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Anopheles gambiae
cluster # 4280 cluster # 4280       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4280#0 length = 1093 sequences # 3  

consensusID : consensus_4280#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1093
fasta sequence
                              [AAATCGGTTAAATTAAGAATGCTTTTTCACAGCGAGCGAGGAAAATCATTTCACCTAAGCGCATTTAGTACACAATTTGTTGTCGTTATTTGGTGGTGATGGTTGGTGTTGTTACATGGGCAAACAGTGCACATCGGGTTCTGTACAGCTTGTCTGGTGCAATACACATGATACACACAAACAATGAGCACACGGTTGCTACACACTGTACATACTCCCTCTCCTCTCACTTCCCTACC-GGATGGACTTCCGAAAGGGCGGAGAATTTGATTGGTTTGTGTGACTGTCTGTGTGTGTTTGTTAAAGGGGAGACCCCCTTTGTCCTGTTATGACTGATTATTGGTTACGCAG-AACGCGGAATGCACCCGCGCCCGTGCTCATTCTCTATTGCATCTATGCGTTGCGGTATATGCAACTACCGCACTACTCGGGGTCCGCTCACTGCGGACTAGCCTCCTGCCTTTGTTCTGCCACTGCCGGCGCCTCCTGAGGTGACGGGGTGGAGGACGCTTTAGCACTGCTCCGATCCACTGCACCCGGTGGCTGGGGCTGCCA--GCGGGCGGACCGTGCCGGTGACCGCTAGGCCAACTGTCATTCGCCCTTCAGCAGCTTGCTAAACTTCTCCTGCTGCTTCTCCTTCCATTCCTTCTTTGGTTTCGAGCGCTTCAGCTGCCCGTCCCAGACGAGATCGACCAGACCGCCCTGGTCGGCGATGACGCGCTTCACGCGCGTTCGCG-AAATCGATCGCCGACTCGCCCTCCTGCCGCTCCATCGGTGGCAGATACCAGACGTCGCACACGATCGCCCAGGAGGTCATCATGAGGAACAGGTACTGCATCATCGAGTAGCGCGACTGTTCCAGAAAGCATCACCAAACCGTGGATCGTATTTGATGGCCACTGGATAGATGACGCCGCCAACCTCAAAGCTGCCCTTTTTGAACTGCATTACGGCGGTGTTGTTGATGCAGGTGCCCTCGGGGAAGATTAGGATGGGTGGATTTTTCGGATCGGTCACGTGCTCCTTTAACCTCTTCGCCACCAGAATACGATCCTTTGCTTCTGCACGCTCGAACCAGATGTGCGGTGAGGCT]

[-] EMBL BM575701             [AAATCGGTTAAATTAAGAATGCTTTTTCACAGCGAGCGAGGAAAATCATTTCACCTAAGCGCATTTAGTACACAATTTGTTGTCGTTATTTGGTGGTGATGGTTGGTGTTGTTACATGGGCAAACAGTGCACATCGGGTTCTGTACAGCTTGTCTGGTGCAATACACATGATACACACAAACAATGAGCACACGGTTGCTACACACTGTACATACTCCCTCTCCTCTCACTTCCCTACCGGGTTGGACTTCCGAAAGGGCGGAGAATTTGATTGGTTTGTGTGACTGTCTGTGTGTGTTTGTTAAAGGGGAGACCCCCTTTGTCCTGTTATGACTGATTATTGGTTACGCAG AACGCGGAATGCATCCGCGCCCGTGCTCATTCTCTATTGCATCGATGCGTTGCGGTATATGCAACTACCGCACTACTCGGGGTCCGCTCACTGCGGACTAGCCTCCTGCCTTTGTTCTGCCACTGCCGGCGCCTCCTGAGGTGACGGGGTGGAGGACGCTTTAGCACTGCTCCGATCCGCTGCACCCGGTGGCTGGGGCTGCCA  GCGGGCGGACCGTGCCGGTGACCGCTAGGCCAACTGTCATTCGCCCTTCAGCAGCTTGCTAAACTTCTCCTGCTGCTTCTCCTTCCATTCCTTCTTTGGTTTCGAGCGCTTCAGCTGCCgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CNS08NT0             [                                                                                                                                                                                                                              CCTCTCACTTCCCTACC GGATGGACTTCCGAAAGGGCGGAGAATTTGATTGGTTTGTGTGACTGTCTGTGTGTGTTTGTTAAAGGGGAGACCCCCTTTGTCCTGTTATGACTGATTATTGGTTACGCAGCCCCCCCGAATGCACCCGCGCCCGTGCTCATTCTCTATTGCATCTATGCGTTGCGGTATATGCAACTACCGCACTACTCGGGGTCCGCTCACTGCGGACTAGCCTCCTGCCTTTGTTCTGCCACTGCCGGCGCCTCCTGAGGTGACGGGGTGGAGGACGCTTTAGCACTGCTCCGATCCACTGCACCCGGTGGCTGGGGCTGCCACCGCGCGCGGACCGTGCCGGTGACCGCTAGGCCAACTGTCATTCGCCCTTCAGCAGCTTGCTAAACTTCTCCTGCTGCTTCTCCTTCCATTCCTTCTTTGGTTTCGAGCGCTTCAGCTGCCCGTCCCAGACGAGATCGACCAGACCGCCCTGGTCGGCGATGACGCGCTTCACGCGCGTTCGCG