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Anopheles gambiae
cluster # 6829 cluster # 6829       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6829#0 length = 1737 sequences # 6  

consensusID : consensus_6829#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1737
fasta sequence
                              [AAACGCATCGGAATTTATACAGTAAAAAAACACAAACTCCCTCCTCCTCCTCTTCATAGTACACAAACGCTCCCTGACACACACTGAAGTTTGATAAGGATAAGTGAATTTAAATCACAAATATTTGTTGGCATGTGAACACACAAAAAATGCTGTTGAAGAAAAAGATGCATTTTAATTTGATGCTTCATACTCTACAATTCCAGCAAAGATACGAAAATTATAGAATTAATTTTCTTTAGAACATTCTCACCCAAAGTTTAACAAGTGCGCATTTGTTAACAGAAAGTTTTGTAACCAATAATCGTGTTAAACATTTCAAAGAGTTTATGTTTTAAAACAGTGGATTTGAAAAAAAAAACGAACATATGTTACGAAAAGCCTTTTCGATGGAGAGCTTTCTCTCGTCGAACCATAGCGCCATCTAGGGTGAGATTTTTTTGTCGTTGATTTGATTCTTTGCTTTTTGATTTTTTATTTCGTGTTTTCTTTTTCAAACGATTCAACCGTTTAGCTAAATTCTATTTAACTGGAGTACGTATATATTTTTTGCGTATAGCTTTTATTTAAACAATATTTTCAAATTCATTTCATCATGCGCAACATCATTACTTTGAAGTAATACCGAATATTCACATTAAAACACACCAAATCTTACATCCACGCAGGCAGTTTAATAATCGCTCCGCTATTATCGTCGCACTTCAAAATTCATTCATTTTGTGTGTGTTCATAGCTGTTTCAAAATGATCTCGATCGCACAAAAATGCTAATTCCCTGTTCGGTAAAACGAAAGATACAGCTTATCCACCAATAAGTACACGTGACGATGGGTTTTGGTGAATTGGAACAGTGACATTTCGCTGCCACCAGATCATGCTGTTTTTTGTATGAATAGATACGAACACTAATTTTAAAAACTCAACTCTAGATAGATAGGAAAGCTTATGCCCGCCATACGATGCGAACACAAGAAGCCCAAATCGTTCGATTGAAAACGTGATGAGTACGTGAGAAGGCAGAACACGACAGAGATCGGATAGAACCGGGAATTATAGCAATGTAAAAACTAGACGTATAAGTGTAAACATTTAAATATAATTATTTTAAATTCTAGTGAATCGGGAACGACACCAGTTCCGCGACGTCAACACTCAGAGCAGTGGTTCGTTATCTTGGAGGAAAAATTCAATGCAATCCTACATTGAACCACTTGATGAAACGCTAATGTAGCAAAACCTTAACAAACATTAGGGACAGAGGTATATCAAAGTGTTACCCGAAAGGATCGAAAAACATATGCAAAGTGTAAATATACTGTAGCTGTAAGATGATCCCCCATCGTATAGAGGAAAATTAAAGCGGATTCTTCTATCACATATACATACATATATACCTTGAGAAAACACTCACAAAACATAAAACTGTCACGTCGTGCGAGATTTATGCAAATTAAATAGACAAAACAACTAAGCTGTACGATCACAACAGATGAAAGCGATGGTGAGTGGGTTATGATCGATCATTCAGTCCAACAAACACTTAAAAACACACACATTCACACAAGAGCAACCCAAAGTTGAGCAAAGAGTTGTGTTTCCTGTTTTTATTTGCGCACAGCGATGCGTAAGAAGAACAACACGATACTGAACAGAAACTGAAAAATGATATTTTAAATAAAGCAGAAATACGAAAAGATTAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAAANAACCTCGGGAGT]

[+] EMBL BX625265             [AAACGCATCGGAATTTATACAGTAAAAAAACACAAACTCCCTCCTCCTCCTCTTCATAGTACACAAACGCTCCCTGACACACACTGAAGTTTGATAAGGATAAGTGAATTTAAATCACAAATATTTGTTGGCATGTGAACACACAAAAAATGCTGTTGAAGAAAAAGATGCATTTTAATTTGATGCTTCATACTCTACAATTCCAGCAAAGATACGAAAATTATAGAATTAATTTTCTTTAGAACATTCTCACCCAAAGTTTAACAAGTGCGCATTTGTTAACAGAAAGTTTTGTAACCAATAATCGTGTTAAACATTTCAAAGAGTTTATGTTTTAAAACAGTGGATTTGAAAAAAAAAACGAACATATGTTACGAAAAGCCTTTTCGATGGAGAGCTTTCTCTCGTCGAACCATAGCGCCATCTAGGGTGAGATTTTTTTGTCGTTGATTTGATTCTTTGCTTTTTGATTTTTTATTTCGTGTTTTCTTTTTCAAACGATTCAACCGTTTAGCTAAATTCTATTTAACTGGAGTACGTATATATTTTTTGCGTATAGCTTTTATTTAAACAATATTTTCAAATTCATTTCATCATGCGCAACATCATTACTTTGAAGTAATACCGAATATTCACATTAAAACACACCAAATCTTACATCCACGCAGGCAGTTTAATAATCGCTCCGCTATTATCGTCGCACTTCAAAATTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BM630262             [                                                                                                                                                                                                             ccgAAGATACGAAAATTATAGAATTAATTTTCTTTAGAACATTCTCACCCAAAGTTTAACAAGTGCGCATTTGTTAACAGAAAGTTTTGGAACCAATAATCGTGTTAAACATTTCAAAGAGTTTATGTTTTAAAACAGTGGATTTG AAAAAAAAACGAACATATGTTACGAAAAGCCTTTTCGATGGAGAGCTTTCTCTCGTCGAACCATAGCGCCATCTAGGGTGAGATTTTTTTGTCGTTGATTTGATTCTTTGCTTTTTGATTTTTTATTTCGTGTTTTCTTTTTCAAACGATTCAACCGTTTAGCTAAATTCTATTTAACTGGAGTACGTATATATTTTTTGCGTATAGCTTTTATTTAAACAATATTTTCAAATTCATTTCATCATGCGCAACATCATTACTTTGAAGTAATACCGAATATTCACATTAAAACACACCAAATCTTACATCCACGCAGGCAGTTTAATAATCGCTCCGCTATTATCGTCGCACTTCAAAATTCATTCATTTTGTGTGTGTTCATAGCTGTTTCAAAATGATCTCGATCGCACAAAAATGCTAATTCCCTGTTCGGTAAAACGAAAGATACAGCTTATCCACCAATAAGTACACGTGACGATGGGTTTTGGTGAATTGGAACAGTGACATTTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
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[+] EMBL BX608841             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTTAAAAACTCAACTCTAGATAGATAGGAAAGCTTATGCCCGCCATACGATGCGAACACAAGAAGCCCAAATCGTTCGATTGAAAACGTGATGAGTACGTGAGAAGGCAGAACACGACAGAGATCGGATAGAACCGGGAATTATAGCAATGTAAAAACTAGACGTATAAGTGTAAACATTTAAATATAATTATTTTAAATTCTAGTGAATCGGGAACGACACCAGTTCCGCGACGTCAACACTCAGAGCAGTGGTTCGTTATCTTGGAGGAAAAATTCAATGCAATCCTACATTGAACCACTTGATGAAACGCTAATGTAGCAAAACCTTAACAAACATTAGGGACAGAGGTATATCAAAGTGTTACCCGAAAGGATCGAAAAACATATGCAAAGTGTAAATATACTGTAGCTGTAAGATGATCCCCCATCGTATAGAGGAAAATTAAAGCGGATTCTTCTATCACATATACATACATATATACCTTGAGAAAACACTCACAAAACATAAAACTGTCACGTCGTGCGAGATTTATGCAAATTAAATAGACAAAACAACTAAGCTGTACGATCACAACAGATGAAAGCGATGGTGAGTGGGTTATGATCGATCATTCAGTCCA                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BX613352             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAGAAGCCCAAATCGTTCGATTGAAAACGTGATGAGTACGTGAGAAGGCAGAACACGACAGAGATCGGATAGAACCGGGAATTATAGCAATGTAAAAACTAGACGTATAAGTGTAAACATTTAAATATAATTATTTTAAATTCTAGTGAATCGGGAACGACACCAGTTCCGCGACGTCAACACTCAGAGCAGTGGTTCGTTATCTTGGAGGAAAAATTCAATGCAATCCTACATTGAACCACTTGATGAAACGCTAATGTAGCAAAACCTTAACAAACATTAGGGACAGAGGTATATCAAAGTGTTACCCGAAAGGATCGAAAAACATATGCAAAGTGTAAATATACTGTAGCTGTAAGATGATCCCCCATCGTATAGAGGAAAATTAAAGCGGATTCTTCTATCACATATACATACATATATACCTTGAGAAAACACTCACAAAACATAAAACTGTCACGTCGTGCGAGATTTATGCAAATTAAATAGACAAAACAACTAAGCTGTACGATCACAACAGATGAAAGCGATGGTGAGTGGGTTATGATCGATCATTCAGTCCAACAAACACTTAAAAACACACACATTCACACAAGAGCAACCCAAAGTTGAGCAAAGAGTTG                                                                                                                                               ]
