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Anopheles gambiae
cluster # 4086 cluster # 4086       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4086#0 length = 974 sequences # 3  

consensusID : consensus_4086#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 974
fasta sequence
                              [TACAATGCAACGCATTGATAATTAATCCGAATTGGTAATTTAATGATAGTCACGTAAGATGATTTAACCAACAAATCCCGTTAATGTCGATACTAAGCTTCGGTTTTTTTTTTAACTTAATTTAATTGCTCTCAATCTGCTTTTCAATAAGCGAAATATTGCGATATTACCATATACATTTTAATGTGAAAATCTAGAGAAGACTAGTTTTTAGCCTAACACACACAAACACACAGAACCTCACACTTGTAAAGTGTGGCAAGGGAAGAACTGATACTGAGTTGTCGATGATCATTTAATGTTCCTTATTTATTAGGCTTTGCGTATGTAAAACACACGTGTGTGTGTAAAAGGGTAGCGTAAACTGAATTGCGTATACTCTGTCACACGCCGAAATGAATATATTCCATGCTCCTCTCCATATAAACCCCTGTGAACCGAATGGTATCGTTAGATATTGCTTTTGCAAACCGTGTTATATAGTCATTTAAGTTTGGGCACGACCTATAAAGCCCCCCCTCTTACCTCCCCGGTTAGGTTATTAGGTTATCCGCATGTCGTGCTCGTGCTGATATTTAATTTCGCCCATAGTGTTTCGCGCAAACAGAGCACGTGCGGTTTGAATAGGATTGCGAATCGATCGAATCGAACTCTTTAGTGTAGTGTAAGTTAGTTAACTGGCCAAGGATGACAG-TCTCGATGTGTACAATGTGGCAGGGTTTTCCCCAGGCGTTCTCATAGCTGTGGGACACTTTATTGACTCTTTCTTAAGTAAAATGTAACGGGAATTGGACTCTATATCACCCTTGTTGGACATATCCAATAGGAATTTCCAACGAACCTTTCCAAAAAGGGTGCAATAGAGTCCAATTTCCGTCATGTGAAGTTCACTTCCCAATTAGAAAGAGTCAAGGAGTAGTGTCTCATAGCTATGAGAACCCTTGGAAAATCCTGTAAACTGCATTTGAACCACT]

