Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 5863 cluster # 5863       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5863#0 length = 974 sequences # 4  
consensusID : consensus_5863#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 974
fasta sequence 
                              [CCGTTTTCCCTACCTTAATACCAATGCAGAATATACTTTTCTTCAAGTAGCGTAGCAAAGGTTCCTCGTAGTGTTTCTGATTAATTCCTTCGTCCGTTAGCGCTCACATGTTGCACGTTTCTCTTCTACGAAAACAATATTCATAATACGTCATAAAAACTTAGTATGAAACCACCACCTCTTTCGCAAATGCAATTTCCAATCGCATTTTTCCAACGTTCCTTGTTCCGTGTTCCAGTTAGCACTATTAGCATATTAGCAGCATTTATACGTTTATTCCAGCTGCGTAGTACGAGTTAAAGTGAAATAGATTAAAACATCATCTTACCCACGGCATGGTTGGTCGACGTTTGCTATTGGATTACAATGTGAGTTGAATTCGTTCGCTATATATGTTTTGTTTTAATCAGATTTTTTTTTTTCAACACAACATTTAACTAATAAGAAATATTGTACGAACTTATGCAAACTGTGCAAAACTCTGGAGGAAAACTAAAGAAAAGGATACGGTAGGGGGTTGCAAAATCTGATATCCTTGCCTTGACCTAATTCCTATTATTTGACCCGCACTTAAGTAGTTCATAACGAAACAAACACAAAAATAAAGCAAACAAATCTTAAATGGTTGTGTTATATGAA-GTGAATAAAGGTTTAAAATAGAATTTCTCCTACGACTACAACAAAAATGCACACCCCGAGTAACATAACGTAACATACCTACAGTAAATGATTGTACTGGGATGTTTGAAGCCCTTCACCGGTCTTTAGCATGCAGCACAATGGTGGTGATACCATTGTTTTCTGACGATCACAACACATCATGCCTAAGGCCTCCTCCATTCGTGCTCGTCCGCATTAGCTTCTCGTAGTGTTAAATACCCTCCACGAAGCTTTAAAGCGAACTCTGTAGAGCGAACAGAATACAGGTGCAAGATGATTGATCAGTGATCAAACAAACCATGCACAACAATACA]

[+] EMBL BM621205             [CCGTTTTCCCTACCTTAATACCAATGCAGAATATACTTTTCTTCAAGTAGCGTAGCAAAGGTTCCTCGTAGTGTTTCTGATTAATTCCTTCGTCCGTTAGCGCTCACATGTTGCACGTTTCTCTTCTACGAAAACAATATTCATAATACGTCATAAAAACTTAGTATGAAACCACCACCTCTTTCGCAAATGCAATTTCCAATCGCATTTTTCCAACGTTCCTTGTTCCGTGTTCCAGTTAGCACTATTAGCATATTAGCAGCATTTATACGTTTATTCCAGCTGCGTAGTACGAGTTAAAGTGAAATAGATTAAAACATCATCTTACCCACGGCATGGTTGGTCGACGTTTGCTATTGGATTACAATGTGAGTTGAATTCGTTCGCTATATATGTTTTGTTTTAATCAGATTTTTTTTTTTCAACACAACATTTAACTAATAAGAAATATTGTACGAACTTATGCAAACTGTGCAAAACTCTGGAGGAAAACTAAAGAAAAGGATACGGTAGGGGGTTGCAAAATCTGATATCCTTGCCTTGACCTAATTCCTATTATTTGACCCGCACTTAAGTAGTTCATAACGAAACAAACACAAAAATAAAGCAAAAAAATCTTAAATGGTTGTGTTATATAAAGGGGAATAAAGGTTTAAAATAGAATTTCTCCTACGACTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BX610646             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTGATATCCTTGCCTTGACCTAATTCCTATTATTTGACCCGCACTTAAGTAGTTCATAACGAAACAAACACAAAAATAAAGCAAACAAATCTTAAATGGTTGTGTTATATGAA GTGAATAAAGGTTTAAAATAGAATTTCTCCTACGACTACAACAAAAATGCACACCCCGAGTAACATAACGTAACATACCTACAGTAAATGATTGTACTGGGATGTTTGAAGCCCTTCACCGGTCTTTAGCATGCAGCACAATGGTGGTGATACCATTGTTTTCTGACGATCACAACACATCATGCCTAAGGCCTCCTCCATTCGTGCTCGTCCGCATTAGCTTCTCGTAGTGTTAAATACCCTCCACGAAGCTTTAAAGCGAACTCTGTAGAGCGAACAGAATACAGGTGCAAGATGATTGATCAGTGATCAAACAAACCATGCACAACAATACA]
