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Anopheles gambiae
cluster # 4595 cluster # 4595       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4595#0 length = 1247 sequences # 3  

consensusID : consensus_4595#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1247
fasta sequence
                              [ATGTTTTCCAAATTGACNTTTAGATTTGTGTCAAGTTAAAACTACATTTTAAGCCATTTTTTACGACTGTTTTGTTNTTAACGGCCACAGTATGATAAACGTAAAAATCAAATCCGCTCATCAAAATTCCTTCCAACCGTGTATTTNNTAAG-TTGATCTAAATATTTGTATTCATGTTACACTTTCACAATATAA-ATATCACGTTCGATAGCCATTGCCGGCCAGGCCATTCCTTCTGCATACATAAAAATCACGTGAAATCTTTAAAATCTCTAAGAACTAAAAGTTCTAATAAGATTTTGAATCACACTTCGTT-CTATACTTGGATGAAAATGTTCTCATTCTACGTTAAGCCAAACTGTGGATACAACAAAACATAAATTTCCTCAAAACAAAAGCTAATGAAACAGTAGCAAATTAAGAAACTAAAACCAGATTGATTCATTCAATGGAATTGTGTACTATGCTGTTGATCCACGCTCTTGCGTATAAAACACTACTATATACATCCGGATATCCGGGCATCGCACACCCTTTACCCCAGGACACGATTCCAACTTGCATATCGCCACAGACCAGTGGGCCACCAGAATCATACGCACAACTGCCTTTGCCGCCATCAACAAAGTCACCCGCACATATCATAGTTTGATCGATCTTTCCTTCGTATGTAGCATTACACAGTACTCGCGAAACCAACGGGATCTGGACCGCCCGTAGCTTATCAAAGCTTTCTTCTTCGTTTAGAGTGCGTCCCCAGCCCGGTGACAACACATTCTCGATCGCTCAAAGCATTATCCAGGCGAAAGGCTAGAGCGATCGGTTGTGCGATTGTAGAAAATACTATCGCATGTTTCAATTGCAGCAAAGCAAAGTCCGCTAACCAGCTATACGGAACATGGTCTGGATGTGAAGTCACTGAGTCCACAGGATGTATCGTTCCACCTTTTTGCGTAAAACGCAGATCCAACACGCACGTTCATGTAAGCAGCTATGGTATCATCTACGCAATGACCTGCTGTTAATACCCATCGATTGGTAATTATCGATCCACCACAAATGTGCTCGTTCAATTCACGTACAGACACTTGGTACGGATGCATTTCAATGTCTACTACATGGCCACCGACAATTCTGTATGTTTTATTTCTATTTTTAACACATTCTGAAATTGACAAAGCACTGCACAAAAATATAAGTAGCTTTAGCATTTCGAACATTCTTTTTTCTGTTGTAAGACCCACAGG]

