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Anopheles gambiae
cluster # 5129 cluster # 5129       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5129#0 length = 898 sequences # 4  

consensusID : consensus_5129#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 898
fasta sequence
                              [CGCCCAGGNTAATACGAGTTAACATGAAGGCCTTCATCTGCTGTTTCTGTTCGTTGCCGGCGCCTTGTGCTGGCGTTGAGGAGAGCATCTGGCTGTCCAAGCAGGTGCGCCTGGATGCCGGCACCAGCGCCGAGTACAATGGCCGCATCGTCGGCGGCTCGACCGT-CCCGATCAGCCAGTTCCCGTACCAG-CTGTC-GCTGCGCCAGAACGGCAACCACATCTGCGGTGCCTCGGTTATCTCCTCCAACTGGGCTCTGTCCGCTGCTCACTGTACCTTCCCGATGCCGAGCGCTGCCTCCATCTCGTTCCGCGGTGGTAGCGACAGCCGTACC-GGCGGTGGTGTCATCTTCCAGGCC-GCCCAGATCATCAACCACCCGCAGTACAACAGCAACAACCTGAACAACGATGTGTGCGTCATCCGTATCACCACCTCGTTCGTCGGTGCCAACATTGCCCCGATCCGTCTGGTCGCTAGCGGAACCAGCTTCGCTGCCGGCACCAACAGCGT-CGTCTCTGGATGGGGTCTGACCTCTCCCGGAGGATCGCTGCCGGTTAACCTACACGCCGTCAACATCCCGGTCGTCGCCCAGGCTACCTGCAG-CTCGCAG-TGGGGAACTGGACGTATCACC-GCCGCCATGG-TGTGCGCTGGTGTTCAGGGCC-GC-GACTCGTGCAACGGT-GACAGCGGTGGCCCGC-TGGTCAC-TGGTGGAGCCCAG-TTC--GGTGTTGTCT-CGTGGGGTGCAGTGCAGTGCGGTGGACCTCTGCCGGGAGTGTACGCCAACATTGGTAACGCCGGCATCCGCAGCTTCATCAGCCAGAACACTGGAGTGTAAGAAGCGACTGGTGCGCACTTTCTAACGAGTCAAACGAATGGATAATTAAAACCAAAACGCTAACGCAACAA]

