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Anopheles gambiae
cluster # 4152 cluster # 4152       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4152#0 length = 1099 sequences # 3  

consensusID : consensus_4152#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1099
fasta sequence
                              [CCGACATGCGACATGCGATCCTTGTTTGCGTCGGTTTGGAAGTGTTGTGTGCGCTTTGTCTAAAAAAAAGAAGAAACGAATTTCCTGCCACCAATAATCTATCCTCTGATACGGCGGCGGGGCCCCGGTGCCGATGGTACACGTTATTACCATTTTCTTCTTCAATTTGATGAGTTTGTTTCCCGTCCTGTTCATTGTTTGCGTCGGGCAAGTTGTTTGTTCGTACCGATCCCGACCCACGAAACCAACCGGACGATAAACAATCTGTGCGCTCCGGTGCCGTGCGCGCACACACTTTCCAATCGTGCGCTGATAACGGCGGGCGGACGAGTGCGCTCAGTCTCAGACTTGTGTTTGTGACTCTGCCCACTCACTAATTAACATTTCCAAACAACGTGACAGTGTGGTTTCTTCTTGTTGCTGCCCCTTTTGTTTGATTTTGATTTGGCCATCCGATTATTGGGTTTGATTATTACATGTTTTTTTTGCTTTGTTTTGCAGTTGCCTTGGTGTGATAATTATTATTCACATTTCGTATCAATAAGTCCGGCTGCTTTATCAAAACAGCAACCCAATTTCCTTTCTTTTTTTTCCTTTTTATTTGCACAGAAGCTTGTTAGAAGCGAAAAAACAACATTGTTGGTTAGAAGACATTTCAAACACACAGTTAAAGAATGTAACGTAATCACAGCACTTTCACACTCACCATTTAGATCTGCTAATGGGTAAATCACTATGTTCACAGCACAATATAGACAGCTCAAGGTAACAATGTAAAACAATTAAAAGCAATTCAATCTTCAAACGGTCTATAGCTGGTTGCACTGCAGCTGCACGCTCGAACTGTGCACGTGCTGGACCCGAACGCCACGAGGTGACTCGCGTGAATCACGACAATCGCTGCTGGCGGTGCGACCACGATCGAGACTCGACCACACCGCTGCTAGCGATC-GGCCCCGGCAATGAGGCAACGTGTTGGCCCCCCGGATAGAGACCGCAACGGGCGCGCCACGGTACCCGGGTAGCGACACACGGTTGAAAATAGAAGACCCCGCCGAGGGAATGGAAAATAAAATTAAAAAAAAAGTGTCAGCTGGAA]

