cluster # 6744

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Anopheles gambiae
cluster # 6744 cluster # 6744 Sequences # 6 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6744#0 length = 666 sequences # 5

consensus_6744#1 length = 616 sequences # 1

consensusID : consensus_6744#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 666
fasta sequence

                              [CCGCGCATCGGCGGTGCGGTCGCTCTGCCCGGTCCCGTCCGTCCGTCCGTGTGTGTGTGTGTTGTGTGCTGTGTGTGTGTGCGTCTGTGTGCAGCGGCGCGAAACTTCGAGCCACCGTCTTGTGAAATCATATGGTCAGCTAAGGTGGGCCCTCGAACAGCAAGATGGCCGATCAGAAGGAACGCGATCTGGAAGAGGCGGTTGCGATGGAAGCGGTAGCGGCTCCACGTGTCGGGTGCTGCCGGCGGACGATGAAGTACATCGGTGCGTACTGGCGCTCGATGGTAGTCATCGTTGCGCCGATGATTGCGTCGCTCGTGTTCCTGATCGACACCACGCCCGCCTATCGGTGTATGTTTGTCGTGCTGACGATGTCACTGTACTGGGTGACGGAAGCGTTACCGCTGCCCGTTACGTCGATGTTACCGATCGTCCTGTTCCCGGTGCTCGGTGTACTGGAAACCGATCGTACCTGCATGATGTACATGAAGGAAACGATGCTGATGTTTATCGGTGGTATCATCATTGCGCTTGCGGTTGAGTACTGCAATCTGCACAAGCGTGTCGCGTTGAAGGTGATC-TCGGTGATCGGTTGTAGCCAGCGGCGCCTCAACTTTGGCCTAACGGTGGTAACGATGTTCGTTTCGATGTGGATTTCGAACACTG]

