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Anopheles gambiae
cluster # 4838 cluster # 4838       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4838#0 length = 1443 sequences # 3  

consensusID : consensus_4838#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1443
fasta sequence
                              [AATTACGTGGCAACCAATCGCTCCGAACGGGGTAAGGTGGTCGAACGAAGTGGACGTTGGTCTTGGGTGGTAACGATCCAATTAAAAGGTTAGGTTTCATTCGTTGTGATTGTTGGCTAGTTGTTTATTGGACTAGAGAGAAGCACGCATGTAAGAGCAGGTACATGGAGGTTGCTTTTCCGTGAAGGATAAGTTTGAGTTTTAAGTTTGTTGGATAGATAAACCATCAGTAAGGATATAGACTAGTGAACAGATGTAACCCCCCCTGGCACAAGCATGTTGAGATCTTCCCAGCACAAAACAGCAACCTCCAATGAATGGACAATCTCCTTCTCCTTTCCAGTATGTGTGCGAAATACTCGAAATGCACTGACAATGTTTTCTACACTCTTGCCGATCCTTAATTTTATCATTTCAAAGACAGTTTTCATCAATTCAAAGCGAGCATTTAACCATGGTCACCTTATTTGGCAAAGTCCACAATCTACCCAATTGTGCTATTGATCCATAACTTCCCATAGACTGCAGTGTTTGCTCCCGTATGGGACGACCTCTAGCGTCCCAGTGCGCTCTCCCACCCGTGTTTTTAGATTGATGGCAGCTATTTTCCTGATGAGCTGCTGCTGCTGATTGTTCCTTCCTTTCTCGGGTCAACCCTTCATTGCATGCTAACATGCGCAACCCGTTCCGCCACCGATAGGGGACCCCAATGCTCCCTAAGGTCCTATATTTCAACGTGTACCACAACTACCGGGCATAGCTTTTACTAAGCAACAGGGAGGTGCGAAGTGGGTTACACGGATTTAATTGCAAATTGCCACCAACGATTGCGTGTACCAAGTAGCTGGGTTGTAGTACTGTGTGGCTAAAAGGAGGGTGGTAATTATCAAGTCACACAAACATAGCATGGTGGAACTGGGCCCCTTGCACCACATGAGAGCGATATATGAAGTCCAACTCCAGTGNGGGTTTGATTGAATAGCATTGAATATGGTGAGGCGCAAAAAAAGGGAAAACAAGTACCATTTTCTTTCCCCCTGTTGGGATGTCAAATTGATACCCCGAGACGAGTTACAGTTGTTAGTAAATGGAATGTGTTATACAATGGAAAACCCCAAAAGCCTGTATCCGAATTGAATTTGTGCACCCTTCCTTCGATCTGTACATCACACCGGTACCGGTAGAAACATATACAAAGCACATAAATACATAAGCTCCAATACAGCTACTAGAAGAAAAAAAAGAAAGCTAGGTTATACTAGACACACGTGCGCACTCCGATATAGTTGTTAAAGTAACGTCTAAACTAGAAGTAATGGAAACATCTCTTTCAGTGCCGCAAACCGAGCACACTGATACACTGTACCCACCAAAAACGAAATACAACAAGTTTAAAACACATACAACCGAAAGAAAGCGATTTAAGCAAATACCGATGTTAAA]

