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Anopheles gambiae
cluster # 5027 cluster # 5027       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5027#0 length = 1534 sequences # 4  

consensusID : consensus_5027#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1534
fasta sequence
                              [TGTAAACCAAGCGCGCAAAATAAAATTCATCGTAACGCGGGGAAGGACGAGAAAACAAAACGAAACAAGTGAAAAACAAACAAACTTACAAAAACAAAGCAAGATTGAAATCAACACCATCTGTGATACTAAAAAAGGGAGTTACGAGTAATGAAGAGAAGAAAACGCAAGCAAACAAACAAACAAACAAACGTAACGTTAACGTATAACATCAAAATGGTCAAAAAACAGAAAAAATCGAATGCTTAATGGTGACTTAAAGCCAAGCCAACGCCGCCCAACCGACAGTGGCAAGCAAAAAACCGTGGCAGCGGCCAGAT-AAAAAAAAAATGGTGGTTAACAACACAAACTAAGCGCTCAATATAAAACGTAACCGCACCATAAAAAAAATGAAAAAACGAAAGTACTGTAGAGAAGTGATAAAACGTACTGTTTAAATTAATATATCAATCGACCCACTCGCCCACCACCTTCTCGGTCGGTCGCGGATCGGAAGTAATTGGAAGCAAATTTAATTTAAATAATAAT--TTTGAAATTTGTTTTTGGTTTTGTCGTGTTTGTTTTATGTTGTAGATGTTGTGTTATAAAAGAATCAAGAGCAAGCACATTGTATACATTGTGAGCAAGTTAAGTCGGTAACAACAGCAAAAGCGACGAAAAATCGAAGCTTCGAAGAAGAGTAACTTAAACGAGCGATAAGCTACGAACAACCGCCAACTGTTCTATGAAGAAGAGAAACAGTTAGCAAAGAGAAAGAGAGAAGATAAATGTGCTAATTTGTGAAGTGAAGTGTGTGTGATATGGTGTGTATCACAACTCGATTCACGACGTACCGATCTTTTGAATCGTTTTACAGAGGGCAAACGTAGAATAATGGGAGGATTATTTTTTTAA-AACACACAGTCTTCACACATACTCTTCAAAACACTGTTGCGATCCTTGATGTGAACATTTAAAATAGCACGTCGCTTATACCGGAGAAAACAGCTATAAAGTGTGCTTCTTCCTTTTTAACGACACGCGTGCCCTCCTGGTACACTGAGTGAAGCAATATTTTCCTTGGGTTTTTGGATGTTTAAACCAAAACCCCTCGAAAAACGAAAATCCTACAATGGAATAGTGAAAAGGAATATTTTGAGTGTGTTTTATGTGTTGAACTTTTCTTTACTTTTTTTTCTAAAATGCTTTGCTAAGCTGACAGGACATTAACCTTGTCTACCAAAATGCAAACGCAAATTAGCAAATTTCCCCCACAATTAACCCCGCCGTGCACAGTAAAAGTGTGTGTGCATATGTGGTGCTTGTGTAAGTATGTATGTTTGCCCTTTCTTGTAATGACATAGTACGCGTACTACATGAATTCGCTGTGTGAACTCTATTATTCAGTCGTCAAACGCGGCAGTGCGCGTGATGCTATTAATCTCTTACGATTGAACAGCAAATGTAATGCAAAAAACCCCGGTCACTGNTGTGCAACTGTGTGTACACAGCTGTACGGTAATCTACATAAATCAACCCTTCTATTCTGTCTCTC]