AAATCGATCGCCGACTCGCCCTCCTGCCGCTCCATCGGTGGCAGATACCAGACGTCGCACACGATCGCCCAGGAGGTCATCATGAGGAACAGGTACTGCATCATCGAGTAGCGCGACTGTTCCAGAAAGCATCACCAAACCGTGGATCGTATTTGATGGCCACTGGATAGATGACGCCGCCAACCTCAAAGCTGCCCTTTTTGAACTGCATTACGGCGGTGTTGTTGATGCAGGTGCCCTCGGGGAAGATTAGGATGGGTGGATTTTTCGGATCGGTCACGTGCTCCTTTAACCTCTTCGCCACCAGAATACGATCCTTTGCTTCTGCACGCTCGAACCAGATGTGCGGTGAGGCT]
[+] EMBL CNS08UVE             [                                                                                                                                                                                                                                 CTCACTT CCTACC GGATGGACTTCCGAAA GGCGGAGAATTTGATTGGTTTGTGTGACTGTCTGTGTGTGTTTGTTAAAGGGGAGACCCCCTTTGTCCTGTTATGACTGATTATTGGTTACGCAG AACGCGGAATGCACCCGCGCCCGTGCTCATTCTCTATTGCATCTATGCGTTGCGGTATATGCAACTACCGCACTACTCGGGGTCCGCTCACTGCGGACTAGCCTCCTGCCTTTGTTCTGCCACTGCCGGCGCCTCCTGAGGTGACGGGGTGGAGGACGCTTTAGCACTGCTCCGATCCACTGCACCCGGTGGCTGGGGCTGCCA  GCGGGCGGACCGTGCCGGTGACCGCTAGGCCAACTGTCATTCGCCCTTCAGCAGCTTGCTAAACTTCTCCTGCCGCTTCTCCTTCCATTCCTTCTTTGGTTTCGAGCGCTTCAGCTGCCCGTCCCAGACGAGATCGACCAGACCGCCCTGGTCGGCGATGACGCGCTTCACGCG GTTCGCGAAAATCGATCGCCGACTCGCCCTCCTGCCGCTCCATCGGTGGCAGAAACCAGACGTCGCACACGATCGCCCAGGAGGTCATCATGAGGAAAAGGTACT                                                                                                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_4280#0 AAATCGGTTAAATTAAGAATGCTTTTTCACAGCGAGCGAGGAAAATCATTTCACCTAAGC GCATTTAGTACACAATTTGTTGTCGTTATTTGGTGGTGATGGTTGGTGTTGTTACATGGG CAAACAGTGCACATCGGGTTCTGTACAGCTTGTCTGGTGCAATACACATGATACACACAA ACAATGAGCACACGGTTGCTACACACTGTACATACTCCCTCTCCTCTCACTTCCCTACCG GATGGACTTCCGAAAGGGCGGAGAATTTGATTGGTTTGTGTGACTGTCTGTGTGTGTTTG TTAAAGGGGAGACCCCCTTTGTCCTGTTATGACTGATTATTGGTTACGCAGAACGCGGAA TGCACCCGCGCCCGTGCTCATTCTCTATTGCATCTATGCGTTGCGGTATATGCAACTACC GCACTACTCGGGGTCCGCTCACTGCGGACTAGCCTCCTGCCTTTGTTCTGCCACTGCCGG CGCCTCCTGAGGTGACGGGGTGGAGGACGCTTTAGCACTGCTCCGATCCACTGCACCCGG TGGCTGGGGCTGCCAGCGGGCGGACCGTGCCGGTGACCGCTAGGCCAACTGTCATTCGCC CTTCAGCAGCTTGCTAAACTTCTCCTGCTGCTTCTCCTTCCATTCCTTCTTTGGTTTCGA GCGCTTCAGCTGCCCGTCCCAGACGAGATCGACCAGACCGCCCTGGTCGGCGATGACGCG CTTCACGCGCGTTCGCGAAATCGATCGCCGACTCGCCCTCCTGCCGCTCCATCGGTGGCA GATACCAGACGTCGCACACGATCGCCCAGGAGGTCATCATGAGGAACAGGTACTGCATCA TCGAGTAGCGCGACTGTTCCAGAAAGCATCACCAAACCGTGGATCGTATTTGATGGCCAC TGGATAGATGACGCCGCCAACCTCAAAGCTGCCCTTTTTGAACTGCATTACGGCGGTGTT GTTGATGCAGGTGCCCTCGGGGAAGATTAGGATGGGTGGATTTTTCGGATCGGTCACGTG CTCCTTTAACCTCTTCGCCACCAGAATACGATCCTTTGCTTCTGCACGCTCGAACCAGAT GTGCGGTGAGGCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)