAGCAGTGCCTTAACCTACTTAACACAAAAAAAAGAGCTGATTCGGTGAACAAATCCTAAGCAAAGGAACTGCTGTTGCGGGTGCAA CAGCGCACCTTCCATGGAGAGGGAGATAAAATGCTAAACATAAGATGAATTAAAAATGAAAACAAACA CCGCGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CNS08IOU             [                                                 AGGCCCCGACAGTTACGCTCCGCCGTGTAATATTTTGTTGTTTTTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CNS08ZA3             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTCCTTTTTTACCTTCACTTAATCGCTAGCAGTGCCTTAACCTACTTAACACAAAAAAAAGAGCTGATTCGGTGAACAAATCCTAAGCAAAGGAACTGCTGTTGCGGGTGCAACCAGCGCAGCCTCCATGGAGAGGGAGATAAAATGCTAAACATAAGATGAATTAAAAATGAAGACAAACACCCGCGCGTAAGCGTTCTAAATCGAACTGAAACTCTGCGCGCTAGAAGTTTCAGCGAGCCTTAATGTTGTATTTTCTTGTTCATTTACCCATTTGTGTGTTTAATTCCGATACGTATAGGGTTTCTATTTCTTTGTGTAATTATAATATTACCGGCGCGTTATATATATAAATATGAATCGTGCACGGATAGCTGACGTTGATGGTGCTGTTCCCATCAACGTACAAACAATATAAAAGTATGTATATTAAACTAGCGTAGTTGAATTAACACGTGTGAGCGATTGCACGCACAACGGGGGGGCGTATGAATGGATGTAAATGCGTAATAAAGCATCAACAAAAAACTACAATCGTCAGTTGGAAAAATAAACGGCCAGCCGAACGGGGGAAAGGGAATGCAAAGTACAAACCGGGA]


>consensus_4029#0 TTAATGCTTGGTACAATTATTATTACGTCTAAAGCACTAGCTTAACAGTAGGCCCCGACA GTTACGCTCCGCCGTGTAATATTTTGTTGTTTTTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT CTCGCTCTGTCTCCCCCTTTCGGCGTTGCGACGCCCAGTGAATGTGAAGCATGAAATTTG GCCATTTCATTTGTGTATGGAAGCGCCTACCGACGGCCGTGTTTAGCGAACGCATCCTTC TCCTTCCTCCTTCGCCGTTACGTTACGCTTTTATTTTGTGTTAATTTATGTTTGCGATGT AATTCCCTTCGCCTATCCCGTCGGACTTCCTTCCCAGCGGGTGAACGTGGGGAAGGATTT GGTGTCTTTCCTTTCCTTTCTTCTACCTCCTCTATTTGGCGTAACCGTCCTACGCGAACA TGCCGGCGGACACGACTGTACCACCGGACCGCCCCCTCCGTAATTCCTTTCCTTTTTTAC CTTCACTTAATCGCTAGCAGTGCCTTAACCTACTTAACACAAAAAAAAGAGCTGATTCGG TGAACAAATCCTAAGCAAAGGAACTGCTGTTGCGGGTGCAACAGCGCACCTTCCATGGAG AGGGAGATAAAATGCTAAACATAAGATGAATTAAAAATGAAAACAAACACCGCGCGTAAG CGTTCTAAATCGAACTGAAACTCTGCGCGCTAGAAGTTTCAGCGAGCCTTAATGTTGTAT TTTCTTGTTCATTTACCCATTTGTGTGTTTAATTCCGATACGTATAGGGTTTCTATTTCT TTGTGTAATTATAATATTACCGGCGCGTTATATATATAAATATGAATCGTGCACGGATAG CTGACGTTGATGGTGCTGTTCCCATCAACGTACAAACAATATAAAAGTATGTATATTAAA CTAGCGTAGTTGAATTAACACGTGTGAGCGATTGCACGCACAACGGGGGGGCGTATGAAT GGATGTAAATGCGTAATAAAGCATCAACAAAAAACTACAATCGTCAGTTGGAAAAATAAA CGGCCAGCCGAACGGGGGAAAGGGAATGCAAAGTACAAACCGGGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)