Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 6866 cluster # 6866       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6866#0 length = 1208 sequences # 6  

consensusID : consensus_6866#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1208
fasta sequence
                              [CCGTACAGAGCTGTTTGTGTGTGTGTGTAAGTTGTCAAGCAAATGCTTGCAGGAGGATAAAATTGGAGAAAAAAACATAAATTATCATAAAAAAATGCAAACTACG---TACAGAGCAAAACAAAACCCCGTTTAAATGTAAGCCCACTTTGCGTGC-G--ATAGTACAGTAAGATACCACAACACGTTAAACGCATAATCTAGGAAGAAAACGATGAATCACCTTGAATCAATGGGAAATGAATGGTGAAGTATTTAAAAGCATGATGCTAACGATCGTGTGCATATTTATCGAAACAATAAATAACACTATTTATGGAACAAAAAATAACGCTCGAAAGTCGCGAACACGCACATACGGGAGGTAGCGTTTAATAGGTGAAGGTAGCGAAGGAGCTCTTACCACCAGCAAAGCATATTTACTCCGACAACGGTTACTGATCGAGTGGCATAACAAAAATGAATTTTCTTGTAGAAGTCATGTAAGGTCTCGCTAGGAGTTTAACGCTCCGCGGTTAGATCATTTTCATTTAAACATGCTTTTGGAATCAATAACATTTTGATTTAAAGTTTGTGAGGGGAAAGAAAAACTCATAATCATCACTTTGGCAAGCATTAATCTTTATTAATGGTTAGGAAAAACGTTTGAATCGATGCAGCAAGTGTTGAGTAAACGTGTGTTAAGACACAGTAAACGGTTTAAGCACAACCTAATAAAACTCATCATCTTAAGCCCTAAATCGATGCTCTGGAACCATAAAACCAATTGGAGTTTATGCTCCGGTAAAAAAGAGGAAATATAAGACACCCCTAAGACACATAACTCTAGTTCGTGTTACGCTTAAATGTTTAAATGCGAAATCAACAATACGGATGGCGTAAAAATGATAAAAAACAGCGCATTGAACCGCATGAAAACATGGAAAAGTGAATGAAGAAACATTTGATAAGGACATTAGAGGAAGGAAGTGCGAAAGCCGGAAAAAATATTCAAATCATTCAAAAGCAAACAAGAAGGATAGGAAAAGCAAAGCAAAGGGGAAGGAATAAAGCAGGAAAAGGAGAAACATAGAACACATTTAAAAGAGAAAGAAACATAAGTGGACGATTAAGCACAGAACGCATCTCGAAGCAGCAGCAACAAGAGCCACACAAAAACAAATACACATATTCATACAAACGTGTTTAAATGGGAAAACAAAATGATAACATGT]

[+] EMBL BM642383             [CCGTACAGAGCTGTTTGTGTGTGTGTGTAAGTTGTCAAGCAAATGCTTGCAGGAGGATAAAATTGGAG AAAAAACATAAATTATCATAAAAAAATGCAAACTACG   TACAGAGCAAAACAAAACCCCGTTTAAATGTAAGCCCACTTTGCGTGC G  ATAGTACAGTAAGATACCACAACACGTTAAACGCATAATCTAGGAAGAAAACGATGAATCACCTTGAATCAATGGGAAATGAATGGTGAAGTATTTAAAAGCATGATGCTAACGATCGTGTGCATATTTATCGAAACAATAAATAACACTATTTATGGAACAAAAAATAACGCTCGAAAGTCGCGAACACGCACATACGGGAGGTAGCGTTTAATAGGTGAAGGTAGCGAAGGAGCTCTTACCACCAGCAAAGCATATTTACTCCGACAACGGTTACTGATCGAGTGGCATAACAAAAATGAATTTTCTTGTAGAAGTCATGTAAGGTCTCGCTAGGAGTTTAACGCTCCGCGGTTAGATCATTTTCATTTAAACATGCTTTTGGAATCAATAACATTTTGATTTAAAGTTTGTGAGGGGAAAGAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BX610804             [                     TGTGTGTAAGTTGTCAAGCAAATGCTTGCAGGAGGATAAAATTGGAGAAAAAAACATAAATTATCATAAAAAAATGCAAACTACG   TACAGAGCAAAACAAAACCCCGTTTAAATGTAAGCCCACTTTGCGTGC