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Anopheles gambiae
cluster # 5419 cluster # 5419       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5419#0 length = 1074 sequences # 4  

consensusID : consensus_5419#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1074
fasta sequence
                              [AGCACACTAACGTTTGTACTAACACACACATTCAAAAACACATACATACATACATACATACATACATACATACATAGAGCACACATTGTTTTACTGTGAATGTATTTTATGATGCATGTATTTGTGAGACAACATTGTACTTTACGGGGTCAGTCCCAGTCCCGGTCGTCTTACTCATCCTTCAATATGATATACTCTATTATGATGTACTCTAACGATGGCCAATATTTGTAATCATATTCATTGTGTCATTCACACACACTCACACACCCACACACAACCATGTAGCTAAATCAATGAACCAACTGTCCGGACTTAACTGACCCGCCCTGTTTGTATGTTGTTACGCGTAAGCCAGGAGAAAACACTAGCAATGCCTACAGGAAGGATGGTTTCCTTCTTTCCGTTGTACTTTTACGACCAAAGTGCCGGAACAGGGGGCAACACACAAAAGAAAACCCTTACTTCTTTACACGCACTATTTGCCGTACCTTATCTAGTTCTGTATCTAGGGCACATGCTTTAATCGAACTGTTTTAACTGGTTACCGTGCCCCTCTACCTAGCCTATGTACCTATGTGCGCCTAGAACCTAACCTAGCCCATCGTTCATTGAGTGTTGCATTTCGTGTCTGCCACACGCTGTCCTCCTTTGTACCTAGTTCACGCTTAACGCATACTCCTTAATGCATACCAACGATCGTTCAGCTGCTGCTGTACATTTGCTGTGCCGTTGTAAAGTAATACGCAACAGAGGAAAAAACCAAAGATTCGTGCACGTCTCGTGCGGTAGTGGTAGTCGCAGTAGAAGGCAGTAGCAGTAGTAGCTTAACGATATTTGTCAGCTGTCCGCGTGCTCGTTTGTTTGACAAAATAAATGCTAGCAATAGATTATTGTTTATCGATGTACATAAATTGAAATAAAATACTAAAAAAAAAACAACATTTGTAAATTGTGATCGTATTATGGAGGGGCAAAGATGGTGGCTTATCTACTACTCTACAGAATAGCTCCTACTATCTACTACTCAGTATTCAAAGCCCAGATGTGTTTGTCTGTGTCTGTCTGTCTGTA]

