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Anopheles gambiae
cluster # 6824 cluster # 6824       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6824#0 length = 926 sequences # 6  

consensusID : consensus_6824#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 926
fasta sequence
                              [AAGACACACACGGCTGGCGGCGTATCGCCCGGGGGGCCGGCTATCTGTTCGGCTCCGACGTCGTGTCACAGTTTAATGCCGCCAACGATATCGACATGATATGCCGGGCGCATCAGCTCGTGATGGAGGGTTACAAGTGGCACTTTAACGAAACCGTACTCACCGTCTGGTCGGCACCCAACTATTGCTATCGGTGTGGTAATGTGGCCGCAATATTAGAACTGAACGAAAACCTTCAGCGCGACTTTACCATCTTCGAAGCAGCACCACAGGAAAGCCGCGGAATACCGTCGAAAAAACCTCAGGCAGACTACTTCCTTTAAGTTATCTTTGATTGTGGTGTCCCTCCTCCTTTCTATTCCTTCCTTCCTTTTTTTATTGTACACCCTTCCATATGTGTGCGAGTATGTGTCCCCGTTCGATCGGCCACATTATCTGTAAAGGCGCTGCTGAAGTGATCGATAGCGACGAGAAGAAATTGTTCGCCATTAGTTTAATACATTGTAACCTTGACACATTAAAACACAACTCTTTTGGGATGATTTCATCCGTTATTTTACGCGACCACTTTTGACCTCGGACCAGCCCCTGTGTCCCGTCACGGGTGCTTGATGTTCTTCGCTCTATCCTGCCGCCTTTCGCATCCGATGTGGACACATGACACAACAAGTTCTACGTACCTAATTTTTGTACTTCTTATGTTTGAAGGTGGTGTGAAGTATTTTCACAGTTTCTCTCCCAGGAAAGCAATAGAGTTTTGAGTTTTGTCCCAACACAATGGTGACGACGATCACGACGATGAGTGAATGGCAGAAGTGTTGCGGTGTGCGAGAAGAAAGTAATGCCCGCATTTGTAAACAGTAAAAATAAAACATTAAAAGTATGACAAGACGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCAAA]

[+] EMBL CNS096GD             [AAGACACACACGGCTGGCGGCGTATCGCCCGGGGGGCCGGCTATCTGTTCGGCTCCGACGTCGTGTCACAGTTTAATGCCGCCAACGATATCGACATGATATGCCGGGCGCACCAGCTCGTGATGGAGGGTTACAAGTGGCACTTTAACGAAACCGTACTCACCGTCTGGTCGGCACCCAACTATTGCTATCGGTGTGGTAATGTGGCCGCAATATTAGAACTGAACGAAAACCTTCAGCGCGACTTTACCATCTTCGAAGCAGCACCACAGGAAAGCCGCGGAATACCGTCGAAAAAACCTCAGGCAGACTACTTCCTTTAAGTTATCTTTGATTGTGGTGTCCCTCCTCCTTTCTATTCCTTCCTTCCTTTTTTTATTGTACACCCTTCCATATGTGTGCGAGTATGTGTCCCCGTTCGATCGGCCACATTATCTGTAAAGGCGCTGCTGAAGTGATCGATAGCGACGAGAAGAAATTGTTCGCCATTAGTTTAATACATTGTAACCTTGACACATTAAAACACAACTCTTTTGGGATGATTTCATCCGTTATTTTACGCGACCACTTTTGACCTCGGACCAGCCCCTGTGTCCCGTCACGGGTGCTTGATGTTCTTCGCTCTATCCTGCCGCCTTTCGCATCCGATGTGGACACATGACACAACAAGTTCTACGTACCTAATTTTTGTACTTCTTATGTTTGAAGGTGGTGTGAAGTATTTTCACAGTTTCTCTCCCAGGAAAGCAATAGAGTTTTGAGTTTTGTCCCAACACAATGGTGACGACGATCACGACGATGAGTGAATGGCAGAAGTGTTGCGGTGTGCGAGAAGAAAGTAATGCCCGCATTTGTAAACAGTAAAAATAAAACATTAAAAGTATGACAAGACGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCAAA]
