These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7766#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1643 fasta sequence [CCGCCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCGGGTTCCGTGGTGTTTGCATGGTGTTTTGTTGTGCAGTCTTTATTATAGTTAATTTTGCCACCTTTTTTGCATCAAATTTCGTTTCACTATCATCCTAGTGCCTTCTGCTGCGATGTCGTCGACGGTGGAAAAGAATGAATACCCGAAAGCATCTAATGCTTTGGTGATTGGTGCGGTGTTGTCATACGTCGCGGCCGTATTTCTGTTGATGAGCTTTTGCTCCCCGTACTGGATCGTGTCGTATCCGGAATCTTTCAGCAGCTTCAAAAATATGGGCCTGTGGGAGTACTGTTTCCGTGATTTCACCTATCCGTACTACCAGTTTCCCAAACAGTTCAACGGGTGCCATCACATCTTCAGCGAGGAGTACTACGTCATCAGGGAATACCTGCTGCCGGGATGGTTGATGGTGGTGCAGGGATTCGTAACGATTTCCTTTCTGTTTACGTTCGGTTCGCTCATCATTATGGCCTGCGAGATTGTCAGGTGGCCGCTTAAGTTTGTACTGCGCTACGAATGGTTGCTAAGCAGCATTTCATTTGCCGGAATAGCATCTTCCTCATTCTTTATGTTCTTAGCCGTGGCCATTTTCGGTGGAAACGCTTACCGGCGCGATTGGTTGATGTACCCCAAGTTTAATGTCCTGT-CGTGGTCGTACGAACTGGCCGTAGTATCGTTTATGATTCTCGGGCTCGCTGCACTG-CTACTGTACAAGGAATCA-CGCAAG-TCAT-ACGAAATG-CGACGCGAGGCGAAGAATTT-GGT-CATGCAGATG-CAGATGCACGAACCGGGATACCATCCATCGCACCACACTAGCCGAAGTCTGCACAGTGGTGGCTATATCTAAGTGAGCTAGGGAAAGGTTCCTGCCGCTCGAACGCTACCCATCCCATTCATATCCAATATGTATGCTACCTCTCTGGTAACCGCACAGCAAAAGGGACTATACCCTTCACCGTCATATCAACGTTCGTACAGTGTATGTCTTTAAATGTGGAAGCGTACGCAGAGCAGAACGTGACACTTCCGTATGCACACATGTATTTTACCAATCGTATTGAACGTAGTAATCTCACCTCCCTTAACAAGTGCCCGAATAATTGGAATACTTCAAAGCATCATCGAACACGCGTGGCCTTATAATGATTGTCTTTTTTCGTAGCATAACTGAAAGGCGCTGCCATGGAACAAGTGCCTGGAGCAATGCAACGCGGAAGCAAAAAATGCGCACCCTCTTATAGCTGTAATCGTAACTATTTGTATGCTTTTATGCGTAGCTATTCGGTACATCCGTCCGTCCGCAGATCTATCTGTTCGTAGCGTTTAGGAATTTTGAATTACTCTTAACTCGTTTATTAACATTTTCCGTCCCAAATCATAAAGACTCGTAAGTAAGATGTGTTTATCACACGAGATGGGCACAACTCTAAGCGAATATGCCCTTGTATTTGTTATATTTTAACAAACACATCTTTGGTCCAGCGAAAGCAAACATTCTTAAGTATACATACTTTTTGACGTCCATATTTAATTGNATAATTCTGTAATTCTTTAAGATTAGCAAGACAAAAACAATTCGCCCACATTCCATCCTCAGTTGGCAGCGTATGAACATTTCT] 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ccgTGCATGGTGTTTTGTTGTGCAGTCTTTATTATAGTTAATTTTGCCACCTTTTTTGCATCAAATTTCGATTCACTATCATCCTAGTGCCTTCTGCTGCGATGTCGTCGACGGTGGAAAAGAATGAATACCCGAAAGCATCTAATGCTTTGGTGATTGGTGCGGTGTTGTCATACGTCGCGGCCGTATTTCTGTTGATGAGCTTTTGCTCCCCGTACTGGATCGTGTCGTATCCGGAATCTTTCAGCAGCTTCAAAAATATGGGCCTGTGGGAGTACTGTTTCCGTGATTTCACCTATCCGTACTACCAGTTTCCCAAACAGTTCAACGGGTGCCATCACATCTTCAGCGAGGAGTACTACGTCATCAGGGAATACCTGCTGCCGGGATGGTTGATGGTGGTGCAGGGATTCGTAACGATTTCCTTTCTGTTTACGTTCGGTTCGCTCATCATTATGGCCTGCGAGATTGTCAGGTGGCCGCTTAAGTTTGTACTGCGCTACGAATGGTTGCTAAGCAGCATTTCATTTGCCGGAATAGCATCTTCCTCATTCTTTATGTTCTTAGCCGTGGCCATTTTCGGTGGAAA ] [+] EMBL BX625614 [ TACGAATGGTTGCTAAGCAGCATTTCATTTGCCGGAATAGCATCTTCCTCATTCTTTATGTTCTTAGCCGTGGCCATTTTCGGTGGAAACGCTTACAGGCGCGATTGGTTGATGTACCCCAAGTTTAATGTCCTGT CGTGGTCGTACGAACTGGCCGTAGTATCGTTTATGATTCTCGGGCTCGCTGCACTG CTACTGTACAAGGAATCA CGCAAG TCAT ACGAAATG CGACGCGAGGCGAAGAATTT GGT CATGCAGATG CAGATGCACGAACCGGGATACCATCCATCGCACCACACTAGCCGAAGTCTGCACAGTGGTGGCTATATCTAAGTGAGCTAGGGAAAGGTTCCTGCCGCTCGAACGCTACCCATCCCATTCATATCCAATATGTATGCTACCTCTCTGGTAACCGCACAGCAAAAGGGACTATACCCTTCACCGTCATATCAACGTTCGTACAGTGTATGTCTTTAAATGTGGAAGCGTACGCAGAGCAGAACGTGACACTTCCGTATGCACACATGTATTTTACCAATCGTATTGAACGTAGTAATCTCACCTCCCTTAACAAGTGCCCGAATAATTGGAATACTTCAAAGCATCATCGAACACGCGTGGCCTTATAATGATTGTCTTTTTTCGTAGCATAACTGAAAGGCGCTGCCATGGAACAAGTGCCTGGAGCAATGCAA ] [+] EMBL BX609247 [ GGAAACCTTTACCGGCGCGATTGGTTGATGTACCCCAAGTTTAATGTCTTGT CGTGGTCGTACGAACTGGCTGTAGTATCGTTTATGATTCTCGGGCTCGCTGCACTG CTACTGTACAAGGAATCA CGCAAG TCAT ACGAAATG CGACGTGAGGCGAAGAATTT GGT CATGCAGATG 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GTGGTGGCTATATCTAAGTGAGCTAGGGAAAGGTTCCTGCCGCTCGAACGCTACCCATCCCATTCATATCCAATATGTATGCTACCTCTCTGGTAACCGCACAGCAAAAGGGACTATACCCTTCACCGTCATATCAACGTTCGTACAGTGTATGTCTTTAAATGTGGAAGCGTACGCAGAGCAGAACGTGACACTTCCGTATGCACACATGTATTTTACCAATCGTATTGAACGTAGTAATCTCACCTCCCTTAACAAGTGCCCGAATAATTGGAATACTTCAAAGCATCATCGAACACGCGTGGCCTTATAATGATTGTTTTTTTTCGTAGCATAACTGAAAGGCGCTGCCATGGAACAAGTGCCTGGAGCAATGCAACGCGGAAGCAAAAAATGCGCACCCTCTTATAGCTATAATCGTAACTATTTGTATGCTTTTATGCGTAGCTATTCGGTACATCCGTCCGTCCGCAGATCTATCTGTACGTAGCGTTTAGGAATTTTGAATTACTCTTAACTCGTTTATTAACATTTTCCGTCCCAAATCATAAAGACTCGTAAGTAAGATGTGTTTACCACACGAGATGGGCACAACTCTAAGCGAATATGCCCTTGTATTTGTTATATTTTAACAAACACATCTTTGGTCCAGCGAAAGCAAACATTCTTAAGTATACATACTTTTTGACGTCCATATTTAATTGNATAATTCTGTAATTCTTTAAGATTAGCAAGACAAAAACAATTCGCCCACATTCCATCCTCAGTTGGCAGCGTATGAACATTTCT] [+] EMBL BX625604 [ nGACACTTCCGTATGCACACATGTATTTTACCAATCGCATTGAACGTAGTAATCTCACC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||