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Anopheles gambiae
cluster # 4692 cluster # 4692       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4692#0 length = 822 sequences # 3  

consensusID : consensus_4692#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 822
fasta sequence
                              [AAAAAAAAGGAAATCGGCACAGAATAATTGCAAACGATCCCTTAGACATTTTGATTCAAACTTTTTCTCAATAAATCCACATTTTGGAAAATGTACACATTGTTGAGTGGTTTTTATAAGTATCTCACACAGAAGGATGAGTATTGCATATTAATACTGGGACTGGACAACGCTGGAAAAACGACCTACCTGGAGGCGGCAAAGACGAAGTTTAGCAAGAACCACCGAGGAATGAACCCGAGCAAAATTACGACAACCGTGGGTTTAAACATTGGCCAGATCGATATTGCTGGCATACGGATGAGCTTTTGGGATTTGGGTGGCCAGCAAGAGCTGCAGTCACTGTGGGATAAATATTACTCGGAATCGCATGCCGTTATCTACGTCGTCGATTCGAATGATCGTGTTCGCATGAATGAATCAAAGGAAGTGTTCGATCGTATGATCAGCAATGAGTATTTATCGGGCATTCCCTTGCTAGTGCTAGCTAACAAACAGGATCTGCCAGATTGCATGGGTGTGCGAGAAATAAAACCCGTCTTCCAGGAGTCCGGTCATCTCATCGGACGCCGAGACTGTCTCGTGATGCCTGTATCAGCGCTTACCGGGGAAGGTGTTGACGAGGGTATAAAATGGTTGGTTGAGTCCATTAAGCGCAATTCAATCATTCGACCACCAAAAACGGAAGACACTTGATTGTAATTGAATGTATCAATGCTTTTATTTTTCTTGCGTATTACGATTGTGATAAAGCTGGGTGGCGATTCAGAGAAGCTATACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTTCCCCCCCCCCC]

[-] EMBL CNS08TH3             [AAAAAAAAGGAAATCGGCACAGAATAATTGCAAACGATCCCTTAGACATTTTGATTCAAACTTTTTCTCAATAAATCCACATTTTGGAAAATGTAAACATTGTTGAGTGGTTTTTATAAGTTTTTAAAAAAGAAGGATGAGTATTGCATATTAATACTGGGACTGGACAACGCTGGAAAAACGACCTACCTGGAGGCGGAAAAGACGAAGTTTAGCAAGAACCACCGAGGAATGAACCCGAGCAAAATTACCACAACCGTGGGTTTAAACATTGGCCAGATCGATATTGCTGGCATACGGATGAGCTTTTGGGATTTGGGTGGCCAGCAAGGGCTGGAGTAACTGTGGGATAAATATTACTCGGAATCGC TTCCGTTATCTACGTCGTCGATTCGAATGATCGTGTTCGCATGAATGAATCAAAGGAAGTGTTCGATCGTATGATCAGCAATGAGTATTTTTCGGGGATTCCCTTGCTAGTGCTAGCTAACAAACAGGGTCTGCCAGATTGCATGGGTGTGCGAGAAATAAAACCCGTCTTCCAGGAGTCCGGTCATCTCATCGGACGCCGAAAATTTCTCGTGATGCCTGTATCAGCGCTTACCGGGGAAGGTGTTGACGAGGGTATAAAATGGTTGGTTGAGTCCATTAAGCGCAATTAAATCATTCGACCACCAAAAACGGGAGAAACTTGATTGTAATTGAATGTATTAATGCTTTTATTTTTCTTGCGTATTACGATTGTGATAAAGCTG                                                                  ]
[+] EMBL CNS08TH2             [            ATCGGCACAGAATAATTGCAAACGATCCCTTAGACATTTTGATTCAAACTTTTTCTCAATAAATCCACATTTTGGAAAATGTACACATTGTTGAGTGGTTTTTATAAGTATCTCACACAGAAGGATGAGTATTGCATATTAATACTGGGACTGGACAACGCTGGAAAAACGACCTACCTGGAGGCGGCAAAGACGAAGTTTAGCAAGAACCACCGAGGAATGAACCCGAGCAAAATTACGACAACCGTGGGTTTAAACATTGGCCAGATCGATATTGCTGGCATACGGATGAGCTTTTGGGATTTGGGTGGCCAGCAAGAGCTGCAGTCACTGTGGGATAAATATTACTCGGAATCGCATGCCGTTATCTACGTCGTCGATTCGAATAATCGTGTTCGCATGAATGAATCAAAGGAAGTGTTCGATCGTATGATCAGCAATGAGTATTTATCGGGCATTCCCTTGCTAGTGCTAGCTAACAAACAGGATCTGCCAGATTGCATGGGTGTGCGAGAAATAAAACCCGTCTTCCAGGAGTCCGGTCATCTCATCGGACGCCGAGACTGTCTCGTGATGCCTGTATCAGCGCTTACCGGGGAAGGTGTTGACGAGGGTATAAAATGGTTGGTTGAGTCCATTAAGCGCAATTCAATCATTCGACCACCAAAAACGGAAGACACTTGATTGTAATTGAATGTATCAATGCTTTTATTTTTCTTGCGTATTACGATTGTGATAAAGCTGGGTGGCGATTCAGAGAAGCTATACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTTCCCCCCCCCCC]
[+] EMBL BX622930             [                                  CGATCCCTTAGACATTTTGATTCAAACTTTTTCTCAATAAATCCACATTTTGGAAAATGTACACATTGTTGAGTGGTTTTTATAAGTATCTCACACAGAAGGATGAGTATTGCATATTAATACTGGGACTGGACAACGCTGGAAAAACGACCTACCTGGAGGCGGCAAAGACGAAGTTTAGCAAGAACTACCGAGGAATGAACCCGAGCAAAATTACGACAACCGTGGGTTTAAACATTGGCCAGATCGATATTGCTGGCATACGGATGAGCTTTTGGGATTTGGGTGGCCAGCAAGAGCTGCAGTCACTGTGGGATAAATATTACTCGGAATCGCATGCCGTTATCTACGTCGTCGATTCGAATGATCGTGTTCGCATGAATGAATCAAAGGAAGTGTTCGATCGTATGATCAGCAATGAGTATTTATCGGGCATTCCCTTGCTAGTGCTAGCTAACAAACAGGATCTGCCAGATTGCATGGGTGTGCGAGAAATAAAACCCGTCTTCCAGGAGTCCGGTCATCTCATCGGACGCCGAGACTGTCTCGTGATGCCTGTATCAGCGCTTACCGGGGAAGGTGTTGACGAGGGTATAAAATGGTTGGTTGAGTCCATTAAGCGCAATTCAATCATTCGACCACCAAAAACGGAAGACACTTGATTGTAATTGAATGTATCAATGCTTTTATTTTTCTTGCGTATTACG                                                                                 ]


>consensus_4692#0 AAAAAAAAGGAAATCGGCACAGAATAATTGCAAACGATCCCTTAGACATTTTGATTCAAA CTTTTTCTCAATAAATCCACATTTTGGAAAATGTACACATTGTTGAGTGGTTTTTATAAG TATCTCACACAGAAGGATGAGTATTGCATATTAATACTGGGACTGGACAACGCTGGAAAA ACGACCTACCTGGAGGCGGCAAAGACGAAGTTTAGCAAGAACCACCGAGGAATGAACCCG AGCAAAATTACGACAACCGTGGGTTTAAACATTGGCCAGATCGATATTGCTGGCATACGG ATGAGCTTTTGGGATTTGGGTGGCCAGCAAGAGCTGCAGTCACTGTGGGATAAATATTAC TCGGAATCGCATGCCGTTATCTACGTCGTCGATTCGAATGATCGTGTTCGCATGAATGAA TCAAAGGAAGTGTTCGATCGTATGATCAGCAATGAGTATTTATCGGGCATTCCCTTGCTA GTGCTAGCTAACAAACAGGATCTGCCAGATTGCATGGGTGTGCGAGAAATAAAACCCGTC TTCCAGGAGTCCGGTCATCTCATCGGACGCCGAGACTGTCTCGTGATGCCTGTATCAGCG CTTACCGGGGAAGGTGTTGACGAGGGTATAAAATGGTTGGTTGAGTCCATTAAGCGCAAT TCAATCATTCGACCACCAAAAACGGAAGACACTTGATTGTAATTGAATGTATCAATGCTT TTATTTTTCTTGCGTATTACGATTGTGATAAAGCTGGGTGGCGATTCAGAGAAGCTATAC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTTCCCCCCCCCCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)