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Anopheles gambiae
cluster # 5013 cluster # 5013       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5013#0 length = 808 sequences # 4  

consensusID : consensus_5013#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 808
fasta sequence
                              [ATTTCACAAATGTGTTGTTAGTTTTTTTTATTTATTTCAATTGCAAGTTTAAATTGATTCGAGCACAATATTAAACAACAGACATACTCTTGAAATGACGCTTTTTGAAAAAAAAAACATGAATAATGGTAAAGATGTGGAAAATTTTTGCAAGGATTTGAATGTAATAACTTTGTAACCAAACTTCAGTGTCTGTTTTTCACGTGTTGTGAGCGCGACGAATAAGAGCGCAAATGGCGACGAATAAGAGTAAGGAAATGGAAGAACAAAAACCGCTAGCATATAAGCAAACGATAGTATTACTGTACTTTATTTATGTATAACATTTCCCTCTATCTCTCTCTTTCTCTTGCTCTATTTTTATCTTGAAAACTCTAAAACTAACTGAAAGACAAATCGATCCAGACGTGCCCAAAGGCAAGATAGTCCGCGGTAGTAGTACATTTTTGGCTAGCAAATCGATTAATGGAAACAACAAAATGGTTTTTGGCTAACAAAATAATGGATGATGGAATGAACGAAAAAAGCGTTTAAATGATTCCAACCACTAACAACCAAAATGCTAACATGGTATTGTCATATTTTTTAAATCTGCAAGTAAAAGTTAACAAAAACCGTTACAAAACAAATTACAGTTTATATATGATATTGAATTTAATCTAGTGCAGTGTTCTAGTGTGGCAAATGGGGTGAAGTGATGAAC-AAAATCAGTAGCAGGCAGAGAAGTAAGC-ACCCAACCACTCCCTATCT-CAGCAATGTGCACCTCTCTC-ACTTAT-CNTAGGATCATAGAATGATTCCATTCCTTTCA]

