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Anopheles gambiae
cluster # 4970 cluster # 4970       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4970#0 length = 915 sequences # 4  

consensusID : consensus_4970#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 915
fasta sequence
                              [CATTATATACACAAACACACCCACCAACAGCCGGTACCGATAGGATCGCGTTTATCATGTGTGTATGGTCTAGTTTTGTAAGTGCTTACAGCATAGTACAGTGCGCGTACTTTAGACTTTACTTTTCCGAACCGACATTATTAGCATGCCTTGCATCAGCTCATGTAATACGCCGTTAATGGACGGATAATATCATGTATTTGCTATCGCTATCGTTTGTTGTTGTTTCGAGCGTGAGCGTAATTATCGATGTCGCCGTTGTCGGAAGATTCATTTTAAAAAGTAAGCAAACGATTCGCTTTTCGACAACTTATAAAGTAAATTGCGGCCCATTTCGGTGAAGGGAATTAACATTACGTTTCAAACCCGTTTCTTTGTTAAGCAGTGCAAATACCTGTAAATTGGGCGATGTCAACTTCACTACTTTGTTATGATGATTCAGCCTTTTATTGTCTGAATATTCGTTATTAGAGAACTTTTTTTGTCGTGCACTACTAGCAACGAGTTGATATGTTGTTTGTTGCATTTAACCTTTAACCTTTTTCGAACGATTTATTAGAACAACAACCAAAACAAAACAGAACTTGCAAAAAAAAGTACTAACGGCTGCGAGAAAATGAATACGCCCATCTTTTTGTACGCTTAACGCTTATTATCCTAACGAAAGTGGAATTATTTCCAGAAAAAGAAAAAGGAAAGAATATAATTCAAGTGTCACCGAAGACGAATGTTTTGCGCCAGAGGAAAGAGGGTTCAAGTTCAAGGTGCGTATGTTAACCACCGGAAAATGAACTATTGAAAAATAAATCATATTTTCTTCAAGCAAGAAGTGTGTATGTGTGTGTGTGTTTAAAATTTTGATTAACAACAATTCGCCCTGTCAGAAGTTTAGAAATATATTCAAATTGGAGTCTG]

