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Anopheles gambiae
cluster # 5324 cluster # 5324       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5324#0 length = 652 sequences # 4  

consensusID : consensus_5324#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 652
fasta sequence
                              [CCGGGTTCCGAGATCACACAACCTAAGTCTATAACCTCAAGCAAGCTCCTTAGTGCATCAGCGTAGTTCATCGAGAACACTACTCCGTTTTGGTGCTTTTAAAGCTGTACCGTTCTGTTTGTGTCCTTGTGTGTGTGTTCGGGTATTCTGAATTAGTTTAAATTGTTTTACCAACAATTAACAATTGAGCAAATATTAAATAAATATACGATCTGCTAGAAATTAAAAAATAATCAACAATGTCATCTATCTCAGATTTTCGCAAGAAGAAGCTATTGTACCTGTTCAACGTTTTCTTCGATGTCAACCAGAGTGGGGAAATTGATCGGAAGGATTTTGAATTAGCTATTGAGAAAATCTGTACATTGCGTGGTTGGCCTGCAGGTAATCCAAAGAACATAGAAACGCACGACTGTATGTTCAAGATCTGGGAAGGCTTACGCTCCAA-GGCAGATAAGGACAACGATGGGCAGGTTTCTGTTGATGAATGGTGCAACATGTGGGATGCTTACGCCAAAGATCCTAGTACAGTCATGGATTGGCAGATAAGATACATGAAC-TTTATGTTCGACCTGGAAGATGCCTCACACGATGGCACTATCGATGGCGATGAATTCTCTATAGTATGCTCAAGCTACGGCGTAGACAAAAA]

