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Anopheles gambiae
cluster # 6340 cluster # 6340       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6340#0 length = 760 sequences # 5  

consensusID : consensus_6340#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 760
fasta sequence
                              [CAGCAGCTGCGAGGTACGTTCGGAGATGGAACTGCCACCTCCGGTAAAGCTGCCACCAACACCAACACCACCACCACCACCGTCACTGCTTCGGTCCGGCGGTTTCGGATGCTTCGAATCGAGGAACGTACTGGCGTTCACGCCGCCCGTGTGCGGCTGCTGCTGCTGCTGGTAGGGCAGATCGGCCAGATTCTCCACGCTGCCGCCAAACCGGGCACCGGTATTGATCAGCACGTTCTCGTAGTTGGCCGTCTTGGGTGCCGACGGCGTCTCACTGTCCTGTGGCGATTTGTCACTAGCACCACCAACACTGGCACCACTGCCACCGTTGCCCTTTGACTCTTTCACCTCGATCACGGTCACGAAATGGCTCGGCGAGGCGAGCAGGGGCTGCTGCGCCTCACTTTGGCTGGCGCTGCGCACCCGGCTTCCTTCCTCCTTCCCGGCCACATCGTGCCCCGGGGTGCCCCCGTTGACGGTTGGTTGCGGACCGATGCTGGTTGATTGCTGGGCCGGACCGCCCGCTTGTTGTTGACTGATGAGCCGGTTCGCCGGCGTTGATTGGGTTGGTCGTGGCGGAGGTGGCTGTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGCCGCCACCAGCTCGCTCACGCACCGGCGGCTGTGCAGATTGGTCGTGAGCTCGTTGATGCACTGATTCAGTGGGCTATTGTTGTTGCGATTGGGTGGCAGCTCGCGCGACCGAAGCTGGACGCTCGGGTCGGACGGCTGCTCGCCGGCCGC]

[+] EMBL AGA284513            [CAGCAGCTGCGAGGTACGTTCGGAGATGGAACTGCCACCTCCGGTAAAGCTGCCACCAACACCAACACCACCACCACCACCGTCACTGCTTCGGTCCGGCGGTTTCGGATGCTTCGAATCGAGGAACGTACTGGCGTTCACGCCGCCCGTGTGCGGCTGCTGCTGCTGCTGGTAGGGCAGATCGGCCAGATTCTCCACGCTGCCGCCAAACCGGGCACCGGTATTGATCAGCACGTTCTCGTAGTTGGCCGTCTTGGGTGCCGACGGCGTCTCACTGTCCTGTGGCGATTTGTCACTAGCACCACCAACACTGGCACCACTGCCACCGTTGCCCTTTGACTCTTTCACCTCGATCACGGTCACGAAATGGCTCGGCGAGGCGAGCAGGGGCTGCTGCGCCTCACTTTGGCTGGCGCTGCGCACCCGGCTTCCTTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AGA284036            [CAGCAGCTGCGAGGTACGTTCGGAGATGGAACTGCCACCTCCGGTAAAGCTGCCACCAACACCAACACCACCACCACCACCGTCACTGCTTCGGTCCGGCGGTTTCGGATGCTTCGAATCGAGGAACGTACTGGCGTTCACGCCGCCCGTGTGCGGCTGCTGCTGCTGCTGGTAGGGCAGATCGGCCAGATTCTCCACGCTGCCGCCAAACCGGGCACCGGTATTGATCAGCACGTTCTCGTAGTTGGCCGTCTTGGGTGCCGACGGCGTCTCACTGTCCTGTGGCGATTTGTCACTAGCACCACCAACACTGGCACCACTGCCACCGTTGCCCTTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AGA281498            [     aCTGCNNGGTACGTTCGGAGATGGAACTGCCACCTCCGGTAAAGCTGCCACCAACACCAACACCACCACCACCACCGTCACTGCTTCGATCCGGC GTTTC GATGCTTCGAATCGAGGAACGTACTGGCGTTAACGCCGCCCGTGTGCGGCT CTGCTGCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL AGA285331            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GCTCGGCGAGGCGAGCAGGGGCTGCTGCGCCTCACTTTGGCTGGCGATGCGCACCCGGCCGGCCGCTTCCTTCCCGGCCACATCGTGCCCCGGGGTGCCCCCGTTGACGGTTGGTTGCGGACCGATGCTGGTTGATTGCTGGGCCGGACCGCCCGCTTGTTGTTGACTGATGAGCCGGTTCGCCGGCGTTGATTGGGTTGGTCGTGGCGGAGGTGGCTGTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGCCGCCACCAGCTCGCTCACGCACCGGCGGCTGTGCAGATTGGTCGTGAGCTCGTTGATGCACTGATTCAGTGGGCTATTGTTGTTGCGATTGGGTGGCAGCTCGCGCGACCGAAGCTGGACGCTCGGGTCGGACGGCTGCTCGCCGGCCGC]
[-] EMBL AGA285818            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCGGGGTGCCCCCGTTGGCGGTTGGTTGCGGACCGTTGCTGGTTGATTGCTGGGCCGGACCGCCGGC TGCTGTTGACTGATGAGCCGGTTCGCCGGCGTTGATTGGGTTGGTCGTGGCGGAGGTGGCTGTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGCCGCCACCAGCTCGCTCACGCACCGGCGGCTGTGCAGATTGGTCGTGAGCTCGTTGATGCACTGATTCAGTGGGCTATTGTTGTTGCGATTGGGTGGCAGCTCGCGCGACCGAAGCTGGACGCTCGGGTCGGACGGCTGCTCGCCGGCCG ]


>consensus_6340#0 CAGCAGCTGCGAGGTACGTTCGGAGATGGAACTGCCACCTCCGGTAAAGCTGCCACCAAC ACCAACACCACCACCACCACCGTCACTGCTTCGGTCCGGCGGTTTCGGATGCTTCGAATC GAGGAACGTACTGGCGTTCACGCCGCCCGTGTGCGGCTGCTGCTGCTGCTGGTAGGGCAG ATCGGCCAGATTCTCCACGCTGCCGCCAAACCGGGCACCGGTATTGATCAGCACGTTCTC GTAGTTGGCCGTCTTGGGTGCCGACGGCGTCTCACTGTCCTGTGGCGATTTGTCACTAGC ACCACCAACACTGGCACCACTGCCACCGTTGCCCTTTGACTCTTTCACCTCGATCACGGT CACGAAATGGCTCGGCGAGGCGAGCAGGGGCTGCTGCGCCTCACTTTGGCTGGCGCTGCG CACCCGGCTTCCTTCCTCCTTCCCGGCCACATCGTGCCCCGGGGTGCCCCCGTTGACGGT TGGTTGCGGACCGATGCTGGTTGATTGCTGGGCCGGACCGCCCGCTTGTTGTTGACTGAT GAGCCGGTTCGCCGGCGTTGATTGGGTTGGTCGTGGCGGAGGTGGCTGTGCTGCTGCTGC TGCTGCTGGCCGCCACCAGCTCGCTCACGCACCGGCGGCTGTGCAGATTGGTCGTGAGCT CGTTGATGCACTGATTCAGTGGGCTATTGTTGTTGCGATTGGGTGGCAGCTCGCGCGACC GAAGCTGGACGCTCGGGTCGGACGGCTGCTCGCCGGCCGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)