[-] EMBL AL694839             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGAACGACACCAGTTCCGCGACGTCAACACTCAGAGCAGTGGTTCGTTATCTTGGAGGAAAAATTCAATGCAATCCTACATTGAACCACTTGATGAAACGCTAATGTAGCAAAACCTTAACAAACATTAGGGACAGAGGTATATCAAAGTGTTACCCGAAAGGATCGAAAAACATATGCAAAGTGTAAATATACTGTAGCTGTAAGATGATCCCCCATCGTATAGAGGAAAATTAAAGCGGATTCTTCTATCACATATACATACATATATACCTTGAGAAAACACTCACAAAACATAAAACTGTCACGTCGTGCGAGATTTATGCAAATTAAATAGAC AAACAA TAAGCTGTACGATCACAACAGATGAAAGCGATGGTGAGTGGGTTATGATCGATCATTCAGTCCAACAAACACTT  AAACA ACACATTCACACAAGAGCAACCCAAAGTTGAGCAAAGAGTTGTGTTTCCTGTTTTTATTTGCGCACAGCGATGCGTAAGAAGAACAACACGATACTGAACAGAAACTGAAAAATGATATTTTAAATAAAGCAGAAATACGAAAAGATTAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAAANAACCTCGGGAGT]


>consensus_6829#0 AAACGCATCGGAATTTATACAGTAAAAAAACACAAACTCCCTCCTCCTCCTCTTCATAGT ACACAAACGCTCCCTGACACACACTGAAGTTTGATAAGGATAAGTGAATTTAAATCACAA ATATTTGTTGGCATGTGAACACACAAAAAATGCTGTTGAAGAAAAAGATGCATTTTAATT TGATGCTTCATACTCTACAATTCCAGCAAAGATACGAAAATTATAGAATTAATTTTCTTT AGAACATTCTCACCCAAAGTTTAACAAGTGCGCATTTGTTAACAGAAAGTTTTGTAACCA ATAATCGTGTTAAACATTTCAAAGAGTTTATGTTTTAAAACAGTGGATTTGAAAAAAAAA ACGAACATATGTTACGAAAAGCCTTTTCGATGGAGAGCTTTCTCTCGTCGAACCATAGCG CCATCTAGGGTGAGATTTTTTTGTCGTTGATTTGATTCTTTGCTTTTTGATTTTTTATTT CGTGTTTTCTTTTTCAAACGATTCAACCGTTTAGCTAAATTCTATTTAACTGGAGTACGT ATATATTTTTTGCGTATAGCTTTTATTTAAACAATATTTTCAAATTCATTTCATCATGCG CAACATCATTACTTTGAAGTAATACCGAATATTCACATTAAAACACACCAAATCTTACAT CCACGCAGGCAGTTTAATAATCGCTCCGCTATTATCGTCGCACTTCAAAATTCATTCATT TTGTGTGTGTTCATAGCTGTTTCAAAATGATCTCGATCGCACAAAAATGCTAATTCCCTG TTCGGTAAAACGAAAGATACAGCTTATCCACCAATAAGTACACGTGACGATGGGTTTTGG TGAATTGGAACAGTGACATTTCGCTGCCACCAGATCATGCTGTTTTTTGTATGAATAGAT ACGAACACTAATTTTAAAAACTCAACTCTAGATAGATAGGAAAGCTTATGCCCGCCATAC GATGCGAACACAAGAAGCCCAAATCGTTCGATTGAAAACGTGATGAGTACGTGAGAAGGC AGAACACGACAGAGATCGGATAGAACCGGGAATTATAGCAATGTAAAAACTAGACGTATA AGTGTAAACATTTAAATATAATTATTTTAAATTCTAGTGAATCGGGAACGACACCAGTTC CGCGACGTCAACACTCAGAGCAGTGGTTCGTTATCTTGGAGGAAAAATTCAATGCAATCC TACATTGAACCACTTGATGAAACGCTAATGTAGCAAAACCTTAACAAACATTAGGGACAG AGGTATATCAAAGTGTTACCCGAAAGGATCGAAAAACATATGCAAAGTGTAAATATACTG TAGCTGTAAGATGATCCCCCATCGTATAGAGGAAAATTAAAGCGGATTCTTCTATCACAT ATACATACATATATACCTTGAGAAAACACTCACAAAACATAAAACTGTCACGTCGTGCGA GATTTATGCAAATTAAATAGACAAAACAACTAAGCTGTACGATCACAACAGATGAAAGCG ATGGTGAGTGGGTTATGATCGATCATTCAGTCCAACAAACACTTAAAAACACACACATTC ACACAAGAGCAACCCAAAGTTGAGCAAAGAGTTGTGTTTCCTGTTTTTATTTGCGCACAG CGATGCGTAAGAAGAACAACACGATACTGAACAGAAACTGAAAAATGATATTTTAAATAA AGCAGAAATACGAAAAGATTAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAAANAACCTCGGGAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)