[-] EMBL BX619222             [ATGTTTTCCAAATTGACNTTTAGATTTGTGTCAAGTTAAAACTACATTTTAAGCCATTTTTTACGACTGTTTTGTTNTTAACGGCCACAGTATGATAAACGTAAAAATCAAATCCGCTCATCAAAATTCCTTCCAACCGTGTATTTNNTAAGTTTGATCTAAATATTTGTATTCATGTTACACTTTCACAATATAANATATCACGTTCGATAGCCATTGCCGGCCAGGCCATTCCTTCTGCATACATAAAAATCACGTGAAATCTTTAAAATCTCTAAGAACTAAAAGTTCTAATAAGATTTTGAATCACACTTCGTTNCTATACTTGGATGAAAATGTTCTCATTCTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CNS097RY             [                                                                                                                                                          gctttgAAATAGTTTTATTCATGTTACACTTTCACAATATAA ATATCACGTTCGATAGCCATTGCCGGCCAGGCCATTCCTTCTGCATACATAAAAATCACGTGAAATCTTTAAAATCTCTAAGAACAAAAAATTCTAATAAGATTTTGAATCACACTTCGTT CTATACTTGGATGAAAATGTTCTCATTCTACGTTAAGCCAAACTGTGGATACAACAAAACATAAATTTCCTCAAAACAAAAGCTAATGAAACAGTAGCAAATTAAGAAACTAAAACCAGATTGATTCATTCAATGGAATTGTGTACTATGCTGTTGATCCACGCTCTTGCGTATAAAACACTACTATATACATCCGGATATCCGGGCATCGCACACCCTTTACCCCAGGACACGATTCCAACTTGCATATCGCCACAGACCAGTGGGCCACCAGAATCATACGCACAACTGCCTTTGCCGCCATCAACAAAGTCACCCGCACATATCATAGTTTGATCGATCTTTCCTTCGTATGTAGCATTACACAGTACTCGCGAAACCAACGGGATCTGGACCGCCCGTAGCTTATCAAAGCTTTCTTCTTCGTTTAGAGTGCGTCCCCAGCCCGGTGACAACACATTCTCGATCGCTCAAAGCATTATCCAGGCGAAAGGCTAGAGCGATCGGTTGTGCGATTGTAGAAAATACTATCGCATGTTTCAATTGCAGCAAAGCAAAGTCCGCTAACCAGCTATACGGAACATGGTCTGGATGTGAAGTCACTGAGTCCACAGGATGTATCGTTCCACCTTTTTGCGTAAAACGCAGATCCAACACGCACGTTCATGTAAGCAGCTATGGTATCATCTACGCAATGACCTGCTGTTAATACCCATCGATTGGTAATTATCGATCCACCACAAATGTGCTCGTTCAATTCACGTACAGACACTTGGTACGGATGCATT                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CNS097RX             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAC TCGTT CTATACTTGGATGAAAATGTTCTCATTCTACGTTAAGCCAAACTGTGGATACAACAAAACATAAATTTCCTCAAAACAAAAGCTAATGAAACAGTAGCAAATTAAGAAACTAAAACCAGATTGATTCATTCAATGGAATTGTGTACTATGCTGTTGATCCACGCTCTTGCGTATAAAACACTACTATATACATCCGGATATCCGGGCATCGCACACCCTTTACCCCAGGACACGATTCCAACTTGCATATCGCCACAGACCAGTGGGCCACCAGAATCATACGCACAACTGCCTTTGCCGCCATCAACAAAGTCACCCGCACATATCATAGTTTGATCGATCTTTCCTTCGTATGTAGCATTACACAGTACTCGCGAAACCAACGGGATCTGGACCGCCCGTAGCTTATCAAAGCTTTCTTCTTCGTTTAGAGTGCGTCCCCAG CCGGTGACAACACATTCTCGATCGCTCAAAGCATTATCCAGGCGAAAGGCTAGAGCGATCGGTTGTGCGATTGTAGAAAATACTATCGCATGTTTCAATTGCAGCAAAGCAAAGTCCGCTAACCAGCTATACGGAACATGGTCTGGATGTGAAGTCACTGAGTCCACAGGATGTATCGTTCCACC TTTTGCGTAAAACGCAGATCCAACACGCACGTTCATGTAAGCAGCTATGGTATCATCTACGCAATGACCTGCTGTTAATACCCATCGATTGGTAATTATCGATCCACCACAAATGTGCTCGTTCAATTCACGTACAGACACTTGGTACGGATGCATTTCAATGTCTACTACATGGCCACCGACAATTCTGTATGTTTTATTTCTATTTTTAACACATTCTGAAATTGACAAAGCACTGCACAAAAATATAAGTAGCTTTAGCATTTCGAACATTCTTTTTTCTGTTGTAAGACCCACAGG]


>consensus_4595#0 ATGTTTTCCAAATTGACNTTTAGATTTGTGTCAAGTTAAAACTACATTTTAAGCCATTTT TTACGACTGTTTTGTTNTTAACGGCCACAGTATGATAAACGTAAAAATCAAATCCGCTCA TCAAAATTCCTTCCAACCGTGTATTTNNTAAGTTGATCTAAATATTTGTATTCATGTTAC ACTTTCACAATATAAATATCACGTTCGATAGCCATTGCCGGCCAGGCCATTCCTTCTGCA TACATAAAAATCACGTGAAATCTTTAAAATCTCTAAGAACTAAAAGTTCTAATAAGATTT TGAATCACACTTCGTTCTATACTTGGATGAAAATGTTCTCATTCTACGTTAAGCCAAACT GTGGATACAACAAAACATAAATTTCCTCAAAACAAAAGCTAATGAAACAGTAGCAAATTA AGAAACTAAAACCAGATTGATTCATTCAATGGAATTGTGTACTATGCTGTTGATCCACGC TCTTGCGTATAAAACACTACTATATACATCCGGATATCCGGGCATCGCACACCCTTTACC CCAGGACACGATTCCAACTTGCATATCGCCACAGACCAGTGGGCCACCAGAATCATACGC ACAACTGCCTTTGCCGCCATCAACAAAGTCACCCGCACATATCATAGTTTGATCGATCTT TCCTTCGTATGTAGCATTACACAGTACTCGCGAAACCAACGGGATCTGGACCGCCCGTAG CTTATCAAAGCTTTCTTCTTCGTTTAGAGTGCGTCCCCAGCCCGGTGACAACACATTCTC GATCGCTCAAAGCATTATCCAGGCGAAAGGCTAGAGCGATCGGTTGTGCGATTGTAGAAA ATACTATCGCATGTTTCAATTGCAGCAAAGCAAAGTCCGCTAACCAGCTATACGGAACAT GGTCTGGATGTGAAGTCACTGAGTCCACAGGATGTATCGTTCCACCTTTTTGCGTAAAAC GCAGATCCAACACGCACGTTCATGTAAGCAGCTATGGTATCATCTACGCAATGACCTGCT GTTAATACCCATCGATTGGTAATTATCGATCCACCACAAATGTGCTCGTTCAATTCACGT ACAGACACTTGGTACGGATGCATTTCAATGTCTACTACATGGCCACCGACAATTCTGTAT GTTTTATTTCTATTTTTAACACATTCTGAAATTGACAAAGCACTGCACAAAAATATAAGT AGCTTTAGCATTTCGAACATTCTTTTTTCTGTTGTAAGACCCACAGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)