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Anopheles gambiae
cluster # 6499 cluster # 6499       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6499#0 length = 1628 sequences # 5  

consensusID : consensus_6499#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1628
fasta sequence
                              [CAGATCGCCAGAGGTNGACTTTACCACCAATCAAATGGTCTTTACGGGTTTGATGAAACCTACTTGACGATGAACAATGGTCTCGGTATACGCACTCACACCGGCCATGGCAATGGGCACACGCAAGTCCACCAGACAGCGACGCAGCAGACGAACCAGCTTAACTCGATCAACTGTCAGAATATGCAGAATATGCAAAACACCAACATGAGCAACATGTACAACGGGACGACGGAACCGCTGCTCAGCCTGGCCAAAACCAATCGCTTATCGAGCCCCAAACGCCCACGATACCGGAGATCGTTTTTACAGATTATTCGACTAGGGACGATTTCGAGGCAGACCTTGGGCTTGGTCATATGGATTTCCAAAGCATCCAGATGCTCTCCGACACCAGCACGATGATTGACCCGATGGACGAGGACAGCTTTCGACGAGATTTACAATAGTGCGAGGCCAACTGGGACGGCTTACCGAACGACTTCTATTAGCCCGATGCGCTAGCTGACCCAGGCCGTC-GAACCAGGCACCCATACTGGCGAGCGACAGAAATACAAACGACAGACGACACAACACGT-TANACA--CATCACAAACATACTG-TGTGAGTGGGTGGGT-GAGGGAAATNGTTAATGAGTAACTGTTACTTGAGGCTGACCGCAAACGTTGATAAACTATAGTTAAGGATAAG------GTGTGTGTGTGTGTGAGAGTGTGAAGTGCTGTTAGCGTACGGCGAGAGTTTTGTAGTATACCAGGATCATATAGAATAGTGGACAGCTGTGCAAAATGGTTATGTTTTAAGGTTGAGCAACAAAACCTTTCCCCACGTTGCGTGTTGCATTGACAAAGTGTTACATTAACTAGATGTGTTTTAGAACTGGTTGGTGTAAAGGTGTGCAAATTAATGTTTAGTTGAGGGCGAGAAACAAAAACACAAGCTTTCCCGTGGATGTTGTGACATTTTTGTGAAGAGCATTGTTTAAACATTGTTTCACAAACAGTTTCCTCCAATGTTGTCCTTCCCATATGGTGATATGGTGTATTTTTTTGTACATTTATGTTGTTTCCTCCTGTTGGTCAAAAGCATTATTGCGATGAGATTTAGATAAATGCTCTGAGAGGAAAACTATTTTCCCCCT-TTTTATGGTCATACTTAAAGGAAAGAAGTAAATCTGTTTGGTTATTGCAGACACGTTGCTGTTACAATGTTTCTGTTTGCTTCACGGGTATGTAACGGAAAGCAAATGTTTAATTTAAACGAGCTGGTTTACTAAAGATTTGGTAAAACTGATTGTCACAAAAGCACAAAAACTTCGTACCGAGTACCTCGATGCCTTTGCTTGAATTACGATTTTACTCCTGCTCTAAACGAATGCTGTTCTTGGTTTAAAGAGTCTGATAGATGAACTCTTGACCAACCGATAGGACGATGAAAAGTGCTAGCTCGAAAAAGGAGCAAGTTTGAGAAAGAGATGCTTAGAGAGACGAACGTGTTTAATAAAAGGAAGGTTAAGTAAGTGATGTGGTCCATCAGTTAGATTGCAAGCAGCAAGGAAAACTCTCGAGTAAATGTAAAACTGTTTTCATGCCGGAATTTAATAAAAAAAAAAATAACCCTGGGGCGATCTGCT]

[+] EMBL AL696982             [CAGATCGCCAGAGGTNGACTTTACCACCAATCAAATGGTCTTTACGGGTTTGATGAAACCTACTTGACGATGAACAATGGTCTCGGTATACGCACTCACACCGGCCATGGCAATGGGCACACGCAAGTCCACCAGACAGCGACGCAGCAGACGAACCAGCTTAACTCGATCAACTGTCAGAATATGCAGAATATGCAAAACACCAACATGAGCAACATGTACAACGGGACGACGGAACCGCTGCTCAGCCTGGCCAAAACCAATCGCTTATCGAGCCCCAAACGCCCACGATACCGGAGATCGTTTTTACAGATTATTCGACTAGGGACGATTTCGAGGCAGACCTTGGGCTTGGTCATATGGATTTCCAAAGCATCCAGATGCTCTCCGACACCAGCACGATGATTGACCCGATGGACGAGGACAGCTTTCGACGAGATTTACAATAGTGCGAGGCCAACTGGGACGGCTTACCGAACGACTTCTATTAGCCCGATGCGCTAGCTGACCCAGGCCGTCAGAACCAGGCACCCATACTGGCGAGCGACAGAAATACAAACGACAGACGACACAACACGT