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Anopheles gambiae
cluster # 5152 cluster # 5152       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5152#0 length = 1331 sequences # 4  

consensusID : consensus_5152#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1331
fasta sequence
                              [ATGGAGGAAAAAGGAAGTATTAAATCGTGACACAGTGTATGGTTGTATCGAAAAAATAGGGGCGCAAAAGCACAGAGTACGCACAATTTCAATTCCCACCCCTCACCCCCTTTTTATCCCTTAATCGTAATGAGATGTACTGGTATTTAACAATTTAGTGTCTAACCATGATCATCTTCTAGATAGGCATTCCTTTGCTTAGGGAATGAGGCTAGAGGCCAGAAACATGGTAAAGGTAGACGATTTATCACGCTGTTTGGTGGGTAAATACTTTAGGATGTGAAAATAGTTTAGGACAACGAAGACGGGGGATAATGGAGCATTTTTTTCGATTATTTTTTCAATCATAAGTTAACTTTGGCGACCTTATTCGCATTATGGCAGTTGTGCAATATTTTACACTGCTTTTATTGATTTGATGTACCATGCTACCAGTTAACATCATACTTTAATTTTAATGTATCACTTTCACTAACACTAACTAAGCACAACTGTCCTTTCGAACGCGTTGTTCGTACACCTTATTGGAGTCCCTTTGTTGGAACGCAAGGGTGGATTGATCTGTACAAATACCGAAAGGATACNCGAAATGGACTCAGCAGCAGCAGCAGCAGAANCAGACAGACAGACGACACGGTAAACCCGAAAAAAGAAAGCAATAATCAACGTCCAATTCGCCCAGCAACTCACCAAATGTGGCAGAGAAATGTACTTCAATCATCGCTGTATCACGACGGGGAGCTCATCCACTACTGCTACTATCACCAGCTGTGTGTG-G-TTGTGTCCTTATCTCCCTTCTTCATCTCCCTTCTAATTGGTAGTATCTCANGGCTTATATAAGGTCTTTTTCAGTGCACCCAATCCATTCTCATCCCTCTATCCTAACTAACTTGTGCTCTCGCTTTTGCCTCCTTGTTTTTGTTGCTACAAATCATTACTGTACACGATTTTCGACGCATCATCCAACACACACTCACCGTCGATGATAATCAACCGACCACCACCCACCCTGTCGCATGAAGCAATTCTCTTTCAGCGTGTAAGTGTCTCTAGCCAATCCTGGAGCGTGGAGTGGAGGAGGTGTTGTTTAGCCGGTGTTGGTAATTAAAGTTGGCATTGGGTTGTGCGAAGAGATCTCCGAGTGATCCCCTTTCTCTATATAGCTCCGTGAGTACTTGTTCTTCCTACTTTGCACAGACAAACACAACACTCACATCCACCTTTTACTGTTGTCTATGGCAACCCGCTTGGTGGATGGTTTTCACTACGATGGTATTACCACCGTCATTATCCTAGAGATAGGAGATTATTTTTCTAATAATTTCATATGA]