[+] EMBL BX624473             [CATTATATACACAAACACACCCACCAACAGCCGGTACCGATAGGATCGCGTTTATCATGTGTGTATGGTCTAGTTTTGTAAGTGCTTACAGCATAGTACAGTGCGCGTACTTTAGACTTTACTTTTCCGAACCGACATTATTAGCATGCCTTGCATCAGCTCATGTAATACGCCGTTAATGGACGGATAATATCATGTATTTGCTATCGCTATCGTTTGTTGTTGTTTCGAGCGTGAGCGTAATTATCGATGTCGCCGTTGTCGGAAGATTCATTTTAAAAAGTAAGCAAACGATTCGCTTTTCGACAACTTATAAAGTAAATTGCGGCCCATTTCGGTGAAGGGAATTAACATTACGTTTCAAACCCGTTTCTTTGTTAAGCAGTGCAAATACCTGTAAATTGGGCGATGTCAACTTCACTACTTTGTTATGATGATTCAGCCTTTTATTGTCTGAATATTCGTTATTAGAGAACTTTTTTTGTCGTGCACTACTAGCAACGAGTTGATATGTTGTTTGTTGCATTTAACCTTTAACCTTTTTCGAACGATTTATTAGAACAACAACCAAAACAAAACAGAACTTGCAAAAAAAAGTACTAACGGCTGCGAGAAAATGAATACGCCCATCTTTTTGTACGCTTAACGCTTATTATCCTAACGAA                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BX621047             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTACGTTTCAAACCCGTTTCTTTGTTAAGCAGTGCAAATACCTGTAAATTGGGCGATGTCAACTTCACTACTTTGTTATGATGATTCAGCCTTTTATTGTCTGAATATTCGTTATTAGAGAACTTTTTTTGTCGTGCACTACTAGCAACGAGTTGATATGTTGTTTGTTGCATTTAACCTTTAACCTTTTTCGAACGATTTATTAGAACAACAACCAAAACAAAACAGAACTTGCAAAAAAAAGTACTAACGGCTGCGAGAAAATGAATACGCCCATCTTTTTGTACGCTTAACGCTTATTATCCTAACGAAAGTGGAATTATTTCCAGAAAAAGAAAAAGGAAAGAATATAATTCAAGTGTCACCGAAGACGAATGTTTTGCGCCAGAGGAAAGAGGGTTCAAGTTCAAGGTGCGTATGTTAACCACCGGAAAATGAACTATTGAAAAATAAATCATATTTTCTTCAAGCAAGAAGTGTGTATGTGTGTGTGTGTTTAAAATTTTGATTAACAACAATTCGCCCTGTCAGAAGTTTAGAAATATATTCAAATTGGAGTCTG]
[-] EMBL AGA282125            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATACCTGTAAATTGGGCGATGTCAACTTCATTACTTTGTTATGATGATTCAGCCTTTTATTGTCTGAATATTCGTTATTAGAGAACTTTTTTTGTCGTGCACTACTAGCAACGAGTTGATATGTTGTATGTTGCATTTAACCTTTAACCTTTTTCGAACGATTTATTAGAACAACAACCAAAACAAAACAGAACTTGCAAAAAAAAGTACTAACGGCTGCGAGAAAATGAATACGCCCATCTTTTTGTACGCTTAACGCTTATTATCCTAACGAAAGTGGAATTATTTCCAGAAAAAGAAAAAGGAAAGAATATAATTCAAGTGTCACCGAAGACGAATGTTTTTCTCCAGAGGAAAGAGGGGGCAACTTCAAGGTGCGTATGTTAACC                                                                                                                                        ]
[-] EMBL AGA282126            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAACGGAACTTGCAAAAAAAAGTCCTAACGGCTGCGAGAAAATGAATACGCCCATCTTTTTGTACGCTTAACGCTTATTATCCTAACGAAAGTGGAATTATTTCCAGAAAAAGAAAAAGGAAAGAATATATTTCAAGTGTCACCGAAGACGAATGTTTTGCGCCAGAGGAAAGAGGGTTCAAGTTCAAGGTGCGTATGTTAACCACCGGAAAATGAACTATTGAAAAATAAATCATATTTTCTTCAAGCAAGAAGTGTGTATGTGTGTGTGTGTTTAAAATTTTGATTAACATCAATTCG CCTGTGAGAAGGGTAGAAATATATTCAAATT GAGTCTG]


>consensus_4970#0 CATTATATACACAAACACACCCACCAACAGCCGGTACCGATAGGATCGCGTTTATCATGT GTGTATGGTCTAGTTTTGTAAGTGCTTACAGCATAGTACAGTGCGCGTACTTTAGACTTT ACTTTTCCGAACCGACATTATTAGCATGCCTTGCATCAGCTCATGTAATACGCCGTTAAT GGACGGATAATATCATGTATTTGCTATCGCTATCGTTTGTTGTTGTTTCGAGCGTGAGCG TAATTATCGATGTCGCCGTTGTCGGAAGATTCATTTTAAAAAGTAAGCAAACGATTCGCT TTTCGACAACTTATAAAGTAAATTGCGGCCCATTTCGGTGAAGGGAATTAACATTACGTT TCAAACCCGTTTCTTTGTTAAGCAGTGCAAATACCTGTAAATTGGGCGATGTCAACTTCA CTACTTTGTTATGATGATTCAGCCTTTTATTGTCTGAATATTCGTTATTAGAGAACTTTT TTTGTCGTGCACTACTAGCAACGAGTTGATATGTTGTTTGTTGCATTTAACCTTTAACCT TTTTCGAACGATTTATTAGAACAACAACCAAAACAAAACAGAACTTGCAAAAAAAAGTAC TAACGGCTGCGAGAAAATGAATACGCCCATCTTTTTGTACGCTTAACGCTTATTATCCTA ACGAAAGTGGAATTATTTCCAGAAAAAGAAAAAGGAAAGAATATAATTCAAGTGTCACCG AAGACGAATGTTTTGCGCCAGAGGAAAGAGGGTTCAAGTTCAAGGTGCGTATGTTAACCA CCGGAAAATGAACTATTGAAAAATAAATCATATTTTCTTCAAGCAAGAAGTGTGTATGTG TGTGTGTGTTTAAAATTTTGATTAACAACAATTCGCCCTGTCAGAAGTTTAGAAATATAT TCAAATTGGAGTCTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)