[+] EMBL AL693347             [CGCCCAGGNTAATACGAGTTAACATGAAGGCCTTCATCTGCTGTTTCTGTTCGTTGCCGGCGCCTTGTGCTGGCGTTGAGGAGAGCATCTGGCTGTCCAAGCAGGTGCGCCTGGATGCCGGCACCAGCGCCGAGTACAATGGCCGCATCGTCGGCGGCTCGACCGTACCCGATCAGCCAGTTCCCGTACCAGACTGTCTGCTGCGCCAGAACGGCAACCACATCTGCGGTGCCTCGGTTATCTCCTCCAACTGGGCTCTGTCCGCTGCTCACTGTACCTTCCCGATGCCGAGCGCTGCCTCCATCTCGTTCCGCGGTGGTAGCGACAG CGTACCTGGCGGTGGTGTCATCTTCCAGGCCTGCCCAGATCATCAACCACCCGCAGTACAACAGCAACAA CTGAACAACGATGTGTGCGTCATCCGTATCACCACCTCGTTCGTCGGTGCCAACATTGGCCCGATCCGTCTGGTCGCTAGCGGAACCAGCTTCGCTGCCGGCACCAACAGCGTACGTCTCTGGATGGGGTCTGACCTCTCCCGGAGGATCGCTGCCGGTTAA CTACACGCCGTCAACAT CCGGTCGTCGCCCAGNCTACCTGCAGCCTCGCAGTTGGGGAACTGGACGTATCACCNGCGGCCATGGTTGTGCGCTGGTGTTCAGGGCCNGCGGACTCGTGCACCGGTGGACAG GGTGGCCCGCTTGGTCCCGTGGTGGGNGCCAGCTTCCGGGTGTTGTCTCCGT GGGTGCCGTGCNGTGCGGTGGANCTC                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BX622983             [                                                       GCCGGCGCCTTG GCTGGCGTTGAGGAGAGCATCTGGCTGTCCAAGCAGGTGCGCCTGGATGCCGGCACCAGCGCCGAGTACAATGGCCGCATCGTCGGCGGCTCGACCGT CCCGATCAGCCAGTTCCCGTACCAG CTGTC GCTGCGCCAGAACGGCAACCACATCTGCGGTGCCTCGGTTATCTCCTCCAACTGGGCTCTGTCCGCTGCTCACTGTACCTTCCCGATGCCGAGCGCTGCCTCCATCTCGTTCCGCGGTGGTAGCGACAGCCGTACC GGCGGTGGTGTCATCTTCCAGGCC GCCCAGATCATCAACCACCCGCAGTACAACAGCAACAACCTGAACAACGATGTGTGCGTCATCCGTATCACCACCTCGTTCGTCGGTGCCAACATTGCCCCGATCCGTCTGGTCGCTAGCGGAACCAGCTTCGCTGCCGGCACCAACAGCGT CGTCTCTGGATGGGGTCTGACCTCTCCCGGAGGATCGCTGCCGGTTAACCTACACGCCGTCAACATCCCGGTCGTCGCCCAGGCTACCTGCAG CTCGCAG TGGGGAACTGGACGTATCACC GCCGCCATGG TGTGCGCTGGTGTTCAGGGCC GC GACTCGTGCAACGGT GACAGCGGTGGCCCGC TGGTCAC TGGTGGAGCCCAG TTC  GGTGTTGTCT CGTGGGGTGCAGTGCAGTGCGGTGGACCTCTGCCGGGAGTGTACGCCAACATTGGTAACGCCGGCATCCGCAGCTTCATCAGCCAGAACACTGGAGTGTAAGAAGCGACTGGTGCGCACTTTCTAACGAGTCAAACGAA                                 ]
[+] EMBL BX627986             [                                                                     CTGGCGTTGAGGAGAGCATCTGGCTGTCCAAGCAGGTGCGCCTGGATGCCGGCACCAGCGCCGAGTACAATGGCCGCATCGTCGGCGGCTCGACCGT CCCGATCAGCCAGTTCCCGTACCAG CTGTC GCTGCGCCAGAACGGCAACCACATCTGCGGTGCCTCGGTTATCTCCTCCAACTGGGCTCTGTCCGCTGCTCACTGTACCTTCCCGATGCCGAGCGCTGCCTCCATCTCGTTCCGCGGTGGTAGCGACAGCCGTACC GGCGGTGGTGTCATCTTCCAGGCC GCCCAGATCATCAACCACCCGCAGTACAACAGCAACAACCTGAACAACGATGTGTGCGTCATCCGTATCACCACCTCGTTCGTCGGTGCCAACATTGCCCCGATCCGTCTGGTCGCTAGCGGAACCAGCTTCGCTGCCGGCACCAACAGCGT CGTCTCTGGATGGGGTCTGACCTCTCCCGGAGGATCGCTGCCGGTTAACCTACACGCCGTCAACATCCCGGTCGTCGCCCAGGCTACCTGCAG CTCGCAG TGGGGAACTGGACGTATCACC GCCGCCATGG TGTGCGCTGGTGTTCAGGGCC GC GACTCGTGCAACGGT GACAGCGGTGGGCCGC TGGTCAC T                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BX623929             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CGGT GACAGCGGTGGCCCGC TGGTCAC TGGTGGAGCCCAG TTC  GGTGTTGTCT CGTGGGGTGCAGTGCAGTGCGGTGGACCTCTGCCGGGAGTGTACGCCAACATTGGTAACGCCGGCATCCGCAGCTTCATCAGCCAGAACACTGGAGTGTAAGAAGCGACTGGTGCGCACTTTCTAACGAGTCAAACGAATGGATAATTAAAACCAAAACGCTAACGCAACAA]


>consensus_5129#0 CGCCCAGGNTAATACGAGTTAACATGAAGGCCTTCATCTGCTGTTTCTGTTCGTTGCCGG CGCCTTGTGCTGGCGTTGAGGAGAGCATCTGGCTGTCCAAGCAGGTGCGCCTGGATGCCG GCACCAGCGCCGAGTACAATGGCCGCATCGTCGGCGGCTCGACCGTCCCGATCAGCCAGT TCCCGTACCAGCTGTCGCTGCGCCAGAACGGCAACCACATCTGCGGTGCCTCGGTTATCT CCTCCAACTGGGCTCTGTCCGCTGCTCACTGTACCTTCCCGATGCCGAGCGCTGCCTCCA TCTCGTTCCGCGGTGGTAGCGACAGCCGTACCGGCGGTGGTGTCATCTTCCAGGCCGCCC AGATCATCAACCACCCGCAGTACAACAGCAACAACCTGAACAACGATGTGTGCGTCATCC GTATCACCACCTCGTTCGTCGGTGCCAACATTGCCCCGATCCGTCTGGTCGCTAGCGGAA CCAGCTTCGCTGCCGGCACCAACAGCGTCGTCTCTGGATGGGGTCTGACCTCTCCCGGAG GATCGCTGCCGGTTAACCTACACGCCGTCAACATCCCGGTCGTCGCCCAGGCTACCTGCA GCTCGCAGTGGGGAACTGGACGTATCACCGCCGCCATGGTGTGCGCTGGTGTTCAGGGCC GCGACTCGTGCAACGGTGACAGCGGTGGCCCGCTGGTCACTGGTGGAGCCCAGTTCGGTG TTGTCTCGTGGGGTGCAGTGCAGTGCGGTGGACCTCTGCCGGGAGTGTACGCCAACATTG GTAACGCCGGCATCCGCAGCTTCATCAGCCAGAACACTGGAGTGTAAGAAGCGACTGGTG CGCACTTTCTAACGAGTCAAACGAATGGATAATTAAAACCAAAACGCTAACGCAACAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)