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Anopheles gambiae
cluster # 5179 cluster # 5179       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5179#0 length = 1680 sequences # 4  

consensusID : consensus_5179#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1680
fasta sequence
                              [TTTCGAATAGCGCTTTTTTATTGATGGTTCATCTTTTGTTTCCTTATTTACCCACTGTTTCGGTGCACGTTTAATCCATCCTAGCCGCGTGTGGCTGCATGCAGCGCAGACAATACTCGACAAACTTTAGGTCCTTTACGTACTCGGTGAGTCGCTTGAAGTGCCGCTCCGTGTACGGAAGCGACGCTTCGAGGTGTTTGTTCAGCTCGCTTACCTGAAACCGGCCCGCCAGCGTCTCCTGCAGCAGTACGTTCAGCGCCACGAGCCGGTCGGCAATTTTTGCTGTTTGTGTTCCACTCGATCGCGTGCCGGAGCAGTCGCTCTTTGTGATCGTTCGACAACTTTGTTCACAGTGTCCTCCAGGCCTTGCTCCTTCGTTCGGATCACCTCGTTAACGATCTTCAGCGTGCTGAGCGGCCGGTCGAGGTTGAGCGACAGGCGCA-CGCTTTCAGCAGCTTCCGCTCGCTCAACAGATTGCTCAGCTCCTGCTCCTGTAGCAGCGTGTCCTTGCGCTGGTCCAGCTCCTGCTGACGTTTGCTTTCCGTAACATCCTGCCACTGGATGAGCTGCGAGTCGGACCCACCGCTGTAGAACATACTCTCGTCCCGCGTCACACACAGCGCCCAGACGCGGTTATCGTGCTTGTCCAGCGTCTGCACACAGTCGGAGGTTTTGATCGACCACAGCTTTACCAGCCCGTCCGCACCCGCCGACAGCAGCTGCATACCGTTGGTGAGAAACTCGACGCGCAGCACC-GAGCTGTCGTGCCCTTCGAGCGTTTTCAGGCAGGTCATATCCTCCAGCGACCACAGTTTGATGGTGCAGTCGGCCGCATTGGTGAGCAGTATCTGATCGACCGGGGAAAACCGTACCGCCCAGATGCCACGCGTATGGCCGCGGAACACGCCCACCACGCTCAGATCGCTCGCGTCCCACAGTTTGGCCGTTTTGTCCTGCGAAGCCGTCGCTATCAGCGGA-CGCGTGGGCGGAATGGTCACACAGTTAATGTCCTTCTCGTGGGCCAACGCGGTCAGGCTGCACTGTAGCCGCGGCAGCTCGCCGTCCTCTTCGGTGGTGAACTTTTTCGGTATTTTCCACGTCTTCAGGCAACGGTCCTGACTGAC-GCTGGCACAGAAATTACCGCCCTGCCTGCTCAGCGTCAC-ACACCCGACCGTGTTCGTGTGCTTCAGCCCGATCGCAACGCAGCTGATCGTGANCGGTTCCTCGGTAAAGCTCCACAGGCGGATCGAGTTATCCTTGG-AGGAGGAAAGC-AAATACCGATCGTTTGCACACAGCG-ACAGCAC-AATGTCCGGTCGTGCGCCCTTCACCAGCCGNCAGTTACATCGTGCTCACGTCGTACACCTTAAAAGTCGCTATCTGTTNGTTGCCATGGCCGATGCTGCTGCTCGCGCATTTGGACCGAACAAGAATCAAGGCTCCCAANTATNTCGCACGTTGTAGCNCCGACGATCTAGCTAGTTGTCACAGCTAGTAGAAGCTGTGTCGCAATACCGATGCACCCAGAATGTTCTGGTCGCCTCAACATCAGACACACCAGTGCTGACNGTCGNGGCTACACTGTAGAACAGGTGCGTAATAGCCAGCCCACCCTCTTCACGCCGCTTTCGCCACGAGACTGTTCGACTGTTTGAAGATATCTTGCAAAACCTCGGGGGATTC]

