These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_4150#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 1004 fasta sequence [GAGTTTCATCATGCCGAGCTGGCCCAGGACGTGTACGACGAGTGTCAGGTGTACATCGACCATCAGGAAGGGGCACGGAAGGAGTTGGCCACACTGCGCTCCAACATTGTCGGCGAGGTTGGGGAGGTGATACTGAGGGAAAACCGGCCGCAAGAGGAGAGTCTGCTACCGAAGCCGGGTGGCATCAGTGTGTTCCAGTCGCTTGGAATGGCCACGGAAGATGTAACCGTTGGCAGGTTAGTTTACGAGAAGTATCTGAAAGCTCATTCGGATCAAATGTGAGGATCGAAAGGAGGTTGAAATCACATTCCATTTAAGTGTTTCCCACTTCGTTTGGATTTATTTAAG-CAATATGAAGATAATACTGTAGCGCAATAGTTCAATTCTTGTTCCCAAGTTCGGCACCAAAATAGTAACCTTTTTATTATATAAAAAAAAACACACACACACACGTTGTACTATATTTGTTCGGTTGG-CATGGTTT-AAAAATTGT-GGATTCGTGGCTT-CGTGATTAGGCACTATTCGATTTAACTCTATTGTATTTAAAAATGCAT-TTAAAGATTCTTGGAGTGATTATACTTTAC-GCACCTTCTTCCTACACA-TTCAAAG--CGGCAGGTCACTTAACTATACTTTTGTTGTTGAAATACTTATCAGCTATCGAGATAAATGGAGTGCATGCACGTATATATTGTATCAAAAATATATGTTTATGGTAAATACGTATATGAATAATTGTGACTATTTTT-TTTGCCGAAAA-AAAACTTCCTCTTCAGGCACGTGCGAGTG-TTTTCAATTCCTGTTTTTCTTAGCCCTAGATTA-AAGCCC-AAATACTATATCC-CTTTCCCTTGTGGATAAAGCTGCCTA-TTTGTAATTTACAGGGTTTTGCAGGAGTTCGCATAGCTGTGGGACACTTTGTTGACTCTTTCATATGTTAAATGAACCAAATGTAGTGGGAATTTTACTCTAGCACCCTTGTTGCACAAATCCAATTGGAATTTTGAAGG] [+] EMBL BX626148 [GAGTTTCATCATGCCGAGCTGGCCCAGGACGTGTACGACGAGTGTCAGGTGTACATCGACCATCAGGAAGGGGCACGGAAGGAGTTGGCCACACTGCGCTCCAACATTGTCGGCGAGGTTGGGGAGGTGATACTGAGGGAAAACCGGCCGCAAGAGGAGAGTCTGCTACCGAAGCCGGGTGGCATCAGTGTGTTCCAGTCGCTTGGAATGGCCACGGAAGATGTAACCGTTGGCAGGTTAGTTTACGAGAAGTATCTGAAAGCTCATTCGGATCAAATGTGAGGATCGAAAGGAGGTTGAAATCACATTCCATTTAAGTGTTTCCCACTTCGTTTGGATTTATTTAAG CAATATGAAGATAATACTGTAGCGCAATAGTTCAATTCTTGTTCCCAAGTTCGGCACCAAAATAGTAACCTTTTTATTATATAAAAAAAAACACACACACACACGTTGTACTATATTTGTTCGGTTGG CATGGTTT AAAAATTGT GGATTCGTGGCTT CGTGATTAGGCACTATTCGATTTAACTCTATTGTATTTAAAAATGCAT TTAAAGATTCTTGGAGTGATTATACTTTAC GCACCTTCTTCCTACACA TTCAAAG CGGCAGGTCACTTAACTATACTTTTGTTGNTGAAATACTTATCAGCTATCGAGATAAATGGAGTGCATGCACGTATATATTGTATC AAAATATATGTTTATG ] [-] EMBL BX610138 [ ATTTAAGCCAATATGAAGATAATACTGTAGCGCAATAGTTCAATTCTTGTCCCCAAGGTCGGCACCAAAATAGTTACCTTTTTATTAT AAAAAA ACACACACACACGTTGTACTATATTTGTTCGGTTGG CATGGTTT AAAAATTGT GGATTCGTGGCTT CGTGATTAGGCACTATTCGATTTAACTCTATTGTATTTAAAAATGCAT TTAAAGATTCTTGGAGTGATTATACTTTAC GCACCTTCTCCCTACACA TTCAAAGTTCTGCAGGTCACTTAACTATCCTTTTGTTGTTGAAATACTTATCAGCTATCGAGATAAATGGAGTGCATGCACGTATATATTGTATCAAAAATATATGTTTATGGTAAATACGTATATGAATAATTGTGACTATTTTT TTTGCCGAAAA AAAACTTCCTCTTCAGGCACGTGCGAGTGTTTTTCAATTCCTGTTTTTCTTAGCCCTAGATTAGAAGCCCAAAATACTATATCC CTTTCCCTTGTGGATAAAGCTGCCTATTTTGTAATTTACAGGGTTTTGCAGGAGTTCGCATAGCTGTGGGACACTTTGTTGACTCTTTCATATGTTAAATGAACCAAATGTAGTGGGAATTTTACTCTAGCACCCTTGTTGCACAAATCCAATTGGAATTTTGAAGG] [-] EMBL AL931605 [ ATTTGTTCGGTTGGCCATGGTTTAAAAAATTGTGGGATTCGTGGCTTCCGTGATTAGNCACTATTCGATTTAACTCTATTGTATTTAAAAATGCATGTTAAAGATTCTTGGAGTGATTATACTTTACGGCACCTTCTTCCTACACAGTTCAAAG CGGCAGGTCACTTAACTATACTTTTGTTGTTGAAATACTTATCAGCTATCGAGATAAATGGAGTGCATGCACGTATATATTGTATCAAAAATATATGTTTATGGTAAATACGTATATAAATAATTGTGACTATTTTTCTTTGCCGAAAATCAAACTTCCTCTTCAGGCACGTGCGAGTG TTTTCCATTCCTGTTTTTCTTAGCCCTAAATTA CAGCCC AAATACTATATCCATTTTCTCTTGTGGATAAAGTTGCCTA TTTGTAATTAACctcgg ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||