[+] EMBL BX610645             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AACACAAAAATAAAGCAAACAAATCTTAAATGGTTGTGTTATATGAA GTGAATAAAGGTTTAAAATAGAATTTCTCCTACGACTACAACAAAAATGCACACCCCGAGTAACATAACGTAACATACCTACAGTAAATGATTGTACTGGGATGTTTGAAGCCCTTCACCGGTCTTTAGCATGCAGCACAATGGTGGTGATACCATTGTTTTCTGACGATCACAACACATCATGCCTAAGGCCTCCTCCATTCGTGCTCGTCCGCATTAGCTTCTCGTAGTGTTAAATACCCTCCACGAAGCTTT                                                                                ]
[+] EMBL BX610647             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGTTATATGAA GTGAATAAAGGTTGAAAATAGAATTTCTCCTACGACTACAACAAAAATGCACACCCCGAGTAACATAACGTAAC                                                                                                                                                                                                                                                                     ]




>consensus_5863#0
CCGTTTTCCCTACCTTAATACCAATGCAGAATATACTTTTCTTCAAGTAGCGTAGCAAAG
GTTCCTCGTAGTGTTTCTGATTAATTCCTTCGTCCGTTAGCGCTCACATGTTGCACGTTT
CTCTTCTACGAAAACAATATTCATAATACGTCATAAAAACTTAGTATGAAACCACCACCT
CTTTCGCAAATGCAATTTCCAATCGCATTTTTCCAACGTTCCTTGTTCCGTGTTCCAGTT
AGCACTATTAGCATATTAGCAGCATTTATACGTTTATTCCAGCTGCGTAGTACGAGTTAA
AGTGAAATAGATTAAAACATCATCTTACCCACGGCATGGTTGGTCGACGTTTGCTATTGG
ATTACAATGTGAGTTGAATTCGTTCGCTATATATGTTTTGTTTTAATCAGATTTTTTTTT
TTCAACACAACATTTAACTAATAAGAAATATTGTACGAACTTATGCAAACTGTGCAAAAC
TCTGGAGGAAAACTAAAGAAAAGGATACGGTAGGGGGTTGCAAAATCTGATATCCTTGCC
TTGACCTAATTCCTATTATTTGACCCGCACTTAAGTAGTTCATAACGAAACAAACACAAA
AATAAAGCAAACAAATCTTAAATGGTTGTGTTATATGAAGTGAATAAAGGTTTAAAATAG
AATTTCTCCTACGACTACAACAAAAATGCACACCCCGAGTAACATAACGTAACATACCTA
CAGTAAATGATTGTACTGGGATGTTTGAAGCCCTTCACCGGTCTTTAGCATGCAGCACAA
TGGTGGTGATACCATTGTTTTCTGACGATCACAACACATCATGCCTAAGGCCTCCTCCAT
TCGTGCTCGTCCGCATTAGCTTCTCGTAGTGTTAAATACCCTCCACGAAGCTTTAAAGCG
AACTCTGTAGAGCGAACAGAATACAGGTGCAAGATGATTGATCAGTGATCAAACAAACCA
TGCACAACAATACA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)