[+] EMBL BX620839             [ATTTCACAAATGTGTTGTTAGTTTTTTTTATTTATTTCAATTGCAAGTTTAAATTGATTCGAGCACAATATTAAACAACAGACATACTCTTGAAATGACGCTTTTTGAAAAAAAAAACATGAATAATGGTAAAGATGTGGAAAATTTTTGCAAGGATTTGAATGTAATAACTTTGTAACCAAACTTCAGTGTCTGTTTTTCACGTGTTGTGAGCGCGACGAATAAGAGCGCAAATGGCGACGAATAAGAGTAAGGAAATGGAAGAACAAAAACCGCTAGCATATAAGCAAACGATAGTATTACTGTACTTTATTTATGTATAACATTTCCCTCTATCTCTCTCTTTCTCTTGCTCTATTTTTATCTTGAAAACTCTAAAACTAACTGAAAGACAAATCGATCCAGACGTGCCCAAAGGCAAGATAGTCCGCGGTAGTAGTACATTTTTGGCTAGCAAATCGATTAATGGAAACAACAAAATGGTTTTTGGCTAACAAAATAATGGATGATGGAATGAACGAAAAAAGCGTTTAAATGATTCCAACCACTAACAACCAAAATGCTAACATGGTATTGTCATATTTTTTAAATCTGCAAGTAAAAGTTAACAAAAACCGTTACAAAACAAATTACAGTTTATATATGATATTGAATTTAATC                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BX620837             [ TTTCACAAATGTGTTGTTAGTTTTTTTTATTTATTTCAATTGCAAGTTTAAATTGATTCGAGCACAATATTAAACAACAGACATACTCTTGAAATGACGCTTTTTGAAAAAAAAAACATGAATAATGGTAAAGATGTGGAAAATTTTTGCAAGGATTTGAATGTAATAACTTTGTAACCAAACTTCAGTGTCTGTTTTTCACGTGTTGTGAGCGCGACGAATAAGAGCGCAAATGGCGACGAATAAGAGTAAGGAAATGGAAGAACAAAAACCGCTAGCATATAAGCAAACGATAGTATTACTGTACTTTATTTATGTATAACATTTCCCTCTATCTCTCTCTTTCTCTTGCTCTATTTTTATCTTGAAAACTCTAAAACTAACTGAAAGACAAATCGATCCAGACGTGCCCAAAGGCAAGATAGTCCGCGGTAGTAGTACATTTTTGGCTAGCAAATCGATTAATGGAAACAACAAAATGGTTTTTGGCTAACAAAATAATGGATGATGGAATGAACGAAAAAAGCGTTTAAATGATTCCAACCACTAACAACCAAAATGCTAACATGGTATTGTCATATTTTTTAAATCTGCAAGTAAAAGTTAACAAAAACCGTTACAAAACAAATTACAGTTTATATATGATATTGAATTTAATCTAGTGCAGTGTTCTAGTGTGGCAAATGGGGTGAAGTGATGAAC AAAATCAGTAGCAGGCAGAGAAGTAAGC ACCCAACCACTCCCTATCT CAGCAATGTGCACCTCTCTC ACTTAT CNTAGGATCATAGAATGATTCCATTCCTTTCA]
[+] EMBL BX618481             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACTCTAAAACTAACTGAAAGACAAATCGATCCAGACGTGCCCAAAGGCAAGATAGTCCGCGGTAGTAGTACATTTTTGGCTAGCAAATCGATTAATGGAAACAACAAAATGGTTTTTGGCTAACAAAATAATGGATGATGGAATTAACGAAAAAAGTGCTTAAATTATTCCAACCACTAACAACCAAAACGCTAACATGGTATTGTCATATTTTTTAAATCTGCAAGTAAAAGTTAACAAAAACCGTTACAAAACAAATTACAGTTTATATATGATATTGAATTTAATCTAGTGCAGTGTTCTAGTGTGGCAAATGGGGTGAAGTGATGAACAAAAATCAGTAGCAGGCAGAGAAGTAAGCAACCAAACCACTCCCTATCTACAGCAATGTGCACCTCTCTCAACTTATCCATAGGATCATAGAAT                ]
[+] EMBL BX614327             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAAGATAGTCCGCGGTAGTAGTACATTTTTGGCTAGCAAATCGATTAATGGAAACAACAAAATGGTTTTTGGCTAACAAAATAATGGATGATGGAATTAACGAAAAAAGCGCTTAAATTATTCCAACCACTAACAACCAAAACGCTAACATGGTATTGTCATATTTTTTAAATCTGCAAGT                                                                                                                                                                                                                      ]


>consensus_5013#0 ATTTCACAAATGTGTTGTTAGTTTTTTTTATTTATTTCAATTGCAAGTTTAAATTGATTC GAGCACAATATTAAACAACAGACATACTCTTGAAATGACGCTTTTTGAAAAAAAAAACAT GAATAATGGTAAAGATGTGGAAAATTTTTGCAAGGATTTGAATGTAATAACTTTGTAACC AAACTTCAGTGTCTGTTTTTCACGTGTTGTGAGCGCGACGAATAAGAGCGCAAATGGCGA CGAATAAGAGTAAGGAAATGGAAGAACAAAAACCGCTAGCATATAAGCAAACGATAGTAT TACTGTACTTTATTTATGTATAACATTTCCCTCTATCTCTCTCTTTCTCTTGCTCTATTT TTATCTTGAAAACTCTAAAACTAACTGAAAGACAAATCGATCCAGACGTGCCCAAAGGCA AGATAGTCCGCGGTAGTAGTACATTTTTGGCTAGCAAATCGATTAATGGAAACAACAAAA TGGTTTTTGGCTAACAAAATAATGGATGATGGAATGAACGAAAAAAGCGTTTAAATGATT CCAACCACTAACAACCAAAATGCTAACATGGTATTGTCATATTTTTTAAATCTGCAAGTA AAAGTTAACAAAAACCGTTACAAAACAAATTACAGTTTATATATGATATTGAATTTAATC TAGTGCAGTGTTCTAGTGTGGCAAATGGGGTGAAGTGATGAACAAAATCAGTAGCAGGCA GAGAAGTAAGCACCCAACCACTCCCTATCTCAGCAATGTGCACCTCTCTCACTTATCNTA GGATCATAGAATGATTCCATTCCTTTCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)