[+] EMBL BM602136             [CCGCGCATCGGCGGTGCGGTCGCTCTGCCCGGTCCCGTCCGTCCGTCCGTGTGTGTGTGTGTTGTGTGCTGTGTGTGTGTGCGTCTGTGTGCAGCGGCGCGAAACTTCGAGCCACCGTCTTGTGAAATCATATGGTCAGCTAAGGTGGGCCCTCGAACAGCAAGATGGCCGATCAGAAGGAACGCGATCTGGAAGAGGCGGTTGCGATGGAAGCGGTAGCGGCTCCACGTGTCGGGTGCTGCCGGCGGACGATGAAGTACATCGGTGCGTACTGGCGCTCGATGGTAGTCATCGTTGCGCCGATGATTGCGTCGCTCGTGTTCCTGATCGACACCACGCCCGCCTATCGGTGTATGTTTGTCGTGCTGACGATGTCACTGTACTGGGTGACGGAAGCGTTACCGCTGCCCGTTACGTCGATGTTACCGATCGTCCTGTTCCCGGTGCTCGGTGTACTGGAAACCGATCGTACCTGCATGATGTACATGAAGGAAACGATGCTGATGTTTATCGGTGGTATCATCATTGCGCTTGCGGTTGAGTACTGCAATCTGCACAAGCGTGTCGCGTTGAAGGTGATC TCGGTGATCGGTTGTAGCCAGCGGCGCCTCAACTTTGGCCTAACGGTGGTAACGATGTTCGTTTCGATGTGGATTTCGAACACTG]
[+] EMBL BM577879             [CCG GCATCGGCGGTGCGGTCGCTCTGCCCGGTCCCGTCCGTCCGTCCGTGTGTGTGCCCG TGTGCG AGTGTGTGTGTGCGTCTGTGTGCAGCGGCGCGAAACTTCGAGCCACCGTCTTGTGAAATCATATGGTCAGCTAAGGTGGGCCCTCGAACAGCAAGATGGCCGATCAGAAGGAACGCGATCTAGAAGAGGCGGTTGCGATGGAAGCGGTAGCGGCTCCACGTGTCGGGTGCTGCCGGCGGACGATGAAGTACATCGGTGCGTACTGGCGCTCGATGGTAGTCATCGTTGCGCCGATGATTGCGTCGCTCGTGTTCCTGATCGACACCACGCCCGCCTACCGGTGTATGTTTGTCGTGCTGACGATGTCACTGTACTGGGTGACGGAAGCGTTACCGCTGCCCGTTACGTCGATGTTACCGATCGTCCTGTTCCCGGTGCTCGGTGTACTGGAAACCGATCGTACCTGTATGATGTACATGAAGGAAACGATGCTGATGTTTATCGGTGGTATCATCATTGCGCTTGCGGTTGAGTACTGTAATCTGCACAAGCGTGTCGCGCTGAAGGTGATCTTCGGTGATCGGT                                                                         ]
[+] EMBL BM607511             [CCGCGCATCGGCGGTGCGGTCGCTCTGCCCGGTCCCGTCCGTCCGTCCGTGTGTGTGTGTGTTGTGTGCTGTGTGTGTGTGCGTCTGTGTGCAGCGGCGCGAAACTTCGAGCCACCGTCTTGTGAAATCATATGGTCAGCTAAGGTGGGCCCTCGAACAGCAAGATGGCCGATCAGAAGGAACGCGATCTGGAAGAGGCGGTTGCGATGGAAGCGGTAGCGGCTCCACGTGTCGGGTGCTGCCGGCGGACGATGAAGTACATCGGTGCGTACTGGCGCTCGATGGTAGTCATCGTTGCGCCGATGATTGCGTCGCTCGTGTTCCTGATCGACACCACGCCCGCCTATCGGTGTATGTTTGTCGTGCTGACGATGTCACTGTACTGGGTGACGGAAGCGTTACCGCTGCCCGTTACGTCGATGTTACCGATCGTCCTGTTCCCGGTGCTCGGTGTACTGGAAACCGATCGTACCTGCATGATGTACATGAAGGAAACGATGCTGATGTTTATCGGTGGTATCATCATTGCGCTTGCGGTTGA                                                                                                                              ]
[+] EMBL BM605371             [  cCGCATCGGCGGTGCGGTCGCTCTGCCCGGTCCCGTCCGTCCGTCCGTGTGTGTG CTG TGTGCG AGTGTGTGTGTGCCTCTGTGTGCAGCGGCGCGAAACTTCGAGCCACCGTCTTGTGAAATCATATGGTCAGCTAAGGTGGGCCCTCGAACAGCAAGATGGCCGATCAGAAGGAACGCGATCTGGAAGAGGCGGTTGCGATGGAAGCGGTAGCGGCTCCACGTGTCGGGTGCTGCCGGCGGACGATGAAGTACATCGGTGCGTACTGGCGCTCGATGGTAGTCATCGTTGCGCCGATGATTGCGTCGCTCGTGTTCCTGATCGACACCACGCCCGCCTACCGGTGCATGTTTGTCGTGCTGACGATGTCACTGTATTGGGTGACGGAAGCGTTACCGCTGCCCGTTACGTCGATGTTACCGATCGTCCTGTTCCCGGTGCTCGGTGTACTGGAAACCGATCGTACCTGTATGATGTACATGAAGGAAACGATGCTGATGTTTATCGGTGGTATCATCATTGCGCTTGCGGTTGAGTA                                                                                                                           ]
[+] EMBL BM635430             [   ccgATCGGCGGTGCGGTCGCTCTGCCCGGTCCCGTCCGTCCGTCCGTGTGTGTGTGTGTTGTGTGCTGTGTGTGTGTGCGTCTGTGTGCAGCGGCGCGAAACTTCGAGCCACCGTCTTGTGAAATCATATGGTCAGCTAAGGTGGGCCCTCGAACAGCAAGATGGCCGATCAGAAGGAACGCGATCTGGAAGAGGCGGTTGCGATGGAAGCGGTAGCGGCTCCACGTGTCGGGTGCTGCCGGCGGACGATGAAGTACATCGGTGCGTACTGGCGCTCGATGGTAGTCATCGTTGCGCCGATGATTGCGTCGCTCGTGTTCCTGATCGACACCACGCCCGCCTATCGGTGTATGTTTGTCGTGCTGACGATGTCACTGTACTGGGTGACGGAAGCGTTACCGCTGCCCGTTACGTCGATGTTACCGATCGTCCTGTTCCCGGTGCTCGGTGTACTGGAAACCGATCGTACCTGCATGATGTACATGAAGGA                                                                                                                                                                              ]




