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Anopheles gambiae
cluster # 5372 cluster # 5372       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5372#0 length = 1307 sequences # 4  

consensusID : consensus_5372#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1307
fasta sequence
                              [CNAGTNACACAGAAACGAAGGTGTCCAACGTGTTGTCTATCACTGTGATATTAGATTATTCTTCGAACGAGATGTGAGAATTGCGAGAAAGGAGTATAAAGTAACACATTGCATAAAGCCGAAGTGCTGTTATAATTCACCCGTACTATGGAAGGTCATTTCAATCAAACATGGACGTTCGAGGTACAGTGCGTTTCACCTGACAGCAGGATAGTCATAACATAAGTCATACACAGATCAAAGTTTACGTACTGCACATGTGGGCATATCTCATTTCTTGCTGCAAGTTTGAATGCATTTCACAGTGATTCACGTGCAAAATGCGTT-AAAACGTTCAACGGATGTTTGTTCGTTTCCCAACAGTTCTTACCAGTCAGATAGATGTATGAGCATTTCAAAATCCCTCTTTGATATGTGAGCAATGAAATTAATACGAGTTCAAAGCGAGGCTTGATAAATGTAGCTATGTATCTTAAATGAAAAAAAGTGCTATCCTGTTTCAAACGCAAGATGATGATTCGCCTTGACGATGAGCTCGAGATTATTAGGATTCAATTCTAGTTAGNATGCAGCATGTAATGACGGGAATGGCAATATTCGTTTCATCCTACCACCATAAAAACGTTGATAAGAAAGCTAAGCGTTTTGTTTGTGTTATCTCTTATTTTATGAACATTAAAAAACATTGTTTCGTATACCCCACGACTAGCATTTTGGGGAACTTTTCACACCACTTCAAGACCTCAATAAGATCAGACTGTAATTGCTTGGTTTAAAATTGGTTCAATTGGTTAAAAGTGAAAGCCAAGATAGCAGCGTGCATAAACTATACTGACGGATACTATTTATTATTGCCGTATTAGCAACGTGCTATAACGTACCGTTTTCATTAAATGCCTTCGCAGGAAATCAGTTTGGATTAGAAATTCATGTGAGGTTTGCATAGGGCCACTAAATAACAGCTGCATTCTCGAAATGATTAATGCAATGAAACGATGAAAATAAACTTGTAAAATTGAAACAAAAAAGAGAGCAAGCAAGAAGAAGCAAGATCGAAAGCAAATGGGTATTAGTGATAGGAGAAGAAGCAAAAGGTACGACTTGTGCGTTAAAATTGTAAATATCAAGGAAACAAAACTCGTAACGCAACGAGCTGCCCACAGATACGATAAAGTGGATAAAGAAACCGAAGGAAGTAAGCTCGTTTGTAAGAGAAAAATATTGAATTTATGAACCTGTAATAAATCTAAAAGGAAAAAGGAAAAAATATGAAAATAAAAGGAAACGCCACATCCTCTATTAATTAC]

