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Anopheles gambiae
cluster # 4150 cluster # 4150       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4150#0 length = 1004 sequences # 3  

consensusID : consensus_4150#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1004
fasta sequence
                              [GAGTTTCATCATGCCGAGCTGGCCCAGGACGTGTACGACGAGTGTCAGGTGTACATCGACCATCAGGAAGGGGCACGGAAGGAGTTGGCCACACTGCGCTCCAACATTGTCGGCGAGGTTGGGGAGGTGATACTGAGGGAAAACCGGCCGCAAGAGGAGAGTCTGCTACCGAAGCCGGGTGGCATCAGTGTGTTCCAGTCGCTTGGAATGGCCACGGAAGATGTAACCGTTGGCAGGTTAGTTTACGAGAAGTATCTGAAAGCTCATTCGGATCAAATGTGAGGATCGAAAGGAGGTTGAAATCACATTCCATTTAAGTGTTTCCCACTTCGTTTGGATTTATTTAAG-CAATATGAAGATAATACTGTAGCGCAATAGTTCAATTCTTGTTCCCAAGTTCGGCACCAAAATAGTAACCTTTTTATTATATAAAAAAAAACACACACACACACGTTGTACTATATTTGTTCGGTTGG-CATGGTTT-AAAAATTGT-GGATTCGTGGCTT-CGTGATTAGGCACTATTCGATTTAACTCTATTGTATTTAAAAATGCAT-TTAAAGATTCTTGGAGTGATTATACTTTAC-GCACCTTCTTCCTACACA-TTCAAAG--CGGCAGGTCACTTAACTATACTTTTGTTGTTGAAATACTTATCAGCTATCGAGATAAATGGAGTGCATGCACGTATATATTGTATCAAAAATATATGTTTATGGTAAATACGTATATGAATAATTGTGACTATTTTT-TTTGCCGAAAA-AAAACTTCCTCTTCAGGCACGTGCGAGTG-TTTTCAATTCCTGTTTTTCTTAGCCCTAGATTA-AAGCCC-AAATACTATATCC-CTTTCCCTTGTGGATAAAGCTGCCTA-TTTGTAATTTACAGGGTTTTGCAGGAGTTCGCATAGCTGTGGGACACTTTGTTGACTCTTTCATATGTTAAATGAACCAAATGTAGTGGGAATTTTACTCTAGCACCCTTGTTGCACAAATCCAATTGGAATTTTGAAGG]

