These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7416#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1208 fasta sequence [CCGGACAAACTAGAGCGAATGGAATTGATTAAAGATGAAGACGTTCTGTTTGAATGGCATAGTCCACTATACATGAACTTTACACATGTAGGTATTATGTTTAAGATGGAAGAAATTTTCCGAGAAAAAGTAAATGGAAGACTAGAGGGTCACATTTATGGCGACATTTACGTACACGAATGTCCCGATGAGTTGAACTTAGTGCTAGAACCATTAGCAGCGAATGAAGTGATCATGAAACCGCTGTGCATCGACGACGTAAAGGATATACACGATTTATATCCGGCAGGTGATATCGAAAGTTTAGAGTTATTTGAAAAGCTAGTCATCCAGCTTCCAGGCTTCGGTGTATTTAATCAATCGGATAATGAACTAGCTGCATGGAGTTTGCAGTC--ATTATGGTGGAATGTTCTCCATGCAAACAAAACCAAAATTTAGAAGAAAAGGATACGGTATTCAGCTAGCACAATCTCTGACTAAGTTGGTAATTCGTCGCGGATATATACCGTTTGTTGTCATAAGGCCAGAAAACGACGCTTCTCGTGGACTTTATACGAAGCTAGGTTTCAGAAAAGCTTTTGAAAGTGTTCGTGGCACATTTGTGCCTTTAGTTGGCGAAAATCATTTGCAGAATAATTTGACGGCCTACAAACAGCGTCAAATTTCAAATGAAGAAAATTGCACAATAGAACCAGCTGAGCTAACTAATGGTATTGCATCATACAAGGATAATGATAATTGCTGAATTTCATGGACCGTAATACATCTCTTAAAAGACCTGTATAGGATTGACATAACCTACTTTGAATGCGTTTTAAAATGAATTATAATTCAAGCGGATTAATATTTAACATAATAGCAAAATCAAGCTGAAACTAACAACTCTAAACAACAAAGCCATCAGCAGCTAAAAAGCAACAACAGCAACAGCAGTTATAATATCCGCGATAACAGCAGCTACAGCGGAAGTAGTAGCCGCCTTAGCAGCGACAACAGCAGCCGACGCCGCCGCCGCAACAGCAGAAGCAGCAGTACCATGAACAAAATCAGATTCAGCAGCAGCAACAGCAACGTCAATAAAATGATTATATTAATGAGTTACTGCTGTTGATTTGCTGTCAGAAAGCCTACACCCTCTACAGCCTTTGCAGTCACAAATAATAGATAGATTTCTTAAATGAATTTCAAACTAATATATAATAACTTTG] [+] EMBL BM647877 [CCGGACAAACTAGAGCGAATGGAATTGATTAAAGATGAAGACGTTCTGTTTGAATGGCATAGTCCACTATACATGAACTTTACACATGTAGGTATTATGTTTAAGATGGAAGAAATTTTCCGAGAAAAAGTAAATGGAAGACTAGAGGGTCACATTTATGGCGACATTTACGTACACGAATGTCCCGATGAGTTGAACTTAGTGCTAGAACCATTAGCAGCGAATGAAGTGATCATGAAACCGCTGTGCATCGACGACGTAAAGGATATACACGATTTATATCCGGCAGGTGATATCGAAAGTTTAGAGTTATTTGAAAAGCTAGTCATCCAGCTTCCAGGCTTCGGTGTATTTAATCAATCGGATAATGAACTAGCTGCATGGAGTTTGCAGTCATATTATGGTGGAATGTTCTCCATGCAAACAAAACCAAAATTTAGAAGAAAAGGATACGGTATTCAGCTAGCACAATCTCTGACTAAGTTGGTAATTCGTCGCGGATATATACCGTTTGTTGTCATAAGGCCAGAAAACGACGCTTCTCGTGGACTTTATACGAAGCTAGGTTTCAGAAAAGCTTTTGAAAGTGTTCGTGGCACATTTGTGCCTTTAGTTGGCGAAAATCATTTGCAGAATAATTTG ] [+] EMBL BX614086 [ GACATTTACGTACACGAATGTCCCGATGAGTTGAACTTAGTGCTAGAACCATTAGCAGCGAATGAAGTGATCATGAAACCGCTGTGCATCGACGACGTAAAGGATATACACGATTTATATCCGGCAGGTGATATCGAAAGTTTAGAGTTATTTGAAAAGCTAGTCATCCAGCTTCCAGGCTTCGGTGTATTTAATCAATCGGATAATGAACTAGCTGCATGGAGTTTGCAGTC