[+] EMBL BX624775             [TACAATGCAACGCATTGATAATTAATCCGAATTGGTAATTTAATGATAGTCACGTAAGATGATTTAACCAACAAATCCCGTTAATGTCGATACTAAGCTTCGGTTTTTTTTTTAACTTAATTTAATTGCTCTCAATCTGCTTTTCAATAAGCGAAATATTGCGATATTACCATATACATTTTAATGTGAAAATCTAGAGAAGACTAGTTTTTAGCCTAACACACACAAACACACAGAACCTCACACTTGTAAAGTGTGGCAAGGGAAGAACTGATACTGAGTTGTCGATGATCATTTAATGTTCCTTATTTATTAGGCTTTGCGTATGTAAAACACACGTGTGTGTGTAAAAGGGTAGCGTAAACTGAATTGCGTATACTCTGTCACACGCCGAAATGAATATATTCCATGCTCCTCTCCATATAAACCCCTGTGAACCGAATGGTATCGTTAGATATTGCTTTTGCAAACCGTGTTATATAGTCATTTAAGTTTGGGCACGACCTATAAAGCCCCCCCTCTTACCTCCCCGGTTAGGTTATTAGGTTATCCGCATGTCGTGCTCGTGCTGATATTTAATTTCGCCCATAGTGTTTCGCGCAAACAGAGCACGTGCGGTTTGAATAGGATTGCGAATCGATCGAATCGAACTCTTTAGTGTAGTGTAAGTTAGTTAACTGGCCAAGGATGACAG TCTCGATGTGTACAATGTGGCAGGGTTTTCCCCAGGCGTTCTCATAGCTGTGGGACACTTTATTGACTCTTTCTTAAGT AAATGTAACGGGAATTGGACTCTAT                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BX623291             [                                                                                                                                                                                                                            ACACACAAACACACAGAACCTCACACTTGTAAAGTGTGGCAAGGGAAGAACTGATACTGAGTTGTCGATGATCATTTAATGTTCCTTATTTATTAGGCTTTGCGTATGTAAAACACACGTGTGTGTGTAAAAGGGTAGCGTAAACTGAATTGCGTATACTCTGTCACACGCCGAAATGAATATATTCCATGCTCCTCTCCATATAAACCCCTGTGAACCGAATGGTATCGTTAGATATTGCTTTTGCAAACCGTGTTATATAGTCATTTAAGTTTGGGCACGACCTATAAAGCCCCCCCTCTTACCTCCCCGGTTAGGTTATTAGGTTATCCGCATGTCGTGCTCGTGCTGATATTTAATTTCGCCCATAGTGTTTCGCGCAAACAGAGCACGTGCGGTTTGAATAGGATTGCGAATCGATCGAATCGAACTCTTTAGTGTAGTGTAAGTTAGTTAACTGGCCAAGGATGACAG TCTCGATGTGTACAATGTGGCAGGGTTTTCCCCAGGCGTTCTCATAGCTGTGGGACACTTTATTGACTCTTTCTTAAGTAAAATGTAACGGGAATTGGACTCTATATCACCCTTGTTGGAC                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BM586444             [                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccgTGATCATTTAATGTTCCTTATTTATTAGGCTTTGCGTATGTAAAACACACGTGTGTGTGTAAAAGGGTAGCGTAAACTGAATTGCGTATACTCTGTCACACGCCGAAATGAATATATTCCATGCTCCTCTCCATATAAACCCCTGTGAACCGAATGGTATCGTTAGATATTGCTTTTGCAAACCGTGTTATATAGTCATTTAAGTTTGGGCACGACCTATAAAGCCCCCCCTCTTACCTCCCCGGTTAGGTTATTAGGTTATCCGCATGTCGTGCTCGTGCTGATATTTAATTTCGCCCATAGTGTTTCGCGCAAACAGAGCACGTGCGGTTTGAATAGGATTGCGAATCGATCGAATCGAACTCTTTAGTGTAGTGTAAGTTAGTTAACTGGCCAAGGATGACAGCTCTCGATGTGTACAATGTGGCAGGGTTTTCCCCAGGCGTTCTCATAGCTGTGGGACACTTTATTGACTCTTTCTTAAGTAAAATGTAACGGGAATTGGACTCTATATCACCCTTGTTGGACATATCCAATAGGAATTTCCAACGAACCTTTCCAAAAAGGGTGCAATAGAGTCCAATTTCCGTCATGTGAAGTTCACTTCCCAATTAGAAAGAGTCAAGGAGTAGTGTCTCATAGCTATGAGAACCCTTGGAAAATCCTGTAAACTGCATTTGAACCACT]


>consensus_4086#0 TACAATGCAACGCATTGATAATTAATCCGAATTGGTAATTTAATGATAGTCACGTAAGAT GATTTAACCAACAAATCCCGTTAATGTCGATACTAAGCTTCGGTTTTTTTTTTAACTTAA TTTAATTGCTCTCAATCTGCTTTTCAATAAGCGAAATATTGCGATATTACCATATACATT TTAATGTGAAAATCTAGAGAAGACTAGTTTTTAGCCTAACACACACAAACACACAGAACC TCACACTTGTAAAGTGTGGCAAGGGAAGAACTGATACTGAGTTGTCGATGATCATTTAAT GTTCCTTATTTATTAGGCTTTGCGTATGTAAAACACACGTGTGTGTGTAAAAGGGTAGCG TAAACTGAATTGCGTATACTCTGTCACACGCCGAAATGAATATATTCCATGCTCCTCTCC ATATAAACCCCTGTGAACCGAATGGTATCGTTAGATATTGCTTTTGCAAACCGTGTTATA TAGTCATTTAAGTTTGGGCACGACCTATAAAGCCCCCCCTCTTACCTCCCCGGTTAGGTT ATTAGGTTATCCGCATGTCGTGCTCGTGCTGATATTTAATTTCGCCCATAGTGTTTCGCG CAAACAGAGCACGTGCGGTTTGAATAGGATTGCGAATCGATCGAATCGAACTCTTTAGTG TAGTGTAAGTTAGTTAACTGGCCAAGGATGACAGTCTCGATGTGTACAATGTGGCAGGGT TTTCCCCAGGCGTTCTCATAGCTGTGGGACACTTTATTGACTCTTTCTTAAGTAAAATGT AACGGGAATTGGACTCTATATCACCCTTGTTGGACATATCCAATAGGAATTTCCAACGAA CCTTTCCAAAAAGGGTGCAATAGAGTCCAATTTCCGTCATGTGAAGTTCACTTCCCAATT AGAAAGAGTCAAGGAGTAGTGTCTCATAGCTATGAGAACCCTTGGAAAATCCTGTAAACT GCATTTGAACCACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)