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Anopheles gambiae
cluster # 4945 cluster # 4945       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4945#0 length = 731 sequences # 4  

consensusID : consensus_4945#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 731
fasta sequence
                              [TAGATATAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAACACAAAACCCCTTAGCAGTGGATGTCAAAATCAAATCAAGTGCCTCCCAACTTTTTCTTTTTGTATTATTGTACGACCGAACGTTACGTTCCCGTGCTCCCCAAACTCTAGTTGTAGTGCATTTTATAGTTGTTTATGTTATATAGTGGCGTAGTGAAATTGTCCCTGTTTTGGAAATATTTTAGTACTTATGTAACCACCAAAGCGGCTCTTTTATAGCCGCTATATTGTACCGACTGCAGCAAAGTTAACAGTTACAAACGAAACATTAAAGAAAGGCGTACGCGTGATATGTTTCGAATGTGTATGAAAGCAATGTTGTTTTTGTTAGCAATTTATGACGTACTATTATTACGCGTAGTTAAGTTATCCGTTTTTGTAAGACGATGGACGGTGGTAATTTTACACAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGAAGCAGCTGCATAAACATTTAAAGAAGGGATGCCAGTGTTAACCGCAAGTTACATTTGGGGCGAAAGTTATATGGGTAAAAGTTGGGGTAACAAAATGTTGCTTTTCCCCCTTTAAAGCGCCAGGCGATCCCCAGGACAGGGCGCCGTTATTGTAGAATTTATTTAAATTGCAGATTTTAAGTAGAAAACAGTAAATATAATGTAACAATCCCCCCTCCCTCGTACACATGTTACACGAAGATGCTCTTTAAAGAAACAATAAATAAAGCAATG]