ATTATGGTGGAATGTTCTCCATGCAAACAAAACCAAAATTTAGAAGAAAAGGATACGGTATTCAGCTAGCACAATCTCTGACTAAGTTGATAATTCGTCGCGGATATATACCGTTTGTTGTCATAAGGCCAGAAAACGACGCTTCTCGTGGACTTTATACGAAGCTAGGTTTCAGAAAAGCTTTTGAAAGTGTTCGTGGCACATTTGTGCCTTTAGTTGGCGAAAATCATTTGCAGAATAATTTGACGGCCTAC ACAGCGTCAAATTTCAAATGAAGAAAATTGCACAATAGAACCAGCTGAGCTAACTAATG ] [+] EMBL BX614087 [ ACACGAATGTCCCGATGAGTTGAACTTAGTGCTAGAACCATTAGCAGCGAATGAAGTGATCATGAAACCGCTGTGCATCGACGACGTAAAGGATATACACGATTTATATCCGGCAGGTGATATCGAAAGTTTAGAGTTATTTGAAAAGCTAGTCATCCAGCTTCCAGGCTTCGGTGTATTTAATCAATCGGATAATGAACTAGCTGCATGGAGTTTGCAGTC ATTATGGTGGAATGTTCTCCATGCAAACAAAACCAAAATTTAGAAGAAAAGGATACGGTATTCAGCTAGCACAATCTCTGACTAAGTTGGTAATTCGTCGCGGATATATACCGTTTGTTGTCATAAGGCC ] [+] EMBL BX614085 [ AAGTGATCATGAAACCGCTGTGCATCGACGACGTAAAGGATATACACGATTTATATCCGGCAGGTGATATCGAAAGTTTAGAGTTATTTGAAAAGCTAGTCATCCAGCTTCCAGGCTTCGGTGTATTTAATCAATCGGATAATGAACTAGCTGCATGGAGTTTGCAGTC ATTATGGTGGAATGTTCTCCATGCAAACAAAACCAAAATTTAGAAGAAAAGGATACGGTATTCAGCTAGCACAATCTCTGACTAAGTTGGTAATTCGTCGCGGATATATACCGTTTGTTGTCATAAGGCCAGA ] [+] EMBL BX615517 [ CAGCTAGCACAATCTCTGACTAAGTTGGTAATTCGTCGCGGATATATACCGTTTGTTGTCATAAGGCCAGAAAACGACGCTTCTCGTGGACTTTATACGAAGCTAGGTTTCAGAAAAGCTTTTGAAAGTGTTCGTGGCACATTTGTGCCTTTAGTTGGCGAAAATCATTTGCAGAATAATTTGACGGCCTACAAACAGCGTCAAATTTCAAATGAAGAAAATTGCACAATAGAACCAGCTGAGCTAACTAATGGTATTGCATCATACAAGGATAATGATAATTGCTGAATTTCATGGACCGTAATACATCTCTTAAAAGACCTGTATAGGATTGACATAACCTACTTTGAATGCGTTTTAAAATGAATTATAATTCAAGCGGATTAATATTTAACATAATAGCAAAATCAAGCTGAAACTAACAACTCTAAACAACAAAGCCATCAGCAGCTAAAAAGCAACAACAGCAACAGCAGTTATAATATCCGCGATAACAGCAGCTACAGCGGAAGTAGTAGCCGCCTTAGCAGCGACAACAGCAGCCGACGCCGCCGCCGCAACAGCAGAAGCAGCAGTACCATGAACAAAATCAGATTCA ] [+] EMBL BM594029 [ ccgAAATCATTTGCAGAATAATTTGACGGCCTACAAACAGCGTCAAATTTCAAATGAAGAAAACTGCACAATAGAACCAGCTGAGCTAACTAATGGTATTGCATCATACAAGGATAATGATAATTGCTGAATTTCATGGACCGTATTACATCTCTTAAAAGACCTGTATAGGATTG ] [-] EMBL BX611620 [ GGTATTGCATCATACAAGGATAATGATAATTGCTGAATTTCATGGACCGTAATACATCTCTTAAAAGACCTGTATAGGATTGACATAACCTACTTTGAATGCGTTTTAAAATGAATTATAATTCAAGCGGATTAATATTTAACATAATAGCAAAATCAAGCTGAAACTAACAACTCTAAACAACAAAGCCATCAGC CTAAAAAGCAACAACAGCAACAGCAGTTATAATATCCGCGATAACAGCAGCTACAGCGGAATTAGTAGCCGCCTTAGCAGCGACAACAGCAGCCGACGCCGCCGCCGCAACAGCAGAAGCAGCAGTACCATGAACAAAATCAGATTCAGCAGCAGCAACAGCAACGTCAATAAAATGATTATATTAATGAGTTACTGCTGTTGATTTGCTGTCAGAAAGCCTACACCCTCTACAGCCTTTGCAGTCACAAATAATAGATAGATTTCTTAAATGAATTTCAAACTAATATATAATAACTTTG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||