[+] EMBL BM624504             [                     ccgcgcCCCGGGGGGCCGGCTATCTGTTCGGCTCCGACGTCGTGTCACAGTTTAATGCCGCCAACGATATCGACATGATATGCCGGGCGCATCAGCTCGTGATGGAGGGTTACAAGTGGCACTTTAACGAAACCGTACTCACCGTCTGGTCGGCACCCAACTATTGCTATCGGTGTGGTAATGTGGCCGCAATATTAGAACTGAACGAAAACCTTCAGCGCGACTTTACCATCTTCGAAGCAGCACCACAGGAAAGCCGCGGAATACCGTCGAAAAAACCTCAGGCAGACTACTTCCTTTAAGTTATCTTTGATTGTGGTGTCCCTCCTCCTTTCTATTCCTTCCTTCCTTTTTTTATTGTACACCCTTCCACATGTGTGCGAGTATGTGTCCCCGTTCGATCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CNS09N3H             [                                                                           ATGCCGCCAACGATATCGACATGATATGCCGGGCGCATCAGCTCGTGACGGAGGGTTACAAGTGGCACTTTAACGAAACCGTACTCACCGTCTGGTCGGCACCCAACTATTGCTATCGGTGTGGTAATGTGGCCGCAATATTAGAACTGAACGAAAACCTTCAGCGCGACTTTACCATCTTCGAAGCAGCACCACAGGAAAGCCGCGGAATACCGTCGAAAAAACCTCAGGCAGACTACTTCCTTTAAGTTATCTTTGATTGTGAAGTCCCTCCTCCTTTCTATTCCTTCCTTCCTTTTTTTATTGTACACCCTTCCATATGTGTGCGAGTATGTGTCCCCGTTCGATCGGCCACATTATCTGTAAAGGCGCTGCTGAAGTGATCGATAGCGACGAGAAGAAATTGTTCGCCATTAGTTTAATACATTGTAACCTTGACATAATAAAACACAACTCTTTTGGGATGATTTCATCCGTTATTTTACGCGACCACTTTTGACCTCGGACCAGCCCCTGTGTCCCGTCACGGGTGCTTGATGTTCTTCGCTCTATCCTGCCGCCTTTCGCATCCGATGTGGACACATGACACAACAAGTTCTACGTACCTAATTTTTGTACTTCTTATGTTTGAAGGTGGTGTGAAGTATTTTCACAGTTTCTCTCCCAGGAAAGCAATAGAGTTTTGAGTTTTGTCCCAACACAATGGTGACGACGATCACGACGATGAGTGAATGGCAGAAGTGTTGCGGTGTGCGAGAAGAAAGTAATGCCCGCATTTGTAAACAGTAAAAATAAAACATTAAAAGTATGACAAGAC                                  ]
[+] EMBL AL694814             [                                                                  cccccggttATG CG CAACGATATCGACATGATATGCCGGGCGCAT AGCTCGTGATGGAGGGTTACAAGTGGCACTTTAACGAAACCGTACTCACCGTCTGGTCGGCACCCAACTATTGCTATCGGTGTGGTAATGTGGCCGCAATATTAGAACTGAACGAAAACCTTCAGCGCGACTTTACCATCTTCGAAGCAGCACCACAGGAAAGCCGCGGAATACCGTCGAAAAAACCTCAGGCAGACTACTTCCTTTAAGTTATCTTTGATTGTGGTGTCCCTCCTCCTTTCTATTCCTTCCTTCCTTTTTTTATTGTACACCCTTCCATATGTGTGCGAGTATGTGTCCCCGTTCGATCGGCCACATTATCTGTAAAGGCGCTGCTGAAGTGATCGATAGCGACGAGAAGAAATTGTTCGCCATTAGTTTAATACATTGTAACCTTGACACATTAAAACACAACTCTTTTGGGATGATTTCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BM631702             [                                                                                                                                                                                                                                                                                              ccgGTCGAAAAAACCTCAGGCAGACTACTTCCTTTAAGTTATCTTTGATTGTGGTGTCCCTCCTCCTTTCTATTCCTTCCTTCCTTTTTTTATTGTACACCCTTCCATATGTGTGCGAGTATGTGTCCCCGTTCGATCGGCCACATTATCTGTAAAGGCGCTGCTGAAGTGATCGATAGCGACGAGAAGAAATTGTTCGCCATTAGTTTAATACATTGTAACCTTGACACATTAAAACACAACTCTTTTGGGATGATTTCATCCGTTATTTTACGCGACCACTTTTGACCTCGGACCAGCCCCTGTGTCCCGTCACGGGTGCTTGATGTTCTTCGCTCTATCCTGCCGCCTTTCGCATCCGATGTGGACACATGACACAACAAGTTCTACGTACCTAATTTTTGTACTTCTTATGTTTGAAGGTGGTGTGAAGTATTTTCACAGTTTCTCTCCCAGGAAAGCAATAGAGTTTTGAGTTTTGTCCCAACACAATGGTGACGACGATCACGACGATGAGTGAATGGCAGAAGTGTTGCGGTGTGCGAGAAGAAAGTAATGCCCGCATTTGTAAACAGTAAAAATAAAACATTAAAAGTATGACAAGACG                                 ]
[-] EMBL CNS096GE             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGATGATTTCATCCGTTTTTTTACGCGACCACTTTTGACCTCGGACCAGCCCCTTTGTCCCGTCACGGGTGCTTGATGTTCTTCGCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]


>consensus_6824#0 AAGACACACACGGCTGGCGGCGTATCGCCCGGGGGGCCGGCTATCTGTTCGGCTCCGACG TCGTGTCACAGTTTAATGCCGCCAACGATATCGACATGATATGCCGGGCGCATCAGCTCG TGATGGAGGGTTACAAGTGGCACTTTAACGAAACCGTACTCACCGTCTGGTCGGCACCCA ACTATTGCTATCGGTGTGGTAATGTGGCCGCAATATTAGAACTGAACGAAAACCTTCAGC GCGACTTTACCATCTTCGAAGCAGCACCACAGGAAAGCCGCGGAATACCGTCGAAAAAAC CTCAGGCAGACTACTTCCTTTAAGTTATCTTTGATTGTGGTGTCCCTCCTCCTTTCTATT CCTTCCTTCCTTTTTTTATTGTACACCCTTCCATATGTGTGCGAGTATGTGTCCCCGTTC GATCGGCCACATTATCTGTAAAGGCGCTGCTGAAGTGATCGATAGCGACGAGAAGAAATT GTTCGCCATTAGTTTAATACATTGTAACCTTGACACATTAAAACACAACTCTTTTGGGAT GATTTCATCCGTTATTTTACGCGACCACTTTTGACCTCGGACCAGCCCCTGTGTCCCGTC ACGGGTGCTTGATGTTCTTCGCTCTATCCTGCCGCCTTTCGCATCCGATGTGGACACATG ACACAACAAGTTCTACGTACCTAATTTTTGTACTTCTTATGTTTGAAGGTGGTGTGAAGT ATTTTCACAGTTTCTCTCCCAGGAAAGCAATAGAGTTTTGAGTTTTGTCCCAACACAATG GTGACGACGATCACGACGATGAGTGAATGGCAGAAGTGTTGCGGTGTGCGAGAAGAAAGT AATGCCCGCATTTGTAAACAGTAAAAATAAAACATTAAAAGTATGACAAGACGAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)