>consensus_6744#0
CCGCGCATCGGCGGTGCGGTCGCTCTGCCCGGTCCCGTCCGTCCGTCCGTGTGTGTGTGT
GTTGTGTGCTGTGTGTGTGTGCGTCTGTGTGCAGCGGCGCGAAACTTCGAGCCACCGTCT
TGTGAAATCATATGGTCAGCTAAGGTGGGCCCTCGAACAGCAAGATGGCCGATCAGAAGG
AACGCGATCTGGAAGAGGCGGTTGCGATGGAAGCGGTAGCGGCTCCACGTGTCGGGTGCT
GCCGGCGGACGATGAAGTACATCGGTGCGTACTGGCGCTCGATGGTAGTCATCGTTGCGC
CGATGATTGCGTCGCTCGTGTTCCTGATCGACACCACGCCCGCCTATCGGTGTATGTTTG
TCGTGCTGACGATGTCACTGTACTGGGTGACGGAAGCGTTACCGCTGCCCGTTACGTCGA
TGTTACCGATCGTCCTGTTCCCGGTGCTCGGTGTACTGGAAACCGATCGTACCTGCATGA
TGTACATGAAGGAAACGATGCTGATGTTTATCGGTGGTATCATCATTGCGCTTGCGGTTG
AGTACTGCAATCTGCACAAGCGTGTCGCGTTGAAGGTGATCTCGGTGATCGGTTGTAGCC
AGCGGCGCCTCAACTTTGGCCTAACGGTGGTAACGATGTTCGTTTCGATGTGGATTTCGA
ACACTG

consensusID : consensus_6744#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 616
fasta sequence

                              [CCGGCAAAATCCGATTTCCTTTCAGTGTTTGTGTGCTTGTGCCTGTGTGTGTGTGCAGCGGCGTTACAGCCACCGTCTTGTGAAATCATATGGTCAGCTAAGGTGGGCCCTCGAACAGCAAGATGGCCGATCAGAAGGAACGCGATCTGGAAGAGGCGGTTGCGATGGAAGCGGTAGCGGCTCCACGTGTCGGGTGCTGCCGGCGGACGATGAAGTACATCGGTGCGTACTGGCGCTCGATGGTAGTCATCGTTGCGCCGATGATTGCGTCGCTCGTGTTCCTGATCGACACCACGCCCGCCTATCGGTGTATGTTTGTCGTGCTGACGATGTCACTGTACTGGGTGACGGAAGCGTTACCGCTGCCCGTTACGTCGATGTTACCGATCGTCCTGTTCCCGGTGCTCGGTGTACTGGAAACCGATCGTACCTGCATGATGTACATGAAGGAAACGATGCTGATGTTTATCGGTGGTATCATCATTGCGCTTGCGGTTGAGTACTGCAATCTGCACAAGCGTGTCGCGTTGAAGGTGATCTCGGTGATCGGTTGTAGCCAGCGGCGCCTCAACTTTGGCCTAACGGTGGTAACGATGTTCGTTTCGATGTGGATTCG]

[+] EMBL BM616547             [CCGGCAAAATCCGATTTCCTTTCAGTGTTTGTGTGCTTGTGCCTGTGTGTGTGTGCAGCGGCGTTACAGCCACCGTCTTGTGAAATCATATGGTCAGCTAAGGTGGGCCCTCGAACAGCAAGATGGCCGATCAGAAGGAACGCGATCTGGAAGAGGCGGTTGCGATGGAAGCGGTAGCGGCTCCACGTGTCGGGTGCTGCCGGCGGACGATGAAGTACATCGGTGCGTACTGGCGCTCGATGGTAGTCATCGTTGCGCCGATGATTGCGTCGCTCGTGTTCCTGATCGACACCACGCCCGCCTATCGGTGTATGTTTGTCGTGCTGACGATGTCACTGTACTGGGTGACGGAAGCGTTACCGCTGCCCGTTACGTCGATGTTACCGATCGTCCTGTTCCCGGTGCTCGGTGTACTGGAAACCGATCGTACCTGCATGATGTACATGAAGGAAACGATGCTGATGTTTATCGGTGGTATCATCATTGCGCTTGCGGTTGAGTACTGCAATCTGCACAAGCGTGTCGCGTTGAAGGTGATCTCGGTGATCGGTTGTAGCCAGCGGCGCCTCAACTTTGGCCTAACGGTGGTAACGATGTTCGTTTCGATGTGGATTCG]




