These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5963#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1663 fasta sequence [AATACATTATTCCAGGAGCCGCGCAAATGCGACGCAGCTGTGCTTTAGAGAAGAGATTCGCGTTTGTCTGGTGTTTTGTTTTTAATTTGTCTGTTTTTTGTTTTAACCATTAAGCCCAAAGTAATTTTTTGTTTCGTTCTATCGCAGCATACAATGCTTATCAATGAATAATTGAATTTAAAAAAAATATATGGAGATAAGCCACATTTATAGGTTAACAGACACACACACCCGTACAGCTGCAGTGGCTGCAGTGAACAGGAAAAGATATACCAAAATTCAACATGTTATCCAAGATAATTCAGAGCAGCGTACACTAAAGCGAAGGTTAAATTGCAACAACAAAAAACACTTACATGCGTCCCTTAACTCACACACAAACACAGATGTATTAAGCCAGCAAGAGGAAGGATGTTTTAGTGCCCTTTCATCACATGAAAACGTAATGACAATGTGTGTTTTATTACTAATTAAGTTAAAACCCCTTTCACCCAATCGAACGGGGGCTCTTCACGAATCGCTAATCAGAATCAGAAGATACACTGAATAATCACGTCTGGCCAAAACACCCCCCAGCAACAACAACAACAACAGCAAGCAATCAATTAGTCGTGTTAAATAAGCAAGAAAACAATCGTGCATAATCACGCGTGCCACGTTCTTCTTCGGTATTATTATGTCCAATCAGAACACATCCGACGTAAAGCTAGGTCTTTTTACACACTGTCGGTTTGTCATTGTATTACCGTTTAACAATCGTTTCTGATTATTTAGAATCACGTGTTGCGGCGCGCGCTCGCGCTC-ATCTGTAACGTTGATTGGTTTAGCGTTAGCTTGTAAGCATGTGTGTAGCGTTTAAAAACAAAAGAAAAAAGGACGGTGAATTAAAAGTAGGACCATGGAGTAGGGTAATTTGATGGAAACGGATAGAGAGCGGAGCGATAGAGAAGACAACATTCGAATGAACAAGTTGAATAGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTCACACTTTTGGTTATAGTTTTTTTTTTTTGTTTCTACAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTCGGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGC-CCTCCCAGAGCTTAGACACGAC-CTGACCAAGACGTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGAACTTTAACATGATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGCAAAGACACAGCTTGATTTGTAAGCGCTTACAATGTCTTATAATTGTATTATTTATAGTTACGCACAGATATATACGTATGTGTACCGTGTACCGTTTACAACTTGTTCCATTCGCATCCTACGACAAACTGTTTAAAATTCGCGTCCCACGCCCAAGAAGGACTGAGGAAGGCTAGGATAGTATCCCCTCTTTTTTGCGTTGTAGTTTCATTGCCGTTACTCTATGCCTTTCGATATAAACACACAAAAACTATTAAGGAGAAAAAGCAAAACATCGAAACGTAACTTCACTCTGTGGGAACTGGGAACGTGGGGAGGGATTGACGCGTGATTGGGAATGAGCGGAGGAAATATTTATTGTATTGAACCTAGAATCTGTTCTTTCTTGTATACCCATTAAAACTGATATTGAAAAC] [+] EMBL CNS09F24 [AATACATTATTCCAGGAGCCGCGCAAATGCGACGCAGCTGTGCTTTAGAGAAGAGATTCGCGTTTGTCTGGTGTTTTGTTTTTAATTTGTCTGTTTTTTGTTTTAACCATTAAGCCCAAAGTAATTTTTTGTTTCGTTCTATCGCAGCATACAATGCTTATCAATGAATAATTGAATTTAAAAAAAATATATGGAGATAAGCCACATTTATAGGTTAACAGACACACACACCCGTACAGCTGCAGTGGCTGCAGTGAACAGGAAAAGATATACCAAAATTCAACATGTTATCCAAGATAATTCAGAGCAGCGTACACTAAAGCGAAGGTTAAATTGCAACAACAAAAAACACTTACATGCGTCCCTTAACTCACACACAAACACAGATGTATTAAGCCAGCAAGAGGAAGGATGTTTTAGTGCCCTTTCATCACATGAAAACGTAATGACAATGTGTGTTTTATTACTAATTAAGTTAAAACCCCTTTCACCCAATCGAACGGGGGCTCTTCACGAATCGCTAATCAGAATCAGAAGATACACTGAATAATCACGTCTGGCCAAAACACCCCCCAGCAACAACAACAACAACAGCAAGCAATCAATTAGTCGTGTTAAATAAGCAAGAAAACAATCGTGCATAATCACGCGTGCCACGTTCTTCTTCGGTATTATTATGTCCAATCAGAACACATCCGACGTAAAGCTAGGTCTTTTTACACACTGTCGGTTTGTCATTGTATTACCGTTTAACAATCGTTTCTGATTATTTAGAATCACGTGTTGCGGCGCGCGCTCGC TTCAATCTGTAACGTTGATTGGTTTA ] [+] EMBL BX628153 [ CCCAGCAACAACAACAACAACAACAGCAAGCAATCAATTAGTCGTGTTAAATAAGCAAGAAAACAATCGTGCATAATCACGCGTGCCACGTTCTTCTTCGGTATTATTATGTCCAATCAGAACACATCCGACGTAAAACTAGGCCTTTTTACACACTGTTGGTTTGTCATTGTATTACCGTTTAACAATCGTTTCTGATTATTTAGAATCACGTGTTGCGGCGCGCGCTCGCGCTC