G  ATAGTACAGTAAGATACCACAACACGTTAAACGCATAATCTAGGAAGAAAACGATGAATCACCTTGAATCAATGGGAAATGAATGGTGAAGTATTTAAAAGCATGATGCTAACGATCGTGTGCATATTTATCGAAACAATAAATAACACTATTTATGGAACAAAAAATAACGCTCGAAAGTCGCGAACACGCACATACGGGAGGTAGCGTTTAATAGGTGAAGGTAGCGAAGGAGCTCTTACCACCAGCAAAGCATATTTACTCCGACAACGGTTACTGATCGAGTGGCATAACAAAAATGAATTTTCTTGTAGAAGTCATGTAAGGTCTCGCTAGGAGTTTAACGCTCCGCGGTTAGATCATTTTCATTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BX610803             [                            AAGTTGTCAAGCAAATGCTTGCAGGAGGATAAAATTGGAGAAAAAAACATAAATTATCATAAAAAAATGCAAACTACG   TACAGAGCAAAACAAAACCCCGTTTAAATGTAAGCCCACTTTGCGTGC G  ATAGTACAGTAAGATACCACAACACGTTAAACGCATAATCTAGGAAGAAAACGATGAATCACCTTGAATCAATGGGAAATGAATGGTGAAGTATTTAAAAGCATGATGCTAACGATCGTGTGCATATTTATCGAAACAATAAATAACACTATTTATGGAACAAAAAATAACGCTCGAAAGTCGCGAACACGCACATACGGGAGGTAGCGTTTAATAGGTGAAGGTAGCGAAGGAGCTCTTACCACCAGCAAAGCATATTTACTCCGACAACGGTTACTGATCGAGTGGCATAACAAAAATGAATTTTCTTGTAGAAGTCATGTAAGGTCTCGCTAGGAGTTTAACGCTCCGCGGTTAGATCATTTTCATTTAAACATGCTTTTGGAATCAATAACATTTTGATTTAAAGTTTGTGAGGGGAAAGAAAAACTCATAATCATCACTTTGGCAAGCATTAATCTTTATTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BX610805             [                               TTGTCAAGCAAATGCTTGCAGGAGGATAAAATTGGAGAAAAAAACATAAATTATCATAAAAAAATGCAAACTACG   TACAGAGCAAAACAAAACCCCGTTTAAATGTAAGCCCACTTTGCGTGC G  ATAGTACAGTAAGATACCACAACACGTTAAACGCATAATCTAGGAAGAAAACGATGAATCACCTTGAATCAATGGGAAATGAATGGTGAAGTATTTAAAAGCATGATGCTAACGATCGTGTGCATATTTATCGAAACAATAAATAACACTATTTATGGAACAAAAAATAACGCTCGAAAGTCGCGAACACGCACATACGGGAGGTAGCGTTTAATAGGTGAAGGTAGCGAAGGAGCTCTTACCACCAGCAAAGCATATTTACTCCGACAACGGTTACTGATCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BM582223             [                                                                                            ccgTGCAAACTACGTACTACAAAGCAAAACAAAACCCCGTTTAAATGTAAGCCCACATTGCGTGCAGTAAGAGTACAGTAAGATACCACAACACGTTAAACGCATAATCTAGGAAGAAAACGATGAATCAGCTTGAATCAATGGGAAATGAATGGTGAAGTATTTAAAAGCATGATGCTAACGATCGTGTGCATATTTATCGAAACAATAAATAACACTATTTATGGAACAAAAAATAACGCTCGAAAGTCGCGAACACGCCCATACGGGAGGTAGCGTTTAATAGGTGAAGGTAGCGAAGGAGCTCTTACTACCAGCAAAGCATATTTACTCCGACAACGG  GCTGATCGTGTGGCATAACAAAAATTAATCTTCTTTTCGAAGTCATGTAAGGTCTCGCTAGGAGTTAAACGCTCCGTGGTTAGATCATTTTCATTTAACCATGCTTTTCGAAACAATAACATTGTGATTTAAAGTTTGTGAGGGGAAAGAAAAACTCATAATCATCACTTTGGCAAGCATTAATCTTTATTAATGGTTAGGAAAAACGTTTGAATCGATGCAGCAAGTGTTGAGTAAACGTGTGTTAAGACACAGTAAACGGTTTAAGCACAACCTAATAAAACTCATCATCTTAAGCCCTAAATCGATGCTCTGGAACCATAAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BX612846             