TANACA  CATCACAAACATACTG TGTGAGTGGGTGGGT GAGGGAAATN                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BM608380             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ccgGGATTTCCAAAGCATCCAGATGCTCTCCGACACCAGCACGATGATTGACCCGATGGACGAGGACAGCTTTCGACGAGATTTACAATAGTGCGAGGCCAACTGGGACGGCTTACCGAACGACTTCTATTAGCCCGATGCGCTAGCTGACCCAGGCCGTC GAACCAGGCACCCATACTGGCGAGCGACAGAAATACAAACGACAGACGACACAAGACGTAAACACACTCACCACACACACACTGTTGTGGGTGGGTGGGTGGAGGGAAATAGTTAATGAGTAACTGTTACTTGAGGCTGACCGCAAACGTTGATAAACTATAGTTAAGGATAAG      GTGTGTGTGTGTGTGAGAGTGTGAAGTGCTGTTAGCGTACGGCGAGAGTTTTGTAGTATACCAGGATCATATAGAATAGTGGACAGCTGTGCAAAATGGTTATGTTTTAAGGTTGAGCAACAAAACCTTTCCCCACGTTGCGTGTTGCATTGACAAAGTGTTACATTAACTAGATGTGTTTTAGAACTGGTTGGTGTAAAGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BM575159             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ccgGTAACTGTTACTTGAGGCTGACCGCAAACGTTGATAAACTATAGTTAAGGATAAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGAAGAGCTGTTAGCGTACGGCGAGAGTTTTGTAGTATACCAGGATCATATAGAATAGTGGACAGCTGTGCAAAATGGTTATGTTTTAAGGTTGAGCAACAAAACCTTTCCCCACGTTGCGTGTTGCATTGACAAAGTGTTACATTAACTAGATGTGTTTTAGAACTGGTTGGTGTAAAGGTGTGCAAATTAATGTTTAGTTGAGGGCGAGAAACAAAAACACAAGCTTTCCCGTGGATGTTGTGACATTTTTGTGAAGAGCATTGTTTAAACATTGTTTCACAAACAGTTTCCTCCAATGTTGTCCTTCCCATATGGTGATATGGTGTATTTTTTTGTACATTTATGTTGTTTCCTCCTGTTGGTCAAAAGCATTATTGCGATGAGATTTAGATAAATGCTCTGAGAGGAAAACTATTTTCCCCCT TTTTATGGTCATACTTAAAGGAAAGAAGTAAATCTGTTTGGTTATTGCAGACACGTTGCTGTTACAATGTTTCTGTTTGCTTCACGGGTATGTAACGGAAAGCAAATGTTTAATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BM609965             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccgTATGTTTTAAGGTTGAGCAACAAAACCTTTCCCCACGTTGCGTGTTGCATTGACAAAGTGTTACATTAACTAGATGTGTTTTAGAACTGGTTGGTGTAAAGGTGTGCAAATTAATGTTTAGTTGAGGGCGAGAAACAAAAACACAAGCTTTCCCGTGGATGTTGTGACATTTTTGTGAAGAGCATTGTTTAAACATTGTTTCACAAACAGTTTCCTCCAATGTTGTCCTTCCCATATGGTGATATGGTGTATTTTTTTGTACATTTATGTTGTTTCCTCCTGTTGGTCAAAAGCATTATTGCGATGAGATTTAGATAAATGCTCTGAGAGGAAAACTATTTTCCCCCT TTTTATGGTCATACTTAAAGGAAAGAAGTAAATCTGTTTGGTTATTGCAGACACGTTGCTGTTACAATGTTTCTGTTTGCTTCACGGGTATGTAACGGAAAGCAAATGTTTAATTTAAACGAGCTGGTTTACTAAAGATTTGGTAAAACTGATTGTCACAAAAGCACAAAAACTTCGTACCGAGTACCTCGATGCCTTTGCTTGAATTACGATTTTACTCCTGCTCTAAACGAATGCTGTTCTTGGTTTAAAGAGTCTGATAGATGAACTCTTGACCAACCGATAGGACGATGAA                