[+] EMBL CNS08VHT             [CCGACATGCGACATGCGATCCTTGTTTGCGTCGGTTTGGAAGTGTTGTGTGCGCTTTGTCTAAAAAAAAGAAGAAACGAATTTCCTGCCACCAATAATCTATCCTCTGATACGGCGGCGGGGCCCCGGTGCCGATGGTACACGTTATTACCATTTTCTTCTTCAATTTGATGAGTTTGTTTCCCGTCCTGTTCATTGTTTGCGTCGGGCAAGTTGTTTGTTCGTACCGATCCCGACCCACGAAACCAACCGGACGATAAACAATCTGTGCGCTCCGGTGCCGTGCGCGCACACACTTTCCAATCGTGCGCTGATAACGGCGGGCGGACGAGTGCGCTCAGTCTCAGACTTGTGTTTGTGACTCTGCCCACTCACTAATTAACATTTCCAAACAACGTGACAGTGTGGTTTCTTCTTGTTGCTGCCCCTTTTGTTTGATTTTGATTTGGCCATCCGATTATTGGGTTTGATTATTACATGTTTTTTTTGCTTTGTTTTGCAGTTGCCTTGGTGTGATAATTATTATTCACATTTCGTATCAATAAGTCCGGCTGCTTTATCAAAACAGCAACCCAATTTCCTTTCTTTTTTTTCCTTTTTATTTGCACAGAAGCTTGTTAGAAGCGAAAAAACAACATTGTTGGTTAGAAGACATTTCAAACACACAGTTAAAGAATGTAACGTAATCACAGCACTTTCACACTCACCATTTAGATCTGCTAATGGGTAAATCACTATGTTCACAGCACAATATAGACAGCTCAAGGTAACAATGTAAAACAATTAAAAGCAATTCAATCTTCAAACGGTCTATAGCTGGTTGCACTGCAGCTGCACGCTCGAACTGTGCACGTGCTGGACCCGAACGCCACGAGGTGACTCGCGTGAATCACGACAATCGCTGCTGGCGGTGCGACCACGATCGAGACTCGACCACACCGCTGCTAGCGATC GGCCCCGGCAATGAGGCAACGTGTTGGCCCCCCGGATAGAGACCGCAACGGGCGCGCCA                                                                                        ]
[-] EMBL CNS08VHU             [                                                                                                                 GCGGCGGGGCCCCGGTGCCGATGGTACACGTTATTACCATTTTCTTCTTCAATTTGATGAGTTTGTTTCCCGTCCTGTTCATTGTTTGCGTCGGGCAAGTTGTTTGTTCGTACCGATCCCCACCCACGAAACCAACCGGACGATAAACAATCTGTGCGCTCCGGTGCCGTGCGCGAACATACTTTCCAATCGTGCGCTGATAACGGCGGGCGGACGAGTGCGCTCAGTCTCAGACTTGTGTTTGTGACTCTGCCCACTCACTAATTAACATTTCCAAACAACGTGACAGTGTGGTTTCTTCTTGTTGCTGCCCCTTTTGTTTGATTTTGATTTGGCCATCCGATTATTGGGTTTGATTATTACATGTTTTTTTTGCTTTGTTTTGCAGTTGCCTTGGTGTGATAATTATTATTCACATTTCGTATCAATAAGTCCGG GGGTTTATCAAAACAGCAACCCAATTTCCTTTCTTTTTTTTCCTTTTTATTTGCACAGAAGCTTGTTAGAAGCGAAAAAACAACATTGTTGGTTAGAAGACATTTCAAACACACAGTTAAAGAATGTAACGTAATCACAGCACTTTCAAACTCACCATTTAGATCTGCTAATGGGTAAATCACTATGTTCACAGCACAATATAGACAGCTCAAGGTAACAATGTAAAACAATTAAAAGCAATTCAATCTTCAAACGGTCTATAGCTGGTTGAACTGCAGCTGCACGCTCGAACTGTGCACGTGCTGGACCCGAACGCCACGAGGTTACTCGCGTGAATCACGACAATCGCTGCTGGCGGTGCGACCACGATCGAGACTCGACCACACCGCTGCTAGCGATCAGGCCCCGGCAATGAGGCAACGTGTTGGCCCCCCGGATAGAGACCGCAACGGGCGCGCCACGGTACCCGGGTAGCGACACACGGTTGAAAATAGAAGACCCCGCCGAGGGAATGGAAAATAAAATTAAAAAAAAAGTGTCAGCTGGAA]
[-] EMBL CNS08OZE             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACAGAAGCTTGTTAGAAGCGAAAAAACAACATTGTTGGTTAGAAGACATTTCAAACACACAGTTAAAGAATGTAACGTAATCACAGCACTTTCACACTCACCATTTAGATCTGCTAATGGGTAAATCACTATGTTCACAGCACAATATAGACAGCTCAAGGTAACAATGTAAAACAATTAAAAGCAATTCAATCTTCAAACGGTCTATAGCTGGTTGCACTGCAGCTGCACGCTCGAACTGTGCACGTGCTGGACCCGAACGCCACGAGGTGACTCGCGTGAATCAC                                                                                                                                                                                                                ]


>consensus_4152#0 CCGACATGCGACATGCGATCCTTGTTTGCGTCGGTTTGGAAGTGTTGTGTGCGCTTTGTC TAAAAAAAAGAAGAAACGAATTTCCTGCCACCAATAATCTATCCTCTGATACGGCGGCGG GGCCCCGGTGCCGATGGTACACGTTATTACCATTTTCTTCTTCAATTTGATGAGTTTGTT TCCCGTCCTGTTCATTGTTTGCGTCGGGCAAGTTGTTTGTTCGTACCGATCCCGACCCAC GAAACCAACCGGACGATAAACAATCTGTGCGCTCCGGTGCCGTGCGCGCACACACTTTCC AATCGTGCGCTGATAACGGCGGGCGGACGAGTGCGCTCAGTCTCAGACTTGTGTTTGTGA CTCTGCCCACTCACTAATTAACATTTCCAAACAACGTGACAGTGTGGTTTCTTCTTGTTG CTGCCCCTTTTGTTTGATTTTGATTTGGCCATCCGATTATTGGGTTTGATTATTACATGT TTTTTTTGCTTTGTTTTGCAGTTGCCTTGGTGTGATAATTATTATTCACATTTCGTATCA ATAAGTCCGGCTGCTTTATCAAAACAGCAACCCAATTTCCTTTCTTTTTTTTCCTTTTTA TTTGCACAGAAGCTTGTTAGAAGCGAAAAAACAACATTGTTGGTTAGAAGACATTTCAAA CACACAGTTAAAGAATGTAACGTAATCACAGCACTTTCACACTCACCATTTAGATCTGCT AATGGGTAAATCACTATGTTCACAGCACAATATAGACAGCTCAAGGTAACAATGTAAAAC AATTAAAAGCAATTCAATCTTCAAACGGTCTATAGCTGGTTGCACTGCAGCTGCACGCTC GAACTGTGCACGTGCTGGACCCGAACGCCACGAGGTGACTCGCGTGAATCACGACAATCG CTGCTGGCGGTGCGACCACGATCGAGACTCGACCACACCGCTGCTAGCGATCGGCCCCGG CAATGAGGCAACGTGTTGGCCCCCCGGATAGAGACCGCAACGGGCGCGCCACGGTACCCG GGTAGCGACACACGGTTGAAAATAGAAGACCCCGCCGAGGGAATGGAAAATAAAATTAAA AAAAAAGTGTCAGCTGGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)