[+] EMBL BM586301             [CCGGGTTAACAGATCACACAACCTAAGTCTATAACCTCAAGCAAGCTCCTTAGTGCATCAGCGTAGTTCATCGAGAACACTACTCCGTTTTGGTGCTTTTAAAGCTGTACCGTTCTGTTTGTGTCCTTGTGTGTGTGTTCGGGTATTCTGAATTAGTTTAAATTGTTTTACCAACAATTAACAATTGAGCAAATATTAAATAAATATACGATCTGCTAGAAATTAAAAAATAATCAACAATGTCATCTATCTCAGATTTTCGCAAGAAGAAGCTATTGTACCTGTTCAACGTTTTCTTCGATGTCAACCAGAGTGGGGAAATTGATCGGAAGGATTTTGAATTAGCTATTGAGAAAATCTGTACATTGCGTGGTTGGCCTGCAGGTAATCCAAAGAACATAGAAACGCACGACTGTATGTTCAAGATCTGGGAAGGCTTACGCTCCAA GGCAGATAAGGACAACGATGGGCAGGTTTCTGTTGATGAATGGTGCAACATGTGGGATGCTTACGCCAAAGATCCTAGTACAGTCATGGATTGGCAGATAAGATACATGAAC TTTATGTTCGACCTGGAAGATGCCTCACACGATGGCACTATCGATGGCGATGAATTCTCTATAGTATGCTCAAGCTACGGCGTAGACAAAAA]
[+] EMBL BM621050             [       CCGAGATCACACAACCTAAGTCTATAACCTCAAGCAAGCTCCTTAGTGCATCAGCGTAGTTCATCGAGAACACTACTCCGTTTTGGTGCTTTTAAAGCTGTACCGTTCTGTTTGTGTCCTTGTGTGTGTGTTCGGGTATTCTGAATTAGTTTAAATTGTTTTTCGAATAATTAACAATTGAACAAATATTAAATAAATATACGATCTGCTAGAAACTAAAAAATAATCAACAATGTCATCTATCTCAGATTTTCGCAAGAAGAAGCTATTGTACCTGTTCAACGTTTTCTTCGATGTCAACCAGAGTGGGGAAATTGATCGGAAGGATTTTGAATTAGCTATTGAGAAAATCTGTACATTGCGTGGTTGGCCTGCAGGTAATCCAAAGAACATAGAAACGCACGACTGTATGTTCAAGATCTGGGAAGGCTTACGCTCCAA GGCAGACAAGGACAACGATGGGCAGGTTTCTGTTGATGAATGGTGCAACATGTGGGATGCTTACGCCAAAGATCCTAGTACAGTCATGGATTGGCAGATAAGATACATGAAC TTTATGTTCGACCTGGAAGATGCCTCACACGATGGCACTATCGAT                                               ]
[+] EMBL BM615516             [       CCGAGATCACACAACCTAAGTCTATAACCTCAAGCAAGCTCCTTAGTGCATCAGCGTAGTTCATCGAGAACACTACTCCGTTTTGGGGCTTTTAAAGCTGTACCGTTCTGTTTGTGTCCTTGTGTGTGTGTTCGGGTATTCTGAATTAGTTTAAATTGTTTTACCAACAATTAACAATTGAGCAAATATTAAATAAATATACGATCTGCTAGAAATTAAAAAATAATCAACAATGTCATCTATCTCAGATTTTCGCAAGAAGAAGCTATTGTACCTGTTCAACGTTTTCTTCGATGTCAACCAGAGTGGGGAAATTGATCGGAAGGATTTTGAATTAGCTATTGAGAAAATCTGTACATTGCGTGGTTGGCCTGCAGGTAATCCAAAGAACATAGAAACGCACGACTGTATGTTCAAGATCTGGGAAGGCTTACGCTCCAA GGCAGATAAGGACAACGATGGGCAGGTTTCTGTTGATGAATGGTGCAACATGTGGGATGCTTACGCCAAAGATCCTAGTACAGTCATGGATTGGCAGATAAGATACATGAACTTTTATGTTCGACCT                                                                              ]
[+] EMBL AL930902             [                               TAACCTC AGC AGCTCCTTA TGCATCAGCGTAGTTCATCGAGAACACTACTCCG TTTGGTGCTTTTAAAGCTGTACCGTTCTGTTTGTGTCC TGTGTGTGTG TCGGGTATTCTGAATTAGTTTAAA TGTTTTACCAACAATTAACAATTGAGCAAATATTAAATAAATATACGATCTGCTAGAAATTAAAAAATAATCAACAATGTCATCTATCTCAGATTTTCGCAAGAAGAAGCTA TGTACCTGTTCAACGTTTTCTTCGATGTCAACCAGAGTGGGGAAATTGATCGGAAGGATTTTGAATTAGCTATTGAGAAAATCTGTACATTGCGTGGTTGGCCTGCAGGTAATCCAAAGAACATAGAAACGCACGACTGTATGTTCAAGATCTGGGAAGGCTTACGCTCCAAGGGCAGATAAGGACAACG                                                                                                                                                                                            ]


>consensus_5324#0 CCGGGTTCCGAGATCACACAACCTAAGTCTATAACCTCAAGCAAGCTCCTTAGTGCATCA GCGTAGTTCATCGAGAACACTACTCCGTTTTGGTGCTTTTAAAGCTGTACCGTTCTGTTT GTGTCCTTGTGTGTGTGTTCGGGTATTCTGAATTAGTTTAAATTGTTTTACCAACAATTA ACAATTGAGCAAATATTAAATAAATATACGATCTGCTAGAAATTAAAAAATAATCAACAA TGTCATCTATCTCAGATTTTCGCAAGAAGAAGCTATTGTACCTGTTCAACGTTTTCTTCG ATGTCAACCAGAGTGGGGAAATTGATCGGAAGGATTTTGAATTAGCTATTGAGAAAATCT GTACATTGCGTGGTTGGCCTGCAGGTAATCCAAAGAACATAGAAACGCACGACTGTATGT TCAAGATCTGGGAAGGCTTACGCTCCAAGGCAGATAAGGACAACGATGGGCAGGTTTCTG TTGATGAATGGTGCAACATGTGGGATGCTTACGCCAAAGATCCTAGTACAGTCATGGATT GGCAGATAAGATACATGAACTTTATGTTCGACCTGGAAGATGCCTCACACGATGGCACTA TCGATGGCGATGAATTCTCTATAGTATGCTCAAGCTACGGCGTAGACAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)