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Anopheles gambiae
cluster # 4045 cluster # 4045       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4045#0 length = 980 sequences # 3  

consensusID : consensus_4045#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 980
fasta sequence
                              [CCGAAAAAAGTGAACATACATACTGAACATACAGACGTACACAAAGCAACACAGCAGCGCAGATTGTCTTCAAAACATGGGTGCCAAGTGAGTTGTGTGGTGAGGTGTCGCAAGTAAACAATTAAAACAAAACAAACCCAAGCTATACACTGTACAGAACACACACACACACACCATCGGCGCCATTTTTTCATTTGATTAGCGGATAGATGGTAGTATACATAGCTCAACACTTGTAGGGACCGGTAAGGACACAGTCAAAAGAAGCAGCAGCA--A-CAGTAA----AAG-GCATCGTAAGAAACAAAACGTTTAAGTTACATTAATTAAGTAT-GTTTTTAGTTTTTAAAGTACTATCTGTATTATTCTTCGGA-TTA-GCAGTTTTAAATCTAAATTTATGCCGTGTTTAGGGGCGCTGAAATTAACGAACCCTTATGCTAATTAACTACTATATGAATGTGGCAGTTGCG--TATAAGTATTGCGCGGATCTATTGCTTTCTTTAGTTTGTGCTTTCCGTTCGTATTCTTTTCACTTTCGTCCACTTGGTCAGGACGTTTTACAGTTTCCATTTTGTTTCTCAGTGAAATGATAGTGTAAGACTAGGCCGATAGGTTTGTTAGCGTGTTGTTGTGATAGTGCTAAATATTACTCGCCTACCCCTCCCCCCTATCTGCCATCCCTCCTTCAACGCTTTACTCTCGCTCTGTCCCTCCCTTCTTGCAAGTGCTGCTGTTGTCAAAAGGTAGATTAACTAAATTCAAGTTTGTTTGTGTTGCGATTGTCGTATGAAAAGTAGCCCTCAGCTATGAACAATGATAATGGATTACAAAGGAAGTAAAAGAAAACAAACACTACACAAAACGACAGCGACAAACGCCACCAAACACACACACATTTCTCGTATAGGATTGTAAAGGGAGGGGAGTAAGCTGTAAAAGTCATAAAAGACATGTTATATTGTAGCGTTGGAGTCGATGGAGTTGGG]