[+] EMBL BM636185             [ATGGAGGAAAAAGGAAGTATTAAATCGTGACACAGTGTATGGTTGTATCGAAAAAATAGGGGCGCAAAAGCACAGAGTACGCACAATTTCAATTCCCACCCCTCACCCCCTTTTTATCCCTTAATCGTAATGAGATGTACTGGTATTTAACAATTTAGTGTCTAACCATGATCATCTTCTAGATAGGCATTCCTTTGCTTAGGGAATGAGGCTAGAGGCCAGAAACATGGTAAAGGTAGACGATTTATCACGCTGTTTGGTGGGTAAATACTTTAGGATGTGAAAATAGTTTAGGACAACGAAGACGGGGGATAATGGAGCATTTTTTTCGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BX623805             [                                                                                                        ACCCCCTTTTTATCCCTTAATCGTAATGAGATGTACTGGTATTTAACAATTTAGCGTCTAACCATGATCATCTTCTAGATAGGCATTCCTTTGCTTAGGGAATGAGGCTAGAGGCCAGTAGCATGGTAAAGGTAGACGATTTATCACGCTGTTTGGTGGGTAAATACTTTAGGATGTGAGAATAGTTTAGGACAACGAANACGGGGGATAATGGAGCATTTTTTTCGATTATTTTTTCAATCATAAGTTAACTTTGGCGACCTTATTCGCATTATGGCAGTTGTGCAATATTTTACACTGCTTTTATTGATTTGATGTACCATGCTACCAGTTAACATCATACTTTAATTTTAATGTATCACTTTCACTAACACTAACTAAGCACAACTGTCCTTTCGAACGCGTTGTTCGTACACCTTATTGGAGTCCCTTTGTTGGAACGCAAGGGTGGATTGATCTGTACAAATACCGAAAGGATACNCGAAATGGACTCAGCAGCAGCAGCAGCAGAANCAGACAGACAGACGACACGGTAAACCCGAAAAAAGAAAGCAATAATCAACGTCCAATTCGCCCAGCAACTCACCAAATGTGGCAGAGAAATGTACTTCAATCATCGCTGTATCACGACGGGGAGCTCATCCACTACTGCTACTATCACCAGCTGTGTGTG G TTGTGTCCTTATCTCCCTTCTTCATCTCCCTTCTAATTGGTAGTATCTCANGGCTTATATAAGGTCTTTTTCAGTGCACCCAATCCATTCTCATCCCTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BX614659             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTCACTAACACTAACTAAGCACAACTGTCCTTTCGAACGCGTTGTTCGTACACCTTATTGGAGTCCCTTTGTTGGAACGCAAGGGTGGAATGCTCTGTACAAATACCAAAAGGATACGCGAAATGGACTCAGCAGCAGCAGCAGCAGAAGCAGACAGACAGACGACACGGTAAACCCGAAAAAAGAAAGCAATAATCAACGTCCACTTCTCCCAGCAACTCACCAAATGTGGCAGAGAAATGTACTACAATCATCGCTGTATCACGACGGGGAGCTCATCCACTACTGCTCCTATCACCAGCTGTGTGTGTGTTTGTGTCCTTATCTCCCTTCTTCATCTCCCTTCTAATTGGTAGTATCTCAGGGCTTATATAGGGTCTTTTTCAGTGCACCAAATCCATTCTCATCCCTCTATCCTAACTAACTTGTGCTCTCGCTTTTGCCTCCTTGTTTTTGTTGCTACAAATCATTACTGTACACGATTTTCGACGCATCATCCAACACACACTCACCGTCGATGATAATCAACCGACCACCACCCACCCTGTCGCATGAAGCAATTCTCTTTCAGCGTGTAAGTGTCTCTAGCCAATCCTGGAGCGTGGAGTGGAGGAGGTGTTGTTTAGCCGGTGTTGGTAATTAAAGTTGGCAT                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BX618977             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATCATTACTGTACACGATTTTCGACGCATCATCCAACACACACTCACCGTCGATGATAATCAACCGACCACCACCCACCCTGTCGCAGGAAGCAATTCTCTTTCAGCGTGTAAGTGTCTCTAGCCGATCCTGGAGCGTGGAGTGGAGGAGGTGTTGTTTAGCCGGTGTTGGTAATTAAAGTTGGCATTGGGTTGTGCGAAGAGATCTCCGAGTGATCCCCTTTCTCTATATAGCTCCGTGAGTACTTGTTCTTCCTACTTTGCACAGACAAACACAACACTCACATCCACCTTTTACTGTTGTCTATGGCAACCCGCTTGGTGGATGGTTTTCACTACGATGGTATTACCACCGTCATTATCCTAGAGATAGGAGATTATTTTTCTAATAATTTCATATGA]


>consensus_5152#0 ATGGAGGAAAAAGGAAGTATTAAATCGTGACACAGTGTATGGTTGTATCGAAAAAATAGG GGCGCAAAAGCACAGAGTACGCACAATTTCAATTCCCACCCCTCACCCCCTTTTTATCCC TTAATCGTAATGAGATGTACTGGTATTTAACAATTTAGTGTCTAACCATGATCATCTTCT AGATAGGCATTCCTTTGCTTAGGGAATGAGGCTAGAGGCCAGAAACATGGTAAAGGTAGA CGATTTATCACGCTGTTTGGTGGGTAAATACTTTAGGATGTGAAAATAGTTTAGGACAAC GAAGACGGGGGATAATGGAGCATTTTTTTCGATTATTTTTTCAATCATAAGTTAACTTTG GCGACCTTATTCGCATTATGGCAGTTGTGCAATATTTTACACTGCTTTTATTGATTTGAT GTACCATGCTACCAGTTAACATCATACTTTAATTTTAATGTATCACTTTCACTAACACTA ACTAAGCACAACTGTCCTTTCGAACGCGTTGTTCGTACACCTTATTGGAGTCCCTTTGTT GGAACGCAAGGGTGGATTGATCTGTACAAATACCGAAAGGATACNCGAAATGGACTCAGC AGCAGCAGCAGCAGAANCAGACAGACAGACGACACGGTAAACCCGAAAAAAGAAAGCAAT AATCAACGTCCAATTCGCCCAGCAACTCACCAAATGTGGCAGAGAAATGTACTTCAATCA TCGCTGTATCACGACGGGGAGCTCATCCACTACTGCTACTATCACCAGCTGTGTGTGGTT GTGTCCTTATCTCCCTTCTTCATCTCCCTTCTAATTGGTAGTATCTCANGGCTTATATAA GGTCTTTTTCAGTGCACCCAATCCATTCTCATCCCTCTATCCTAACTAACTTGTGCTCTC GCTTTTGCCTCCTTGTTTTTGTTGCTACAAATCATTACTGTACACGATTTTCGACGCATC ATCCAACACACACTCACCGTCGATGATAATCAACCGACCACCACCCACCCTGTCGCATGA AGCAATTCTCTTTCAGCGTGTAAGTGTCTCTAGCCAATCCTGGAGCGTGGAGTGGAGGAG GTGTTGTTTAGCCGGTGTTGGTAATTAAAGTTGGCATTGGGTTGTGCGAAGAGATCTCCG AGTGATCCCCTTTCTCTATATAGCTCCGTGAGTACTTGTTCTTCCTACTTTGCACAGACA AACACAACACTCACATCCACCTTTTACTGTTGTCTATGGCAACCCGCTTGGTGGATGGTT TTCACTACGATGGTATTACCACCGTCATTATCCTAGAGATAGGAGATTATTTTTCTAATA ATTTCATATGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)