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Anopheles gambiae
cluster # 5963 cluster # 5963       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5963#0 length = 1663 sequences # 5  

consensusID : consensus_5963#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1663
fasta sequence
                              [AATACATTATTCCAGGAGCCGCGCAAATGCGACGCAGCTGTGCTTTAGAGAAGAGATTCGCGTTTGTCTGGTGTTTTGTTTTTAATTTGTCTGTTTTTTGTTTTAACCATTAAGCCCAAAGTAATTTTTTGTTTCGTTCTATCGCAGCATACAATGCTTATCAATGAATAATTGAATTTAAAAAAAATATATGGAGATAAGCCACATTTATAGGTTAACAGACACACACACCCGTACAGCTGCAGTGGCTGCAGTGAACAGGAAAAGATATACCAAAATTCAACATGTTATCCAAGATAATTCAGAGCAGCGTACACTAAAGCGAAGGTTAAATTGCAACAACAAAAAACACTTACATGCGTCCCTTAACTCACACACAAACACAGATGTATTAAGCCAGCAAGAGGAAGGATGTTTTAGTGCCCTTTCATCACATGAAAACGTAATGACAATGTGTGTTTTATTACTAATTAAGTTAAAACCCCTTTCACCCAATCGAACGGGGGCTCTTCACGAATCGCTAATCAGAATCAGAAGATACACTGAATAATCACGTCTGGCCAAAACACCCCCCAGCAACAACAACAACAACAGCAAGCAATCAATTAGTCGTGTTAAATAAGCAAGAAAACAATCGTGCATAATCACGCGTGCCACGTTCTTCTTCGGTATTATTATGTCCAATCAGAACACATCCGACGTAAAGCTAGGTCTTTTTACACACTGTCGGTTTGTCATTGTATTACCGTTTAACAATCGTTTCTGATTATTTAGAATCACGTGTTGCGGCGCGCGCTCGCGCTC-ATCTGTAACGTTGATTGGTTTAGCGTTAGCTTGTAAGCATGTGTGTAGCGTTTAAAAACAAAAGAAAAAAGGACGGTGAATTAAAAGTAGGACCATGGAGTAGGGTAATTTGATGGAAACGGATAGAGAGCGGAGCGATAGAGAAGACAACATTCGAATGAACAAGTTGAATAGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTCACACTTTTGGTTATAGTTTTTTTTTTTTGTTTCTACAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTCGGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGC-CCTCCCAGAGCTTAGACACGAC-CTGACCAAGACGTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGAACTTTAACATGATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGCAAAGACACAGCTTGATTTGTAAGCGCTTACAATGTCTTATAATTGTATTATTTATAGTTACGCACAGATATATACGTATGTGTACCGTGTACCGTTTACAACTTGTTCCATTCGCATCCTACGACAAACTGTTTAAAATTCGCGTCCCACGCCCAAGAAGGACTGAGGAAGGCTAGGATAGTATCCCCTCTTTTTTGCGTTGTAGTTTCATTGCCGTTACTCTATGCCTTTCGATATAAACACACAAAAACTATTAAGGAGAAAAAGCAAAACATCGAAACGTAACTTCACTCTGTGGGAACTGGGAACGTGGGGAGGGATTGACGCGTGATTGGGAATGAGCGGAGGAAATATTTATTGTATTGAACCTAGAATCTGTTCTTTCTTGTATACCCATTAAAACTGATATTGAAAAC]

[+] EMBL CNS09F24             [AATACATTATTCCAGGAGCCGCGCAAATGCGACGCAGCTGTGCTTTAGAGAAGAGATTCGCGTTTGTCTGGTGTTTTGTTTTTAATTTGTCTGTTTTTTGTTTTAACCATTAAGCCCAAAGTAATTTTTTGTTTCGTTCTATCGCAGCATACAATGCTTATCAATGAATAATTGAATTTAAAAAAAATATATGGAGATAAGCCACATTTATAGGTTAACAGACACACACACCCGTACAGCTGCAGTGGCTGCAGTGAACAGGAAAAGATATACCAAAATTCAACATGTTATCCAAGATAATTCAGAGCAGCGTACACTAAAGCGAAGGTTAAATTGCAACAACAAAAAACACTTACATGCGTCCCTTAACTCACACACAAACACAGATGTATTAAGCCAGCAAGAGGAAGGATGTTTTAGTGCCCTTTCATCACATGAAAACGTAATGACAATGTGTGTTTTATTACTAATTAAGTTAAAACCCCTTTCACCCAATCGAACGGGGGCTCTTCACGAATCGCTAATCAGAATCAGAAGATACACTGAATAATCACGTCTGGCCAAAACACCCCCCAGCAACAACAACAACAACAGCAAGCAATCAATTAGTCGTGTTAAATAAGCAAGAAAACAATCGTGCATAATCACGCGTGCCACGTTCTTCTTCGGTATTATTATGTCCAATCAGAACACATCCGACGTAAAGCTAGGTCTTTTTACACACTGTCGGTTTGTCATTGTATTACCGTTTAACAATCGTTTCTGATTATTTAGAATCACGTGTTGCGGCGCGCGCTCGC TTCAATCTGTAACGTTGATTGGTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BX628153             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCCAGCAACAACAACAACAACAACAGCAAGCAATCAATTAGTCGTGTTAAATAAGCAAGAAAACAATCGTGCATAATCACGCGTGCCACGTTCTTCTTCGGTATTATTATGTCCAATCAGAACACATCCGACGTAAAACTAGGCCTTTTTACACACTGTTGGTTTGTCATTGTATTACCGTTTAACAATCGTTTCTGATTATTTAGAATCACGTGTTGCGGCGCGCGCTCGCGCTC ATCTGTAACGTTGATTGGTTTAGCGTTAGCTTGTAAGCATGTGTGTAGCGTTTAAAAACAAAAGAAAAAAGGACGGTGAATTAAAAGTAGGACCATGGAGTAGGGTAATTTGATGGAAACGGATAGAGAGCGGAGCGATAGAGAAGACAACATTCGAATGAACAAGTTGAATAGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTCACACTTTTGGTTATAGTTTTTTTTTTTTGTTTCTACAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTCGGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGC CCTCCCAGAGCTTAGACACGAC CTGACCAAGACGTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGAACTTTAACATGATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGCAAAGACACAGCTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BX615037             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TATTACCGTTTAACAATCGTTTCTGATTATTTAGAATCACGTGTTGCGGCGCGCGCTCGCGCTC ATCTGTAACGTTGATTGGTTTAGCGTTAGCTTGCAAGCATGTGTGTAGCGTTTAAAAACAAAAGAAAAAAGGACGGTGAATTAAAAGTAGGACCATGGAGTAGGGTAATTTGATGGAAACGGATAGAGAGCGGAGCGATAGAGAAGACAACATTCGAATGAACAAGTTGAATAGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTCACACTTTTGGTTATAGTTTTTTTTTTTTGTTTCTACAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTCGGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGC CCTCCCAGAGCTTAGACACGAC CTGACCAAGACGTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGAACTTTAACATTATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGCAAAGACACAGCTTGATTTGTAAGCGCTTACAATGTCTTATAATTGTATTATTTATAGTTACGCACAGATATATACGTATGTGTACCGTGTACCGTTTACAACTTGTTCCATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BX616704             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATCTGTAACGTTGATTGGTTTAGCGTTAGCTTGTAAGCATGTGTGTAGCGTTTAAAAACAAAAGAAAAAAGGACGGTGAATTAAAAGTAGGACCATGGAGTAGGGTAATTTGATGGAAACGGATAGAGAGCGGAGCGATAGAGAAGACAACATTCGAATGAACAAGTTGAATAGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTCACACTTTTGGTTATAG TTTTTTTTTTTGTTTCTACAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTCGGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGC CCTCCCAGAGCTTATACACGAC CTGACCAAGACGTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGAACTTTAACATGATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGCAAAGACACAGCTTGATTTGTAAGCGCTTACAATGTCTTATAATTGTATTATTTATAGTTACGCACAGATATATACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CNS09F25             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTAACACATTTGGTTATAG  TTTTTTGTTTGTTTGTGCAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTCGGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGCACCTCTCAGAGCTTAGACACGACACTGACCAAGACTTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGAACTTTAACATGATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGAAAAGACACAGCTTGGTTTGTAAGCGCTTACAATGTCTTATAATTGTATTATTTATAGTTACGCACAGATATATACGTATGTGTACCGTGTACCGTTTACAACTTGTTCCATTCGCATCCTACGACAAACTGTTTAAAATTCGCGTCCCACGCCCAAGAAGGACTGAGGAAGGCTAGGATAGTATCCCCTCTTTTTTGCGTTGTAGTTTCATTGCCGTTACTCTATGCCTTTCGATATAAACACACAAAAACTATTAAGGAGAAAAAGCAAAACATCGAAACGTAACTTCACTCTGTGGGAACTGGGAACGTGGGGAGGGATTGACGCGTGATTGGGAATGAGCGGAGGAAATATTTATTGTATTGAACCTAGAATCTGTTCTTTCTTGTATACCCATTAAAACTGATATTGAAAAC]


>consensus_5963#0 AATACATTATTCCAGGAGCCGCGCAAATGCGACGCAGCTGTGCTTTAGAGAAGAGATTCG CGTTTGTCTGGTGTTTTGTTTTTAATTTGTCTGTTTTTTGTTTTAACCATTAAGCCCAAA GTAATTTTTTGTTTCGTTCTATCGCAGCATACAATGCTTATCAATGAATAATTGAATTTA AAAAAAATATATGGAGATAAGCCACATTTATAGGTTAACAGACACACACACCCGTACAGC TGCAGTGGCTGCAGTGAACAGGAAAAGATATACCAAAATTCAACATGTTATCCAAGATAA TTCAGAGCAGCGTACACTAAAGCGAAGGTTAAATTGCAACAACAAAAAACACTTACATGC GTCCCTTAACTCACACACAAACACAGATGTATTAAGCCAGCAAGAGGAAGGATGTTTTAG TGCCCTTTCATCACATGAAAACGTAATGACAATGTGTGTTTTATTACTAATTAAGTTAAA ACCCCTTTCACCCAATCGAACGGGGGCTCTTCACGAATCGCTAATCAGAATCAGAAGATA CACTGAATAATCACGTCTGGCCAAAACACCCCCCAGCAACAACAACAACAACAGCAAGCA ATCAATTAGTCGTGTTAAATAAGCAAGAAAACAATCGTGCATAATCACGCGTGCCACGTT CTTCTTCGGTATTATTATGTCCAATCAGAACACATCCGACGTAAAGCTAGGTCTTTTTAC ACACTGTCGGTTTGTCATTGTATTACCGTTTAACAATCGTTTCTGATTATTTAGAATCAC GTGTTGCGGCGCGCGCTCGCGCTCATCTGTAACGTTGATTGGTTTAGCGTTAGCTTGTAA GCATGTGTGTAGCGTTTAAAAACAAAAGAAAAAAGGACGGTGAATTAAAAGTAGGACCAT GGAGTAGGGTAATTTGATGGAAACGGATAGAGAGCGGAGCGATAGAGAAGACAACATTCG AATGAACAAGTTGAATAGATAGGTAAAAATGGAACTTTTTGCATTCACACTTTTGGTTAT AGTTTTTTTTTTTTGTTTCTACAAAACACGACGACCGCAGGCGGAAGCGTATCTGTGTTC GGTCAAACTGTGTTCGACTTACTAACTTCACTGTGCCATCATCAGCCCTCCCAGAGCTTA GACACGACCTGACCAAGACGTTTATTAACCCTCTTCAATCCGCAACACACATGACGACGA ACTTTAACATGATCGCATCACATTCACTGCTCGCTCCGTTGCTGTGCAAAGACACAGCTT GATTTGTAAGCGCTTACAATGTCTTATAATTGTATTATTTATAGTTACGCACAGATATAT ACGTATGTGTACCGTGTACCGTTTACAACTTGTTCCATTCGCATCCTACGACAAACTGTT TAAAATTCGCGTCCCACGCCCAAGAAGGACTGAGGAAGGCTAGGATAGTATCCCCTCTTT TTTGCGTTGTAGTTTCATTGCCGTTACTCTATGCCTTTCGATATAAACACACAAAAACTA TTAAGGAGAAAAAGCAAAACATCGAAACGTAACTTCACTCTGTGGGAACTGGGAACGTGG GGAGGGATTGACGCGTGATTGGGAATGAGCGGAGGAAATATTTATTGTATTGAACCTAGA ATCTGTTCTTTCTTGTATACCCATTAAAACTGATATTGAAAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)