These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7199#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1048 fasta sequence [ATTGTTTAAAATTAAAA-TATGTGCCCAACCTACAGGGCCGCTCTCAGTGGCGTCGGTATTGCTTCTTGAACTTGTCGAAATGATAATCATCGGTCGCTTTCTTCGGCACACGGTCATCGTGCCGCTGGTCGCGATGATCCTCCTGATAGCGGCGCTTGGCCGGCGCAGGATTATCGATCCGATAGCGATTGTGCTGCATAAAGTTGACTGCCATGTTCGAGGGCACAAAGTGCGACGGGAGATCCTTCTTGCGCTGCTGCTCCTGCATGTACTTGAGCTTGGCGTCTTCGGTCGCTTCGATGTTTTTAATTTTCGCCTCAATGCCCAGATCGATCTCCGGGATGCCGCTCAGCATCTGGTTGGACAGCATCTCTTCCGAGCGCTGGGAGGACGTTTGGCTAAGGTGGGCGGGGAGCGAGAGTAGTGCTGCCTCCT-CCGGG-CTGAGGTACTTGCCGGACGATTCGCCCTCCGTCTGGTTGTCCTGCTCCTGCGCGATGCCTTTCCGTTTGCCCAGCTCCTCTTCAATGTATTTCATCATTTCTTCGTCTTCGTCCCGTTTGTTTGTTTCGGCGGAGAATTGTGTCCCTATGCCCGTGTCGTACGGGTCTTCGACTGCGGCCTTCAATTTTCCCGCCTTCAGTGCCTGCATGTTGACCATCCCGCCAGTTTTTATATTAAATGGATCTTTAACTGTAATCTCCTCCTCAATGGTTATTTTTTTTACCCGCAGCCAGGCTTAGGATGTTAACACCGTTCCGTCTATTGCGCAGCTTTTGTCGCTCCTTGGTTTCCTCTAGCTTTGCTAATATATCAGCTTCTGTTTCTTGCTCCTGCTCATCGTCCTCACTGTTGGAAGGTTTCCTTTGCCGAAGCTGTTTCTTGCCCTTCTTTTTAAACTCCACCTTCACTTGGGGCTCTTCACTTTCAGACATTTTGTTCGGAAATGTTACAAATACTTTAAAGAAATAGATATTTTCCTGACTTTTGTGAGAAATCGGGAGAAAATCACAATGTAAACAACAGCACTGCGAGCCGGACGCGTGGGCGG] [+] EMBL CNS09BVD [ATTGTTTAAAATTAAAA TATGTGCCCAACCTACAGGGCCGCTCTCAGTGGCGTCGGTATTGCTTCTTGAACTTGTCGAAATGATAATCATCGGTCGCTTTCTTCGGCACACGGTCATCGTGCCGCTGGTCGCGATGATCCTCCTGATAGCGGCGCTTGGCCGGCGCAGGATTATCGATCCGATAGCGATTGTGCTGCATAAAGTTGACTGCCATGTTCGAGGGCACAAAGTGCGACGGGAGATCCTTCTTGCGCTGCTGCTCCTGCATGTACTTGAGCTTGGCGTCTTCGGTCGCTTCGATGTTTTTAATTTTCGCCTCAATGCCCAGATCGATCTCCGGGATGCCGCTCAGCATCTGGTTGGACAGCATCTCTTCCGAGCGCTGGGAGGACGTTTGGCTAAGGTGGGCGGGGAGCGAGAGTAGTGCTGCCTCCT CCGGG CTGAGGTACTTGCCGGACGATTCGCCCTCCGTCTGGTTGTCCTGCTCCTGCGCGATGCCTTTCCGTTTGCCCAGCTCCTCTTCAATGTATTTCATCATTTCTTCGTCTTCGTCCCGTTTGTTTGTTTCGGCGGAGAATTGTGTCCCTATGCCCGTGTCGTACGGGTCTTCGACTGCGGCCTTCAATTTTCCCGCCTTCAGTGCCTGCATGTTGACCATCCCGCCAGTTTTTATATTAAATGGATCTTTAACTGTAATC ] [+] EMBL CNS09BVV [ atAAATTAAAAGTATGTGCCCAACCTACAGGGCCGCTCTCAGTGGCGTCGGTATTGCTTCTTGAACTTGTCGAAATGATAATCATCGGTCGCTTTCTTCGGCACACGGTCATCGTGCCGCTGGTCGCGATGATCCTCCTGATAGCGGCGCTTGGCCGGCGCAGGATTATCGATCCGATAGCGATTGTGCTGCATAAAGTTGACTGCCATGTTCGAGGGCACAAAGTGCGACGGGAGATCCTTCTTGCGCTGCTGCTCCTGCATGTACTTGAGCTTGGCGTCTTCGGTCGCTTCGATGTTTTTAATTTTCGCCTCAATGCCCAGATCGATCTCCGGGATGCCGCTCAGCATCTGGTTGGACAGCATCTCTTCCGAGCGCTGGGAGGACGTTTGGCTAAGGTGGGCGGGGAGCGAGAGTAGTGCTGCCTCCT CCGGG CTGAGGTACTTGCCGGACGATTCGCCCTCCGTCTGGTTGTCCTGCTCCTGCGCGATGCCTTTCCGTTTGCCCAGCTCCTCTTCAATGTATTTCATCATTTCTTCGTCTTCGTCCCGTTTGTTTGTTTCGGCGGAGAATTGTGTCCCTATGCCCGTGTCGTACGGGTCTTCGACTGCGGCCTTCAATTTTCCCGCCTTCAGTGCCTGCATGTTGACCATCCCGCCAGTGTTTATATTAAATGGATCTTTAACTGTAATCTCCTCCTCAATGGTTATTTTTTTTACCCGCAGCCAGGCTTAGGATGTTAACACCGTTCCGTCTATTGCGCAGTTTTTGTCGCTCCTTGGTTTCCTCTAGCTTTGCTAATATATCAGCTTCTGTTTCTTGCTCCTGCTCATCGTCCTCACTGTTGGAAGGTTTCCTTTGCCGAAGCTGTTTCTTGCCCTTCTTTT ] [-] EMBL BX625885 [ 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CTGAGGTACTTGCCGGACGATTCGCCCTCCGTCTGGTTGTCCTGCTCCTGCGCGATGCCTTTCCGTTTGCCCAGCTCCTCTTCAATGTATTTCATCATTTCTTCGTCTTCGTCCCGTTTGTTTGTTTCGGCGGAGAATTGTG CCCTATGCCCGTGTCGTACGGG CTTCGACTGCGGCCTTCAATTTTCCCGCCTTCAGTGCCTGCATGTTGACCATCCCGCCAGTTTTTATATTAAATGGATCTTTAACTGTAATCTCCTCCTCAATGGTTATTTTTTTTACCCGCAGCCAGGCTTAGGATGTTAACACCGTTCCGTCTATTGCGCAGCTTTTGTCGCTCCTTGGTTTCCTCTAGCTTTGCTAATATATCAGCTTCTGTTTCTTGCTCCTGCTCATCGTCCTCACTGTTGGAAGGTTTCCTTTGCCGAAGCTGTTTCTTGCCCTTCTTTTTAAACTCCACCTTCACTTGGGGCTCTTCACTTTCAGACATTTTGTTCGGAAATGTCACAAATACTTTAAAGAAATAGATATTTTCCTGACTTTTGTGAGAAATCGGGAGAAAATCACAATGTAAACAAC ] [-] EMBL CNS09BVC [ TTTTAATTTTCGCCTCAATGCCCAGATCGATCTCCGGGATGCCGCTCAGCATCTGGTTGGACAGCATCTCTTCCGAGCGCTGGGAGGACGTTTGGCTAAGGTGGGCGGGGAGCGAGAGTAGTGCTGCCTCCT CCGGG CTGAGGTACTTGCCGGACGATTCGCCCTCCGTCTGGTTGTCCTGCTCCTGCGCGATGCCTTTCCGTTTGCCCAGCTCCTCTTCAATGTATTTCATCATTTCTTCGTCTTCGTCCCGTTTGTTTGTTTCGGCGGAGAATTGTGTCCCTATGCCCGTGTCGTAC 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TTTTTTTACCCGCAGCCAGGCTTAGGATGTTAACACCGTTCCGTCTATTGCGCAGCTTTTGTCGCTCCTTGGTTTCCTCTAGCTTTGCTAATACATCAGCTTCTGTTTCTTGCTCCTGCTCATCGTCCTCACTGTTGGAAGGTTTCCTTTGCCGAAGCTGTTTCTTCCCCTTCTTTTTAAACTCCACCTTCACTTGCGGCTCTTCACTTTCAGACATTTTGTTCGGAAATGTTACAAATACTTTAAAGAAATAGATATTTTCCTGACTTTTGGGAGAAATCGGGAGAAAATCACAATGTAAACAACAGCACTGCGAGCCGGACGCGTGGGCGG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||