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGGTAGCGAAGGAGCTCTTACCACCAGCAAAGCATATTTACTCCGACAACGGTTACTGATCGAGTGGCATAACAAAAATGAATTTTCTTGTAGAAGTCATGTAAGGTCTCGCTAGGAGTTTAACGCTCCGCGGTTAGATCATTTTCATTTAAACATGCTTTTGGAATCAATAACATTTTGATTTAAAGTTTGTGAGGGGAAAGAAAAACTCATAATCATCACTTTGGCAAGCATTAATCTTTATTAATGGTTAGGAAAAACGTTTGAATCGATGCAGCAAGTGTTGAGTAAACATGTGTTAAAACAAAGTCAACGGTTTAAGCACAACCTAATAAAACTCATCGTCTTAAGCCCTAAATCGATGCTCTGGAACCGTAAAACCAATTGGAGTTTATGCTCCGGTAAAAAAGAGGAAATATAAGACACCCCTAAGACACATAACTCTAGTTCGTGTTACGCTTAAATGTTTAAATGCGAAATCAACAATACGGATGGCGTAAAAATGATAAAAAACAGCGCATTGAACCGCATGAAAACATGGAAAAGTGAATGAAGAAACATTTGATAAGGACATTAGAGGAAGGAAGTGCGAAAGCCGGAAAAAATATTCAAATCATTCAAAAGCAAACAAGAAGGATAGGAAAAGCAAAGCAAAGGGGAAGGAATAAAGCAGGAAAAGGAGAAACATAGAACACATTTAAAAGAGAAAGAAACATAAGTGGACGATTAAGCACAGAACGCATCTCGAAGCAGCAGCAACAAGAGCCACACAAAAACAAATACACATATTCATACAAACGTGTTTAAATGGGAAAACAAAATGATAACATGT]


>consensus_6866#0 CCGTACAGAGCTGTTTGTGTGTGTGTGTAAGTTGTCAAGCAAATGCTTGCAGGAGGATAA AATTGGAGAAAAAAACATAAATTATCATAAAAAAATGCAAACTACGTACAGAGCAAAACA AAACCCCGTTTAAATGTAAGCCCACTTTGCGTGCGATAGTACAGTAAGATACCACAACAC GTTAAACGCATAATCTAGGAAGAAAACGATGAATCACCTTGAATCAATGGGAAATGAATG GTGAAGTATTTAAAAGCATGATGCTAACGATCGTGTGCATATTTATCGAAACAATAAATA ACACTATTTATGGAACAAAAAATAACGCTCGAAAGTCGCGAACACGCACATACGGGAGGT AGCGTTTAATAGGTGAAGGTAGCGAAGGAGCTCTTACCACCAGCAAAGCATATTTACTCC GACAACGGTTACTGATCGAGTGGCATAACAAAAATGAATTTTCTTGTAGAAGTCATGTAA GGTCTCGCTAGGAGTTTAACGCTCCGCGGTTAGATCATTTTCATTTAAACATGCTTTTGG AATCAATAACATTTTGATTTAAAGTTTGTGAGGGGAAAGAAAAACTCATAATCATCACTT TGGCAAGCATTAATCTTTATTAATGGTTAGGAAAAACGTTTGAATCGATGCAGCAAGTGT TGAGTAAACGTGTGTTAAGACACAGTAAACGGTTTAAGCACAACCTAATAAAACTCATCA TCTTAAGCCCTAAATCGATGCTCTGGAACCATAAAACCAATTGGAGTTTATGCTCCGGTA AAAAAGAGGAAATATAAGACACCCCTAAGACACATAACTCTAGTTCGTGTTACGCTTAAA TGTTTAAATGCGAAATCAACAATACGGATGGCGTAAAAATGATAAAAAACAGCGCATTGA ACCGCATGAAAACATGGAAAAGTGAATGAAGAAACATTTGATAAGGACATTAGAGGAAGG AAGTGCGAAAGCCGGAAAAAATATTCAAATCATTCAAAAGCAAACAAGAAGGATAGGAAA AGCAAAGCAAAGGGGAAGGAATAAAGCAGGAAAAGGAGAAACATAGAACACATTTAAAAG AGAAAGAAACATAAGTGGACGATTAAGCACAGAACGCATCTCGAAGCAGCAGCAACAAGA GCCACACAAAAACAAATACACATATTCATACAAACGTGTTTAAATGGGAAAACAAAATGA TAACATGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)