[+] EMBL BM645916             [CCGAAAAAAGTGAACATACATACTGAACATACAGACGTACACAAAGCAACACAGCAGCGCAGATTGTCTTCAAAACATGGGTGCCAAGTGAGTTGTGTGGTGAGGTGTCGCAAGTAAACAATTAAAACAAAACAAACCCAAGCTATACACTGTACAGAACACACACACACACACCATCGGCGCCATTTTTTCATTTGATTAGCGGATAGATGGTAGTATACATAGCTCAACACTTGTAGGGACCGGTAAGGACACAGTCAAAAGAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGTAAGAGCATTGTAAGAAACAAAACGTTTAAGTTACATTAATTAAGTAT GTTTTTAGTTTTTAAAGTACTATCTGTATTATTCTTCGGATTTAGGCAGTTTTAAATCTAAATTTATGCCGTGTTTTGGGGCGCTGAAATTAACGAACCCTTATGCTAATTAACTACTATATGAATGTGGCAGTTGCGTATATAAGTATTGCGCGGATCTATTGCTTTCTTTAGTTTGTGCTTTCCGTTCGTATTCTTTTCACTTTCGTCCACTTGGTCAGGACGTTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BX606938             [                                                                                                                                                                                                        AGCGGATAGATGGTAGTATACATAGCTCAACACTGGTAGGGATCGGTAAGGACACAGTCAAAAGAAGCAGCAGCA  A CAGTAA    GA  GCATCGTAAGAAACAAAACGTTTAAGTTACATAAAATAAGTAT GTTTTTAGTTTTTAAAGTACTGTCTGTATTATTCTTCGGA TTA GCAGTTTTAAATCTAAATTTATGCCGTGTTTAGGGGCGCTGAAATGAACGAACCCTTATGCTAATTAACTACTATATGAATGTGGCAGTTGCG  TACAAGTATTGCGCGGATCTATTGCTTTCTTTAGTTTGTGCTTTCCGTTCGTATTCTTTTCACTTTCGTCCACTTGGTCAGGACTTTTTACAGTTTCCATTTTGTTTCTCAGTGAAATGATAGTGTAAGACTAGGCCGATAGGTTTGTTAGCGTGTTGTTGTGATAGTGCTAAATATTACTCGCCTACCCCTCCCCCCTATCTGCCATCCCTCCTTCAACGCTTTACTCTCGCTCTGTCCCTCCCTTCTTGCAAGTGCTGCTGTTGTCAAAAGGTAGATTAACTAAATTCAAGTTTGTTTGTGTTGCGATTGTCGTATGAAAAGTAGCCCTCAGCTATGAACAATGATAATGGATTACAAAGGAAGTAAAAGAAAACAAACACTAC                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BX622030             [                                                                                                                                                                                                                                                                                GCA  A CAGTAA    AAG GCATCGTAAGCAACAAAACGTTAAAGTTACATTAATTAAGTATCGTTTTTAGTTTTTAAAGTACTATCTGTATTATTCTTCGGA TTA GCAGTTTTAAATCTAAATTTATGCCGTGTTTAGGGGCGCTGAATTTAACGAACCCTTATGCTAATTAACTACTATATGAATGTGGCAGTTGCG  TATAAGTATTGCGCGGATCTATTGCTTTCTTTAGTTTGTGCTTTCCGTTCGTATTCTTTTCACTTTGGTCCACTTTGTCAGGACGTTTTACGGTTTCCATTTTGTTTCTCAGTGAAATGATAGTGTAAGACTAGGCCGATAGGTTTGTTAGCGTGTTGTTGTGATAGTGCTAAATATTACTCGCCTACCCCTCCCCCCTATCTGCCATCCCCCCTTCAACGCTTTACTCTCGCTCTGTCCCTCCCTTCTTGCAAGTGCTGCTGTTTTCAAAAGGTATATTAACTAAATTCAAGTTTGTTTGTGTTGCGATTGTCGTATGAAAAGTAGCCCTCAGCTATGAACAATGATAATGGATTACAAAGGAAGTAAAAGAAAACAAACACTACACAAAACGACAGCGACAAACGCCACCAAACACACACACATTTCTCGTATAGGATTGTAAAGGGAGGGGAGTAAGCTGTAAAAGTCATAAAAGACATGTTATATTGTAGCGTTGGAGTCGATGGAGTTGGG]


>consensus_4045#0 CCGAAAAAAGTGAACATACATACTGAACATACAGACGTACACAAAGCAACACAGCAGCGC AGATTGTCTTCAAAACATGGGTGCCAAGTGAGTTGTGTGGTGAGGTGTCGCAAGTAAACA ATTAAAACAAAACAAACCCAAGCTATACACTGTACAGAACACACACACACACACCATCGG CGCCATTTTTTCATTTGATTAGCGGATAGATGGTAGTATACATAGCTCAACACTTGTAGG GACCGGTAAGGACACAGTCAAAAGAAGCAGCAGCAACAGTAAAAGGCATCGTAAGAAACA AAACGTTTAAGTTACATTAATTAAGTATGTTTTTAGTTTTTAAAGTACTATCTGTATTAT TCTTCGGATTAGCAGTTTTAAATCTAAATTTATGCCGTGTTTAGGGGCGCTGAAATTAAC GAACCCTTATGCTAATTAACTACTATATGAATGTGGCAGTTGCGTATAAGTATTGCGCGG ATCTATTGCTTTCTTTAGTTTGTGCTTTCCGTTCGTATTCTTTTCACTTTCGTCCACTTG GTCAGGACGTTTTACAGTTTCCATTTTGTTTCTCAGTGAAATGATAGTGTAAGACTAGGC CGATAGGTTTGTTAGCGTGTTGTTGTGATAGTGCTAAATATTACTCGCCTACCCCTCCCC CCTATCTGCCATCCCTCCTTCAACGCTTTACTCTCGCTCTGTCCCTCCCTTCTTGCAAGT GCTGCTGTTGTCAAAAGGTAGATTAACTAAATTCAAGTTTGTTTGTGTTGCGATTGTCGT ATGAAAAGTAGCCCTCAGCTATGAACAATGATAATGGATTACAAAGGAAGTAAAAGAAAA CAAACACTACACAAAACGACAGCGACAAACGCCACCAAACACACACACATTTCTCGTATA GGATTGTAAAGGGAGGGGAGTAAGCTGTAAAAGTCATAAAAGACATGTTATATTGTAGCG TTGGAGTCGATGGAGTTGGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)