ATCTGTAACGTTGATTGGTTTAGCGTTAGCTTGTAAGCATGTGTGTAGCGTTTAAAAACAAAAGAAAAAAGGACGGTGAATTAAAAGTAGGACCATGGAGTAGGGTAATTTGATGGAAACGGATAGAGAGCGGAGCGATAGAGAAGACAACATTCGAATGAACAAGTTGAATAGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTCACACTTTTGGTTATAGTTTTTTTTTTTTGTTTCTACAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTCGGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGC CCTCCCAGAGCTTAGACACGAC CTGACCAAGACGTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGAACTTTAACATGATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGCAAAGACACAGCTTG ] [+] EMBL BX615037 [ TATTACCGTTTAACAATCGTTTCTGATTATTTAGAATCACGTGTTGCGGCGCGCGCTCGCGCTC ATCTGTAACGTTGATTGGTTTAGCGTTAGCTTGCAAGCATGTGTGTAGCGTTTAAAAACAAAAGAAAAAAGGACGGTGAATTAAAAGTAGGACCATGGAGTAGGGTAATTTGATGGAAACGGATAGAGAGCGGAGCGATAGAGAAGACAACATTCGAATGAACAAGTTGAATAGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTCACACTTTTGGTTATAGTTTTTTTTTTTTGTTTCTACAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTCGGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGC CCTCCCAGAGCTTAGACACGAC CTGACCAAGACGTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGAACTTTAACATTATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGCAAAGACACAGCTTGATTTGTAAGCGCTTACAATGTCTTATAATTGTATTATTTATAGTTACGCACAGATATATACGTATGTGTACCGTGTACCGTTTACAACTTGTTCCATTC ] [+] EMBL BX616704 [ ATCTGTAACGTTGATTGGTTTAGCGTTAGCTTGTAAGCATGTGTGTAGCGTTTAAAAACAAAAGAAAAAAGGACGGTGAATTAAAAGTAGGACCATGGAGTAGGGTAATTTGATGGAAACGGATAGAGAGCGGAGCGATAGAGAAGACAACATTCGAATGAACAAGTTGAATAGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTCACACTTTTGGTTATAG TTTTTTTTTTTGTTTCTACAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTCGGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGC CCTCCCAGAGCTTATACACGAC CTGACCAAGACGTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGAACTTTAACATGATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGCAAAGACACAGCTTGATTTGTAAGCGCTTACAATGTCTTATAATTGTATTATTTATAGTTACGCACAGATATATACG ] [-] EMBL CNS09F25 [ AGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTAACACATTTGGTTATAG TTTTTTGTTTGTTTGTGCAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTCGGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGCACCTCTCAGAGCTTAGACACGACACTGACCAAGACTTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGAACTTTAACATGATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGAAAAGACACAGCTTGGTTTGTAAGCGCTTACAATGTCTTATAATTGTATTATTTATAGTTACGCACAGATATATACGTATGTGTACCGTGTACCGTTTACAACTTGTTCCATTCGCATCCTACGACAAACTGTTTAAAATTCGCGTCCCACGCCCAAGAAGGACTGAGGAAGGCTAGGATAGTATCCCCTCTTTTTTGCGTTGTAGTTTCATTGCCGTTACTCTATGCCTTTCGATATAAACACACAAAAACTATTAAGGAGAAAAAGCAAAACATCGAAACGTAACTTCACTCTGTGGGAACTGGGAACGTGGGGAGGGATTGACGCGTGATTGGGAATGAGCGGAGGAAATATTTATTGTATTGAACCTAGAATCTGTTCTTTCTTGTATACCCATTAAAACTGATATTGAAAAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||