These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6710#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1358 fasta sequence [TTATAGTATTAGGGGTTTTAAAATGTAGTCCATGCCTAACTCTTTCCTTCCTTCACTTTCTCTCTCTCTTCCCCCTCCTTCTTTCTATCTCTCTCTATTGCGCGCTCTCTCTGTCTCTCTATTACTTTCTCTTTGCCTCTCCATGTCCATGCCTCATGTGTGTTTCCCTGTATTTTGTTTCCTTTTTTATTTCTATTTCCATTCTCAGTGAGTAATGAGAATATGCGATTTAACATGAGATGTTTAAAATTACAAAAGAATTTGACGAAAATGTTGTATTGTAAGCATATCTTAATTTTTGTGAGTTTCTTCGCATAT-CTTCCTTGATAAATGTTAGCTGTTGCTAATTTCATTGTCCTCTGTTGTTTCGGTATTTGTCTTTGTGGTCGTCTGGTATCGGTTTTGTTTGAATGTGCGGCTTTAATACGCTTCATACGAGGGTCTATATTGTGGGTGCGTGTAGAGGATTCTACAACAGTGAAGTAGAACCATTTTGAGTTAGTTTGGCTATAACTGTATGACGCAAGTATGAGTTTGCTATGAAAACTGTATATTCATGTATGCCTCACAATAGGAATCAAGCGAAAAGTGAAACTGTCCCATGCTTGATTATTGTTGCATTGTTTAGTTTTACCTTTCAACTAAAGTACTTTTATCATTTGTT-CCGCGAGTTTAATAGTTTTTACAAATAAGCATTGATTGATACATCGATTTCATCTCACCTTCACCTTTTCATCCAACGTAAAACGATACTTTCGGTTTGATTAAACATGCTGCATCTGTAAAAAGCAATAAATGGTGTATCATAAATGAGATAACAACACAAGAAATCGCCAGTTGAATGGTACTGTTTATCAATCCGCCGCACTGTATGAGCTATAGATTTGGACATATATTTGTGAAGTACGTTGTGTGTAGCTTAAACCACATCTAACTATATAGCACTCACCTGAATTGGTGCCAGTTCCGAAGCACGCACTTAACAGCAGACGTTTGGTTTTAAATTACAACGTTTTCAAGGGATGGCCAACAAATCCGTCGTGACAGTGGTGCTCGGAGAGCTTAAACCCGAGTGTTGTCGTAGAAACATATTCGCTGATAGAACTATTGAACGATAAGCAACTAAAACCTAGTGCAAGAAGCAATTGTTGACGTAAGTTTTTAGTGTGCATATTTCTAGTTTCCGATAGCAATCAATGTATGTATGGGTTGTATGTATATAGCAGTTATGTATAGTAAATATACATAAGGGCTTTTATGCATATATAAATACACAGCTACGTGAGATTGTGCCACGCTAGGCAAAACGAAACATGTTAATAGTG-TTTTTATTTGTTAAGTGTATTCATTAGGCGATA] [+] EMBL BX620757 [TTATAGTATTAGGGGTTTTAAAATGTAGTCCATGCCTAACTCTTTCCTTCCTTCACTTTCTCTCTCTCTTCCCCCTCCTTCTTTCTATCTCTCTCTATTGCGCGCTCTCTCTGTCTCTCTATTACTTTCTCTTTGCCTCTCCATGTCCATGCCTCATGTGTGTTTCCCTGTATTTTGTTTCCTTTTTTATTTCTATTTCCATTCTCAGTGAGTAATGAGAATATGCGATTTAACATGAGATGTTTAAAATTACAAAAGAATTTGACGAAAATGTTGTATTGTAAGCATATCTTAATTTTTGTGAGTTTCTTCGCATATCCTTCCTTGATAAATGTTAGCTGTTGCTAATTTCATTGTCCTCTGTTGTTTCGGTATTTGTCTTTGTGGTCGTCTGGTATCGGTTTTGTTTGAATGTGCGGCTTTAATACGCTTCATACGAGGGTCTATATTGTGGGTGCGTGTAGAGGATTCTACAACAGTGAAGTAGAACCATTTTGAGTTAGTTTGGCTATAACTGTATGACGCAAGTATGAGTTTGCTATGAAAACTGTATATTCATGTATGCCTCACAATAGGAATCAAGCGAAAAGTGAAACTGTCCCATGCTTGATTATTGTTGCATTGTTTAGTTTTACCTTTCAACTAAAGTACTTTTATCATTTGTTCCCGCGAGTTTAATAGTTTTTACNAATAAGCATTGATTGATACATCGATTTCATCTCACCTTCACC TTTCATCCAACGTAAAA ] [+] EMBL BM626156 [ CCGTTTTTATTTCTATTTCCATTCTCAGTGAGTAATGAGAATATGCGATTTAACATGAGATGTTTAAAATTACAAAAGAATTTGACGAAAATGTTGTATTGTAAGCATATCTTAATTTTTTTGAGTTTCTTCGCATAT CTTCCTTGATAAATGTTAGCTGTTGCTAATTTCATTGTCCTCTGTTGTTTCGGTATTTGTCTTTGTGGTCGTCTGGTATCGGTTTTGTTTGAATGTGCGGCTTTAATACGCTTCATACGAGGGTCTATATTGTGGGTGCGTGTAGAGGATTCTACAACAGTGAAGTAGAACCATTTTGAGTTAGTTTGGCTATAACTGTATGACGCAAGTATGAGTTTGCTATGAAAACTGTATATTCATGTATGCCTCACAATAGGAATCAAGCGAAAAGTGAAACTGTCCCATGCTTGATTATTGTTGCATTGTTTAGTTTTACCTTTCAACTAAAGTACTTTTATCATTTGTT