[+] EMBL BX609767             [AGCACACTAACGTTTGTACTAACACACACATTCAAAAACACATACATACATACATACATACATACATACATACATAGAGCACACATTGTTTTACTGTGAATGTATTTTATGATGCATGTATTTGTGAGACAACATTGTACTTTACGGGGTCAGTCCCAGTCCCGGTCGTCTTACTCATCCTTCAATATGATATACTCTATTATGATGTACTCTAACGATGGCCAATATTTGTAATCATATTCATTGTGTCATTCACACACACTCACACACCCACACACAACCATGTAGCTAAATCAATGAACCAACTGTCCGGACTTAACTGACCCGCCCTGTTTGTATGTTGTTACGCGTAAGCCAGGAGAAAACACTAGCAATGCCTACAGGAAGGATGGTTTCCTTCTTTCCGTTGTACTTTTACGACCAAAGTGCCGGAACAGGGGGCAACACACAAAAGAAAACCCTTACTTCTTTACACGCACTATTTGCCGTACCTTATCTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BX612509             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         CATGTAGCGAAATCAATGAACCAACTGTCCGGACTTAACTGACCCGCCCTGTTTGTATGTTGTTACGCGTAAGCCAGGAGAAAACACTAGCAATGCCTACAGGAAGGATGGTTTCCTTCTTTCCGTTGTACTTTTACGACCAAAGTGCCGGAACAGGGGGCAACACACAAAAGAAAACCCTTACTTCTTTACACGCACTATTTGCCGTACCTTATCTAGTTCTGTATCTAGGGCACATGCTTTAATCGAACTGTTTTAACTGGTTACCGTGCCCCTCTACCTAGCCTATGTACCTATGTGCGCCTAGAACCTAACCTAGCCCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BX612671             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTTGTTACGCGTAAGCCAGGAGAAAACACTAGCAATGCCTACAGGAAGGATGGTTTCCTTCTTTCCGTTGTACTTTTACGACCAAAGTGCCGGAACAGGGGGCAACACACAAAAGAAAACCCTTACTTCTTTACACGCACTATTTGCCGTACCTTATCTAGTTCTGTATCTAGGGCACATGCTTTAATCGAACTGTTTTAACTGGTTACCGTGCCCCTCTACCTAGCCTATGTACCTATGTGCGCCTAGAACCTAACCTAGCCCATCGTTCATTGAGTGTTGCATTTCGTGTCTGCCACACGCTGTCCTCCTTTGTACCTAGTTCACGCTTAACGCATACTCCTTAATGCATACCAACGATCGTTCAGCTGCTGCTGTACATTTGCTGTGCCGTTGTAAAGTAATACGCAACAGAGGAAAAAACCAAAGATTCGTGCACGTCTCGTGCGGTAGTGGTAGTCGCAGTAGAAGGCAGTAGCAGTAGTAGCTTAACGATATTTGTCAGCTGTCCGCGTGCTCGTTTGTTTGACAAAATAAATGCTAGCAATAGATTATTGTTTATCGATGTACATAAATTGAAATAAAATACTAAAAAAAAAACAACATTTGTAAATTGTGATCGTATTATGGAGGGGCAAAGATGGTGGCTTATCTACTACTCTACAGAATAGCTCCTACTATCTACTACTCAGTATTCAAAGCCCAGATGTGTTTGTCTGTGTCTGTCTGTCTGTA]
[+] EMBL BX612260             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAGCCAGGAGAAAACACTAGCAATGCCTACAGGAAGGATGGTTTCCTTCTTTCCGTTGTACTTTTACGACCAAAGTGCCGGAACAGGGGGCAACACACAAAAGAAAACCCTTACTTCTTTACACGCACTATTTGCCGTACCTTATCTAGTTCTGTATCTAGGGCACATGCTTTAATCGAACTGTTTTAACTGGGTACCGTGCCCCTCTACCTAGCCTATGTACCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]


>consensus_5419#0 AGCACACTAACGTTTGTACTAACACACACATTCAAAAACACATACATACATACATACATA CATACATACATACATAGAGCACACATTGTTTTACTGTGAATGTATTTTATGATGCATGTA TTTGTGAGACAACATTGTACTTTACGGGGTCAGTCCCAGTCCCGGTCGTCTTACTCATCC TTCAATATGATATACTCTATTATGATGTACTCTAACGATGGCCAATATTTGTAATCATAT TCATTGTGTCATTCACACACACTCACACACCCACACACAACCATGTAGCTAAATCAATGA ACCAACTGTCCGGACTTAACTGACCCGCCCTGTTTGTATGTTGTTACGCGTAAGCCAGGA GAAAACACTAGCAATGCCTACAGGAAGGATGGTTTCCTTCTTTCCGTTGTACTTTTACGA CCAAAGTGCCGGAACAGGGGGCAACACACAAAAGAAAACCCTTACTTCTTTACACGCACT ATTTGCCGTACCTTATCTAGTTCTGTATCTAGGGCACATGCTTTAATCGAACTGTTTTAA CTGGTTACCGTGCCCCTCTACCTAGCCTATGTACCTATGTGCGCCTAGAACCTAACCTAG CCCATCGTTCATTGAGTGTTGCATTTCGTGTCTGCCACACGCTGTCCTCCTTTGTACCTA GTTCACGCTTAACGCATACTCCTTAATGCATACCAACGATCGTTCAGCTGCTGCTGTACA TTTGCTGTGCCGTTGTAAAGTAATACGCAACAGAGGAAAAAACCAAAGATTCGTGCACGT CTCGTGCGGTAGTGGTAGTCGCAGTAGAAGGCAGTAGCAGTAGTAGCTTAACGATATTTG TCAGCTGTCCGCGTGCTCGTTTGTTTGACAAAATAAATGCTAGCAATAGATTATTGTTTA TCGATGTACATAAATTGAAATAAAATACTAAAAAAAAAACAACATTTGTAAATTGTGATC GTATTATGGAGGGGCAAAGATGGTGGCTTATCTACTACTCTACAGAATAGCTCCTACTAT CTACTACTCAGTATTCAAAGCCCAGATGTGTTTGTCTGTGTCTGTCTGTCTGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)