[-] EMBL AGA284187            [TGTAAACCAAGCGCGCAAAATAAAATTCATCGTAACGCGGGGAAGGACGAGAAAACAAAACGAAACAAGTGAAAAACAAACAAACTTACAAAAACAAAGCAAGATTGAAATCAACACCATCTGTGATACTAAAAAAGGGAGTTACGAGTAATGAAGAGAAGAAAACGCAAGCAAACAAACAAACAAACAAACGTAACGTTAACGTATAACATCAAAATGGTCAAAAAACAGAAAAAATCGAATGCTTAATGGTGACTTAAAGCCAAGCCAACGCCGCCCAACCGACAGTGGCAAGCAAAAAACCGTGGCAGCGGCCAGAT AAAAAAAAAATGGTGGTTAACAACACAAACTAAGCGCTCAATATAAAACGTAACCGCACCATAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BX605540             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCGGCCAGATAAAAAAAAAAATGGTGGTTAACAACACAAACTAAGCGCTCAATATAAAACGTAACCGCACCATAAAAAAAATGAAAAAACGAAAGTACTGTAGAGAAGTGATAAAACGTACTGTTTAAATTAATATATCAATCGACCCACTCGCCCACCACCTTCTCGGTCGGTCGCGGATCGGAAGTAATTGGAAGCAAATTTAATTTAAATAATAAT  TTTGAAATTTGTTTTTGGTTTTGTCGTGTTTGTTTTATGTTGTAGATGTTGTGTTATAAAAGAATCAAGAGCAAGCACATTGTATACATTGTGAGCAAGTTAAGTCGGTAACAACAGCAAAAGCGACGAAAAATCGAAGCTTCGAAGAAGAGTAACTTAAACGAGCGATAAGCTACGAACAACCGCCAACTGTTCTATGAAGAAGAGAAACAGTTAGCAAAGAGAAAGAGAGAAGATAAATGTGCTAATTTGTGAAGTGAAGTGTGTGTGATATGGTGTGTATCACAACTCGATTCACGACGTACCGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BM618459             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccgCTTCTCGGTCGGTCGCGGATCGGAAGTAATTGGAAGCAAATTTAATTTAAATAATAATGGTTTGAAATTTGTTTTTGGTTTTGTCGTGTTTGTTTTATGTTGTAGATGTTATGTTATAAAAGAATGAAGAGCAAGCACATTGTATACATTGTGAGCAAGTAAAGTCGGTAACAACAGCAAAAGCGACGAAAAATCGAAGCTTCGAAGATGAGTAACTTAAACGAGCGAAAAGCTACGAACAACCGCCTACTGTTCTATGAAGAAGAGAAACAGTTAGCAAAGAGAAAGAGAGAAGATAAATGTGCTATTTTGTGAAGTGAAGTCCGTGTGATATGGTGTGTATCAGCACTCGATCCACGACGTACCGATCTTTTGAATCGTTTTACAGAGGGCAAACGTAGAATAATGGGAGGATTATTTTTTTAA AACACACAGTCTTCACACATACTCTTCAAAACACTGTTGCGATCCTTGATGTGAACATTTAAAATAGCACGTCGCTTATACCGGAGAAAACAGCTATAAAGTGTGCTTCTTCCTTTTTAACGACACGCGTGCCCTCCTGGTACACTGAGTGAAGCAATATTTTCCTTGGGTTTTTGGATGTTTAAACCAAAACCCCTCGAAAAACGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BX621691             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTGTATCACAACTCGATTCACGACGTACCGATCTTTTGAATCGTTTTACAAAGGGCAAACGCGGAATAATGGAAGGATT