[+] EMBL AL932124             [CNAGTNACACAGAAACGAAGGTGTCCAACGTGTTGTCTATCACTGTGATATTAGATTATTCTTCGAACGAGATGTGAGAATTGCGAGAAAGGAGTATAAAGTAACACATTGCATAAAGCCGAAGTGCTGTTATAATTCACCCGTACTATGGAAGGTCATTTCAATCAAACATGGACGTTCGAGGTACAGTGCGTTTCACCTGACAGCAGGATAGTCATAACATAAGTCATACACAGATCAAAGTTTACGTACTGCACATGTGGGCATATCTCATTTCTTGCTGCAAGTTTGAATGCATTTCACAGTGATTCACGTGCAAAATGCGTT AAAACGTTCAACGGATGTTTGTTCGTTTCCCAACAGTTCTTACCAGTCAGATAGATGTATGAGCATTTCAAAATCCCTCTTTGATATGTGAGCAATGAAATTAATACGAGTTCAAAGCGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BX624927             [                                                                                                                                                                         CATGGACGTTCGAGGTACAGTGCGTTTCACCTGACAGCAGGATAGTCATAACATAAGTCATACACAGATCAAAGTTTACGTACTGCACATGTGGGCATATCTCATATCTTGCTGCAAGTTTGAATGCATTTCACAGTGATTCACGTGCAAAATGCGTTAAAAACGTTCAACGGATGTTTGTTCGTTTCCCAACAGCTCTTACCAGTCAGATAGATGTATGAACATTTCAAAATCCCTCTTTGATATGTGAGCAATGAAATTAATACGAGTTCAAAGCGAGGCTTGATAAATGTAGCTATGTATCTTAAATGAAAAAAAGTGCTATCCTGTTTCAAACGCAAGATGATGATTCGCCTTGACGATGAGCTCGAGATTATTAGGATTCAATTCTAGTTAGNATGCAGCATGTAATGACGGGAATGGCAATATTCGTTTCATCCTACCACCATAAAAACGTTGATAAGAAAGCTAAGCGTTTTGTTTGTGTTATCTCTTATTTTATGAACATTAAAAAACATTGTTTCGTATACCCCACGACTAGCATTTTGGGGAACTTTTCACACCACTTCAAGACCTCAATAAGATCAGACTGTAATTGCTTGGTTTAAAATTGGTTCAATTGGTTAAAAGTGAAAGCCAAGATAGCAGCGTGCATAAACTATACTGACGGATACTATTTATTATTGCCGTATTAGCAACGTGCTATAACGTACCGTTTTCATTAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BM614813             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ccgAATTGGTTCAATTGGTTAAAAGTGAAAGCCAAGATAGCGGCGTGCATAAACTATACTGACTGATACTATTTATTATTGCCGTATTAGCAACGTGCTATAACGTACCGTTTTCATTAAATGCCTTCGCAGGAAATCAGTTTGGATTAGAAATTCATGTGAGGTTTGCATAGGGCCACTAAATAACAGCTGCATTCTCGAAATGATTAATGCAATGAAACGATGAAAATAAACTTGTAAAATTGAAACAAAAAAGAGAGCAAGCAAGAAGAAGCAAGATCGAAAGCAAATGGGTATTAGTGATAGGAGAAGAAGCAAAAGGTACGACTTGTGCGTTAAAATTGTAAATATCAAGGAAACAAAACTCGTAACGCAACGAGCTGCCCACAGATACGATAAAGTGGATAAAGAAACCGAAGGAAGTAAGCTCGTTTGTAAGAGAAAAATATTGAATTTATGAACCTGTAATAAATCTAAAAGGAAAAAGGAAAAAATATGAAAATAAAAGGAAACGCCACATCCTCTATTAATTAC]
[+] EMBL BM640097             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ccGAGAAGAAGCAAAAGGTACGACTTGTGCGTTAAAATTGTAAATATCAAGGAAACAAAACTCGTAACGCAACGAGCTGCCCACAGATACGATAAAGTGGATAACGAAACCGAAGGAAGTAAGCTCGTTTGTAAGAGAAAAATATTGAATTTATGAACCTGTAATAAATCTAAAAGGAAAAAGGAAAAAATATGAAAATAAAAGGAAACGCCACATCCT           ]


>consensus_5372#0 CNAGTNACACAGAAACGAAGGTGTCCAACGTGTTGTCTATCACTGTGATATTAGATTATT CTTCGAACGAGATGTGAGAATTGCGAGAAAGGAGTATAAAGTAACACATTGCATAAAGCC GAAGTGCTGTTATAATTCACCCGTACTATGGAAGGTCATTTCAATCAAACATGGACGTTC GAGGTACAGTGCGTTTCACCTGACAGCAGGATAGTCATAACATAAGTCATACACAGATCA AAGTTTACGTACTGCACATGTGGGCATATCTCATTTCTTGCTGCAAGTTTGAATGCATTT CACAGTGATTCACGTGCAAAATGCGTTAAAACGTTCAACGGATGTTTGTTCGTTTCCCAA CAGTTCTTACCAGTCAGATAGATGTATGAGCATTTCAAAATCCCTCTTTGATATGTGAGC AATGAAATTAATACGAGTTCAAAGCGAGGCTTGATAAATGTAGCTATGTATCTTAAATGA AAAAAAGTGCTATCCTGTTTCAAACGCAAGATGATGATTCGCCTTGACGATGAGCTCGAG ATTATTAGGATTCAATTCTAGTTAGNATGCAGCATGTAATGACGGGAATGGCAATATTCG TTTCATCCTACCACCATAAAAACGTTGATAAGAAAGCTAAGCGTTTTGTTTGTGTTATCT CTTATTTTATGAACATTAAAAAACATTGTTTCGTATACCCCACGACTAGCATTTTGGGGA ACTTTTCACACCACTTCAAGACCTCAATAAGATCAGACTGTAATTGCTTGGTTTAAAATT GGTTCAATTGGTTAAAAGTGAAAGCCAAGATAGCAGCGTGCATAAACTATACTGACGGAT ACTATTTATTATTGCCGTATTAGCAACGTGCTATAACGTACCGTTTTCATTAAATGCCTT CGCAGGAAATCAGTTTGGATTAGAAATTCATGTGAGGTTTGCATAGGGCCACTAAATAAC AGCTGCATTCTCGAAATGATTAATGCAATGAAACGATGAAAATAAACTTGTAAAATTGAA ACAAAAAAGAGAGCAAGCAAGAAGAAGCAAGATCGAAAGCAAATGGGTATTAGTGATAGG AGAAGAAGCAAAAGGTACGACTTGTGCGTTAAAATTGTAAATATCAAGGAAACAAAACTC GTAACGCAACGAGCTGCCCACAGATACGATAAAGTGGATAAAGAAACCGAAGGAAGTAAG CTCGTTTGTAAGAGAAAAATATTGAATTTATGAACCTGTAATAAATCTAAAAGGAAAAAG GAAAAAATATGAAAATAAAAGGAAACGCCACATCCTCTATTAATTAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)