[+] EMBL CNS08SSL             [TTTCGAATAGCGCTTTTTTATTGATGGTTCATCTTTTGTTTCCTTATTTACCCACTGTTTCGGTGCACGTTTAATCCATCCTAGCCGCGTGTGGCTGCATGCAGCGCAGACAATACTCGACAAACTTTAGGTCCTTTACGTACTCGGTGAGTCGCTTGAAGTGCCGCTCCGTGTACGGAAGCGACGCTTCGAGGTGTTTGTTCAGCTCGCTTACCTGAAACCGGCCCGCCAGCGTCTCCTGCAGCAGTACGTTCAGCGCCACGAGCCGGTCGGCAATTTTTGCTGTTTGTGTTCCACTCGATCGCGTGCCGGAGCAGTCGCTCTTTGTGATCGTTCGACAACTTTGTTCACAGTGTCCTCCAGGCCTTGCTCCTTCGTTCGGATCACCTCGTTAACGATCTTCAGCGTGCTGAGCGGCCGGTCGAGGTTGAGCGACAGGCGCA CGCTTTCAGCAGCTTCCGCTCGCTCAACAGATTGCTCAGCTCCTGCTCCTGTAGCAGCGTGTCCTTGCGCTGGTCCAGCTCCTGCTGACGTTTGCTTTCCGTAACATCCTGCCACTGGATGAGCTGCGAGTCGGACCCACCGCTGTAGAACATACTCTCGTCCCGCGTCACACACAGCGCCCAGACGCGGTTATCGTGCTTGTCTAGCGTTTGCACACAGTCGGAGGTTTTGATTGACCACAGCTTTACCAGCCCGTCTGCACCCGCCGACAGCAGCTGCATACCGTTGGTGAGAAACTCGACGCGCA CACCGGAGCTATCGTGCCCTTCGAGCGTTTTCAGGCAGGTCATGTCCTCCAGCGACCACAGCTTGATGGTGCAGTCGGCCGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL BM649615             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAGGCGCAGCGCTTTCAGCAGCTTCCGCTCGCTCAACAGATTGCTCAGCTCCTGCTCCTGTAGCAGCGTGTCCTTGCGCTGGTCCAGCTCCTGCTGACGTTTGCTTTCCGTAACATCCTGCCACTGGATGAGCTGCGAGTCGGAGCCACCGCTGTAGAACATACTCTCATCCCGCGTCACACACAGCGCCCAGACGCGGTTATCGTGCTTGTCCAGCGTCTGCACACAGTCGGAGGTTTTGATCGACCACAGCTTTACCAGCCCGTCCGCACCCGCCGACAGCAGCTGCATACCGTTGGTGAGAAACTCGACGCGCAGCACC GAGCTGTCGTGCCCTTCGAGCGTTTTCAGGCAGGTCATATCCTCCAGCGACCACAGTTTGATGGTGCAGTCGGCCGCATTGGTGAGCAGTATCTGATCGACCGGGGAAAACCGTACCGCCCAGATGCCACGCGTATGGCCGCGGAACACGCCCACCACGCTCAGATCGCTCGCGTCCCACAGTTTGGCCGTTTTGTCCTGCGAAGCCGTCGCTATCAGCGGA CGCGTGGGCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL BX620250             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCAGCGTCTGCACACAGTCGGAGGTTTTGATCGACCACAGCTTTACCAGCCCGTCCGCACCCGCCGACAGCAGCTGCATACCGTTGGTGAGAAACTCGACGCGCAGCACC GAGCTGTCGTGCCCTTCGAGCGTTTTCAGGCAGGTCATATCCTCCAGCGACCACAGTTTGATGGTGCAGTCGGCCGCATTGGTGAGCAGTATCTGATCGACCGGGGAAAACCGTACCGCCCAGATGCCACGCGTATGGCCGCGGAACACGCCCACCACGCTCAGATCGCTCGCGTCCCACAGTTTGGCCGTTTTGTCCTGCGAAGCCGTCGCTATCAGCCGATCG TTCGGCGAAATGGTCACACAGTTAATGTCCTTCTCGTGGGCCAACGCGGTCAGGCTGCACTGTAGCCGCGGCAGCTCGCCGTCCTCTTCGGTGGTGAACTTTTTCGGTATTTTCCACGTCTTCAGGCAACGGTCCTGACTGAC GCTGGCACAGAAATTACCGCCCTGCCTGCTCAGCGTCAC ACACCCGACCGTGTTCGTGTGCTTCAGCCCGATCGCAACGCAGCTGATCGTGANCGGTTCCTCGGTAAAGCTCCACAGGCGGATCGAGTTATCCTTGG AGGAGGAAAGC AAATACCGATCGTTTGCACACAGCG ACAGCAC AATGTCCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL AL694866             