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Anopheles gambiae
cluster # 5988 cluster # 5988       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5988#0 length = 1649 sequences # 5  

consensusID : consensus_5988#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1649
fasta sequence
                              [CCTCACTGTTGTTGCTTTACTAACTCCTATGTCAAAGCCCGATAACACTTCCACTCCCCGCTCCCTACAAACCAAACGGATTGTTCCTCACCGGCCGCTGGTAAAAATTGATCGTGTGCTCATCCAGATGCGAGATGGTACAGAACCGTGCCTCGCACTGCTTGCACTTGTTCGTTTTGTAGCGATCGTTCACATTGCTCTCGTTCACCTCTTCGGCGCCCGACTTGATCAG-CCGGTTCTTGATGATGTCTACGTTCGTGTGCGACACGAACGAGTCCGGCGGGCGCAGTATGATGGGCTGCGTGCCCATCACACT-CCCCACCGACAGTGCATTGTTCATGCCCGCCCCAAAGCGGAACGTGTCCACCAGCGACGGTTTGTCCTTGGGCGACCCGCCAGACCCACTGTCGCTCAGTGAATCGAGCTTGATCGTTCCGTAAGTGTGGCGGGTTAAAAATGCTCCATCGTGCCCCTTCGCATCGATCGCGGACACTGCCGGCTCACCATCGTCCGTCATCGGCCCGTCCGTCGGCTCGCCGGCCGTCTCGTCCTCTTCCAGCTCACCGTCGTACGACAGCACCAGCCGGTAGCACTTGCGCACCGTAAACACGGCCCGCCGTATAAACTCGAACGCCGAGATGGCGCTCTGCTCGCGCAGGTACATAATGTGGTACAGGGCCCGGATCGCCTCGGTCAGCTTGTACAGCAGACACTCGGTCAGGTGCTGCGAGTACGTTTCCGAGAACATGAACCGCTTCCGGCAGGCGAACATTTTCTTCTCCTTGTAGTCCTCCGGCAGCGTAAACGTGACGCCGTGCTCCTGCAACCCGTCCAGCTCCATCACGTCGTCCTCGATGAACTCCTTCTCCCGGTACCCGAACAGCCCGCTGCTCGTAGGTTCGTCCAGCTCACCGAACACATTGTCCAGCTCCTCCTCCGCATTGTTGTTCGGTGGTTTGGCCACGAACCGATGCATCATGGCCGGGGGCTTTTTGGTGGTTTGTTTCGCCGCGCTGCGCGTGCTCGGCGCGTTGGCAAGGTTGACCGAGCGGTAGCCCGTACCGTCGCCGGTCGGTATGATTTCATCCCGGCCTATCACATGCTGCTGCTCACTGTCCAGGGCGGACTTTTTGCTTTCCGGCCGGAGATTCGAAAGGTACTTGGCCGTCAGCAGTCCCGCAATGTTGTCGATCGCTTGCCGCCGGAAGGTGTACGCGTGCTTGAGGTACGAAATGCACAGCACGCAGATGCGCTTCGGCAGGCCATCGTTTTCCGTAATCTCAACGCCAGTCACCTCAGCAATCAGCATAAAGATGGGTTGCTTCCAGCGGGCGTACTCCCGATAGTGCTCGTGGCAGTAGGCCGGTATGCGGCCGAAAATGCTGTGCGAACCAGCACTGGAGCAGACGCGGCAGAGCGTATCCATGTTTGCAAGGTTTTCCATTTCTTTCCCCGTCCTATTCACAGCCAACAACAAAACACAGCACAATGATTTGCCACTCAACAGGCCCCACACAAATCACACGCACACACACAAGACAGCCTTAACGTTAAGTATCTACACTGCACTAACTATTGGCACGCAGGAAAGTGAGTAAAACACTAAAATATCATTTCGAGTCAGCACAAAATACAAAACAGCAAAAGTT]

[+] EMBL CNS09BSF             [CCTCACTGTTGTTGCTTTACTAACTCCTATGTCAAAGCCCGATAACACTTCCACTCCCCGCTCCCTACAAACCAAACGGATTGTTCCTCACCGGCCGCTGGTAAAAATTGATCGTGTGCTCATCCAGATGCGAGATGGTACAGAACCGTGCCTCGCACTGCTTGCACTTGTTCGTTTTGTAGCGATCGTTCACATTGCTCTCGTTCACCTCTTCGGCGCCCGACTTGATCAGCCCGGTTCTTGATGATGTCTACGTTCGTGTGCGACACGAACGAGTCCGGCGGGCGCAGTATGATGGGCTGCGTGCCCATCACACTCCCCCACCGACAGTGCATTGTTCATGCCCGCCCCAAAGCGGAACGTGTCCACCAGCGACGGTTTGTCCTTGGGCGACCCGCCAGACCCACTGTCGCTCAGTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CNS09M92             [     CTGTTGTTGCTTTACTAACTCCTATGTCAAAGCCCGATAACACTTCCACTCCCCGCTCCCTACAAACCAAACGGATTGTTCCTCACCGGCCGCTGGTGTACCTTGATCGTGTGCTCATCCAGATGCGAGATGGTACAGAACCGTGCCTCGCACTGCTTGCACTTGATCGTTTTGTAGCGATCGTTCACATTGCTCTCGTTCACCTCTTCGGCGCCCGACTTGATCAG CCGGTTCTTGATGATGTCTACGTTCGTGTGCGACACGAACGAGTCCGGCGGGCGCAGTATGATGGGCTGCGTGCCCATCACACT CCCCACCGACAGTGCATTGTTCATGCCCGCCCCAAAGCGGAACGTGTCCACCAGCGACGGTTTGTCCTTGGGCGACCCGCCAGACCCACTGTCGCTCAGTGAATCGAGCTTGATCGTTCCGTAAGTGTGGCGGGTTAAAAATGCTCCATCGTGCCCCTTCGCATCGATCGCGGACACTGCCGGCTCACCATCGTCCGTCATCGGCCCGTCCGTCGGCTCGCCGGCCGTCTCGTCCTCTTCCAGCTCACCGTCGTACGACAGCACCAGCCGGTAGCACTTGCGCACCGTAAACACGGCCCGCCGTATAAACTCGAACGCCGAGATGGCGCTCTGCTCGCGCAGGTACATAATGTGGTACAGGGCCCGGATCGCCTCGGTCAGCTTGTACAGCAGACACTCGGTCAGGTGCTGCGAGTACGTTTCCGAGAACATGAACCGCTTCCGGCAGGCGAACATTTTCTTCTCCTTGTAGTCCTCCGGCAGCGTAAACGTGACGCCGTGCTCCTGCAACCCGTCCAGCTCCATCACGTCGTCCTCGATGAACTCCTTCTCCCGGTACCCGAACAGCCCGCTGCTCGTAGGTTCGTCCAGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL BX622277             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATCACGTCGTCCTCGATGAACTCCTTCTCCCGGTACCCGAACAGCCCGCTGCTCGTAGGTTCGTCCAGCTCACCGAACACATTGTCCAGCTCCTCCTCCGCATTGTTGTTCGGTGGTTTGGCCACGAACCGATGCATCATGGCCGGGGGCTTTTTGGTGGTTTGTTTCGCCGCGCTGCGCGTGCTCGGCGCGTTGGCAAGGTTGACCGAGCGGTAGCCCGTACCGTCGCCGGTCGGTATGATTTCATCCCGGCCTATCACATGCTGCTGCTCACTGTCCAGGGCGGACTTTTTGCTTTCCGGCCGGAGATTCGAAAGGTACTTGGCCGTCAGCAGTCCCGCAATGTTGTCGATCGCTTGCCGCCGGAAGGTGTACGCGTGCTTGAGGTACGAAATGCACAGCACGCAGATGCGCTTCGGCAGGCCATCGTTTTCCGTAATCTCAACGCCAGTCACCTCAGCAATCAGCATAAAGATGGGTTGCTTCCAGCGGGCGTACTCCCGATAGTGCTCGTGGCAGTAGGCCGGTATGCGGCCGAAAATGCTGTGCGAACCAGCACTGGAGCAGACGCGGCAGAGCGTATCCATGTTTGCAAGGTTTTCCATTTCTTTCCCCGTCCTATTCACAGCCAACAACAAAACACAGCACAATGATTTGCCACTCAACAGGCCCCACACAAATCACACGCACACACACAAGACAGCCTTAACGTTAAGTATCTACACTGCACTAACTATTGGCACGCAGGAA                                                            ]
[-] EMBL CNS09M91             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGTTTCGAC CGCTGCGCGTGCTCGGCGCGTTGGCAAGGTTGACCGAGCGGTAGCCCGTACCGTCGCCGGTCGGTATGATTTCATCCCGGCCTATCACATGCTGCTGCTCACTGTCCAGGGCGGACTTTTTGCTTTCCGGCCGGAGATTCGAAAGGTACTTGGCCGTCAGCAGTCCCGCAATGTTGTCGATCGCTTGCCGCCGGAAGGTGTACGCGTGCTTGAGGTACGAAATGCACAGCACGCAGATGCGCTTCGGCAGGCCATCGTTTTCCGTAATCTCAACGCCAGTCACCTCAGCAATCAGCATAAAGATGGGTTGCTTCCAGCGGGCGTACTCCCGATAGTGCTCGTGGCAGTAGGCCGGTATGCGGCCGAAAATGCTGTGCGAACCAGCACTGGAGCAGACGCGGCAGAGCGTATCCATGTTTGCAAGGTTTTCCATTTCTTTCCCCGTCCTATTCACAGCCAACAACAAAACACAGCACAATGATTTGCCACTCAACAGGCCCCACACAAATCACACGCACACACACAAGACAGCCTTAACGTTAAGTATCTACACTGCACTAACTATTGGCACGCAGGAAAGTGAGTAAAACACTAAAATATCATTTCGAGTCAGCACAAAATACAAAACAGCAAAAGTT]
