These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6499#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1628 fasta sequence [CAGATCGCCAGAGGTNGACTTTACCACCAATCAAATGGTCTTTACGGGTTTGATGAAACCTACTTGACGATGAACAATGGTCTCGGTATACGCACTCACACCGGCCATGGCAATGGGCACACGCAAGTCCACCAGACAGCGACGCAGCAGACGAACCAGCTTAACTCGATCAACTGTCAGAATATGCAGAATATGCAAAACACCAACATGAGCAACATGTACAACGGGACGACGGAACCGCTGCTCAGCCTGGCCAAAACCAATCGCTTATCGAGCCCCAAACGCCCACGATACCGGAGATCGTTTTTACAGATTATTCGACTAGGGACGATTTCGAGGCAGACCTTGGGCTTGGTCATATGGATTTCCAAAGCATCCAGATGCTCTCCGACACCAGCACGATGATTGACCCGATGGACGAGGACAGCTTTCGACGAGATTTACAATAGTGCGAGGCCAACTGGGACGGCTTACCGAACGACTTCTATTAGCCCGATGCGCTAGCTGACCCAGGCCGTC-GAACCAGGCACCCATACTGGCGAGCGACAGAAATACAAACGACAGACGACACAACACGT-TANACA--CATCACAAACATACTG-TGTGAGTGGGTGGGT-GAGGGAAATNGTTAATGAGTAACTGTTACTTGAGGCTGACCGCAAACGTTGATAAACTATAGTTAAGGATAAG------GTGTGTGTGTGTGTGAGAGTGTGAAGTGCTGTTAGCGTACGGCGAGAGTTTTGTAGTATACCAGGATCATATAGAATAGTGGACAGCTGTGCAAAATGGTTATGTTTTAAGGTTGAGCAACAAAACCTTTCCCCACGTTGCGTGTTGCATTGACAAAGTGTTACATTAACTAGATGTGTTTTAGAACTGGTTGGTGTAAAGGTGTGCAAATTAATGTTTAGTTGAGGGCGAGAAACAAAAACACAAGCTTTCCCGTGGATGTTGTGACATTTTTGTGAAGAGCATTGTTTAAACATTGTTTCACAAACAGTTTCCTCCAATGTTGTCCTTCCCATATGGTGATATGGTGTATTTTTTTGTACATTTATGTTGTTTCCTCCTGTTGGTCAAAAGCATTATTGCGATGAGATTTAGATAAATGCTCTGAGAGGAAAACTATTTTCCCCCT-TTTTATGGTCATACTTAAAGGAAAGAAGTAAATCTGTTTGGTTATTGCAGACACGTTGCTGTTACAATGTTTCTGTTTGCTTCACGGGTATGTAACGGAAAGCAAATGTTTAATTTAAACGAGCTGGTTTACTAAAGATTTGGTAAAACTGATTGTCACAAAAGCACAAAAACTTCGTACCGAGTACCTCGATGCCTTTGCTTGAATTACGATTTTACTCCTGCTCTAAACGAATGCTGTTCTTGGTTTAAAGAGTCTGATAGATGAACTCTTGACCAACCGATAGGACGATGAAAAGTGCTAGCTCGAAAAAGGAGCAAGTTTGAGAAAGAGATGCTTAGAGAGACGAACGTGTTTAATAAAAGGAAGGTTAAGTAAGTGATGTGGTCCATCAGTTAGATTGCAAGCAGCAAGGAAAACTCTCGAGTAAATGTAAAACTGTTTTCATGCCGGAATTTAATAAAAAAAAAAATAACCCTGGGGCGATCTGCT] [+] EMBL AL696982 [CAGATCGCCAGAGGTNGACTTTACCACCAATCAAATGGTCTTTACGGGTTTGATGAAACCTACTTGACGATGAACAATGGTCTCGGTATACGCACTCACACCGGCCATGGCAATGGGCACACGCAAGTCCACCAGACAGCGACGCAGCAGACGAACCAGCTTAACTCGATCAACTGTCAGAATATGCAGAATATGCAAAACACCAACATGAGCAACATGTACAACGGGACGACGGAACCGCTGCTCAGCCTGGCCAAAACCAATCGCTTATCGAGCCCCAAACGCCCACGATACCGGAGATCGTTTTTACAGATTATTCGACTAGGGACGATTTCGAGGCAGACCTTGGGCTTGGTCATATGGATTTCCAAAGCATCCAGATGCTCTCCGACACCAGCACGATGATTGACCCGATGGACGAGGACAGCTTTCGACGAGATTTACAATAGTGCGAGGCCAACTGGGACGGCTTACCGAACGACTTCTATTAGCCCGATGCGCTAGCTGACCCAGGCCGTCAGAACCAGGCACCCATACTGGCGAGCGACAGAAATACAAACGACAGACGACACAACACGT TANACA CATCACAAACATACTG TGTGAGTGGGTGGGT GAGGGAAATN ] [+] EMBL BM608380 [ ccgGGATTTCCAAAGCATCCAGATGCTCTCCGACACCAGCACGATGATTGACCCGATGGACGAGGACAGCTTTCGACGAGATTTACAATAGTGCGAGGCCAACTGGGACGGCTTACCGAACGACTTCTATTAGCCCGATGCGCTAGCTGACCCAGGCCGTC GAACCAGGCACCCATACTGGCGAGCGACAGAAATACAAACGACAGACGACACAAGACGTAAACACACTCACCACACACACACTGTTGTGGGTGGGTGGGTGGAGGGAAATAGTTAATGAGTAACTGTTACTTGAGGCTGACCGCAAACGTTGATAAACTATAGTTAAGGATAAG GTGTGTGTGTGTGTGAGAGTGTGAAGTGCTGTTAGCGTACGGCGAGAGTTTTGTAGTATACCAGGATCATATAGAATAGTGGACAGCTGTGCAAAATGGTTATGTTTTAAGGTTGAGCAACAAAACCTTTCCCCACGTTGCGTGTTGCATTGACAAAGTGTTACATTAACTAGATGTGTTTTAGAACTGGTTGGTGTAAAGGTG ] [+] EMBL BM575159 [ ccgGTAACTGTTACTTGAGGCTGACCGCAAACGTTGATAAACTATAGTTAAGGATAAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGAAGAGCTGTTAGCGTACGGCGAGAGTTTTGTAGTATACCAGGATCATATAGAATAGTGGACAGCTGTGCAAAATGGTTATGTTTTAAGGTTGAGCAACAAAACCTTTCCCCACGTTGCGTGTTGCATTGACAAAGTGTTACATTAACTAGATGTGTTTTAGAACTGGTTGGTGTAAAGGTGTGCAAATTAATGTTTAGTTGAGGGCGAGAAACAAAAACACAAGCTTTCCCGTGGATGTTGTGACATTTTTGTGAAGAGCATTGTTTAAACATTGTTTCACAAACAGTTTCCTCCAATGTTGTCCTTCCCATATGGTGATATGGTGTATTTTTTTGTACATTTATGTTGTTTCCTCCTGTTGGTCAAAAGCATTATTGCGATGAGATTTAGATAAATGCTCTGAGAGGAAAACTATTTTCCCCCT TTTTATGGTCATACTTAAAGGAAAGAAGTAAATCTGTTTGGTTATTGCAGACACGTTGCTGTTACAATGTTTCTGTTTGCTTCACGGGTATGTAACGGAAAGCAAATGTTTAATTT ] [+] EMBL BM609965 [ ccgTATGTTTTAAGGTTGAGCAACAAAACCTTTCCCCACGTTGCGTGTTGCATTGACAAAGTGTTACATTAACTAGATGTGTTTTAGAACTGGTTGGTGTAAAGGTGTGCAAATTAATGTTTAGTTGAGGGCGAGAAACAAAAACACAAGCTTTCCCGTGGATGTTGTGACATTTTTGTGAAGAGCATTGTTTAAACATTGTTTCACAAACAGTTTCCTCCAATGTTGTCCTTCCCATATGGTGATATGGTGTATTTTTTTGTACATTTATGTTGTTTCCTCCTGTTGGTCAAAAGCATTATTGCGATGAGATTTAGATAAATGCTCTGAGAGGAAAACTATTTTCCCCCT TTTTATGGTCATACTTAAAGGAAAGAAGTAAATCTGTTTGGTTATTGCAGACACGTTGCTGTTACAATGTTTCTGTTTGCTTCACGGGTATGTAACGGAAAGCAAATGTTTAATTTAAACGAGCTGGTTTACTAAAGATTTGGTAAAACTGATTGTCACAAAAGCACAAAAACTTCGTACCGAGTACCTCGATGCCTTTGCTTGAATTACGATTTTACTCCTGCTCTAAACGAATGCTGTTCTTGGTTTAAAGAGTCTGATAGATGAACTCTTGACCAACCGATAGGACGATGAA ] [-] EMBL AL930369 [ ttTTTTTTTGTACATTTATGTTGTTTCCTCCTGTTGGTC AAAGCATTATTGCGATGAGATTTAGATAAATGCTCTGAGAGGAAAACTATTTTCCCCCTGTTTTATGGTCATACTTAAAGGAAAGAAGTAAATCTGTTTGGTTATTGCAGACACGTTGCTGTTACAATGTTTCTGTTTGCTTCACGGGTATGTAACGGAAAGCAAATGTTTAATTTAAACGAGCTGGTTTACTAAAGATTTGGTAAAACTGATTGTCACAAAAGCAC AAAACTTCGTACCGAGTACCTCGATGCCTTTGCTTGAATTACGATTTTACTCCTGCTCTAAACGAATGCTGTTCTTGGTTTAAAGAGTCTGATAGATGAACTCTTGACCAACCGATAGGACGATGAAAAGTGCTAGCTCGAAAAAGGAGCAAGTTTGAGAAAGAGATGCTTAGAGAGACGAACGTGTTTAATAAAAGGAAGGTTAAGTAAGTGATGTGGTCCATCAGTTAGATTGCAAGCAGCAAGGAAAACTCTCGAGTAAATGTAAAACTGTTTTCATGCCGGAATTTAATAAAAAAAAAAATAACCCTGGGGCGATCTGCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||