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTCGGTATTTNCCACGTCTTCAGGCAACGGTCCTGACTGACAGCTGGCACAGAAATNACCGCCCTGCCTGCTCAGCGTCACAACACCCGACCGTGTTCGTGTGCTTCAGCCCGATCGCAACGCAGCTGATCGTGAACGGTTCCTCGGTAAAGCTCCACAGCCGGATCGAGTTATCCTTGGAAGGAGGAAAGCAAAATACCGATCGTTTGCACACAGCGNACAGCACAAATGTCACGTCGTGCGCCCTTCACCAGCCGNCAGTTACATCGTGCTCACGTCGTACACCTTAAAAGTCGCTATCTGTTNGTTGCCATGGCCGATGCTGCTGCTCGCGCATTTGGACCGAACAAGAATCAAGGCTCCCAANTATNTCGCACGTTGTAGCNCCGACGATCTAGCTAGTTGTCACAGCTAGTAGAAGCTGTGTCGCAATACCGATGCACCCAGAATGTTCTGGTCGCCTCAACATCAGACACACCAGTGCTGACNGTCGNGGCTACACTGTAGAACAGGTGCGTAATAGCCAGCCCACCCTCTTCACGCCGCTTTCGCCACGAGACTGTTCGACTGTTTGAAGATATCTTGCAAAACCTCGGGGGATTC]


>consensus_5179#0 TTTCGAATAGCGCTTTTTTATTGATGGTTCATCTTTTGTTTCCTTATTTACCCACTGTTT CGGTGCACGTTTAATCCATCCTAGCCGCGTGTGGCTGCATGCAGCGCAGACAATACTCGA CAAACTTTAGGTCCTTTACGTACTCGGTGAGTCGCTTGAAGTGCCGCTCCGTGTACGGAA GCGACGCTTCGAGGTGTTTGTTCAGCTCGCTTACCTGAAACCGGCCCGCCAGCGTCTCCT GCAGCAGTACGTTCAGCGCCACGAGCCGGTCGGCAATTTTTGCTGTTTGTGTTCCACTCG ATCGCGTGCCGGAGCAGTCGCTCTTTGTGATCGTTCGACAACTTTGTTCACAGTGTCCTC CAGGCCTTGCTCCTTCGTTCGGATCACCTCGTTAACGATCTTCAGCGTGCTGAGCGGCCG GTCGAGGTTGAGCGACAGGCGCACGCTTTCAGCAGCTTCCGCTCGCTCAACAGATTGCTC AGCTCCTGCTCCTGTAGCAGCGTGTCCTTGCGCTGGTCCAGCTCCTGCTGACGTTTGCTT TCCGTAACATCCTGCCACTGGATGAGCTGCGAGTCGGACCCACCGCTGTAGAACATACTC TCGTCCCGCGTCACACACAGCGCCCAGACGCGGTTATCGTGCTTGTCCAGCGTCTGCACA CAGTCGGAGGTTTTGATCGACCACAGCTTTACCAGCCCGTCCGCACCCGCCGACAGCAGC TGCATACCGTTGGTGAGAAACTCGACGCGCAGCACCGAGCTGTCGTGCCCTTCGAGCGTT TTCAGGCAGGTCATATCCTCCAGCGACCACAGTTTGATGGTGCAGTCGGCCGCATTGGTG AGCAGTATCTGATCGACCGGGGAAAACCGTACCGCCCAGATGCCACGCGTATGGCCGCGG AACACGCCCACCACGCTCAGATCGCTCGCGTCCCACAGTTTGGCCGTTTTGTCCTGCGAA GCCGTCGCTATCAGCGGACGCGTGGGCGGAATGGTCACACAGTTAATGTCCTTCTCGTGG GCCAACGCGGTCAGGCTGCACTGTAGCCGCGGCAGCTCGCCGTCCTCTTCGGTGGTGAAC TTTTTCGGTATTTTCCACGTCTTCAGGCAACGGTCCTGACTGACGCTGGCACAGAAATTA CCGCCCTGCCTGCTCAGCGTCACACACCCGACCGTGTTCGTGTGCTTCAGCCCGATCGCA ACGCAGCTGATCGTGANCGGTTCCTCGGTAAAGCTCCACAGGCGGATCGAGTTATCCTTG GAGGAGGAAAGCAAATACCGATCGTTTGCACACAGCGACAGCACAATGTCCGGTCGTGCG CCCTTCACCAGCCGNCAGTTACATCGTGCTCACGTCGTACACCTTAAAAGTCGCTATCTG TTNGTTGCCATGGCCGATGCTGCTGCTCGCGCATTTGGACCGAACAAGAATCAAGGCTCC CAANTATNTCGCACGTTGTAGCNCCGACGATCTAGCTAGTTGTCACAGCTAGTAGAAGCT GTGTCGCAATACCGATGCACCCAGAATGTTCTGGTCGCCTCAACATCAGACACACCAGTG CTGACNGTCGNGGCTACACTGTAGAACAGGTGCGTAATAGCCAGCCCACCCTCTTCACGC CGCTTTCGCCACGAGACTGTTCGACTGTTTGAAGATATCTTGCAAAACCTCGGGGGATTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)