[-] EMBL CNS09BSE             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GCACGCAGATGCGCTTCGGCAGGCCATCGTTTTCCGTAATCTCAACGCCAGTCACCTCAGCAATCAGCATAAAGATGGGTTGCTTCCAGCGGGCGTACTCCCGATAGTGCTCGTGGCAGTAGGCCGGTATGCGGCCGAAAATGCTGTGCGAACCAGCACTGGAGCAGACGCGGCAGAGCGTATCCATGTTTGCAAGGTTTTCCATGTCTTTCCCCGTCCTATTCACAGCCAACAACAAAACACAGCACAATGATTTGCCACTCAACAGGCCCCACACAAATCACACGCACACACACAAGACAGCCTTAACGTTTTTTTTTTACATTGCACTAACTAT                                                                         ]


>consensus_5988#0 CCTCACTGTTGTTGCTTTACTAACTCCTATGTCAAAGCCCGATAACACTTCCACTCCCCG CTCCCTACAAACCAAACGGATTGTTCCTCACCGGCCGCTGGTAAAAATTGATCGTGTGCT CATCCAGATGCGAGATGGTACAGAACCGTGCCTCGCACTGCTTGCACTTGTTCGTTTTGT AGCGATCGTTCACATTGCTCTCGTTCACCTCTTCGGCGCCCGACTTGATCAGCCGGTTCT TGATGATGTCTACGTTCGTGTGCGACACGAACGAGTCCGGCGGGCGCAGTATGATGGGCT GCGTGCCCATCACACTCCCCACCGACAGTGCATTGTTCATGCCCGCCCCAAAGCGGAACG TGTCCACCAGCGACGGTTTGTCCTTGGGCGACCCGCCAGACCCACTGTCGCTCAGTGAAT CGAGCTTGATCGTTCCGTAAGTGTGGCGGGTTAAAAATGCTCCATCGTGCCCCTTCGCAT CGATCGCGGACACTGCCGGCTCACCATCGTCCGTCATCGGCCCGTCCGTCGGCTCGCCGG CCGTCTCGTCCTCTTCCAGCTCACCGTCGTACGACAGCACCAGCCGGTAGCACTTGCGCA CCGTAAACACGGCCCGCCGTATAAACTCGAACGCCGAGATGGCGCTCTGCTCGCGCAGGT ACATAATGTGGTACAGGGCCCGGATCGCCTCGGTCAGCTTGTACAGCAGACACTCGGTCA GGTGCTGCGAGTACGTTTCCGAGAACATGAACCGCTTCCGGCAGGCGAACATTTTCTTCT CCTTGTAGTCCTCCGGCAGCGTAAACGTGACGCCGTGCTCCTGCAACCCGTCCAGCTCCA TCACGTCGTCCTCGATGAACTCCTTCTCCCGGTACCCGAACAGCCCGCTGCTCGTAGGTT CGTCCAGCTCACCGAACACATTGTCCAGCTCCTCCTCCGCATTGTTGTTCGGTGGTTTGG CCACGAACCGATGCATCATGGCCGGGGGCTTTTTGGTGGTTTGTTTCGCCGCGCTGCGCG TGCTCGGCGCGTTGGCAAGGTTGACCGAGCGGTAGCCCGTACCGTCGCCGGTCGGTATGA TTTCATCCCGGCCTATCACATGCTGCTGCTCACTGTCCAGGGCGGACTTTTTGCTTTCCG GCCGGAGATTCGAAAGGTACTTGGCCGTCAGCAGTCCCGCAATGTTGTCGATCGCTTGCC GCCGGAAGGTGTACGCGTGCTTGAGGTACGAAATGCACAGCACGCAGATGCGCTTCGGCA GGCCATCGTTTTCCGTAATCTCAACGCCAGTCACCTCAGCAATCAGCATAAAGATGGGTT GCTTCCAGCGGGCGTACTCCCGATAGTGCTCGTGGCAGTAGGCCGGTATGCGGCCGAAAA TGCTGTGCGAACCAGCACTGGAGCAGACGCGGCAGAGCGTATCCATGTTTGCAAGGTTTT CCATTTCTTTCCCCGTCCTATTCACAGCCAACAACAAAACACAGCACAATGATTTGCCAC TCAACAGGCCCCACACAAATCACACGCACACACACAAGACAGCCTTAACGTTAAGTATCT ACACTGCACTAACTATTGGCACGCAGGAAAGTGAGTAAAACACTAAAATATCATTTCGAG TCAGCACAAAATACAAAACAGCAAAAGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)