[+] EMBL BX608575             [TAGATATAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAACACAAAACCCCTTAGCAGTGGATGTCAAAATCAAATCAAGTGCCTCCCAACTTTTTCTTTTTGTATTATTGTACGACCGAACGTTACGTTCCCGTGCTCCCCAAACTCTAGTTGTAGTGCATTTTATAGTTGTTTATGTTATATAGTGGCGTAGTGAAATTGTCCCTGTTTTGGAAATATTTTAGTACTTATGTAACCACCAAAGCGGCTCTTTTATAGCCGCTATATTGTACCGACTGCAGCAAAGTTAACAGTTACAAACGAAACATTAAAGAAAGGCGTACGCGTGATATGTTTCGAATGTGTATGAAAGCAATGTTGTTTTTGTTAGCAATTTATGACGTACTATTATTACGCGTAGTTAAGTTATCCGTTTTTGTAAGACGATGGACGGTGGTAATTTTACACAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGAAGCAGCTGCATAAACATTTAAAGAAGGGATGCCAGTGTTAACCGCAAGTTACATTTGGGGCGAAAGTTATATGGGTAAAAGTTGGGGTAACAAAATGTTGCTTTTCCCCCTTTAAAGCGCCAGGCGATCCCCAGGACAGGGCGCCGTTATTGTAGAATTTATTTAAATTGCAGATTTTAAGTAGAAAACAGTAAATATAATGTAACAATCCCCCCTCCCTCGTACACATGTTACACGAAGATGCTCTTTAAAGAAACAATAAATAAAGCAATG]
[+] EMBL BX622560             [          TAGAGAGAGAGAGAGAGAACACAAAACCCCTTAGCAGTGGATGTCAAAATCAAATCAAGTGCCTCCCAACTTTTTCTTTTTGTATTATTGTACGACCGAACGTTACGTTCCCGTGCTCCCCAAACTCTAGTTGTAGTGCATTTTATAGTTGTTTATGTTATATAGTGGCGTAGTGAAATTGTCCCTGTTTTGGAAATATTTTAGTACTTATGTAACCACCAAAGCGGCTCTTTTATAGCCGCTATATTGTACCGACTGCAGCAAAGTTAACAGTTACAAACGAAACATTAAAGAAAGGCGTACGCGTGATATGTTTCGAATGTGTATGAAAGCAATGTTGTTTTTGTTAGCAATTTATGACGTACTATTATTACGCGTAGTTAAGTTATCCGTTTTTGTAAGACGATGGACGGTGGTAATTTTACACAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGAAGCAGCTGCATAAACATTTAAAGAAGGGATGCCAGTGTTAACCGCAAGTTACATTTGGGGCGAAAGTTATAT                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL AGA282995            [                                                                               tTTTTTTTTTTTGTATTATTGTACGACCGAACGTTACGTTCCCGTGCTCCCCAAACTCTAGTTGTAGTGCATTTTATAGTTGTTTATGTTATATAGTGGCGTAGTGAAATTGTCCCTGTTTTGGAAATATTTTAGTACTTATGTAACCACCAAAGCGGCTCTTTTATAGCCGCTATATTGTACCGACTGCAGCAAAGTTAACAGTTACAAACGAAACATTAAAGAAAGGCGTACGCGTGATATGTTTCGAATGTGTATGAAAGCAATGTTGTTTTTGTTAGCAATTTATGACGTACTATTATTACGCGTAGTTAAGTTATCCGTTTTTGTAAGACGATGGACGGTGGTAATTTTACACAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGAAGCAGCTGCATAAACATTTAAAGAAGGGATGCCAGTGTTAACCGCAAGTTACATTTGGGGCGAAAGTTATATGGGTAAAAGTTGGGGTAACAAAATGTTGCTTTTCCCCCTTTAAAGCGCCAGGCGATCCCCAGGACAGGGCGCCGTTATTGTAGAATTTATTTAAATTGCAGATTTTAAGTAGAAAACAGTAAATATAATGT                                                                      ]
[+] EMBL AGA281380            [                                                                                  TTTTTTTTTGTATTATTGTACGACCGAACGTTACGTTCCCGTGCTCCCCAAACTCTAGTTGTAGTGCATTTTATAGTTGTTTATGTTATATAGTGGCGTAGTGAAATTGTCCCTGTTTTGGAAATATTTTAGTACTTATGTAACCACCAAAGCGGCTCTTTTATAGCCGCTATATTGTACCGACTGCAGCAAAGTTAACAGTTACAAACGAAACATTAAAGAAAGGCGTACGCGTGATATGTTTCGAATGTGTATGAAAGCAATGTTGTTTTTGTTAGCAATTTATGACGTACTATTATTACGCGTAGTTAAGTTATCCGTTTTTGTAAGACGATGGACGGTGGTAATTTTACACAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGAAGCAGCTGCATAAACATTTAAAGAAGGGATGCCAGTGTTAACCGCAAGTTACATTTGGGGCGAAAGTTATATGGGTAAAAGTTGGGGTAACAAAATGTTGCTTTTCCCCCTT                                                                                                                                                                 ]


>consensus_4945#0 TAGATATAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAACACAAAACCCCTTAGCAGTGGATGTCAAAAT CAAATCAAGTGCCTCCCAACTTTTTCTTTTTGTATTATTGTACGACCGAACGTTACGTTC CCGTGCTCCCCAAACTCTAGTTGTAGTGCATTTTATAGTTGTTTATGTTATATAGTGGCG TAGTGAAATTGTCCCTGTTTTGGAAATATTTTAGTACTTATGTAACCACCAAAGCGGCTC TTTTATAGCCGCTATATTGTACCGACTGCAGCAAAGTTAACAGTTACAAACGAAACATTA AAGAAAGGCGTACGCGTGATATGTTTCGAATGTGTATGAAAGCAATGTTGTTTTTGTTAG CAATTTATGACGTACTATTATTACGCGTAGTTAAGTTATCCGTTTTTGTAAGACGATGGA CGGTGGTAATTTTACACAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGAAGCAGCTGCATAAACATTTAAA GAAGGGATGCCAGTGTTAACCGCAAGTTACATTTGGGGCGAAAGTTATATGGGTAAAAGT TGGGGTAACAAAATGTTGCTTTTCCCCCTTTAAAGCGCCAGGCGATCCCCAGGACAGGGC GCCGTTATTGTAGAATTTATTTAAATTGCAGATTTTAAGTAGAAAACAGTAAATATAATG TAACAATCCCCCCTCCCTCGTACACATGTTACACGAAGATGCTCTTTAAAGAAACAATAA ATAAAGCAATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)