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL AL930369             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTTTTTTTGTACATTTATGTTGTTTCCTCCTGTTGGTC AAAGCATTATTGCGATGAGATTTAGATAAATGCTCTGAGAGGAAAACTATTTTCCCCCTGTTTTATGGTCATACTTAAAGGAAAGAAGTAAATCTGTTTGGTTATTGCAGACACGTTGCTGTTACAATGTTTCTGTTTGCTTCACGGGTATGTAACGGAAAGCAAATGTTTAATTTAAACGAGCTGGTTTACTAAAGATTTGGTAAAACTGATTGTCACAAAAGCAC AAAACTTCGTACCGAGTACCTCGATGCCTTTGCTTGAATTACGATTTTACTCCTGCTCTAAACGAATGCTGTTCTTGGTTTAAAGAGTCTGATAGATGAACTCTTGACCAACCGATAGGACGATGAAAAGTGCTAGCTCGAAAAAGGAGCAAGTTTGAGAAAGAGATGCTTAGAGAGACGAACGTGTTTAATAAAAGGAAGGTTAAGTAAGTGATGTGGTCCATCAGTTAGATTGCAAGCAGCAAGGAAAACTCTCGAGTAAATGTAAAACTGTTTTCATGCCGGAATTTAATAAAAAAAAAAATAACCCTGGGGCGATCTGCT]


>consensus_6499#0 CAGATCGCCAGAGGTNGACTTTACCACCAATCAAATGGTCTTTACGGGTTTGATGAAACC TACTTGACGATGAACAATGGTCTCGGTATACGCACTCACACCGGCCATGGCAATGGGCAC ACGCAAGTCCACCAGACAGCGACGCAGCAGACGAACCAGCTTAACTCGATCAACTGTCAG AATATGCAGAATATGCAAAACACCAACATGAGCAACATGTACAACGGGACGACGGAACCG CTGCTCAGCCTGGCCAAAACCAATCGCTTATCGAGCCCCAAACGCCCACGATACCGGAGA TCGTTTTTACAGATTATTCGACTAGGGACGATTTCGAGGCAGACCTTGGGCTTGGTCATA TGGATTTCCAAAGCATCCAGATGCTCTCCGACACCAGCACGATGATTGACCCGATGGACG AGGACAGCTTTCGACGAGATTTACAATAGTGCGAGGCCAACTGGGACGGCTTACCGAACG ACTTCTATTAGCCCGATGCGCTAGCTGACCCAGGCCGTCGAACCAGGCACCCATACTGGC GAGCGACAGAAATACAAACGACAGACGACACAACACGTTANACACATCACAAACATACTG TGTGAGTGGGTGGGTGAGGGAAATNGTTAATGAGTAACTGTTACTTGAGGCTGACCGCAA ACGTTGATAAACTATAGTTAAGGATAAGGTGTGTGTGTGTGTGAGAGTGTGAAGTGCTGT TAGCGTACGGCGAGAGTTTTGTAGTATACCAGGATCATATAGAATAGTGGACAGCTGTGC AAAATGGTTATGTTTTAAGGTTGAGCAACAAAACCTTTCCCCACGTTGCGTGTTGCATTG ACAAAGTGTTACATTAACTAGATGTGTTTTAGAACTGGTTGGTGTAAAGGTGTGCAAATT AATGTTTAGTTGAGGGCGAGAAACAAAAACACAAGCTTTCCCGTGGATGTTGTGACATTT TTGTGAAGAGCATTGTTTAAACATTGTTTCACAAACAGTTTCCTCCAATGTTGTCCTTCC CATATGGTGATATGGTGTATTTTTTTGTACATTTATGTTGTTTCCTCCTGTTGGTCAAAA GCATTATTGCGATGAGATTTAGATAAATGCTCTGAGAGGAAAACTATTTTCCCCCTTTTT ATGGTCATACTTAAAGGAAAGAAGTAAATCTGTTTGGTTATTGCAGACACGTTGCTGTTA CAATGTTTCTGTTTGCTTCACGGGTATGTAACGGAAAGCAAATGTTTAATTTAAACGAGC TGGTTTACTAAAGATTTGGTAAAACTGATTGTCACAAAAGCACAAAAACTTCGTACCGAG TACCTCGATGCCTTTGCTTGAATTACGATTTTACTCCTGCTCTAAACGAATGCTGTTCTT GGTTTAAAGAGTCTGATAGATGAACTCTTGACCAACCGATAGGACGATGAAAAGTGCTAG CTCGAAAAAGGAGCAAGTTTGAGAAAGAGATGCTTAGAGAGACGAACGTGTTTAATAAAA GGAAGGTTAAGTAAGTGATGTGGTCCATCAGTTAGATTGCAAGCAGCAAGGAAAACTCTC GAGTAAATGTAAAACTGTTTTCATGCCGGAATTTAATAAAAAAAAAAATAACCCTGGGGC GATCTGCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)