[+] EMBL BX608381             [AATTACGTGGCAACCAATCGCTCCGAACGGGGTAAGGTGGTCGAACGAAGTGGACGTTGGTCTTGGGTGGTAACGATCCAATTAAAAGGTTAGGTTTCATTCGTTGTGATTGTTGGCTAGTTGTTTATTGGACTAGAGAGAAGCACGCATGTAAGAGCAGGTACATGGAGGTTGCTTTTCCGTGAAGGATAAGTTTGAGTTTTAAGTTTGTTGGATAGATAAACCATCAGTAAGGATATAGACTAGTGAACAGATGTAACCCCCCCTGGCACAAGCATGTTGAGATCTTCCCAGCACAAAACAGCAACCTCCAATGAATGGACAATCTCCTTCTCCTTTCCAGTATGTGTGCGAAATACTCGAAATGCACTGACAATGTTTTCTACACTCTTGCCGATCCTTAATTTTATCATTTCAAAGACAGTTTTCATCAATTCAAAGCGAGCATTTAACCATGGTCACCTTATTTGGCAAAGTCCACAATCTACCCAATTGTGCTATTGATCCATAACTTCCCATAGACTGCAGTGTTTGCTCCCGTATGGGACGACCTCTAGCGTCCCAGTGCGCTCTCCCACCCGTGTTTTTAGATTGATGGCAGCTATTTTCCTGATGAGCTGCTGCTGCTGATTGTTCCTTCCTTTCTCGGGTCAACCCTTCATTGCATGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BX620516             [                                                                                                                                                                                                                  TTGGATAGATAAACCATCAGTAAGGATATAGACTAGTGAACAGATGTAACCCCCCCTGGCACAAGCATGTTGAGATCTTCCCAGCACAAAACAGCAACCTCCAATGAATGGACAATCTCCTTCTCCTTTCCAGTATGTGTGCGAAATACTCGAAATGCACTGACAATGTTTTCTACACTCTTGCCGATCCTTAATTTTATCATTTCAAAGACAGTTTTCATCAATTCAAAGCGAGCATTTAACCATGGTCACCTTATTTGGCAAAGTCCACAATCTACCCAATTGTGCTATTGATCCATAACTTCCCATAGACTGCAGTGTTTGCTCCCGTATGGGACGACCTCTAGCGTCCCAGTGCGCTCTCCCACCCGTGTTTTTAGATTGATGGCAGCTATTTTCCTGATGAGCTGCTGCTGCTGATTGTTCCTTCCTTTCTCGGGTCAACCCTTCATTGCATGCTAACATGCGCAACCCGTTCCGCCACCGATAGGGGACCCCAATGCTCCCTAAGGTCCTATATTTCAACGTGTACCACAACTACCGGGCATAGCTTTTACTAAGCAACAGGGAGGTGCGAAGTGGGTTACACGGATTTAATTGCAAATTGCCACCAACGATTGCGTGTACCAAGTAGCTGGGTTGTAGTACTGTGTGGCTAAAAGGAGGGTGGTAATTATCAAGTCACACAAACATAGCATGGTGGAACTGGGCCCCTTGCACCACATGAGAGCGATATATGAAGTCCAACTCCAGTGNGGGTTTGATTGAATAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BX604396             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAAGTGGGTTACACGGATTTAATTGCAAATTGCCACCAACGATTGCGTGTACCAAGTAGCTGGGTTGTAGTACTGTGTGGCTAAAAGGAGGGTGGTAATTATCAAGTCACACAAACATAGCATGGT GAACT GGCCCCTTGCACCACATGAGAGCGATATATGAAGTCCAACTCCAGTG TGGTTTGATTGAATAGCATTGAATATGGTGAGGCGCAAAAAAAGGGAAAACAAGTACCATTTTCTTTCCCCCTGTTGGGATGTCAAATTGATACCCCGAGACGAGTTACAGTTGTTAGTAAATGGAATGTGTTATACAATGGAAAACCCCAAAAGCCTGTATCCGAATTGAATTTGTGCACCCTTCCTTCGATCTGTACATCACACCGGTACCGGTAGAAACATATACAAAGCACATAAATACATAAGCTCCAATACAGCTACTAGAAGAAAAAAAAGAAAGCTAGGTTATACTAGACACACGTGCGCACTCCGATATAGTTGTTAAAGTAACGTCTAAACTAGAAGTAATGGAAACATCTCTTTCAGTGCCGCAAACCGAGCACACTGATACACTGTACCCACCAAAAACGAAATACAACAAGTTTAAAACACATACAACCGAAAGAAAGCGATTTAAGCAAATACCGATGTTAAA]


>consensus_4838#0 AATTACGTGGCAACCAATCGCTCCGAACGGGGTAAGGTGGTCGAACGAAGTGGACGTTGG TCTTGGGTGGTAACGATCCAATTAAAAGGTTAGGTTTCATTCGTTGTGATTGTTGGCTAG TTGTTTATTGGACTAGAGAGAAGCACGCATGTAAGAGCAGGTACATGGAGGTTGCTTTTC CGTGAAGGATAAGTTTGAGTTTTAAGTTTGTTGGATAGATAAACCATCAGTAAGGATATA GACTAGTGAACAGATGTAACCCCCCCTGGCACAAGCATGTTGAGATCTTCCCAGCACAAA ACAGCAACCTCCAATGAATGGACAATCTCCTTCTCCTTTCCAGTATGTGTGCGAAATACT CGAAATGCACTGACAATGTTTTCTACACTCTTGCCGATCCTTAATTTTATCATTTCAAAG ACAGTTTTCATCAATTCAAAGCGAGCATTTAACCATGGTCACCTTATTTGGCAAAGTCCA CAATCTACCCAATTGTGCTATTGATCCATAACTTCCCATAGACTGCAGTGTTTGCTCCCG TATGGGACGACCTCTAGCGTCCCAGTGCGCTCTCCCACCCGTGTTTTTAGATTGATGGCA GCTATTTTCCTGATGAGCTGCTGCTGCTGATTGTTCCTTCCTTTCTCGGGTCAACCCTTC ATTGCATGCTAACATGCGCAACCCGTTCCGCCACCGATAGGGGACCCCAATGCTCCCTAA GGTCCTATATTTCAACGTGTACCACAACTACCGGGCATAGCTTTTACTAAGCAACAGGGA GGTGCGAAGTGGGTTACACGGATTTAATTGCAAATTGCCACCAACGATTGCGTGTACCAA GTAGCTGGGTTGTAGTACTGTGTGGCTAAAAGGAGGGTGGTAATTATCAAGTCACACAAA CATAGCATGGTGGAACTGGGCCCCTTGCACCACATGAGAGCGATATATGAAGTCCAACTC CAGTGNGGGTTTGATTGAATAGCATTGAATATGGTGAGGCGCAAAAAAAGGGAAAACAAG TACCATTTTCTTTCCCCCTGTTGGGATGTCAAATTGATACCCCGAGACGAGTTACAGTTG TTAGTAAATGGAATGTGTTATACAATGGAAAACCCCAAAAGCCTGTATCCGAATTGAATT TGTGCACCCTTCCTTCGATCTGTACATCACACCGGTACCGGTAGAAACATATACAAAGCA CATAAATACATAAGCTCCAATACAGCTACTAGAAGAAAAAAAAGAAAGCTAGGTTATACT AGACACACGTGCGCACTCCGATATAGTTGTTAAAGTAACGTCTAAACTAGAAGTAATGGA AACATCTCTTTCAGTGCCGCAAACCGAGCACACTGATACACTGTACCCACCAAAAACGAA ATACAACAAGTTTAAAACACATACAACCGAAAGAAAGCGATTTAAGCAAATACCGATGTT AAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)