CCGCGAGTTTAATAGTTTTTACAAATAAGCATTGATTGATACATCGATTTCATCTCACCTTCACCTTTTCATCCAACGTAAAACGAAACTTTCGGTTTGATTAAACATGCTGCATCTGTAAAAAGCAATAAATGGTGTATCATAAATGAGATAACAACACAAGAAATCGCCAG ] [+] EMBL BX612213 [ ACAAAAGAATTTGACGAAAATGTTTTATTGTAAGCATATCTTAATTTTTGTGAGTTTCTTCGCATAT CTTCCTTGATAAATGTTAGCTGTTGCTAATTTCATTGTCCTCTGTTGTTTCGGTATTTGTCTTTGTGGTCGTCTGGTATCGGTTTTGTTTGAATGTGCGGCTTTAATACGCTTCATACGAGGGTCTATATTGTGGGTGCGTGTAGAGGATTCTACAACAGTGAAGTAGAACCATTTTGAGTTAGTTTGGCTATAACTGTATGACGCAAGTATAAGTTTGCTATGAAAACTGCATATTCATGTATGCCTCACAATAGGAATCAAGCGAAAAGTGAAACTGTCCCATGCTTGATTATTGTTGCATTGTTTAGTTTTACCTTTCAACTAAAGTACTTTTATCATTTGTT CCGCGAGTTTAATAGTTTTTACAAATAAGCATTGATTGATACATCGATTTCATCTCACCTTCACCTTTTCATCCAACGTAAAACGATACTTTCGGTTTGATTAAACATGCTGCATCTGTAAAAAGCAATAAATGGTGTATCATAAATGAGATAACAACACAAGAAATCGCCAGTTGAATGGTACTGTTTATCAATCCGCCGCACTGTATGAGCTATAGATTTGGAC ] [+] EMBL BX614515 [ TTCGCATATCCTTCCTTGATAAATGTTAGCTGTTGCTAATTTCATTGTCCTCTGTTGTTTCGGTATTTGTCTTTGTGGTCGTCTGGTATCGGTTTTGTTTGAATGTGCGGCTTTAATACGCTTCATACGAGGGTCTATATTGTGGGTGCGTGTAGAGGATTCTACAACAGTGAAGTAGAACCATTTTGAGTTAGTTTGGCTATAACTGTATGACGCAAGTATGAGTTTGCTATGAAAACTGTATATTCATGTATGCCTCACAATAGGAATCAAGCGAAAAGTGAAACTGTCCCATGCTTGATTATTGTTGCATTGTTTAGTT ] [+] EMBL BX612683 [ GCTTGATTATTGTTGCATTGTTTAGTTTTACCTTTCAACTAAAGTACTTTTATCATTTGTT CCGCGAGTTTAATAGTTTTTACAAATAAGCATTGATTGATACATCGATTTCATCTCACCTTCACCTTTTCATCCAACGTAAAACGATACTTTCGGTTTGATTAAACATGCTGCATCTGTAAAAAGCAATAAATGGTGTATCATAAATGAGATAACAACACAAGAAATCGCCAGTTGAATGGTATTGTTTATCAATCCGCCGCACTGTATGAGCTATAGATTTGGACATATATTTGTGAAGTACGTTGTGTGTAGCTTAAACCACATCTAACTATATAGCACTCACCTGAATTGGTGCCAGTTCCGAAGCACGCACTTAACAGCAGACGTTTGGTTTTAAATTACAACGTTTTCAAGGGATGGCCAACAAATCCGTCGTGACAGTGGTGCTCGGAGAGCTTAAACCCGAGTGTTGTCGTAGAAACATATTCGCTGATAGAACTATTGAACGATAAGCAACTAAAACCTAGTGCAAGAAGCAATTGTTGACGTAAGTTTTTAGTGTGCATATTTCTAGTTTCCGATAGCAATCAATGTATGTATGGGTTGTATGTATATAGCAGTTATGTATAGTAAATATACATAAGGGCTTTTATGCATATATAAATACACAGCTACGTGAGATTGTGCCACGCTAGGCAAAACGAAACATGTTAATAGTG TTTTTATTTGTTAAGTGTATTCATTAGGCGATA] [+] EMBL BX615440 [ AAAGCAATAAATGGTGTATCATAAATGAGATAACAACACAAGAAATCGCCAGTTGAATGGTACTGTTTATCAATCCGCCGCACTGTATGAGCTATAGATTTGGACATATATTTGTGAAGTACGTTGTGTGTAGCTTAAACCACATCTAACTATATAGCACTCACCTGAATTGGTGCCATTTTCGAAGCACGCACTTAACAGCAGACGTTTGGTTTTAAATTACAACGTTTTCAAGGGATGGCCAACAAATCCGTCGTGACAGTGGTGCTCGGAGAGCATAAACCCGAGTGTTGTCGTAGAAATATATTCGCTGATAGAACTATTGAACGATAAGCAACTAAAACCTAGTGCAAGAAGCAATTGTTGACGTAAGTTTTTAGTGTGCATATTTCTAGTTTCCGATAGCAATCAATGTATGTATGGGTTGTATGTATATAGCAGTTATGTATAGTAAATATACATAAGGGCTTTTATGCATATATAAATACACAGCTACGTGAGATTGTGCCACGCTAGGCAAAACGAAACATGTTAATAGTGTTTTTTATTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||