>consensus_6744#1
CCGGCAAAATCCGATTTCCTTTCAGTGTTTGTGTGCTTGTGCCTGTGTGTGTGTGCAGCG
GCGTTACAGCCACCGTCTTGTGAAATCATATGGTCAGCTAAGGTGGGCCCTCGAACAGCA
AGATGGCCGATCAGAAGGAACGCGATCTGGAAGAGGCGGTTGCGATGGAAGCGGTAGCGG
CTCCACGTGTCGGGTGCTGCCGGCGGACGATGAAGTACATCGGTGCGTACTGGCGCTCGA
TGGTAGTCATCGTTGCGCCGATGATTGCGTCGCTCGTGTTCCTGATCGACACCACGCCCG
CCTATCGGTGTATGTTTGTCGTGCTGACGATGTCACTGTACTGGGTGACGGAAGCGTTAC
CGCTGCCCGTTACGTCGATGTTACCGATCGTCCTGTTCCCGGTGCTCGGTGTACTGGAAA
CCGATCGTACCTGCATGATGTACATGAAGGAAACGATGCTGATGTTTATCGGTGGTATCA
TCATTGCGCTTGCGGTTGAGTACTGCAATCTGCACAAGCGTGTCGCGTTGAAGGTGATCT
CGGTGATCGGTTGTAGCCAGCGGCGCCTCAACTTTGGCCTAACGGTGGTAACGATGTTCG
TTTCGATGTGGATTCG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_6744#0      CCGCGCATCGGCGGTGCGGTCGCTCTGCCCGGTCCCGTCCGTCCGTCCGTGTGTGTGTGT 60
consensus_6744#1      ----------------------------CCGGCAAAATCCGATTTCCTTTCAGTGT---- 28
                                                  ****     ****     *  *  ****    

consensus_6744#0      GTTGTGTGCTGTGTGTGTGTGCGTCTGTGTGCAGCGGCGCGAAACTTCGAGCCACCGTCT 120
consensus_6744#1      -TTGTGTGCT---TGTGCCTGTGTGTGTGTGCAGCGGCG------TTACAGCCACCGTCT 78
                       *********   ****  ** ** **************      **  ***********

consensus_6744#0      TGTGAAATCATATGGTCAGCTAAGGTGGGCCCTCGAACAGCAAGATGGCCGATCAGAAGG 180
consensus_6744#1      TGTGAAATCATATGGTCAGCTAAGGTGGGCCCTCGAACAGCAAGATGGCCGATCAGAAGG 138
                      ************************************************************

consensus_6744#0      AACGCGATCTGGAAGAGGCGGTTGCGATGGAAGCGGTAGCGGCTCCACGTGTCGGGTGCT 240
consensus_6744#1      AACGCGATCTGGAAGAGGCGGTTGCGATGGAAGCGGTAGCGGCTCCACGTGTCGGGTGCT 198
                      ************************************************************

consensus_6744#0      GCCGGCGGACGATGAAGTACATCGGTGCGTACTGGCGCTCGATGGTAGTCATCGTTGCGC 300
consensus_6744#1      GCCGGCGGACGATGAAGTACATCGGTGCGTACTGGCGCTCGATGGTAGTCATCGTTGCGC 258
                      ************************************************************

consensus_6744#0      CGATGATTGCGTCGCTCGTGTTCCTGATCGACACCACGCCCGCCTATCGGTGTATGTTTG 360
consensus_6744#1      CGATGATTGCGTCGCTCGTGTTCCTGATCGACACCACGCCCGCCTATCGGTGTATGTTTG 318
                      ************************************************************

consensus_6744#0      TCGTGCTGACGATGTCACTGTACTGGGTGACGGAAGCGTTACCGCTGCCCGTTACGTCGA 420
consensus_6744#1      TCGTGCTGACGATGTCACTGTACTGGGTGACGGAAGCGTTACCGCTGCCCGTTACGTCGA 378
                      ************************************************************

consensus_6744#0      TGTTACCGATCGTCCTGTTCCCGGTGCTCGGTGTACTGGAAACCGATCGTACCTGCATGA 480
consensus_6744#1      TGTTACCGATCGTCCTGTTCCCGGTGCTCGGTGTACTGGAAACCGATCGTACCTGCATGA 438
                      ************************************************************

consensus_6744#0      TGTACATGAAGGAAACGATGCTGATGTTTATCGGTGGTATCATCATTGCGCTTGCGGTTG 540
consensus_6744#1      TGTACATGAAGGAAACGATGCTGATGTTTATCGGTGGTATCATCATTGCGCTTGCGGTTG 498
                      ************************************************************

consensus_6744#0      AGTACTGCAATCTGCACAAGCGTGTCGCGTTGAAGGTGATCTCGGTGATCGGTTGTAGCC 600
consensus_6744#1      AGTACTGCAATCTGCACAAGCGTGTCGCGTTGAAGGTGATCTCGGTGATCGGTTGTAGCC 558
                      ************************************************************

consensus_6744#0      AGCGGCGCCTCAACTTTGGCCTAACGGTGGTAACGATGTTCGTTTCGATGTGGATTTCGA 660
consensus_6744#1      AGCGGCGCCTCAACTTTGGCCTAACGGTGGTAACGATGTTCGTTTCGATGTGGATTCG-- 616
                      ********************************************************    

consensus_6744#0      ACACTG 666
consensus_6744#1      ------