[+] EMBL BX626148             [GAGTTTCATCATGCCGAGCTGGCCCAGGACGTGTACGACGAGTGTCAGGTGTACATCGACCATCAGGAAGGGGCACGGAAGGAGTTGGCCACACTGCGCTCCAACATTGTCGGCGAGGTTGGGGAGGTGATACTGAGGGAAAACCGGCCGCAAGAGGAGAGTCTGCTACCGAAGCCGGGTGGCATCAGTGTGTTCCAGTCGCTTGGAATGGCCACGGAAGATGTAACCGTTGGCAGGTTAGTTTACGAGAAGTATCTGAAAGCTCATTCGGATCAAATGTGAGGATCGAAAGGAGGTTGAAATCACATTCCATTTAAGTGTTTCCCACTTCGTTTGGATTTATTTAAG CAATATGAAGATAATACTGTAGCGCAATAGTTCAATTCTTGTTCCCAAGTTCGGCACCAAAATAGTAACCTTTTTATTATATAAAAAAAAACACACACACACACGTTGTACTATATTTGTTCGGTTGG CATGGTTT AAAAATTGT GGATTCGTGGCTT CGTGATTAGGCACTATTCGATTTAACTCTATTGTATTTAAAAATGCAT TTAAAGATTCTTGGAGTGATTATACTTTAC GCACCTTCTTCCTACACA TTCAAAG  CGGCAGGTCACTTAACTATACTTTTGTTGNTGAAATACTTATCAGCTATCGAGATAAATGGAGTGCATGCACGTATATATTGTATC AAAATATATGTTTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL BX610138             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATTTAAGCCAATATGAAGATAATACTGTAGCGCAATAGTTCAATTCTTGTCCCCAAGGTCGGCACCAAAATAGTTACCTTTTTATTAT     AAAAAA ACACACACACACGTTGTACTATATTTGTTCGGTTGG CATGGTTT AAAAATTGT GGATTCGTGGCTT CGTGATTAGGCACTATTCGATTTAACTCTATTGTATTTAAAAATGCAT TTAAAGATTCTTGGAGTGATTATACTTTAC GCACCTTCTCCCTACACA TTCAAAGTTCTGCAGGTCACTTAACTATCCTTTTGTTGTTGAAATACTTATCAGCTATCGAGATAAATGGAGTGCATGCACGTATATATTGTATCAAAAATATATGTTTATGGTAAATACGTATATGAATAATTGTGACTATTTTT TTTGCCGAAAA AAAACTTCCTCTTCAGGCACGTGCGAGTGTTTTTCAATTCCTGTTTTTCTTAGCCCTAGATTAGAAGCCCAAAATACTATATCC CTTTCCCTTGTGGATAAAGCTGCCTATTTTGTAATTTACAGGGTTTTGCAGGAGTTCGCATAGCTGTGGGACACTTTGTTGACTCTTTCATATGTTAAATGAACCAAATGTAGTGGGAATTTTACTCTAGCACCCTTGTTGCACAAATCCAATTGGAATTTTGAAGG]
[-] EMBL AL931605             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTGTTCGGTTGGCCATGGTTTAAAAAATTGTGGGATTCGTGGCTTCCGTGATTAGNCACTATTCGATTTAACTCTATTGTATTTAAAAATGCATGTTAAAGATTCTTGGAGTGATTATACTTTACGGCACCTTCTTCCTACACAGTTCAAAG  CGGCAGGTCACTTAACTATACTTTTGTTGTTGAAATACTTATCAGCTATCGAGATAAATGGAGTGCATGCACGTATATATTGTATCAAAAATATATGTTTATGGTAAATACGTATATAAATAATTGTGACTATTTTTCTTTGCCGAAAATCAAACTTCCTCTTCAGGCACGTGCGAGTG TTTTCCATTCCTGTTTTTCTTAGCCCTAAATTA CAGCCC AAATACTATATCCATTTTCTCTTGTGGATAAAGTTGCCTA TTTGTAATTAACctcgg                                                                                                                           ]


>consensus_4150#0 GAGTTTCATCATGCCGAGCTGGCCCAGGACGTGTACGACGAGTGTCAGGTGTACATCGAC CATCAGGAAGGGGCACGGAAGGAGTTGGCCACACTGCGCTCCAACATTGTCGGCGAGGTT GGGGAGGTGATACTGAGGGAAAACCGGCCGCAAGAGGAGAGTCTGCTACCGAAGCCGGGT GGCATCAGTGTGTTCCAGTCGCTTGGAATGGCCACGGAAGATGTAACCGTTGGCAGGTTA GTTTACGAGAAGTATCTGAAAGCTCATTCGGATCAAATGTGAGGATCGAAAGGAGGTTGA AATCACATTCCATTTAAGTGTTTCCCACTTCGTTTGGATTTATTTAAGCAATATGAAGAT AATACTGTAGCGCAATAGTTCAATTCTTGTTCCCAAGTTCGGCACCAAAATAGTAACCTT TTTATTATATAAAAAAAAACACACACACACACGTTGTACTATATTTGTTCGGTTGGCATG GTTTAAAAATTGTGGATTCGTGGCTTCGTGATTAGGCACTATTCGATTTAACTCTATTGT ATTTAAAAATGCATTTAAAGATTCTTGGAGTGATTATACTTTACGCACCTTCTTCCTACA CATTCAAAGCGGCAGGTCACTTAACTATACTTTTGTTGTTGAAATACTTATCAGCTATCG AGATAAATGGAGTGCATGCACGTATATATTGTATCAAAAATATATGTTTATGGTAAATAC GTATATGAATAATTGTGACTATTTTTTTTGCCGAAAAAAAACTTCCTCTTCAGGCACGTG CGAGTGTTTTCAATTCCTGTTTTTCTTAGCCCTAGATTAAAGCCCAAATACTATATCCCT TTCCCTTGTGGATAAAGCTGCCTATTTGTAATTTACAGGGTTTTGCAGGAGTTCGCATAG CTGTGGGACACTTTGTTGACTCTTTCATATGTTAAATGAACCAAATGTAGTGGGAATTTT ACTCTAGCACCCTTGTTGCACAAATCCAATTGGAATTTTGAAGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)