TTAATTTAACAACACACAGTCTTCACACATACTCTTCAAAACACTGTTGCGATCCTTGGTGTGGACATTTAAAATAGCACGTCGCTTATACCGGAGAAAACAGCTATAAAGTGTGCTTCTTCCTTTTTAATGACACGCGTGTCCTCCTGGTACACTGAGTGAAGCAATATTTTCCTTGCTTTTTTGGATGTTTAAACCAAAACCCCTTGAAAAACGAAAATCCTACAATGGAATAGTGAAAAGGAATATTTTGAGTGTGTTTTATGTGTTGAACTTTTCTTTACTTTTTTTTCTAAAATGCTTTGCTAAGCTGACAGGACATTAACCTTGTCTACCAAAATGCAAACGCAAATTAGCAAATTTCCCCCACAATTAACCCCGCCGTGCACAGTAAAAGTGTGTGTGCATATGTGGTGCTTGTGTAAGTATGTATGTTTGCCCTTTCTTGTAATGACATAGTACGCGTACTACATGAATTCGCTGTGTGAACTCTATTATTCAGTCGTCAAACGCGGCAGTGCGCGTGATGCTATTAATCTCTTACGATTGAACAGCAAATGTAATGCAAAAAACCCCGGTCACTGNTGTGCAACTGTGTGTACACAGCTGTACGGTAATCTACATAAATCAACCCTTCTATTCTGTCTCTC]


>consensus_5027#0 TGTAAACCAAGCGCGCAAAATAAAATTCATCGTAACGCGGGGAAGGACGAGAAAACAAAA CGAAACAAGTGAAAAACAAACAAACTTACAAAAACAAAGCAAGATTGAAATCAACACCAT CTGTGATACTAAAAAAGGGAGTTACGAGTAATGAAGAGAAGAAAACGCAAGCAAACAAAC AAACAAACAAACGTAACGTTAACGTATAACATCAAAATGGTCAAAAAACAGAAAAAATCG AATGCTTAATGGTGACTTAAAGCCAAGCCAACGCCGCCCAACCGACAGTGGCAAGCAAAA AACCGTGGCAGCGGCCAGATAAAAAAAAAATGGTGGTTAACAACACAAACTAAGCGCTCA ATATAAAACGTAACCGCACCATAAAAAAAATGAAAAAACGAAAGTACTGTAGAGAAGTGA TAAAACGTACTGTTTAAATTAATATATCAATCGACCCACTCGCCCACCACCTTCTCGGTC GGTCGCGGATCGGAAGTAATTGGAAGCAAATTTAATTTAAATAATAATTTTGAAATTTGT TTTTGGTTTTGTCGTGTTTGTTTTATGTTGTAGATGTTGTGTTATAAAAGAATCAAGAGC AAGCACATTGTATACATTGTGAGCAAGTTAAGTCGGTAACAACAGCAAAAGCGACGAAAA ATCGAAGCTTCGAAGAAGAGTAACTTAAACGAGCGATAAGCTACGAACAACCGCCAACTG TTCTATGAAGAAGAGAAACAGTTAGCAAAGAGAAAGAGAGAAGATAAATGTGCTAATTTG TGAAGTGAAGTGTGTGTGATATGGTGTGTATCACAACTCGATTCACGACGTACCGATCTT TTGAATCGTTTTACAGAGGGCAAACGTAGAATAATGGGAGGATTATTTTTTTAAAACACA CAGTCTTCACACATACTCTTCAAAACACTGTTGCGATCCTTGATGTGAACATTTAAAATA GCACGTCGCTTATACCGGAGAAAACAGCTATAAAGTGTGCTTCTTCCTTTTTAACGACAC GCGTGCCCTCCTGGTACACTGAGTGAAGCAATATTTTCCTTGGGTTTTTGGATGTTTAAA CCAAAACCCCTCGAAAAACGAAAATCCTACAATGGAATAGTGAAAAGGAATATTTTGAGT GTGTTTTATGTGTTGAACTTTTCTTTACTTTTTTTTCTAAAATGCTTTGCTAAGCTGACA GGACATTAACCTTGTCTACCAAAATGCAAACGCAAATTAGCAAATTTCCCCCACAATTAA CCCCGCCGTGCACAGTAAAAGTGTGTGTGCATATGTGGTGCTTGTGTAAGTATGTATGTT TGCCCTTTCTTGTAATGACATAGTACGCGTACTACATGAATTCGCTGTGTGAACTCTATT ATTCAGTCGTCAAACGCGGCAGTGCGCGTGATGCTATTAATCTCTTACGATTGAACAGCA AATGTAATGCAAAAAACCCCGGTCACTGNTGTGCAACTGTGTGTACACAGCTGTACGGTA ATCTACATAAATCAACCCTTCTATTCTGTCTCTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)